首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往

医疗图像分割结果的3D可视化

1.1 Dicom 数据 Dicom文件包含了诸多的元数据信息(比如像素尺寸,每个维度的一像素代表真实世界里的长度),Dicom文件文件后缀为.dcm的文件。...可以使用Python的dicom依赖包来读取dicom数据dicom.read_file(‘a.dcm’) 1.2 mhd格式 每个病人一个mhd文件和一个同名的raw文件的格式,mhd即meta header...单独的.nii格式文件的优势就是可以用标准的压缩软件(如gzip),而且一些分析软件包(比如FSL)可以直接读取和写入压缩的.nii文件(扩展名为.nii.gz)。...2.3D可视化 由于ITK-SNAP的展示界面不够立体直观,可以借助paraview来展示我们的分割结果。 分割好的.img或.nii文件拖到ITK-SNAP页面 ?...第二项对标签分别生成方便后续选择性的展示,会给每个标签生成一个.vtk文件 ? 打开paraview,file->open将上步生成的.vtk全部加载 ? 1. 点Apply 2.

8.1K40
您找到你想要的搜索结果了吗?
是的
没有找到

使用QtTesting建立可视化软件的自动化测试系统

实际应用于VTK, ParaView, Slider3D,WELSIM等大型可视化软件中。是被实践证明的有效且好用的测试框架。...开发人员还可以创建自己的观察者来实现自定义功能,例如事件序列化到日志文件、Python 脚本等。 录制模块也可以记录检验事件,如验证某个属性。在检查,一个覆盖层会在鼠标悬停的小部件上绘制。...当点击小部件进行检查记录一个检查事件,并输出一个相关的QString 值。此功能也是WELSIM自动化测试中验证数值计算准确性的重要部分。...QtTesting在VTKParaView等软件上已经成功的应用,但是并没有公开测试案例。...支持读取*.wstb文件,此文件包含一组*.xml文件,实现更简单的一次性读取多个测试案例。 2. 保存测试失败的算例保存至*.wstb文件。用户无需手动选择测试案例保存。 3.

14510

【linux命令讲解大全】147.curl命令:命令行文件传输工具(上)

–cookie:cookie字符串或文件读取位置 –basic:使用HTTP基本验证 -B/–use-ascii:使用ASCII /文本传输 -c/–cookie-jar:操作结束后把cookie写入到这个文件中...-C/–continue-at:断点续传 -d/–data:HTTP POST方式传送数据 –data-ascii:以ascii的方式post数据 –data-binary:以二进制的方式post数据...,发送命令到服务器 -r/–range:检索来自HTTP/1.1或FTP服务器字节范围 –range-file:读取(SSL)的随机文件 -R/–remote-time:在本地生成文件,保留远程文件时间...–retry:传输出现问题,重试的次数 –retry-delay:传输出现问题,设置重试间隔时间 –retry-max-time:传输出现问题,设置最大重试时间 -s/–silent:静默模式。...下载文件输出到终端,所有下载的数据都被写入到stdout: curl URL --silent 使用选项-O下载的数据写入到文件,必须使用文件的绝对地址: curl http://example.com

31010

Python学习入门基础 — 第八章 文件读写操作、模块和包、异常

文件的概念 1.1 文件的概念和作用 计算机的 文件,就是存储在某种 长期储存设备 上的一段 数据 长期存储设备包括:硬盘、U 盘、移动硬盘、光盘… 文件的作用 数据长期保存下来,在需要的时候使用 1.2...指定内容写入文件 04 close 关闭文件 open 函数负责打开文件,并且返回文件对象 read/write/close 三个方法都需要通过 文件对象 来调用 2.3 read 方法 —— 读取文件...文件指针 文件指针 标记 从哪个位置开始读取数据 第一次打开 文件,通常 文件指针会指向文件的开始位置 当执行了 read 方法后,文件指针 会移动到 读取内容的末尾 默认情况下会移动到 文件末尾...,因为函数重名并没有任何的提示,出现问题不好排查 1.3 模块的搜索顺序 Python 的解释器在 导入模块 ,会: 搜索 当前目录 指定模块名的文件,如果有就直接导入 如果没有,再搜索 系统目录...就是一个 模块 在导入文件文件中 所有没有任何缩进的代码 都会被执行一遍!

1.3K30

USOVA3D2019——超声3D卵巢和卵泡分割识别

只有在对相同数据进行测试,才能对不同的卵泡检测方法进行客观比较。 二、USOVA3D2019任务 自动分割卵巢和卵泡结构。...他们使用了ITK-SNAP工具,该工具基于 VTK 数据格式导入和导出文件。因此,所有分割都以3D形式实现,并且每个分割都保存在一个单独的VTK格式文件中。...数据库包含五个文件,每个文件如下:一个包含3D图像的文件、两个包含卵巢的文件和两个包含卵泡分割的文件,由两个独立的评估者生成。所有数据文件均采用VTK数据格式。...四、技术路线 1、由于数据是以vtk格式存储的,首先需要将vtk图像转换成体数据格式,可以直接使用itksnap导出或者用vtk函数代码导出。...2、图像缩放到固定大小256x128x256,然后采用z-score归一化方式进行归一化处理,数据划分成训练集(14例)和验证集(2例),其中训练集进行20倍数据增强,包括旋转和平移操作。

26230

python︱处理与使用json格式的数据(jsonUltraJSONDemjson)、pickle模块、yaml模块

1、变量解码、编码为Json格式 2、文件读出、导入json格式 注意: 使用json需要注意的地方:python中字典的key在经过json转化后都变成了string类型 ---- 文章目录 1...、变量解码、编码为Json格式 2、文件读出、导入json格式 . 3、其他用法 4 yaml数据格式的使用 延伸一:python3中读保存成中文 Demjson UltraJSON pickle模块.../data.json', 'w').write(json.dumps(json_data,ensure_ascii = False)) 若依旧出现问题,报错:UnicodeEncodeError: 'gbk...: 输出限制为ASCII,并将所有扩展字符转义为127以上。...json数据 . ---- 延伸:用json解析网页 使用urlopen方法打开网址后, 使用json.load(u)以文件方法来读取.

95330

USOVA3D2019——基于Transformer超声3D卵泡分割识别

只有在对相同数据进行测试,才能对不同的卵泡检测方法进行客观比较。 二、USOVA3D2019任务 自动分割卵巢和卵泡结构。...他们使用了ITK-SNAP工具,该工具基于 VTK 数据格式导入和导出文件。因此,所有分割都以3D形式实现,并且每个分割都保存在一个单独的VTK格式文件中。...数据库包含五个文件,每个文件如下:一个包含3D图像的文件、两个包含卵巢的文件和两个包含卵泡分割的文件,由两个独立的评估者生成。所有数据文件均采用VTK数据格式。...四、技术路线 1、由于数据是以vtk格式存储的,首先需要将vtk图像转换成体数据格式。...2、图像缩放到固定大小160x160x160,然后采用z-score归一化方式进行归一化处理,数据划分成训练集(14例)和验证集(2例),其中训练集进行20倍数据增强,包括旋转和平移操作。

42120

curl语法整理

–cookie cookie字符串或文件读取位置 –basic 使用HTTP基本验证 -B/–use-ascii 使用ASCII /文本传输 -c/–cookie-jar 操作结束后把cookie写入到这个文件中...-C/–continue-at 断点续传 -d/–data HTTP POST方式传送数据 –data-asciiascii的方式post数据 –data-binary 以二进制的方式post数据...–retry 传输出现问题,重试的次数 –retry-delay 传输出现问题,设置重试间隔时间 –retry-max-time 传输出现问题,设置最大重试时间 -s/–silent 静默模式。...读取本地文本文件数据,向服务器发送 curl -d '@data.txt' https://wangchujiang.com/upload # 读取data.txt文件的内容,作为数据体向服务器发送。...使用选项-O下载的数据写入到文件,必须使用文件的绝对地址: curl http://example.com/text.iso --silent -O 选项-o下载数据写入到指定名称的文件中,并使用-

30830

windows环境下 curl 安装和使用

-b/--cookie cookie字符串或文件读取位置            --basic 使用HTTP基本验证  -B/--use-ascii 使用ASCII /文本传输  -c/--...cookie-jar 操作结束后把cookie写入到这个文件中  -C/--continue-at 断点续转  -d/--data HTTP POST方式传送数据            --data-ascii...,发送命令到服务器  -r/--range 检索来自HTTP/1.1或FTP服务器字节范围       --range-file 读取(SSL)的随机文件  -R/--remote-time 在本地生成文件...,保留远程文件时间            --retry 传输出现问题,重试的次数            --retry-delay 传输出现问题,设置重试间隔时间            --...retry-max-time 传输出现问题,设置最大重试时间  -s/--silent 静默模式。

1.7K60

文件操作及函数

数据文件 文件的内容不一定是程序,而是程序运行时读写的数据,比如程序运行需要从中读取数据文件,或者输出内容的文件。...返回值:如果成功,返回一个非负值。出错,该函数返回EOF。 fgets函数 他有3个参数,参数1是要存放的字符数组str,参数2是读入一个长度为num-1的字符串,参数3是pf指向的文件。...以ASCII字符的形式存储的文件就是文本文件。 字符一律以ASCII形式存储。数值型数据可以ASCII形式,也可以二进制形式存储。 如上图,1的ASCII值是49,所以是00110001。...feof——在文件读取结束后,用来判断文件是否因为读取过程中遇到文件结束标志而结束。 如上图,当遇到文件结束标志而结束,则feof为真。 如果ferror返回值为0(假),表示为出错。...刷新缓冲区可以用fflush()函数,参数是指向文件的指针。刷新缓冲区,才输出(读入)缓冲区的数据文件(内存)。

24810

windows下使用curl命令

-B/–use-ascii 使用ASCII /文本传输 -c/–cookie-jar 操作结束后把cookie写入到这个文件中 -C/–continue-at 断点续转 -d/–data HTTP...POST方式传送数据 –data-asciiascii的方式post数据 –data-binary 以二进制的方式post数据 –negotiate 使用HTTP身份验证 –digest...,发送命令到服务器 -r/–range 检索来自HTTP/1.1或FTP服务器字节范围 –range-file 读取(SSL)的随机文件 -R/–remote-time 在本地生成文件,保留远程文件时间...–retry 传输出现问题,重试的次数 –retry-delay 传输出现问题,设置重试间隔时间 –retry-max-time 传输出现问题,设置最大重试时间 -s/–silent静音模式...debug –trace-ascii Like --跟踪但没有hex输出 –trace-time 跟踪/详细输出,添加时间戳 -T/–upload-file 上传文件 –url Spet URL

2.5K20

curl命令调试接口「建议收藏」

使用HTTP基本验证 -B/–use-ascii 使用ASCII文本传输 -d/–data HTTP POST方式传送数据 –data-asciiascii的方式post数据 –data-binary...读取文件忽略session cookie –interface 使用指定网络接口/地址 –krb4 使用指定安全级别的krb4 -k/–insecure 允许不使用证书到SSL站点...-K/–config 指定的配置文件读取 -l/–list-only 列出ftp目录下的文件名称 –limit-rate 设置传输速度 –local-port 强制使用本地端口号...,发送命令到服务器 –range-file 读取(SSL)的随机文件 -R/–remote-time 在本地生成文件,保留远程文件时间 –retry 传输出现问题,重试的次数 –retry-delay...传输出现问题,设置重试间隔时间 –retry-max-time 传输出现问题,设置最大重试时间 -S/–show-error 显示错误 –socks4 用socks4

1.7K30

VS2008下VTK安装指南

vtk-5.0.4.zip解压到d:\Program Files (x86)\VTK 5.8.0,即解压后为:d:\Program Files (x86)\VTK 5.8.0\vtk5.8.0; vtkdata...还有要注意的就是: vtk_data_root: 目的是告诉cmake,vtk 需要的数据都在哪里,我们的数据在d:\Program Files (x86)\VTK 5.8.0\vtk5.8.0\vtkdata...如果用静态库编程,即off,应用程序可以独立运行,尺寸也比较大,如果用动态库编程,即on,应用程序必须找到动态库才能运行,但尺寸可以做得比较小。...建议选On, 我试过选OFF,所谓的静态编译,但之后新建一个项目,还是会出现找不到文件的问题。...第4步build_shared_libs是ON的话,把C:/VTK 5.0/bin/bin/Debug里生成的dll文件都拷到windows/system目录下。 7.

1.4K30

字符集问题的初步探讨(四)

导出使用的字符集将会记录在导出文件中,当文件导入时,将会检查导出使用的字符集设置,如果这个字符集不同于导入客户端的NLS_LANG 设置,字符集根据导入客户端NLS_LANG设置进行转换,如果必要,...通常在导出最好把客户端字符集设置得和数据库端相同,这样可以避免在导出发生不必要的数据转换,导出文件数据库具有相同的字符集。...即使将来会把导出文件导入到不同字符集的数据库中,这样做也可以把转换延缓至导入时刻。...我们简单看一下导入的转换过程(以Oracle8i为例): 1.确定导出数据库字符集环境 通过读取导出文件头,可以获得导出文件的字符集设置 2.确定导入session的字符集,即导入Session使用的NLS_LANG...环境变量 3.IMP读取导出文件 读取导出文件字符集ID,和导入进程的NLS_LANG进行比较 4.如果导出文件字符集和导入Session字符集相同,那么在这一步骤内就不需要转换 如果不同,就需要把数据转换为导入

57830
领券