我一直在尝试将平滑融入到我创建的runjags模型中，该模型用于模拟海鸟洞穴的数量和分布。通过从模型输出中提取计数数据以及x和y坐标，并使用此页面上的JAGAM教程，我成功地生成了一些平滑代码
我认为我可以通过将平滑合并到jags模型中来提高模型性能，但我不知道如何做到这一点。我在下面附加了runjags代码和JAGAM输出的一部分。ru
浏览 12提问于2018-08-14得票数 1
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我有一个runjags对象，它有两个混合非常好的链(链1和链3)，而另一个链没有混合(链2)。如何将runjags对象修剪为只包含链1和链3？这是一个使用runjags生成JAGS模型的可重复示例(尽管这里的链混合得很好)。library(runjags)
x <- seq(1,10, by = 0.1)
浏览 2提问于2017-08-22得票数 1
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)package ‘runjags’ was built under R version 4.2.1
Loading required4.2.1 > jags.parallel(model.file = bayes_gpd,data = jags
浏览 10提问于2022-08-01得票数 0
因为具有所有情节的runjags对象都是，所以我尝试用plot=FALSE进行run.jags，将结果的runjags对象保存到文件中，在新的R会话中恢复它(作为out)，然后通过(有关此技巧，请参见此处讨论：)o
浏览 0提问于2014-09-21得票数 1
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我试图使用一个新的包运行JAGS，因为 (完整的模型代码在问题中)：out <- run.jags("Poisson.OD.t.test.txt", params, win.data, nc, inits,plot(out2, layout = c(4, 2))
这个包的缺点是，由runjags函数返回的run.jags<
浏览 0提问于2014-02-17得票数 3
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我把R中runjags模型的输出作为mcmc.list。下面是生成3条1,000个样本链的代码。我想把所有的12条链都剪到最后的400个样品上。下面是运行runjags模型并将输出转换为mcmc.list的一些数据model {for (i in 1:N){y.hat[i] <- m0m0 ~ dnorm(0, .0001)
tau <- pow(sigma
浏览 1提问于2018-04-25得票数 1
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似乎runjags突然(在更新到2.0.3-2版之后)在查找JAGS二进制文件时遇到了问题，并发出一个错误：我通过将这一行放到我的Rprofile中修复了这个问题
.runjags.options <- list(jagspath ="c:/Program
浏览 4提问于2016-11-01得票数 0
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我正在使用RJAGS修改现有的模型。我想并行运行链，偶尔检查Gelman收敛诊断，看看是否需要继续运行。如果我不重新编译模型，RJAGS会抱怨。当链停止时，是否有一种方法来存储链的位置，这样我就可以从我停止的地方重新初始化？这里我将给出一个非常简单的例子。[[i]]$recompile()
jags.samples <- coda.samples(jags[[i]],c('mu','tau'),100)
浏览 0提问于2015-04-06得票数 6
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我试图使用runjags包运行JAGS，并生成定制的绘图--改变链的颜色(完整的模型代码在问题中)：out2 <- run.jags("Poisson.OD.t.test.txt这似乎已经是run.jags调用中的情节了！但这似乎也不允许改变情节选择。
为什么他们已经在run.jags中创建了地块？通常，设计良好的应用程序会将逻辑(<
浏览 0提问于2014-02-15得票数 2
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我正在使用r2openbugs来拟合一组模型。这要求我为我尝试的每个模型创建一个新的模型文件。我有一套组合，我想测试(不同的协变量集，是否包括随机效应，是否计算预测等)。我想要创建一个脚本，它接受一组参数(包含的协变量列表，随机效应和预测的T/F )并输出一个有效的openbug模型文件。当前针对问题的尝试:我目前正在编写我希望使用的每个模型，并使用R闭包在它们之间进行选择。然而，这显然是重复了大量的代码，而且需要很长时间。我确信可以根据某些参数为基本模型添加
浏览 2提问于2017-06-15得票数 2
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对于下面的网，A是离散的，D和E是连续的：对于rjags模型，我想要的是在值节点A上定义节点E的参数:伪代码 A ~ dcat(c(0.0948, 0.9052 ))1.180965*D, 1/2.960002^2) } sig = 2.960002 - (A==2)*(2.960002 - 6.554402)
浏览 4提问于2017-08-23得票数 2
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本书中有一个简单的练习，涉及到剪切和粘贴以下代码，以便在Winbug中运行：ytilde ~ dbin(theta代码，但遇到了一些麻烦。我认为我可以以这样的方式直接编写我的R2Jags代码： #Likelihoods yt ~ dbin(theta,m))Error in jags.mo
浏览 4提问于2017-02-03得票数 0
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我正在通过R包runjags运行JAGS模型。我刚刚从Jags3.4更新到Jags4.0.0，并注意到了一些与更新相关的意外行为。首先，当我运行模型时，我现在得到一个警告消息WARNING: Unused variable(s) in data table:，后面是模型中引用并作为数据提供的数据对象列表。我现在似乎无法重新创建更新失败，但下面是一个可重复的代码示例，演示了奇怪的警告信息。run.jags帮助页上的代码
浏览 5提问于2015-10-09得票数 1
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我使用R中的runjags包在一个单独的处理节点上运行每个链的贝叶斯统计模型，我希望通过使用run.jags包在并行循环中嵌套run.jags调用来一次适应多个模型。下面是一个错误消息示例：
socketConnection中的错误(“localhost”、port = port、server= TRUE、blocking = TRUE )：无法打开连接
下面是一些生成数据并适合两个<e
浏览 2提问于2018-12-03得票数 3
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我使用rjags运行逻辑模型，但错误总是发生(见下文)，我觉得我的代码包含了所有需要的东西，而且它们是合乎逻辑的，所以到目前为止，我无法检测到代码中的错误。下面是错误RUNTIME ERROR:#loading the data?list( 'ro
浏览 4提问于2016-09-03得票数 1
我正在使用R中的JAGS将威布尔模型拟合到离散值。我可以将威布尔模型拟合到连续数据，但当我切换到离散值时，我会遇到麻烦。以下是一些数据，以及在JAGS中拟合威布尔模型的代码：y <- rweibull(200, shape = 1, scale= 0.9)
#load jags, specify a ja
浏览 5提问于2017-08-26得票数 1
我正在使用R的runjags包运行一些JAGS模型。我在远程服务器上通过Rstudio运行R。最近，我开始在长时间的模型运行(> 30分钟)中得到这个错误。此外，我可以运行相同的代码，这有时会发生，但不会发生在其他时候。这告诉我这可能是服务器问题，而不是JAGS或runjags本身的问题。有没有猜到？Error: The following error was encountered while attempting to run the JAGS</em
浏览 4提问于2016-07-12得票数 1
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我正在使用jags来模拟贝叶斯框架中的工程反问题。我想知道我是否可以在jags模型中包含一个函数来定义µ参数。mu[i]=function(c,fi){...} c ~ dnorm( 9 , 1/9 )}谢谢
浏览 0提问于2018-09-04得票数 1
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我正在尝试使用在R中实现的JAGS将多变量模型拟合到物种组成数据。我有3个物种相对丰度的数据(介于0，1之间)，其中两个是相关的。下面是生成类似数据的代码。我想对这些数据拟合一个仅截距模型，使用dirlichet分布来解释因变量之间的协方差，这是beta分布的多变量扩展。library(runjags)
#Write JAGS model, save
浏览 21提问于2018-03-03得票数 3
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我在函数summarise = TRUE中设置了run.jags，然后将输出对象保存为save(out, file="out.RData")。
错误:提供了无效的runja
浏览 2提问于2015-09-15得票数 0
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