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2023.4生信马拉松day7-R语言综合应用

本节课程大纲 六个专题—— 1.玩转字符串★★★ 2.玩转数据框★★★ 3.条件循环★★★★★ 4.表达矩阵画箱线图★★★★ 5.隐式循环★★★ 6.两个数据框的连接★★ 课前提示: 六个专题互不干扰互相独立...★★★ 1. arrange() 数据框排序 -(1)arrange(test, Sepal.Length)默认按照某对整行进行排序,不改变之间的对应关系; -(2)默认从小到大排序;要改为从大到小排序的话改成...;且使用if语句,后面大括号里的代码可以折叠; 实例:用if(F){}注释掉暂时不想运行但以后还可能运行的代码(运行时把F改为T即可);直接删掉的话下次想用就得重新写;用#号大段大段注释不能折叠,影响阅读...转换数据:把表格转换成两数据 -(1) 第一步:转置 -(2) 第二步:把行名作为一添加到数据中(因为ggplot2容易把行名丢掉,所以倾向于把行名作为一) -(3) 第三步:新增一“group...加载test1.Rdata,两个数据框按照probe_id连接在一起,按共同取交集 #2.

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    Kotlin 布尔值教程:深入理解应用示例

    Kotlin 有以下条件语句使用 if 指定在条件为 true 时要执行的一段代码使用 else 指定在条件为 false 时要执行的一段代码使用 else if 在第一个条件为 false 时测试新的条件使用...when 指定多个替代代码块来执行注意: Java 不同,if..else 可以在 Kotlin 中用作语句或表达式(为变量赋值)。...println("x 大于 y")}示例解释在上面的示例中,我们使用两个变量 x y 来测试 x 是否大于 y(使用 > 运算符)。...在 else if 语句中的下一个条件也为 false,因此我们转到 else 条件,因为 condition1 condition2 都为 false,并在屏幕上打印 "Good evening"...Kotlin If..Else 表达式在 Kotlin 中,您还可以 if..else 语句用作表达式(为变量赋值并返回):示例val time = 20val greeting = if (time

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    R语言︱数据分组统计函数族——apply族用法心得

    函数名 功能 特点 apply 按行、运算均值、求和、众数等 简单运算 tapply=table apply 在apply之上加入table功能,可以分组汇总 table结合,可以分组汇总 lapply...=list apply 都需要数据框格式,可以list合用,返回仍是list list用法 sapply=simplify apply=unlist(lapply) 都需要数据框格式,可以list合用...,返回是矩阵 lapply一样,但是可以输出矩阵格式 apply Apply Functions Over Array Margins对阵列行或者使用函数 apply(X, MARGIN, FUN...函数sapply 每一数据采用同一种函数形式,比如求X变量得分位数,比如求X变量的循环函数。...lapply使用格式为: lapply(X, FUN, ...) lapply的返回值是一个X有相同的长度的list对象, 这个list对象中的每个元素是函数FUN应用到X的每一个元素。

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    单细胞测序—标准流程代码(3)—marker 基因富集分析_差异基因

    以下是 scores 的具体内容作用:scores 的内容得分矩阵:scores通常是一个矩阵或数据框,其中每行对应一个基因,每对应一个细胞群或组别。...Reactome 的数据是以事件(event)为基础组织的,涵盖了反应(reaction)通路(pathway)。通路被分为多个层级的子通路,并且可以在不同的细胞上下文或条件下展示。...:rbind()函数用于多个数据框或矩阵按行绑定在一起。do.call()用于rbind应用到lapply()生成的结果列表中,将不同细胞类型的统计结果合并为一个矩阵或数据框。...res$symbol = rownames(x):基因名称添加到res数据框中,作为一,列名为symbol。EnhancedVolcano():使用EnhancedVolcano包生成火山图。...lab = res$symbol:用基因符号(symbol)作为图中的标签。x = 'avg_log2FC:使用avg_log2FC作为x轴变量,表示基因的log2倍数变化。

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    R语言入门系列之三:R脚本

    写在前面: 在前面两篇文章R语言入门系列之一R语言入门系列之二中,我分别介绍了R语言中的对象结构、数据的输入输出及可视化。...2条件执行 在条件执行也即选择结构中,语句只有在满足一定条件时才会执行,主要有if-else、ifelse、switch三种。...apply函数家族 apply函数家族主要成员如下: apply 对数组行或者使用函数 apply(X, MARGIN, FUN, ...) lapply 对列表或者向量使用函数 lapply...lapply()通过对x的每一个元素运用函数,生成一个元素个数相同的值列表: lapply(X, FUN, ...)...如果simplify="array",结果返回一个数组。举例如下: 4自定义函数 用户可以根据需求自定义函数,R函数是通过使用关键字function来创建。

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    慕课网三小时入门php笔记

    ,甚至可以使用汉字进行开头,数字进行命名但是用汉字进行变量命名是很不常用的,变量名不允许包含空格,如果变量名包含多个单词组成,那么建议使用”_“进行分隔, 当然我们也可以使用比较著名的驼峰命名法如$helLo...在脚本中无法改变该值,有效的常量名以字符下划线开头 ,常量名称没有$开头 , 变量不同 常量贯穿整篇代码 ,为全局性质的。 ?...我写道这里想给大家说下输出的问题,如下 输出 echo print 的区别 echo 可以输出多个字符串,使用逗号分隔 echo为语言结构,并不是函数,不能作为表达式的一部分使用。如下所示 ?...break的作用是结束switch(后面会有专门举例说明),使用 switch 语句可以避免冗长的 “if..else if..else”代码块。 而在我的理解中如下 ?...这个理解成必执行一条语句,然后执行条件 这两种的区别,官方解释;whiledo…while循环语句的区别是,while先判断条件是否成立,后执行循环,do...while先执行一次任务,再判断是否继续执行循环

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    sql学习

    ,如果需要有条件的从表中选取数据可将where子句添加到select语句中 语法:SELECT 列名称 FROM 表名称 WHERE 运算符 值 可在where子句中使用的运算符: 操作符 描述...SQL AND & OR 运算符 ANDor用于基于一个以上的条件对记录进行过滤 在一个WHERE子句中将两个或多个条件结合起来。 也可以ANDOR使用圆括号结合起来组成复杂表达式。...UNIQUE UNIQUE主见约束均为或者集合提供了唯一性的保证,每个表可以有多个的UNIQUE约束,但是每个表只能有一个主键约束。...SQL Date函数 处理日期时,为了确保所插入的日期的格式,也就是数据库中日期格式相匹配。...GROUP BY() 用于结合合计函数,根据一个或多个对结果集进行分组。 HAVING子句 当WHERE关键字无法和合计函数一起使用时,使用HAVING子句。

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    生信入门马拉松之R语言基础-脚本项目管理、条件循环、表达矩阵一丢丢数据挖掘(Day 7)

    if条件语句:如果。。。就。。。2. 脚本项目管理、条件循环2.1 长脚本管理方式2.1.1 不想运行且不想删除的代码:用if函数if(T){...}...save(pd,exp,gpl,file = "steploutput,Rdata"),这句代码几个第一个脚本有用的变量保存到Rdata文件中,下次使用这些变量时直接加载load这个Rdata文件即可...Rdata可以保存多个变量,下次使用只需要一次load可以的到多个数据。-Rdata不仅可以保存数据框,也可以保存其他任何数据结构,包括复杂的对象!...跟多个条件的两句代码比较看哈!!...加载test1.Rdata,两个数据框按照probe_id连接在一起,按共同取交集load("test1.Rdata")library(dplyr)merge1 <- merge(dat,ids,

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    SQL数据分析:从基础入门到进阶,提升SQL能力

    SQL 基础语言学习 在了解 SQL 基础语句使用之前,我们先讲一下 表 是什么? 一个数据库通常包含一个或多个表。每个表由一个名字标识(例如“客户”或者“订单”)。表包含带有数据的记录(行)。...WHERE – 条件过滤 如果需要从表中选取指定的数据可将 WHERE 子句添加到 SELECT 语句。...如果是数值,请不要使用引号。 AND & OR – 运算符 AND OR 可在 WHERE 子语句中把两个或多个条件结合起来。...如果第一个条件第二个条件都成立,则 AND 运算符显示一条记录。 如果第一个条件第二个条件中只要有一个成立,则 OR 运算符显示一条记录。...AND OR 运算符: 我们也可以把 AND OR 结合起来(使用圆括号来组成复杂的表达式): SELECT * FROM Persons WHERE (FirstName='Thomas'

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    Moloch 非官方手册

    在工作中,我使用的是国内某家公司的全流量分析系统,相比之下,我认为 Moloch 作为一款开源系统,其对流量数据的解析功能非常强大,可以花式构造过滤语句。...(Moloch 可将 Suricata作为插件结合,有兴趣的朋友可以试试) 文中用法多为个人理解,可能存在偏差,在此仅做抛砖引玉,希望各位表哥多交流指点! 一、Sessions 界面 ?...应用&创建默认过滤 经预先设置后,指定的条件作为默认过滤。 如图1-2:选择该条已定义好的规则,检索所有捕获到的 TCP 数据,然后检索出 IP 10.0.1.1 相关 TCP数据。 ?...数据信息 如图1-16显示的为元数据信息,如源IP,源端口,目的IP,目的端口等。 ? 可以通过点击图 1-17 中所示按钮,可将想要在页面中显示的字段应用为。 ?...通过查看 “Settings” 面板中的 “Column Configs” 条目,可以清楚的看到默认配置 “A” 配置的区别,即选择默认配置时多出一 “info” 信息。 ?

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    【OCP最新题库解析(052)--题34】You want to audit update statements that

    因为审计触发器代码在每次插入、更新或删除操作发生时都必须执行,所以标准数据库审计相比,使用基于值的审计时,性能下降幅度比较大。性能下降幅度取决于触发器代码的效率。...标准数据库审计或基于值的数据库审计相比,FGA重点审计的范围设置得更窄。可将FGA选项设置为按表或视图中的各个进行审计,还可将其设置为条件选项,以便只在符合管理员定义的特定规范时才捕获审计。...FGA策略支持多个相关。默认情况下,如果其中任何一出现在SQL语句中,就会审计该语句。...通过使用DBMS_FGA.ALL_COLUMNSDBMS_FGA.ANY_COLUMNS,可对语句中是否使用了任何或全部相关来进行审计。...可使用DBMS_FGA PL/SQL程序包来创建对目标表或视图的审计策略。如果查询块中返回的任何行审计列指定的审计条件相匹配,则审计事件会导致在审计线索中创建并存储审计记录。

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