)
dat=fread( "GSE182434_raw_count_matrix.txt.gz",data.table = F)
dim(dat)
dat[1:4,1:4]
rownames(dat)=...dat[,1]
dat=dat[,-1]
dat[1:4,1:4]
annotation = fread( "GSE182434_cell_annotation.txt.gz",data.table =...投影的降维图
DimHeatmap(sce, dims = 1:15, cells = 500, balanced = TRUE)#DimHeatmap()允许轻松探索数据集中异质性的主要来源,并且在尝试决定要包括哪些...作为 UMAP 和 tSNE 的输入,我们建议使用相同的 PC 作为聚类分析的输入。...tree, filename="Tree_diff_resolution.pdf",width = 10,height = 11)
##(4)分群
#最后分群选择的resolution=0.4,细胞聚类为