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尝试加载具有JPEG2000压缩的胸部x射线DICOM文件，提取像素阵列，裁剪它，然后另存为新的DICOM文件。在Windows10和MacOS计算机上尝试此操作，但收到类似的错误。在conda环境中运行Python3.6.13，GDCM2.8.0，OpenJpeg 2.3.1，Pillow 8.1.2 (在安装Pillow和Pydicom之前先安装OpenJPEG和GDCM )。See pydicom.encaps.encapsulate() for more inf
浏览 365提问于2021-04-02得票数 3
我想将Dicom标签添加到一系列Dicom图像中，并希望保存修改后的批次。我已经使用pydicom编写了一个简单的python脚本，可以在单个dicom图像中编辑和添加Dicom标签，但我想对整个图像集(比如20或30张图像)执行相同的过程。有没有人能建议我用pydicom或python来完成这项任务？
浏览 3提问于2019-04-04得票数 2
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我正在尝试光栅通过一个目录，并转换所有的DICOM文件中的TIFF文件。我已经得到了搜索功能的工作，但我有一个很难保存的图像作为TIFF。我使用pydicom库来读入DICOM并操作头信息。此外，我还尝试使用pydicom中的save_as函数保存到TIFF，但我宁愿使用PIL中的save函数来正确设置TIFF的压缩。我认为问题是我不能/不理解如何从<e
浏览 0提问于2012-02-15得票数 3
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使用pydicom尝试读取测试文件，如下所示：filename = get_testdata_files(pass_dicom)[0]Traceback (most recent call last):
File "t.py", line 4, in <mo
浏览 2提问于2018-08-13得票数 0
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我正在尝试从imagenet上的预训练模型进行迁移学习，以解决肺CT切片的分类任务。
这些切片存储在dicom文件中，因此它们的值在Hounsfield标度中以12位表示。我的问题是: keras / tf2 api的preprocess_input需要一个0,255的值矩阵，那么我如何对我的图像进行预处理，以便将它们提供给预先训练的convnet？我可以在0,1中归一化图像的范围吗?还是强制使用模型的preprocess_input？如果preprocess_input是必需的，我如何映射0,
浏览 1提问于2020-06-20得票数 0
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我正试着把所有的图像保存在一个多帧的DICOM文件中。现在，通过使用pydicom和matplotlib库，我能够成功地在单帧DICOM文件中查看和保存单个图像，如下所示：ds = pydicom.dcmread(filena
浏览 13提问于2022-04-11得票数 1
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当我试图在pydicom包中导入dicom时，出现了错误。我执行了以下步骤。下载pydicom-0.9.9.tar文件，解压缩并在cmd.But中执行“jython setup.py安装”--它无法工作。这是因为jython与python的兼容性吗？如何使pydicom在jython中工作？
浏览 4提问于2016-06-27得票数 1
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我是python的新手，并且使用pydicom模块编写了一个简单的python脚本。import pydicomfrom pydicom.datasetimport Datase
浏览 0提问于2019-04-03得票数 0
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我正在尝试学习如何使用pydicom来读取和处理dicom图像。我使用的是Python 3。import dicom ds = pydicom.read_file(lstFilesDCM[0])我得到一个错误的NameError: name 'pydicom' is not defined。如果我改变了
ds = pydico
浏览 0提问于2017-11-28得票数 0
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我试图在Python环境中使用dicom映像并使用OpenCV对其进行操作。到目前为止，我已经使用pydicom库读取dicom(.dcm)图像数据，并使用像素数组属性使用OpenCV imshow方法显示图片。但是输出只是一个空白窗口。下面是我目前正在使用的代码片段。import numpy as npimport pydicom as
浏览 0提问于2018-12-10得票数 2
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我正在编辑多个dicom图像的元数据，这些图像在dicomdirs之间划分。我已经成功地加载了dicomdir，遍历了它以找到图像，编辑了它们的元数据，并覆盖了原始的dicom文件。当我尝试重新运行我的代码时，我得到以下错误消息：File "dicom_run.py", line 28, in <module>我使用以下代码来实现这
浏览 2提问于2019-08-10得票数 2
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我正在尝试使用dicom数据和nifti GT训练我的Pytorch模型，然而，权重文件的大小小得离谱，因为模型训练没有正常执行。我认为数据加载器有问题。原始图像文件格式为dicom，GT图像格式为niftidef __getitem__(self, index):
image_path = self.image_paths
浏览 36提问于2021-11-24得票数 1
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错误信息：import pydicom as dicomio<ipython-input-1-102814c2908e> in <module>()要安装
浏览 0提问于2015-11-01得票数 3
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我正在读取一个dicom图像并访问它的像素阵列。之后，使用sitk.Write将该数组再次保存为dicom格式，但要读取的原始图像和写入后的相同图像之间存在差异。如何才能获得相同的图像显示。我正在使用Radiant Viewer来可视化Dicom图像。我想要与输入相同的输出。代码以及输入和输出图像如下所示： # Reading a dicom i
浏览 144提问于2020-09-03得票数 0
我有一个12位的2D DICOM图像，我需要对Bits-Store做一些修改以将其转换为8位。为此，我修改了pixel_array。要将修改后的新pixel_array保存为DICOM图像，我需要与原始图像相同的meta_data，以便生成的DICOM是完全可读的。import pydicom
ds = pydicom.dcmread(
浏览 1提问于2019-07-03得票数 0
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我正尝试在opencv- python中显示DICOM图像。我正在使用pydicom库，然后添加API来使用DOTNET创建一个完整的DICOM查看器，它运行python(当然，C#调用python与进程实例！！)。我无法转换或查看未压缩的DICOM图像。raise NotImplementedError("Pixel Data is compressed in a format pydicom does
浏览 1提问于2014-06-04得票数 4
我有很多图片(pydicom文件)。我想一分为二。从1图像，我想2个图像:部分左和部分右。 输入: 1000x1000输出: 500x1000 (宽x高)。 目前，我只能读取文件。ds = pydicom.read_file(image_fps[0]) # read dicom image from filepath 第一部分，我想把一半放在一个文件夹里，另一半放到第二个文件夹里这就是我所拥有的：enter image description here这就是我想要的：enter image descri
浏览 38提问于2019-03-23得票数 0
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我使用 DICOM 命令将DICOM图像数据保存为TIFF图像。但在整个过程中，图像强度是倒置的(倒置LUT)。有什么办法克服这个问题吗？我尝试使用来自PIL的ImageOps.invert函数，但是如果给我“不支持此图像模式”的错误。这是我使用的代码：import Image
meta=dicom</e
浏览 4提问于2012-02-16得票数 0
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我正在使用pydicom处理Dicom图像。但是我的项目是在fasai中，我想使用library库打开Dicom映像。因此，我使用pydicom，它们得到它们的像素数组，然后转换为RGB and resized.我有一个问题，我如何打开一个Dicom图像，就像我们打开一个简单的png图像一样。我们打开正常的图像，比如在fastai：
im = open_image(img_path
浏览 5提问于2021-07-14得票数 1
我想读一些DICOM文件，所以我正在测试pydicom的工作，我认为这是相当有用的。现在我想加载现有的DICOM文件，用另一个像素数组(例如预处理或字面上的另一个DICOM像素数组)替换像素数据数组，最重要的是，我想用任何DICOM查看器应用程序再次读取它。对于这个测试，我使用了下面的教程代码。此代码加载一个测试数据文件。图像大小为64*64。下面的代码对原始数据进行了次采样.然后，图像大小为8*8，并将结果保存到after.dcm中
浏览 0提问于2018-02-19得票数 6
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