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Venn网络展示富集分析结果

前面讲述了富集分析泡泡图绘制,富集分析结果也可以用网络形式同时展示富集条目以及对应基因。 首先看下示例数据,列数可多可少,这里只用到Description列和geneID列。..._higherThan_.untrt 采用BIC工具Explode matrix对矩阵进行转换,把geneID列基因按行拆分开: http://www.ehbio.com/Cloud_Platform...HALLMARK_ANDROGEN_RESPONSE 把这个文件粘贴到最全Venn图绘制工具Evenn (http://www.ehbio.com/test/venn/#/,更多功能见这个Venn 网络很漂亮...Venn network处,直接点击submit。...点击提交后,直接出来一张网络图 点击Preferred layout按钮,看动画,调布局 (具体操作可查看EVennHelp帮助文档和对应视频)。

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启动网络自我训练流程,展示网络数字图片识别效果

上一节,我们完成了网络训练代码实现,还有一些问题需要做进一步的确认。网络最终目标是,输入一张手写数字图片后,网络输出该图片对应数字。...当神经网络认为图片数字是5,那么编号为5输出节点会给出0.99高比率,如果网络认为图片对应数字是0,那么编号为0节点输出0.95高比率。...由于一张图片总共有28*28 = 764个数值,因此我们需要让网络输入层具备764个输入节点,于是网络初始化以及将数据输入网络进行训练实现代码为: #初始化网络 input_nodes = 784...上面代码把一百条数据输入网络进行训练,现在我们看看训练后网络表现怎样。...从结果上看,当训练网络数据流增大后,网络识别的正确性由原来0.6提升到0.9,我们再次用新训练后网络识别原来那十张数字图片,得到结果如下: ?

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【hacker错误集】ValueError: IO operation on closed file

✅作者简介:大家好我是hacker707,大家可以叫我hacker,新星计划第三季python赛道Top1 个人主页:hacker707csdn博客 系列专栏:hacker错误集 推荐一款模拟面试...csv for p in person: writer.writerow(p) 报错分析 ValueError: I/O operation on closed file.依旧是使用单词意思来分析报错原因...ValueError值错误 closed file关闭文件 通过分析可以得出:with open处理了已经被关闭数据。...使用with open打开文件,如果语句在with open之外是无效,因为文件已经被关闭了 居然:那应该怎么解决呢 hacker: 解决方案 其实解决方法很简单,只需要将你要处理数据都加到with...~ 感谢大家对hacker支持

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解读Linux下ip命令展示网络连接信息

前言 ip 命令可以告诉你很多网络连接配置和状态信息,但是所有这些词和数字意味着什么? 让我们深入了解一下,看看所有显示值都试图告诉你什么。...当您使用 ip a(或 ip addr)命令获取系统上所有网络接口信息时,您将看到如下所示内容: $ ip a 1: lo: mtu 65536 qdisc...新命名方案被称为“可预测网络接口Predictable Network Interface”。 它已经在基于systemd Linux 系统上使用了一段时间了。...网络电缆已插入,设备已连接至网络 列出其他值也告诉了我们很多关于接口知识,但我们需要知道 brd 和 qlen 这些词代表什么意思。...所以,这里显示是上面展示 ip 信息其余部分翻译。

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FediForum展示联邦宇宙应用和开发者网络

然而,FediForum 今年展示是,fediverse 不仅包含 Mastodon(以及即将推出 Threads),还包含更多应用程序。我将在本文中讨论一些更有前途应用程序/服务。...第一天演示亮点是被 Meta 员工 Peter Cottle 演示 所掩盖,该演示展示了 Threads 如何连接到 Mastodon。...在演示中,Pate 展示了如何关注来自各种开放网络协议提要——ActivityPub、RSS 和 IndieWeb 格式,如微格式和 webmentions。...Fediverse 开发者网络 英国开发者 Andy Piper 在第二天主持了一场关于新兴联邦宇宙开发者网络会议。他首先将其与 Mozilla 开发者网络 (MDN) 进行了比较。...FediForum 上大多是积极氛围 总体而言,为期两天 FediForum 展示了不断壮大联邦宇宙社区热情。

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基于面部照片亲属关系预测深度神经网络

这是本文将尝试通过使用野外家庭:以Kaggle共享格式亲属识别基准数据集: https://www.kaggle.com/c/recognizing-faces-in-the-wild/data 将探索有效深度神经网络和转移学习技术来训练一个神经网络...,该神经网络将预测两个人是否与血液相关或者没有给出他们脸部图片。...模型: 为了解决这个问题,将使用一个连体网络,该网络拍摄一对图像并预测1如果照片中的人是相关,否则为0。 暹罗网络 图像编码器应用于每个输入图像并将它们中每一个编码为固定长度矢量。...两个图像矢量之间平方被馈送到完全连接层,然后该层预测亲属二元标签。...结论: 展示了训练一个暹罗网络来预测两个人是否有血缘关系。通过使用迁移学习,能够在AUC ROC中获得0.81令人鼓舞结果,特别是考虑到亲属预测任务对于人类而言相当困难。

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Python遇到坑--ValueError: check_hostname requires server_hostname

: raise ValueError("check_hostname requires server_hostname") ValueError: check_hostname requires...报错原因: 这个其实跟选用python版本关系不大,主要原因是因为每次使用 pip install 命令下载插件时候,下载都是最新版本,比如下载requests插件,它会自动将依赖urllib3...这个插件也安装,然后依赖插件版本太高,就导致了这个报错问题。...所以说,一般遇到这种莫名其妙问题时候,可以先去看一下是不是插件问题导致,解决措施就是 将urllib3插件版本降低就可以,当然,直接在安装requests插件时候,选择用低版本也可以解决这个问题...,比如有的小伙伴在学习django,然后照着别人博客写文章操作,最后报错,很有可能就是插件版本导致

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如何用Python实现iPhone X的人脸解锁功能?

实际上,FaceID 使用是类似暹罗式卷积神经网络(siamese-like convolutional neural network)来驱动。...▌暹罗神经网络及其优势 一般而言,它由两种相同神经网络组成,这两种神经网络共享所有权重。该网络结构可以计算特定类型数据(如图像)之间距离。...通过暹罗网络传递数据,或者简单地通过两个不同步骤向同一网络传递数据,网络会将其映射到一个低维特征空间,好比一个 n 维数组。...同样地,一个暹罗神经网络可以帮你完成这件事,用不同编码来表示目标的不同特征,就像是一个自动编码器。...▌结论 在这篇文章中,从概念到实验验证,展示了如何基于人脸嵌入和暹罗卷积神经网络来实现FaceID 解锁机制。 所有相关 Python 代码都在这里,收好不谢!

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python使用AI实现识别暹罗与英短

那么如果提供500张暹罗500张英短短图片呢,是不是猜对概率可以更高? 我们是怎么识别暹罗和英短呢?...当然是先归纳两种猫特征如面部颜色分布、眼睛颜色等等,当再有一张要识别短图片时,我们就看看面部颜色分布、眼睛颜色是不是可暹罗特征一致。...下面就该主角出场了,卷及神经网络(Convolutional Neural Network, CNN). 最简单卷积神经网络就长下面的样子。 分为输入、卷积层、池化层(采样层)、全连接和输出。...每一层都将最重要识别信息进行压缩,并传导至下一层。 卷积层:帮助提取特征,越深(层数多)卷积神经网络会提取越具体特征,越浅网络提取越浅显特征。 池化层:减少图片分辨率,减少特征映射。...下面使用apple卷积神经网络框架TuriCreate实现区分暹罗和英短。

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谷歌大脑研究人员展示可以劫持神经网络对抗攻击方法

就在本月,研究人员证明了一种流行物体检测API可能会被人误以为猫是“疯狂被子”和“玻璃纸”。不幸是,这不是最糟糕:它们也可能被迫计算图像中方块,对数字进行分类,并执行预期任务之外任务。...转移学习新形式甚至不需要攻击者指定输出。 ? 研究人员写道:“我们研究结果首次证明了目的是重新规划神经网络对抗攻击可能性,这些结果证明了深度神经网络中令人惊讶灵活性和脆弱性。”...以下是它工作原理:恶意攻击者可以访问正在执行任务对抗神经网络参数,然后以转换形式引入扰动或对抗数据,以输入图像。随着对抗性输入被馈送到网络中,它们将其学习功能重新用于新任务。...尽管该论文作者没有在复现神经网络(一种常用于语音识别的网络)中测试该方法,但他们假设成功攻击可能会导致这类算法执行一系列非常广泛任务。...幸运是,研究人员指出,随机神经网络似乎比其他神经网络更不容易受到攻击,并且对抗性攻击可以使机器学习系统更易于重新利用,更灵活,更高效。

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gps实时位置展示

概述 很多时候,我们有这样使用场景:外业人员在外作业,我们需要知道人员的当前实时位置和人员信息,如何实现呢?本文将为大家简单说明该场景下我们应该实现。 效果 ? ?...思路 解决实时位置展示,最核心有两点:1、数据传输与存储;2、设备端如何和监控端进行数据交互。 首先,我们来说第一个问题:数据传输与存储。...大多时候,设备传输过来位置信息数需要做存储,除了个别情况外。因此,我们可以考虑在数据库中建立一张表,来记录设备实时位置数据。...这个问题解决方式有两种:1、前端定时刷新;2、后端实时推送。...如果是前端定时刷新,我们可以用setInterval(function, time)来处理;如果是后端实时推送,这里面涉及两个方面的思考:a、位置信息传输过来入库后触发器;b、websocket数据实时推送

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利用Python网络爬虫抓取微信好友签名及其可视化展示

前几天给大家分享了如何利用Python词云和wordart可视化工具对朋友圈数据进行可视化,利用Python网络爬虫抓取微信好友数量以及微信好友男女比例,以及利用Python网络爬虫抓取微信好友所在省位和城市分布及其可视化...今天,小编继续给大家分享如何利用Python网络爬虫抓取微信好友签名及其可视化展示,具体教程如下所示。 1、代码实现还是基于itchat库,关于这个神奇库,在之前文章中有提及, 再次不多赘述。...3、随机验证一下微信好友签名,再此以小编对象微信签名为例,她签名是“得之安然、失之坦然、处之泰然、顺其自然、争其必然!”...代码关键部分是需要底图和字体,底图小编用是路飞,注意要使用白色底图图片,不然词云可视化时候效果不佳。 ?...6、之后我们可以看到漂亮词云图就展示在我们面前了,如下图所示。 ? 根据词云可视化效果来看,关键词:人生、努力、时间、我们、哈哈哈……等词语,出现频率较高。

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微调预训练 NLP 模型

不幸是,通用模型常常忽略这些微妙关系。 下表展示了从基本多语言 USE 模型获得相似性差异: 为了解决这个问题,我们可以使用高质量、特定领域数据集来微调预训练模型。...在本教程中,我们将专注于一次(几次)学习方法与用于微调过程暹罗架构相结合。 理论框架 可以通过监督学习和强化学习等各种策略来微调 ML 模型。...在本教程中,我们将专注于一次(几次)学习方法与用于微调过程暹罗架构相结合。 方法 在本教程中,我们使用暹罗神经网络,它是一种特定类型的人工神经网络。...该网络利用共享权重,同时处理两个不同输入向量来计算可比较输出向量。受一次性学习启发,这种方法已被证明在捕获语义相似性方面特别有效,尽管它可能需要更长训练时间并且缺乏概率输出。...通过利用高质量、特定领域数据集和暹罗神经网络,我们可以增强模型捕获语义相似性能力。 本教程以通用句子编码器 (USE) 模型为例,提供了微调过程分步指南。

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tensorflow_cookbook--preface

第6章,神经网络涵盖了如何在TensorFlow中实现神经网络,从操作门和激活功能概念开始。然后我们显示一个浅层神经网络,并展示如何建立各种不同类型图层。...我们展示如何实现文字技巧和TF-IDF文本。然后,我们用CBOW和skip-gram引入神经网络文本表示,并将这些技术用于Word2Vec和Doc2Vec进行现实世界预测。...卷积神经网络。         第8章,通过说明如何在具有卷积神经网络(CNN)图像上使用神经网络来扩展我们对神经网络知识。...我们通过解释和展示TensorFlow中stylenet /神经风格和深层梦想算法来结束本章。         第9章,循环神经网络解释了如何在TensorFlow中实现复发神经网络(RNN)。...通过显示暹罗RNN网络在地址上进行记录匹配用法,我们不用说这一章。

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R tips:交互式网络展示GO富集子通路

如下图所示一个goplot是根据clusterProfiler自带数据绘制,goplot可以展示富集通路父通路,并最终定位到了cellular_component(CC)上(这是自然,因为就是进行...一般进行富集分析GO数据是来源于Rorg.db包,但是org.db里面并没有GO通路父子通路数据,如果拿到这个数据,也可以用于进一步展示显著通路子通路(有别于DAG是展示父通路)。...富集分析时dotplot只展示最显著n(n=10, 15, 20,等等)条通路,那么子通路网络图可以进一步展示这些显著通路是否有显著子通路(绿色箭头指示)。...这些网络图有一个缺点,不能展示相应通路名,否则的话,整个网络图会非常凌乱(我把相应代码注释了,可以自己尝试展示通路名情况),这个时候可以考虑使用交互网络图来完成。 ?...sigmaNet绘制交互网络图 交互网络图如下,红色线是“is_a”,紫色线是“part_of”,点大小代表连接数量,由于子通路往往不止一条,所以大点代表父通路,小点代表子通路,着色点是显著通路

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从输入URL到页面展示过程:深入解析网络请求与渲染

这背后涉及到一系列复杂技术和过程。本文将带领大家深入了解从输入URL到页面展示过程,并给出相应代码示例,让我们一起探索这个神奇而又复杂世界。 1....网络请求发起 通过浏览器输入URL后,浏览器会根据协议类型(如HTTP或HTTPS)向服务器发起请求。...API来发起网络请求,并将服务器响应转换为文本输出到控制台。...DNS解析 在发送网络请求前,浏览器首先需要将URL中域名解析成对应IP地址。这个过程称为DNS解析。...这包括减少网络请求次数、压缩资源文件、使用缓存等策略。同时,优化JavaScript和CSS编写方式也可以提升页面的加载速度和响应性能。

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