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【免费】站长线下课:用STAR去Mapping~~~~

结合小站之前的教程这一步应该插在STAR Mapping之后从零到壹:10元~Mapping神器STAR的安装及用随便选一个样本,在样本文件夹里找到bam文件,然后用samtools index建立baibam与bai要在一个目录下,载入到IGV软件中,就是视频那个样子啦。位置信息是chr12:123,406,542-123,416,558首先看是不是链特异性,右键选color alignments by first-of-pair strand如视频那样,红蓝分布,就是链特异性再看是什么样的链特异性在链特异性那个样本右键选color alignments by read strand鼠标放在红或者蓝的read上,看信息。显示first of pair那个read的箭头方向与基因的方向相反,这就提示是dUTP建库的方法。知道这些有啥用呢?在STAR运行结束后的ReadsPerGene.out.tab文件中非链特异性的要选第二列那个数而dUTP链特异性建库要选第四列那个数所以批量处理counts数教程中"站长,Mapping之后counts怎么合并成一个表?"df.use <- data.frame(v1 = df.read 这句代码中V4就是第四列,选择这个是针对dUTP链特异性建库测序的,如果是非链特异性建库图中那个位置应该改成V2就可以啦~~

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疫情之下,组织一场线下的技术大会有多难?(免费福利)

送过不少技术大会的免费票:北京的,上海的,深圳的... ,这次,广州的来了。 疫情之下,线下组织一场技术大会太难了,很多大会要么取消,要么无限期延期,要么转战线上了。为了技术的交流,为了技术的传播,为了技术的氛围,艰难之下,依然有孤勇者。 相比传统门票动辄几千块的技术大会,这个大会,门票只有几十,实在是业界良心。刷脸找举办方要了一些免费票,送给大家。 画外音:见文末。 事件:Gdevops全球敏捷架构运维峰会 地点:广州 时间:6月17日 话题方向:云原生、数据库、架构、存储,运维、金融科技等 一些话题大

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中共中央办公厅 国务院办公厅印发《关于推进实施国家文化数字化战略的意见》

近日,中共中央办公厅、国务院办公厅印发了《关于推进实施国家文化数字化战略的意见》(以下简称《意见》),并发出通知,要求各地区各部门结合实际认真贯彻落实。 《意见》明确,到“十四五”时期末,基本建成文化数字化基础设施和服务平台,形成线上线下融合互动、立体覆盖的文化服务供给体系。到2035年,建成物理分布、逻辑关联、快速链接、高效搜索、全面共享、重点集成的国家文化大数据体系,中华文化全景呈现,中华文化数字化成果全民共享。 《意见》提出了8项重点任务。一是统筹利用文化领域已建或在建数字化工程和数据库所形成的成果

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