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    【免费】站长线下课:用STAR去Mapping~~~~

    结合小站之前的教程这一步应该插在STAR Mapping之后从零到壹:10元~Mapping神器STAR的安装及用随便选一个样本,在样本文件夹里找到bam文件,然后用samtools index建立baibam与bai要在一个目录下,载入到IGV软件中,就是视频那个样子啦。位置信息是chr12:123,406,542-123,416,558首先看是不是链特异性,右键选color alignments by first-of-pair strand如视频那样,红蓝分布,就是链特异性再看是什么样的链特异性在链特异性那个样本右键选color alignments by read strand鼠标放在红或者蓝的read上,看信息。显示first of pair那个read的箭头方向与基因的方向相反,这就提示是dUTP建库的方法。知道这些有啥用呢?在STAR运行结束后的ReadsPerGene.out.tab文件中非链特异性的要选第二列那个数而dUTP链特异性建库要选第四列那个数所以批量处理counts数教程中"站长,Mapping之后counts怎么合并成一个表?"df.use <- data.frame(v1 = df.read 这句代码中V4就是第四列,选择这个是针对dUTP链特异性建库测序的,如果是非链特异性建库图中那个位置应该改成V2就可以啦~~

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    疫情之下,组织一场线下的技术大会有多难?(免费福利)

    送过不少技术大会的免费票:北京的,上海的,深圳的... ,这次,广州的来了。 疫情之下,线下组织一场技术大会太难了,很多大会要么取消,要么无限期延期,要么转战线上了。为了技术的交流,为了技术的传播,为了技术的氛围,艰难之下,依然有孤勇者。 相比传统门票动辄几千块的技术大会,这个大会,门票只有几十,实在是业界良心。刷脸找举办方要了一些免费票,送给大家。 画外音:见文末。 事件:Gdevops全球敏捷架构运维峰会 地点:广州 时间:6月17日 话题方向:云原生、数据库、架构、存储,运维、金融科技等 一些话题大

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