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R语言】额外年终奖到手却笑不起来,XML和RCurl安装问题及解决过程

2019年是丰收一年,作为回报,老板又额外发了个新笔记本电脑(thinkbook14 8G+512G)作为年终奖一部分(不要羡慕本君哟~站长注解:这是什么神仙老板,过年一定会多发红包!)...拿到电脑就迫不及待参考果子老师前期帖子将一系列生信所需R进行安装,然后在假期继续相关学习,然而安装过程中却遇到两个R包装不上问题(原来没遇到过),困扰小编2天时间才解决,特此进行分享(大神略过...安装问题 首先上图,安装过程一直都是无脑点“是”,然而“XML”却提示安装不成功,尝试多次均是相同报错。...同理,进行RCurl安装,也顺利安装成功,见下图 安装成功后,与树神交流了下,说这个complication有时候点‘是’可以,有时候又不可以~,不过具体原因,本君还没探究,其他大神看到也可以讲解下...总结 到此,XML和RCurl均已安装成功,这个问题原来在其他电脑上没遇到过,在新电脑上首次遇到,但是这两个却很重要,绕不过去,他们是R语言爬虫相关两大利器,也是许多依赖,如RTCGA、TCGAbiolinks

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为什么一行代码就可以完成3个RRNA-seq差异分析呢

在教师节收到学生提问,刷B站74小时视频时候看到我演示了RNA-seq差异分析只用了一行代码就完成了3大R全部分析,并且输出了对应图表结果,觉得很神奇,但是B站视频并没有配套讲义和代码还有测试数据...首先一直使用airway数据集做测试 airway数据集这里就不多说了,搜索生信技能树早期教程可以看到很多介绍,使用下面代码就可以简单探索。...使用包装好函数即可 可以看到,下面的代码非常简洁,因为仅仅是使用了 run_DEG_RNAseq 函数,就根据表达矩阵和分组信息,完成了全部分析!...下面的图表是如何自动出来呢? ? 因为这个 run_DEG_RNAseq 函数代码非常长,这里就不贴在公众号了哈,大家可以GitHubGEO项目找到它!...这个时候是没有标准答案,因为每个R都非常热门,引用量都是好几千,你选择哪个都符合市场规律,不过,这里有一个代码,对3个结果根据阈值筛选交集。

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一个由于侵入框架引起故障

不需要引入接口 jar ,而是直接通过 通用接口来发起服务调用,参数及返回值中所有 pojo均用 map 表示)。...这本是大文豪王献之写给他爱妾桃诗。因为桃怕坐船,王献之就说了:“你只管渡江就好,不用想太多,自然会在江边迎接你。”这里温客行用隐隐表露出自己小心思,倒也用妙。...和湘沾边是前半句“九嶷缤兮并迎“出自屈原《九歌.湘夫人》。而后半句是曹植《洛神赋》。洛神叫甄宓啊,和湘字没有半毛钱关系,纯粹是串了。所以温客行说听小曹诗,屈原都能被气活过来。...他来了一首:“沧浪之水清兮,可以缨;沧浪之水浊兮,可以足。”只是觉得人家在喝水,你又是洗衣服又是洗脚,这水喝着真倒胃口。你倒是来一首:“问渠那得清如许?为有源头活水来。”...他在屋顶上说是:“冲天香阵透岳阳,满城尽是琉璃甲”。这本是黄巢写菊花诗:“冲天香阵透长安,满城尽带黄金甲。” 你要是改,也要改彻底一点,人家菊花是香,香阵一词用妙,琉璃甲和香有什么关系

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不懂贝斯模型?!可视化一下就简单啦...

参与课程你将获取到:学员答疑、可视化资源分享、可视化技巧补充、可视化业务代做(学员和甲方对接)、副业交流、提升认知等等。 可视化贝斯难?...看看这两个工具 在新增我们统计可视化课程时候,发现了贝斯分析,且其可视化结果也是应用非常广泛,本期推文就给大家简单介绍下Python和R语言中用于贝斯模型分析好用工具。...R语言中bayesplot也是一个用于可视化贝斯推断结果工具。...两个工具都非常适合用于数据分析、模型诊断、模型比较等领域。由于 Python 和 R 语言在不同领域都有自己优势,因此选择使用哪个工具要根据具体情况而定。 如何快速学习科研绘图技巧?...懵了··· 节后第一天,就因为论文配图,被导师怼了一上午····· plotnine,打死不学R语言, 可以用Python40岁.....

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宏观人脑功能网络通用分类

是否存在“核心”功能网络,如果有,它们空间形状是什么?什么样命名惯例?脑功能网络分类能被描绘出来?...例如以下三个陈述:“带状盖网络包括前额叶皮层、前岛/额叶岛盖、侧前扣带皮层和丘脑”;“岛前皮层被认为是突显网络关键节点,该网络还包括侧前扣带皮层和其他皮层下和边缘结构”;“腹侧[注意]网络核心区域包括颞顶结合部...出于简约考虑,我们建议研究人员在进一步详细说明任何给定一组发现在多大程度上保证使用额外命名法来更完整地描述所观察网络结构之前,可以使用这里建议广泛解剖网络名称。...利用高阶ICA可以观察左右分离,17个网络中部分网络出现了侧(手)和腹侧(脸)子系统。在更高分辨率MRI中,听觉和体感面部区域也可以分离。注意,PN是主要感觉和运动通路皮层组成部分。...B)7网络橙色网络。 C)来自元分析认知控制/执行功能网络。 D)额顶叶网络(黄色)。

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Annals of Neurology:新生儿卒中后发展性传导性失语多模态脑成像研究

考虑重复缺陷可以通过大脑半球间重组来改善,还使用功能磁共振成像(fMRI)对这些被试语言功能偏侧性进行了评估。...除2名儿童外,所有儿童都接受主流教育,12名(40%)接受额外教育支持。...通过在前颞白质4个相邻轴向切片上放置一个种子ROI来确定UF。从颞上回至颞回前白质中收集末端囊纤维。两个区域目标ROI均为末端白质纤维通过区域,在4个轴向切片上进行了识别。...考虑一般认知能力差异(反映在全面的FSIQ分数中)时,语言特异性影响更容易被发现。同样地,当考虑语言偏侧化改变,尤其是在有发育性脑损伤的人群中,损伤对认知影响也可以被揭示。...值得注意是,这些相关语言缺陷与句子重复损伤程度是直接相关,甚至在FSIQ加入协变量后也是如此(r =0.67 - 0.42, p均<0.05)。

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统计学:你是贝斯主义者还是频率主义者?

如果告诉你我可以通过抛硬币来展示贝斯统计和频率统计区别呢? ? 在左边,一切都与视角有关。在右边,这完全是关于不会移动数量。...可能不知道答案,但这不能改变硬币是正面朝上,概率是100%如果硬币是反面朝上,概率是0% 贝斯:“对来说,概率是50%!对你来说,是什么都可以。”...它们都基于假设,因此它们基本上是主观。 关键区别在于,一旦确定了决策上下文,它们将如何协助决策。 等等,样本量呢?贝斯不是处理小数据方法?...这取决于形势是否需要在行动和形成基于证据观点之间做出选择。 应该选择支持哪一方? 建议不要只投入一个阵营(除非你花了几年时间思考统计学哲学,你愿意死在这座山上)。...很高兴在杜克大学做研究生工作(杜克大学对于贝斯统计来说就像梵蒂冈对于天主教一样),注意,对贝斯统计优势说得最大声并不是教授们……而是那些新生,他们因为不用再古怪频率置信区间(贝斯可信区间要简单得多

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前端vue面试题2021_vue框架面试题

,那么我们可以通过登录后获取到token来判断 如果有token就直接next()放行 如果没有的前提下,我们再判断用户访问页面是不是登陆页面,是的话就放行 不是就跳回登录页 token失效期,...(重要) 捕获: 从document开始,层层子元素传递,直到点击当前子元素 冒泡: 从点击当前子元素开始,层层父级传递,直到document 事件委托: 将子元素事件交给父元素处理(主要是添加节点...(必) 答: 函数内部自己调用自己, 这个函数就是递归函数 作用和循环效果一样,但很容易发生“栈溢出”错误,必须加退出条件return。 42.什么是闭?...(必) 答: 函数嵌套函数,函数内部可以访问外部变量,外部不能直接访问该变量闭保存了自己私有变量,通过提供接口给外部使用 延申了作用范围 43.改变this 指向方式(必) 答: call(...(必) 创建一个空对象 this指向这个对象 给这个对象添加属性和方法 返回这个对象 47.什么是同源(必) 答: 同源就是两个页面有相同协议 域名 端口 就属于同源 其中只要一个不同就不同源 48

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对PTSD和MDD共病患者TMS临床治疗反应脑网络机制探索性研究

ECN涉及执行功能和情绪控制,其核心区域包括外侧前额叶(DLPFC)、后外侧顶叶。SN涉及察觉和注意指向、显著环境刺激,其核心区域包括侧前扣带回(dACC)、前岛、杏仁核以及前海马区。...2)头动和PTSD改善相关sgACC种子点与左侧岛之间连接显著相关(r=0.44,p=0.03), 3)头动与症状改变相关MVPA团块之间存在显著相关,包括一些与PTSD改善相关团块(左壳核r...=-0.20,p=0.02;左梭状回r=-0.21,p=0.01;左角回r=-0.19,p=0.03)和MDD改善相关团块(右侧ACCr=-0.27,p=<0.01;右尾状核r=-0.23,p<0.01...图1D:多体素模式激活表明,顶下小叶、杏仁核、海马旁回、外侧前额叶和腹内侧前额叶连接变化预测PTSD症状减轻(右),而顶下叶、侧前扣带回和岛之间连接预测抑郁症症状减轻(左)。 ?...需要额外数据来确定本研究观察与症状改善相关网络变化是持久,还是随疾病不同阶段而波动。

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R分享|CRAN中竟然有这么一个网站

简介 有好多读者问我: “闪闪,xxx方法/xxx方向有什么可以推荐不会用呀!” 每次遇到这种情况时候,只要和我专业不大相关真的回答不来,隔行如隔山!...有时更尴尬事,“好奇”读者会说: “哎,以为统计专业,这些都会呢。” emmm,小编很无奈,苦笑一下。现在,有了这个网站你可以查阅各个领域用到和其主要用途。接下来,详细介绍一下。...封面截图 本站贡献: 简要介绍各个领域相关 R ,当然,你可以使用ctv[1]自动安装所有任务视图中包含 R 。 安装ctv install.packages("ctv") 2....慢慢等待 当然,你可以不用安装所有,查阅任务视图后,找到自己想要R,再安装也是可以。 接下来看看,每个 Topic(领域/话题)内部信息吧,这里以贝斯为例。点击进入后,界面如下: ?...可以说是满满干货!并且维护者会用一句话简单概述每个主要功能。以及对应每个链接,你可以进一步学习对应知识!可以说是一个宝藏网站了。 这里,随便进入一个链接,截图如下: ?

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European Heart Journal:边缘和自主神经加工改变支持心碎综合征脑神经机制

构成副交感和交感相关子网络重要大脑区域包括:杏仁核、海马和岛,以及扣带皮质、顶叶、颞和小脑区域。...此外,还构建了一个基于AAL2模板全脑网络种子点图谱,将脑岛额外分为前部和后部,并添加了左右伏隔核和脑干,最终形成一个125个脑区标签全脑图谱,包括了小脑。 ?...补充图4 全脑网络种子点放置以及TTS症状相关边(低阈值下) 其中基于网络统计确定了组间静息态功能连接性改变子网络,连边比较使用了NBS工具。...这些结点包括左右杏仁核、左右扣带回、左外侧前额叶、左前岛、左右小脑、左右缘上回和顶上小叶(见图B)。 ?...这个子网络涉及左右海马、左侧海马旁回、双侧侧和腹侧前额内侧皮质、左右后扣带回、左侧颞极、双侧顶下后小叶和左右颞顶交界处。

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网易云音乐机器学习算法四面面经

过程很辛苦,从下午两点半面晚上接近9点,不过网易小哥哥小姐姐们挺贴心,买了饼干和牛奶给我们补充能量,随便拿随便吃。期间也认识了几位很优秀、谈得来大佬,不虚此行。 ...(会手推算法很重要,自己准备了感知机,LR,朴素贝斯,最大熵,EM算法,SVM,XGBoost,牛顿,拟牛顿,HMM里前向后向算法、维特比算法,BP算法等算法手推,除了BP算法和XGB外,这些算法在李航老师...(因为比赛中用过贝斯调参,所以会问到)  知不知道排名第一大佬是怎么做?(这个问题很多面试官都会问,参加过比赛同学可以去研究一下前排大佬做法,这题答得好会加分很多)  为什么不实习? ...这里做了一个优化,空间复杂度从O(m*n)降低到O(min(m,n)))  三面(hr面)  面试官小姐姐上来就自己做自我介绍,把吓了一跳  问我自我介绍(被吐槽说是不是2333)  觉得比赛中提分大是哪个步骤...实际使用过程中对两者感受是怎样?从原理解释下原因?  会L-BFGS?L-BFGS哪一步很巧妙?是看过论文?  你有什么想问

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算法金 | 奇奇怪怪正则化

这会导致模型无法准确预测未知数据,从而降低模型实用性通过添加额外约束或惩罚项,正则化限制了模型复杂度,使其在训练数据和未知数据上表现更一致例如,当我们使用线性回归模型时,正则化可以通过限制回归系数大小...正则化通俗理解正则化在机器学习中作用,可以用一个简单比喻来理解想象一下,一个学生为了应对考试,只是死记硬了所有可能答案。...“死记硬”,而是学习数据一般规律,从而在面对新数据时依然能有良好表现通过引入正则化项,我们对模型参数施加约束,防止模型过于复杂,以提高其泛化能力4....通过实验和验证,可以找到最适合数据和模型正则化方法,提高模型泛化能力和稳定性。6. 正则化如何影响模型复杂度正则化通过引入额外约束或惩罚项,直接影响模型参数,从而调控模型复杂度。...以下是主要内容简要回顾:正则化定义:正则化通过引入额外约束或惩罚项,防止模型过拟合,提高泛化能力通俗理解:正则化类似于让学生不死记硬,而是理解知识,从而在新问题上表现良好正则化方法:L1正则化(Lasso

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BRAIN:X连锁肌张力障碍-帕金森综合症基底节和小脑病理研究

考虑纹状小体和基质在空间上分布,文章推测,在XDP早期,纹状体嘴侧可能比外侧表现出更严重神经退行性变。...2.3基于体素形态分析(灰质体素强度) 2.3.1预处理 预处理采用SPM8和DARTEL完成。(思影可以手把手教零基础你,能懂会用,完全没必要像文章里写这么不清楚还麻烦)。...2.3.4小脑和脑干分析 小脑和脑干VBM分析是利用SUIT工具实现。SUIT工具提供小脑和脑干高分辨率图谱,非常适用于幕下结构结构分析。...3.2小脑和脑干 小脑VBM分析显示,XDP患者在小脑蚓部I,小脑蚓部II外侧,双侧小脑VIIb灰质体素强度显著下降;而在双侧小脑I-IV,左侧小脑V,和侧部脑桥-中脑脑干灰质体素强度显著增加...由于先前研究报道,这一区域与不同形式肌张力障碍小脑-丘脑束微观结构变化有关,我们将该区域设为种子点(起始点),分别与小脑(小脑脑V)和丘脑做概率性纤维追踪,由此我们可以重建连接小脑和丘脑并途径该区域纤维束

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斯线性回归和多元线性回归构建工资预测模型|附代码数据

在劳动经济学领域,收入和工资研究为从性别歧视高等教育等问题提供了见解 工资模型 在本文中,我们将分析横断面工资数据,以期在实践中使用贝斯方法,如BIC和贝斯模型来构建工资预测模型。...加载 在本实验中,我们将使用dplyr包探索数据,并使用ggplot2进行数据可视化。我们也可以在其中一个练习中使用MASS来实现逐步线性回归。...我们将在实验室稍后使用此软件中使用BAS.LM来实现贝斯模型。 数据 本实验室将使用数据是在全国935名受访者中随机抽取。...你对上一个练习回答有变化?...m_lwage_iq = lm(lwage ~ iq, data = wage) 练习:检查该模型残差。假设正态分布残差合理? 基于上述残差图,可以假定对数工资线性模型与iq正态分布。

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斯学派与频率学派有何不同?

当重复试验次数趋近无穷大时,事件发生频率会收敛真实概率之上。 下面可以看到,随着随机事件次数不断增大,最终待估计值会收敛真实值上。 ?...看到这里或许你会提问,如果观测样本有限,那真实概率还会精准? 答案是不一定。...就是说100组置信区间里面有多少个是包括了真实值。 2、机器学习中频率学派 上面就是频率学派一般思想了。为了加深理解,这里额外扩展一下机器学习中频率学派应用。...因此,贝先验分布概率非常重要,要想后验概率大,需要 和 同时大,这就涉及最大后验概率估计概念了。...当然对于贝理论还有很多东西可以研究,真的非常强大。如果机器学习从判别式和生成式角度考虑又是一庞大分类。

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Nature子刊:语言、心智和脑

也欢迎参加思影科技课程,可添加微信号siyingyxf或19962074063进行咨询。...那么,在我们看来高度自动化语言和我们智能以及脑之间是什么样关系,我们对语言抱有怎样误解?人认知功能和思维能力真的能够离开语言?语言究竟是如何在大脑中表征?...Broca区两个亚区通过明显白质纤维束与颞皮层相连。BA 44通过侧通路连接,而BA 45通过腹侧通路连接颞皮层(图3)。...因此,作者认为由BA44构成侧额颞网络和由侧通路连接pSTC有助于对复杂句子掌握。...在成人大脑中,可以检测到两条侧通路:一条是连接颞皮层(通过弧形束和上纵束)和额下回(即布洛卡区后部)(紫色束);另一个连接颞皮层和前运动皮层(蓝色束)。

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QSM研究:帕金森病全脑磁化扰动模式

这些被认为发生在脑干早期,在到达前额叶和感觉相关等皮质之前,逐渐扩散无皮质和颞边缘旁皮质易损部位。...此类影响通常过于微妙,无法在单一被试中进行可靠识别,但可以在最先进T1加权模板上解决。图1显示了黑质细分为侧(高信号)和腹侧(低信号)层。...在脑桥前部(包括脑桥基底和脑桥被盖上部);小脑上脚;中脑尾部(包括黑质侧和中脑被盖下部);颞结构(包括颞上、中、下、梭形、海马旁、内嗅脑区和海马头部分,明显右侧偏倚和最大核团集中在右颞中间部分);...单被试QSM检查 对中脑和小脑核团更仔细检查显示QSM异常,在个体目视检查中很明显(图4)。在侧黑质区观察最显著效应——与全脑结果一致。...因此,使用年龄校正绝对值QSM数据计算了组统计量(图6),其在黑质中返回了强烈变化-主要是由侧层易感性增加驱动,但在腹侧脑区也很明显-外侧枕叶、后顶叶和吻侧中间前额叶皮质区,以及额外(尽管不太明显

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R语言STAN贝斯线性回归模型分析气候变化影响北半球海冰范围和可视化检查模型收敛性|附代码数据

像任何统计建模一样,贝斯建模可能需要为你研究问题设计合适模型,然后开发该模型,使其符合你数据假设并运行1. 了解 Stan统计模型可以R或其他统计语言各种中进行拟合。...但有时你在概念上可以设计完美模型,在限制了你可以使用分布和复杂性软件或程序中很难或不可能实现。这时你可能想转而使用统计编程语言,如Stan。...现在,让我们使用 lm().l1 <- lm(exnoh ~ yer, data = sie)summary(l1)我们可以将该模型添加到我们绘图中:ablne(m1, l = 2, ty = 2, ...在这种情况下,我们真的想知道从数据集开始数据集结束海冰是否发生了变化,而不是 1979 年 2017 年。...我们可以通过执行对象名称来获取参数估计和采样器诊断汇总统计信息:fit模型输出展示了什么?你怎么知道你模型已经收敛了?您能看到指示您 C++ 编译器已运行文本

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