也就是说，如果给定序列GGCCAATT，程序将返回AATTGGCC？而且，无论空格(空格或制表符)、大小写和换行符，程序都必须正常工作。
浏览 31提问于2021-09-28得票数 0
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我必须创建一个函数来打印一段DNA中最长的回文子字符串。我已经编写了一个函数来检查一段DNA本身是否为回文。请参阅下面的函数。在遗传学的背景下，回文的含义与用于单词和句子的定义略有不同。由于一个双螺旋是由两条在5‘到3’方向</em
浏览 25提问于2020-04-25得票数 2
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我正在RStudio平台上开发一个R软件包。我有很多用python编写的函数，我想用R来调用它们。现在，我刚刚为DNA序列实现了一个简单的反向补码函数。在RStudio上编写和构建项目时，代码工作正常。一旦我在github上释放它并从回购系
浏览 2提问于2016-05-17得票数 0
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我必须建立一个函数，打印DNA片段中最长的回文子串。我已经写了一个函数来检查DNA片段是否是回文本身。请参见下面的函数。在遗传学的背景下，回文的含义与词语和句子的定义略有不同。由于双螺旋是由两条核苷酸组成，它们在5‘到3’的意义上是相反的<
浏览 0提问于2020-04-25得票数 1
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我正在尝试使用Python3.6编写一个程序来查找DNA序列中的所有回文。我已经有一个检查DNA序列是否为回文的工作函数(这与单词回文稍有不同)，但我似乎无法获得从DNA序列返回所有回文的函数。现在，它只在全部DN
浏览 1提问于2017-04-25得票数 0
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C中函数参数/调用函数的故障
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由于不同类型的参数，我在我的程序中实现不同的功能有困难。我正在编写一个程序，从输入文件中读取三个字母序列，将这些序列存储在单独的数组中，然后比较数组并打印重叠百分比。我在我的程序中使用以下函数：
<e
浏览 1提问于2014-03-02得票数 0
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我正在用Python编写一个辅助程序，我有一个问题，如果你能回答的话。我想要写一个函数，返回一个列表，其中包含所有在序列中出现的"ATG“的第一个核苷酸的位置。例如，我们可以说我们的DNA序列是AATGCATGC
浏览 3提问于2017-11-14得票数 1
鉴于以下清单：我想过滤超过3个字符的字符串。(length) > 3:print long_dna
但是我希望我的代码更通用，这样以后我可以过滤任意长度的字符串
浏览 6提问于2016-01-05得票数 15
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我收集了一组包含DNA序列片段的fasta文件。我试图计算在每个文件中可以找到的k的总出现次数。计数k的好处是，可以创建一个大小为4**k的数组，其中k是所使用的k-mer的大小。我正在处理的序列文件是来自新一代测序机的短读序列，因此假设读取全部来自5‘-&
浏览 4提问于2016-12-03得票数 3
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我意识到有许多简单的答案可以解决如何在Java中这样做，但我正在寻找一个在概念上类似于我可能在Python程序中执行的实现的解决方案，因为这对我来说要熟悉得多。我的Java函数cgRatio获取一个DNA字符串，并遍历每个索引来计数字符串中出现的"C“和"G”字符值，并返回
浏览 1提问于2017-02-03得票数 1
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假设我的长序列如下：这个长序列中的两个斜体子序列(这里在两个星形内)一起被称为反向重复模式。这两个子序列中A、T、G、C等四个字母的长度和组合是不同的。但是在这两个子序列之间有一个关系。注意，当你考虑第一个子
浏览 3提问于2013-01-13得票数 6
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搜索DNA序列中的字符串
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我试着研究基因序列中某些核苷酸的模式。我刚刚完成了read.table来获取它，但是我也尝试将它转换成向量和数据帧。我就是这样把数据输入到程序中的
浏览 0提问于2016-12-01得票数 1
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为什么Python有内置函数？
编辑：@TanveerAlam reversed实际上不是一个函数，而是一个类，尽管它列在页面上。
浏览 4提问于2014-11-18得票数 4
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函数继承Python
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我有一个程序，它读取DNA序列的输入文本文件(DNA.txt)，然后使用此函数将DNA序列(保存为字符串)转换为各种氨基酸SLC代码：
每个文件都有一个长的DNA序列。现在，我想<em
浏览 0提问于2015-09-14得票数 0
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反向补码字符串
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我正在编写一个面向吡咯烷酮的生物应用程序，在其中一个步骤中，我有一个提取dna序列的火花数据。对于那些出现在负链中的，我想反向补充。我能够使用udf执行任务，但我理解这限制了高效的能力(特别是因为这是火花放电)。这也会导致OOM问题。如果没有，在java中实现它并将其注册为<
浏览 2提问于2021-03-02得票数 0
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查找stop_codon
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我试图在我的cds中找到开始和结束密码子。我使用过正则表达式，但是当我运行这个python脚本时，我得到了一个空的停止代码列表。任何帮助都是非常感谢的。,"GGA":"G|Gly","GGG":"G|Gly"}
for
浏览 1提问于2013-03-19得票数 1
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搜索字符串中的序列。DNA
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我需要做一个程序，从3到一个字符串的大小，并比较其他序列的3在同一字符串。我要解释一下。第一个字符是："ACT"，我们需要将其与其他
浏览 5提问于2015-03-25得票数 3
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我最近刚刚开始使用python，我对python和一般的编码都是非常陌生的，我在一个类中，我们被指派在Python中找到一个函数，该函数接受两个DNA序列字符串(比如string1和string2)作为输入，并返回一个位置列表，其中string2作为stri
浏览 8提问于2019-02-10得票数 1
5回答
假设我有一串DNA 'GAAGGAGCGGCGCCCAAGCTGAGATAGCGGCTAGAGGCGGGTAACCGGCA‘我想把每一个重叠的双字元'GA'，'AA'，'AG'，'GG‘替换成对应于它们发生的可能性的一些数字，把它们加起来。比如'GA‘= 1，'AA’= 2，'AG‘= .7，'GG’=
浏览 1提问于2013-11-26得票数 4
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