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套娃一样的conda和r

最近有粉丝提问,他在R里面安装了conda,但是不知道如何启动和配置那个conda,让非常吃惊。...我们在这个环境里面安装了 bioconductor的 singlecelltk和singlecellsignalr,因为它们本身就会依赖大量的其它R语言包,所以理论上这个时候你的这个 conda activate...,奈何有一些R包,它依赖很多操作系统的外部环境,所以这个R包就自己给他的电脑安装了一个conda,所以他就不知道如何调用这个conda了。..., in _wait_for_tstate_lock elif lock.acquire(block, timeout): 这个其实是conda常见的问题,很容易通过修改镜像的方式解决掉,前提是你知道自己的...再怎么强调生物信息学数据分析学习过程的计算机基础知识的打磨都不为过,把它粗略的分成基于R语言的统计可视化,以及基于Linux的NGS数据处理: 《生信分析人员如何系统入门R(2019更新版)》 《生信分析人员如何系统入门

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修复 MacVim 9.0 的 Python3 支持

发现问题 今早看到一个有意思的 Vim 插件,安装上试用了下,感觉对来说不太实用,就删掉配置,打算运行 :PlugClean 清理掉它,结果 MacVim 提示即将删掉的插件有两个——除了试用的这个以外...它要找的这个文件路径确实不存在……毕竟默认的是 3.9 版本,所以 /usr/local/Frameworks/Python.framework/Versions/ 下只有 3.9 和 current...它为啥放着配置好的 3.9 版本不用,非得这么头铁去找 3.10 版本呢?这个问题先不回答,留待后面的刨根问底环节。现在先解决问题。...所以这个问题找到了两种解决方法: 一、在 _vimrc 里添加配置,指定动态加载的 Python3 支持库路径,比如: let &pythonthreedll='/usr/local/Frameworks...: brew unlink python@3.9 brew link python@3.10 经验证以上两个方法都可以解决问题最终用了第二种。

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Python实现交互式股市大盘指数查询与个股股价显示端

那么本文接下来就来介绍如何使用Python编写一个交互式的股市大盘指数查询与个股股价显示端,而且将使用Python的相关库和API来获取实时股票数据,并通过shell端展示出来,方便读者进行实践和自定义..., tablefmt="grid")) 在上面的这个函数中,主要使用了tabulate库来将数据以表格的形式展示在shell端,函数接收一个字典类型的数据作为输入,将其转换为表格并打印出来。...,需要你将YOUR_API_KEY替换为你自己的股票数据API密钥,在运行代码之后,你就会看到大盘指数数据和个股股价数据以表格的形式展示在shell端。...(注意:这只是一个简单的示例,你可以根据自己的需求对代码进行扩展和优化,但是在实际开发应用中,还需要考虑异常处理、用户输入验证等方面的问题。)...结束语 通过上文关于使用python语言实现shell端的股市相关的查询显示,想必大家对python的使用又有了新的认识和了解,而且个人觉得使用Python编程语言可以轻松实现交互式股市大盘指数查询与个股股价显示端

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向量数据库入坑:入门向量数据库 Milvus 的 Docker 工具镜像

为了大家都能简单的上手,做了一个 210MB 的 Docker 镜像,本篇文章就来讲讲这个镜像如何使用,以及如何制作这个镜像的。...写在前面因为这个工具基于 Docker,所以我们需要先完成 Docker 运行环境的安装,如果你的本地环境中已经安装了 Docker,那么可以跳过这个小节,阅读后面的内容。...对于有更高技术追求的同学,可以继续阅读如何优化这个镜像的,如果你只想愉快的在本地玩 Milvus,那么文章到此就可以结束啦。...为了解决这些问题决定花一些时间,制作一个体验更好的工具镜像。...先基于 Python 官方镜像创建一个只安装了 milvus 软件包的 Docker 镜像,来作为“资源镜像”:FROM python:3.9-slim-buster AS BuilderRUN sed

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macOS M1如何配置机器学习环境(二)

如何配置机器学习环境》,是基于python3.8版本配置的tensorflow,最近实验过程中发现些问题没办法解决,无奈之下卸载了重装,结果随便捣鼓一下,整个假期就快没了 至于为什么这么点背,,可能还是因为学的多了...年初安装时啥都没学,就是一个试验代码通了就通了,后来随着学习的深入,发现要用到很多模块,关键嘛,这个M1设备据说python3.9更适配一些,心理也有在作祟。...之前就是装了3.8和3.9混用,实在搞不懂为毛有些模块在M1的3.8版本死活装不上,3.9就服服帖帖。但是要跑tensorflow的话又只能滚回3.8,之前没有交叉就瞎玩,最近偶遇交叉直接死菜。...,于是给卸载重新安装了1.21.2版本,问题得以解决。...另外,部分模块无法使用conda安装,找不到资源,改用pip安装,问题解决。 opencv-python无法正常安装,又是捣鼓了好一阵。。

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【SAS Says】基础篇:3. 描述数据

本节介绍如何利用SAS写一份数据报告,给出数据的基本信息。 从3.11开始的内容,是留给处女座的,主要说如何用proc tabulate和proc report产生一个更加耐看的报告。...Value语句中的name是格式的名字,如果格式是位字符串设计,则必须以$开头,长度不能超过32个字节(包括$),不能以数字结尾,除了下划线,不能包含其他任何特殊符号。且名字不能与已有的格式名冲突。...最后,语句put_age_是在每个学生报告下面插上页码,程序运行后,日志说明如下: ? 前三页报告如下: ? ? ?...SAS如何使用这个变量,可能的usage选项包括: Across:为变量的每一个变量值都创建一个列 Analysis:为变量创建统计量,数值变量默认有这个usage选项,且统计量默认为sum。...这个变量必须是group变量或order变量,并且要在define语句中定义过。可以在任何报告中使用rbreak语句,只能在有最起码一个group或者order变量的报告中使用break语句。

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Python完全自学教程》免费在线连载1.7

图1-7-17 在 CMD 窗口进入交互模式 1.7.3 Linux 在1.5.2节中以 Ubuntu 为例简介了 Linux ,此处继续以其为例,演示如何在它上面安装和运行 Python 。...这也是解决图1-7-20所示问题的方法——不必输入 python3.9 。...经验二:使用1.2节自学建议中提到的搜索引擎,耐心地到网上搜索解决方案——“日光之下并无新事”,你所遇到的,其他人已经解决,并很大方地把方案放到网上,需要你亲自动手去找一找。...如果是一种可能的方案,必须要勇敢地动手尝试——尝试过程中要牢记自己的所有操作,甚至于做笔记,这样就能逐步提升自己解决实际问题的能力了。 “人非生而知之者,孰能无惑?”...,互联网是解决自学者之“惑”的最佳选择,无他。请抛弃“是初学者,所以我不会”的心理(这与“有理”、“不跟我玩就哭”有相通之处)。”

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如何python写一个卓APP?(上)

噢耶~Let's Go~~ ——聪明的瓦肯人 ---- 1 针对这个问题 劝大伙儿谨慎尝试 谨慎尝试 为什么咧 把大家骗进来的目的 就是让大家看看 什么叫做 好惨一男的 不过放心 你依然可以看到...这个问题的 可能有效解决方案 然后 你就可以付诸实践 至于结果 就不知道了 2 想必大家都知道 正常卓APP的开发 主流靠的是Java、Kotlin 而其他语言的开发可能就需要 开发框架 python...就不例外 要想使用python开发 就需要使用kivy这个 开源的python开发框架 具体如何操作呢 继续往下看 3 首先 你肯定得安装了python 这一点不多说 然后 以Windows为例安装kivy...中出现的 bios未开启虚拟机允许等问题 自行解决 kivy官方还算良心 已经帮我做好了安装好buildozer的 虚拟机镜像 下载地址 http://txzone.net/files/torrents...以为 添加了Aild即可 其实 又开启了一段 与bug要死要活的斗争 over ---- 预知后事如何,请听下回分解!

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KaliLinux-剪切板攻击-PasteJacker工具的安装

pip 由于我是用python3 安装的所有执行如下命令 pip3 --version 如果你是 python2.x 的用下面查看 pip --version 查看版本,有结果说明你是有pip的就不需要安装了...系统 2022.1的,自动python的环境的,python2.x 和python3.x的,用的是3.x 用2.x 就把 3去掉即可 在你下载pip安装包的目录下执行: python3 get-pip.py.../PasteJacker-master 安装过程一般没问题,有问题就再执行一次命令,一致到提示如下图,就安装成功了 运行PasteJacker 第一次运行可以会出现一个问题如下图,这个是连接更新地址导致的问题...很简单做一下改动代码即可,最好和我下面操作的一样,不然容易出问题 安装的时候用的是 python3 安装的 所以它会在 python3.9 文件夹下 这是找到的目录路径: /usr/...local/lib/python3.9/dist-packages/PasteJacker/Core 如果你的没在这个目录中,你可以执行一下 find / -name "dist-packages"

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树莓派3B+中下载miniconda3

1、引言 在树莓派3B中下载miniconda后(3.16的版本2018年的相当老旧;)才发现他并不能下载3.7以上的版本,3.6可以,、、使用该命令对conda升级后也不能实现; conda update...以上貌似都会出现问题,勉强支持到Python3.4版本左右,而且官方的作者对armv7结尾的.sh文件已经停更很久了,不建议安装使用,推荐树莓派安装64位的Linux。...如果系统中已经安装了 Python 3.10 或更高版本,这可能不会造成问题。)...所以比系统小一个版本是没有问题的; 但是树莓派4B安装的系统为ubuntu 22 server时,所配置的miniconda版本为4.2,python版本3.8。...目前还兼容不了miniconda 4.10以上的版本。因此,建议安装的版本是Miniconda 4.9.22。

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用虚拟环境实现开发隔离

如此,在本地计算机的开发环境中就出现了同一个包的不同版本冲突,如何解决? 我们希望是每个项目都有相对独立的开发环境,与系统配置、其他项目的配置之间相隔离,从而能在该项目中“为所欲为”。...python3 activate activate.fish easy_install-3.9 pip3 python python3.9 这说明此虚拟环境已经配置了 Python...3.9 ,这是因为在创建虚拟环境的时候,指令 pythonPython 3.9 。.../python3.9/site-packages 子目录( Windows 系统上是 Lib\site-packages ),以后在本虚拟环境中安装的第三方包都会放在这里。...asgiref, sqlparse, django Successfully installed asgiref-3.4.1 django-3.2.5 pytz-2021.1 sqlparse-0.4.1 在这个虚拟环境中安装了

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用ChatGPT开发卓APP的亲身经历

ChatGPT到底能不能真的代替程序员?让我们通过一个卓APP的开发任务深度体验一下。 当然,这个文档也尝试去用ChatGPT来写。的感受是:有些可以用,关键部分还得自己写。...开发环境搭建 上面的文字勉强还可以使用,直到这一小节,实在忍不了了,它的输出是这样的: 上面的教程根本不能用,还是自己来吧: 3.1安装 BeeWare 平台 根据 BeeWare 的文档说明(...这个方面借助ChatGPT确实非常方便。 接下来就是高光时刻了: 先让ChatGPT帮我生成一个代码: 上面的代码让非常轻松的入门BeeWare开发。而且还教我如何运行。非常的体贴。...它尝试生成了多种解决方案的代码,最终都已失败告终。在它写不下去时,会返回一个:网络错误! 即便是错误,有时还会问你,这个比上一个好还是不好。显然它在利用你为他进行人工标注。...4.5 试试ChatGPT如何改错 但是,上面这段程序是有问题的。运行时遇到了错误!想看看它是怎么解决的: 相对比较聪明,它用if建立了2个分支,来解决跨平台的兼容性问题

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Python3.8 了解的差不多了吧,Python3.9 新特性了解一下!

正文共:4946 字 1 图 预计阅读时间:13 分钟 作者:陈祥 原文有删改:https://docs.python.org/3.9/whatsnew/3.9.html 本文将解释 Python 3.9...https://docs.python.org/3.9/whatsnew/changelog.html#changelog 目前官网只有 3.8 的下载包,3.9 需要自己编译 Cpython,可以参考之前的文章里面有编译部分的内容...在此之前,如果守护进程线程仍然在运行,则子解释器终止过程会出现 Python 致命错误。...random 模块之前接受任何的 hashable 类型作为种子值,不幸的是,其中一些类型不能保证具有确定性的散列值。...后记 需要注意的是这个文档目前只是个草稿格式,随着 Python3.9 的正式发布,一些特性可能还会添加或删除。下面我们看看语言上的变化。

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跟着PNAS学作图:python做花瓣图(flower plot)展示草莓泛基因组的数据

(schloarscope这个插件变成收费的插件了) 本地存储 草莓PNAS.pdf 今天的推文我们试着重复一下论文中的figure1C 如何用R语言的ggplot2做现在也有了思路,但是找资料的时候发现了一个...先试试能不能行 首先是安装 pip install git+https://github.com/MrTomRod/flower-plot.git 运行安装命令没有问题 接下来试试他的例子 遇到报错...瞎猜是python版本的问题,我们换一个版本试试 新建一个虚拟环境 conda create -n flower_plot python=3.9 激活环境 conda activate flower_plot...安装flower_plot pip install git+https://github.com/MrTomRod/flower-plot.git 这里遇到一个问题是虚拟环境里是python 3.9...,如何在使用jupyter lab的时候调用这个虚拟环境还是用python3.9这个还是没有搞定,只能换一个annconda是自带python3.9的了 用python3.9运行出了结果 接下来我们用

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Python3.8 了解的差不多了吧,Python3.9 新特性了解一下!

正文共:4946 字 1 图 预计阅读时间:13 分钟 作者:陈祥 原文有删改:https://docs.python.org/3.9/whatsnew/3.9.html 本文将解释 Python...https://docs.python.org/3.9/whatsnew/changelog.html#changelog 目前官网只有 3.8 的下载包,3.9 需要自己编译 Cpython,可以参考之前的文章里面有编译部分的内容...在此之前,如果守护进程线程仍然在运行,则子解释器终止过程会出现 Python 致命错误。...random 模块之前接受任何的 hashable 类型作为种子值,不幸的是,其中一些类型不能保证具有确定性的散列值。...后记 需要注意的是这个文档目前只是个草稿格式,随着 Python3.9 的正式发布,一些特性可能还会添加或删除。下面我们看看语言上的变化。

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Python3.8 了解的差不多了吧,Python3.9 新特性了解一下!

作者:陈祥 本文转自:Python学习开发 正文共:4946 字 1 图 原文有删改: 目前官网只有 3.8 的下载包,3.9 需要自己编译 Cpython,可以参考之前的文章里面有编译部分的内容...cpython/script.py'] sys.path[0]='/Users/chenxiangan/cpython' 但是对于下面这段代码,这段代码请在 Python3.8 下运行 script.js...在此之前,如果守护进程线程仍然在运行,则子解释器终止过程会出现 Python 致命错误。...random 模块之前接受任何的 hashable 类型作为种子值,不幸的是,其中一些类型不能保证具有确定性的散列值。...后记 需要注意的是这个文档目前只是个草稿格式,随着 Python3.9 的正式发布,一些特性可能还会添加或删除。下面我们看看语言上的变化。

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