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功能数据库专题-GSEA

根据已有的对基因的定位、功能、生物学意义等知识的基础上,首先构建了一个分子标签数据库数据库中包含了多个功能基因集。通过分析基因表达数据,得到表达状况是否在某种功能上显著富集。...这容易遗漏部分差异表达不显著却有重要生物学意义的基因,忽略一些基因的生物特性、基因调控网络之间的关系及基因功能和意义等有价值的信息。...GSEA可以进行线上线下两种方法,但是都要基于后台数据库MSigDB(Molecular Signatures Database),数据库中定义了已知的标签基因集合(如下图)可以登录数据库网站http:...如果要在线下进行分析,需要下载感兴趣的基因集合(可以下载全部8个clusters,但是最好分开运行,否则PC可能会卡死),另外GSEA研发团队会根据组学知识的发展不断修改和扩展数据库中的基因集合,建议童鞋们采取调取后台数据库的在线分析方法

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服务器端Javascript

我们服务器端也是用Javascript啊,当然有时也用C,B好像是Apple的粉丝,它在服务器端用Javascript+Object-C哦!     ...那么相对而言,我们软件工程可以相对轻松一些,因为目前前端开发和后台开发使用语言都是不同的,并且服务器端语言还有很多种,这无疑给Web软件工程师打来很大的学习成本和压力。...我接触服务器Javascript应该去年,当时有同学告诉我,Javascript就是客户端脚本语言,只能运行在浏览器中,不可能运行在服务器端。呵呵!...我后来查询了相关外文资料,发现他说的不对,Javascript可以运行在服务器端。当然目前需要服务器安装javascript脚本引擎吧!当Jaxer横空出世时,这一切都改变了。...1606466.html 帕兰映像 http://paranimage.com/aptana-jaxer-the-worlds-first-real-server-ajax/ 第一个Javascript服务器端程序

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融合基因功能预测数据库

点击蓝字 关注我们 昨天我们介绍的融合基因查询的数据库,可以查询发生基因融合的基因。由于发生了基因融合,所以就相当于形成了新的基因,对于这种基因的功能是什么,昨天的数据库没有介绍。...1 数据库分析流程 由于要分析融合基因的功能,所以第一步就是要选择分析哪些融合基因的功能。这里作者纳入了三个数据库当中和肿瘤相关的融合基因。...最终收集到了48000个融合基因,进一步作者对这这些融合基因进行肿瘤相关的功能注释。 ? 2 主要注释内容 对于这些的融合基因,作者进行了多种功能的注释。 通过开放阅读框进行功能注释。...对其基因功能变化进行了注释。 以及对下游的基因表达的变化的注释。 ? 3 数据库使用 对于数据库的使用而言,比较简单,我们输入我们想要查看的和某一个基因有关的融合基因即可。...4 数据下载 另外这个数据库提供了所有相关数据的下载,如果想要查看某一个方面的所有数据库的话,可以来下载具体的数据。 ?

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openGauss数据库闪回功能验证

背景 openGauss闪回功能能够有选择性的高效撤销一个已提交事务的影响,从人为错误中恢复。在采用闪回技术之前,只能通过备份恢复、PITR等手段找回已提交的数据库修改,恢复时长需要数分钟甚至数小时。...采用闪回技术后,恢复已提交的数据库修改前的数据,只需要秒级,而且恢复时间和数据库大小无关。适用于: 1)误删除表的场景; 2)需要将表中的数据恢复到指定时间点或者CSN。...后来查看管理员指南,在特性描述倒是说了“ASTORE引擎暂不支持闪回功能。备机不支持闪回操作。”在开发者指南 CREATE TABLE部分找到这么一句话。...但是,为什么数据库的默认值给的是astore呢?补课学习下ustore和astore的差异。...对于主机,在recovery_parse_workers参数设置大于1的情况下,创建USTORE存储引擎的表将返回报错;对于备机,如果数据库中已经包含USTORE表,那么后续如果再打开极致RTO功能,可能会导致回放失败和报错

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Java服务器端结构

数据库连接池: 应用程序想要访问数据库中的数据,需要和数据库建立连接。而数据库连接池就是用来 负责分配、管理和释放数据库连接,你可以把数据库连接池理解为一把钥匙,而数据库就是锁。...1)数据库连接池允许应用程序重复使用一个现有的数据库连接,而不是再重新建立一个 2)释放空闲时间超过最大空闲时间的数据库连接来避免因为没有释放数据库连接而引起的数据库连接遗漏。...数据库中的事务: 数据库事务(Database Transaction),是指一个功能(里面有多个要执行的Sql),这些Sql语句要么同时执行成功,要么都不执行。...比如转账功能,一个账户要转入100,就必须有一个账户转出100;两个必须同时执行成功;不能说其中的一个执行成功,这样就会造成数据错乱。 HTTP协议:数据传输协议 浏览器如何与服务器进行数据的交互?...3)服务器端操作系统,将来你要学习的就是Linux操作系统。 4)浏览器通过http协议去访问服务器。

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服务器端网页编程-前言

开始服务器端编程通常比客户端编程要简单,因为动态的页面倾向于执行非常类似的操作(从数据库中获取数据然后显示到一个页面中,确认用户输入的数据以及保存到一个数据库中,检查用户的权限和登陆用户,以及更多),并且它是用能使这些和其他的常见网页服务端操作变简单的网页框架来构建的...服务端web框架 服务器端框架(亦称 "web 应用框架") 使编写、维护和扩展web应用更加容易。...它们提供工具和库来实现简单、常见的开发任务, 包括 路由处理, 数据库交互, 会话支持和用户验证, 格式化输出 (e.g. HTML, JSON, XML), 提高安全性应对网络攻击....效率:效率是指一旦你熟悉某一个框架之后,你能够多块地创造一个新功能的衡量方式,包括编写和维护代码的代价(因为当前面的功能崩掉之后,你没法编写新的功能)。...其他框架也提供相似的功能,但是通常在默认情况下是不直接开启的。 可能还有其他一些原因,包括许可证、框架是否处于动态发展过程中等等。

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Gene Ontology-基因产物功能数据库

Gene Ontology, 中文名叫做基因本体论,采用GO terms描述基因产物的功能, 并且提供了不同GO terms 之间的关系。...官网如下 http://geneontology.org/ GO定义的基因功能分成以下3大类别: molecular function cellular component biological process...GO本身是一个跨物种的概念,官方提供的GO文件涵盖了大部分的物种的所有功能。...但是对于特定领域的物种来说,其功能只占整个GO的一部分,此时,可以从整个GO中抽取出对应的部分,构成一个子集,这个子集就叫做GO Slim, 在以下链接中,提供了不同领域的GO Slim。...除此之外,还提供了GO与其他数据库,比如KEGG Pathway, RDP, COG等数据库的映射关系,链接如下 http://www.geneontology.org/page/download-mappings

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MariaDB数据库整合Tableau商业智能功能

“世界上数以百万计的用户依靠MariaDB和Tableau运行和分析着关键业务应用环境”,MariaDB的产品营销高级总监Shane Johnson说,“我们之间的整合,将使开源数据库和商业智能更加可靠...Tableau和MariaDB认证与MariaDB TX的可用性事务工作负载的性能将增加,一个开源的数据库解决方案提供现代数据分析与数据仓库,加上Tableau的数据视觉分析软件,增加了MariaDB和...而MariaDB作为通用的数据库系统,已经从而部署到支持等范围给用户提供强大的动力,而数据的健康分析,性能诊断、成本监控等能力将随着Tableau的加入,将产生更好以及更创新的服务。...在OpenStack云部署中,通过可靠之调查,MariaDB亦被人们作为最常用的数据库。MariaDB在Linux不同的发行版以及云端供应商的广泛使用,证明它的易用与灵活性越来越显现。...相信MariaDB很快会成为现代企业的开源数据库标准。 21CTO社区编译自网络

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