首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往

热图中分组与聚类不匹配的问题

分组与聚类不匹配的问题,是没错,但不好解释的问题。 期待:tumor normal 各成一簇 实际上,不一定。...成一簇:说明画热图的基因在两个分组间有明显的表达模式 不成一簇:说明画热图的基因在两个分组间表达模式不是特别明显 换一组基因或者增删基因 可能改变聚类的结果。...分组和聚类是两件独立的事情,聚类是以样本为单位,而不是以分组为单位。每个样本属于那个分组的信息是已知的。...希望各成一簇,两个选择: 1.增删、换基因 2.取消聚类- cluster_cols = F a.前提:矩阵列的顺序是先tumor后normal,或者先normal后tumor i.不聚类时,热图列的顺序与矩阵列的顺序完全匹配...# 如何调整表达矩阵列的顺序?

24910
  • 您找到你想要的搜索结果了吗?
    是的
    没有找到

    挖掘文本的奇妙力量:传统与深度方法探索匹配之道

    挖掘文本的奇妙力量:传统与深度方法探索匹配之道文本向量表示咋做?文本匹配任务用哪个模型效果好?许多 NLP 任务的成功离不开训练优质有效的文本表示向量。...可解释性较好缺点:依赖人工寻找特征,泛化能力一般,而且由于特征数量的限制,模型的效果比较一般代表模型:BM25BM25 算法,通过候选句子的字段对 qurey 字段的覆盖程度来计算两者间的匹配得分,得分越高的候选项与...2.深度方法:基于表征的匹配基于表征的匹配方式,初始阶段对两个文本各自单独处理,通过深层的神经网络进行编码(encode),得到文本的表征(embedding),再对两个表征进行相似度计算的函数得到两个文本的相似度优点...,此处不讨论和比较 2018 年之前的模型(如果有兴趣了解的同学,可以参考中科院开源的 MatchZoo 和 MatchZoo-py)。...3.深度方法:基于交互的匹配基于交互的匹配方式,则认为在最后阶段才计算文本的相似度会过于依赖文本表征的质量,同时也会丢失基础的文本特征(比如词法、句法等),所以提出尽可能早的对文本特征进行交互,捕获更基础的特征

    27410

    Python+OpenCV实现旋转文本校正

    参考链接: python opencv 基础5 : putText() 为图像增加文本 假设我们有一幅图像,图像中的文本被旋转了一个未知的角度。...为了对文字进行角度的校正,我们需要完成如下几个步骤:  1、检测出图中的文本范围  2、计算出文本被旋转的角度  3、将图像旋转特定的角度  第一步、读取图像,并做二值化处理 #读取图像,做二值化处理...cv.threshold(gray, 0, 255, cv.THRESH_BINARY_INV | cv.THRESH_OTSU) cv.imshow('thresh', thresh)  第二步、计算包含了被旋转文本的最小边框...#计算包含了旋转文本的最小边框 coords = np.column_stack(np.where(thresh > 0)) print(coords) #该函数给出包含着整个文字区域矩形边框,这个边框的旋转角度和图中文本的旋转角度一致...angle = cv.minAreaRect(coords)[-1] print(angle)  我们将这些坐标传给函数cv.minAreaRect,该函数将给出包含着整个文字区域的矩形边框,这个边框的旋转角度和图中文本的旋转角度一致

    1.3K00

    【文本检测与识别-白皮书-3.1】第一节:常用的文本检测与识别方法

    pooling,RoI-Pooling)操作,增加了特征尺寸,然后在Fast R-CNN 中额外增加了一个分支预测旋转的矩形以及一个针对倾斜框的非极大值抑制后处理算法以解决多方向文本的检测问题。...Ma 等人(2018)同样也指出应该用旋转矩形替代水平矩形来进行文本检测。...作者提出了旋转候选区域生成网络(rotated region proposal network,RRPN),结合旋转矩形的锚点框(anchor)来生成倾斜的文本候选区域。...考虑到将Faster R-CNN 用于文本检测时,矩形锚点框与文本的形状相差过大,会导致区域生成网络(region proposal network,RPN)在生成文本候选区域时效率不高,鲁棒性也不强,...Liu 和Jin (2017)也是基于相同的框架提出了深度匹配先验网络(deep matching prior network, DMPNet),首次使用四边形锚点框来替换原来的矩形锚点框,实现了多方向文本检测

    1.3K30

    EasyDSS前端用户管理界面分页与页面内容不匹配的优化

    EasyDSS视频平台作为一套网页视频流媒体平台,观看视频推流直播不需要安装插件,网页直接即可播放,且近期我们已经更新了系统的内核,在性能上也会有进一步的提升。...近期在对EasyDSS进行日常维护时发现,用户管理切换第二页后刷新,数据显示第二页,但还存在底部分页显示第一页的问题,如下: 这种问题基本就是前端编译中出现的问题,经过排查后,我们把问题锁定在了页面的赋值上...实现效果如下,问题解决: 针对EasyDSS的精细优化,我们还在探索当中,但EasyDSS本身来说已经是一个非常完整的视频流媒体服务了,其现存的基本功能已经可以直接投入使用,比如在线教育、在线医疗等。

    1.7K20

    自然场景文本检测识别技术综述

    ·文本行是有方向性的。常规物体边框BBox的四元组描述方式信息量不充足。 ·自然场景中某些物体局部图像与字母形状相似,如果不参考图像全局信息将有误报。...这种方案中,一个文本区域的ground truth被表示为具有5元组(x,y,h,w,θ)的旋转边框, 坐标(x,y)表示边框的几何中心, 高度h设定为边框的短边,宽度w为长边,方向是长边的方向。...它使用Resnet-101做基础网络,使用了多尺度融合的特征图。标注数据包括文本实例的像素掩码和边框,使用像素预测与边框检测多目标联合训练。 ?...该模型中,支持旋转矩形框、任意四边形两种文本区域标注形式。对应于四边形标注,模型执行时会对特征图中每个像素预测其到四个顶点的坐标差值。...对应于旋转矩形框标注,模型执行时会对特征图中每个像素预测其到矩形框四边的距离、以及矩形框的方向角。 根据开源工程中预训练模型的测试,该模型检测英文单词效果较好、检测中文长文本行效果欠佳。

    3.6K20

    最新图文识别技术综述

    :包括图像降噪、图像旋转校正、线检测、特征匹配、文字轮廓提取及分割等。...1.2 图文检测与识别流程 1.2.1 传统OCR检测及识别流程 传统的OCR识别流程主要包含以下步骤:图像预处理(噪声过滤、灰度变换、图像旋转校正、二值化等)、版面分析(表格线检测、关键区域的特征匹配...RRPN[30]网络,将旋转因素并入经典区域候选网络,一个图像文本区域的ground truth用5元组的旋转边框来描述;训练阶段,首先生成倾斜候选框(含方向角),然后在边框回归过程阶段,学习文本方向角...DMPNet[31]网络,使用四边形(非矩形)标注文本框;SegLink[32] 网络,首先将每个单词切分为小的、带方向的、更易检测的文字块,然后用邻近连接方法将各小文字块连接成单词。...在该网络中,一个图像文本区域的ground truth用5元组的旋转边框来描述:边框的几何中心坐标、边框的短边、边框的长边和方向角。

    2.6K30

    CVPR 2018 | 华中科技大学提出多向文本检测方法:基于角定位与区域分割

    与一般目标检测相比,场景文本检测更加复杂,因为:1)场景文本可能以任意方向存在于自然图像中,因此边界框可能是旋转的矩形或者四边形;2)场景文本边界框的长宽比变化比较大;3)因为场景文本的形式可能是字符、...新研究的动机主要来源于两方面的观察:1)不管矩形的大小如何、长宽比如何、方向如何,它都可以由角点决定;2)区域分割图可以提供有效的文本位置信息。...( 3 ) 新提出的方法可以同时处理多方向场景文本中的诸多挑战(如旋转、宽高比变化、非常闭合的实例)。 ( 4 ) 新方法在精度和效率上均取得了较好或有竞争力的结果。...MSRA-TD500 上的测试结果。有†表示的模型不基于 VGG16。 ? 表 6. COCO-Text 上的测试结果。∗代表多尺度。...与之前的方法相比,我们的方法能够自然地处理长定向文本,并且不需要复杂的后处理过程。

    1.2K60

    自然场景文本检测识别技术综述

    ·文本行是有方向性的。常规物体边框BBox的四元组描述方式信息量不充足。 ·自然场景中某些物体局部图像与字母形状相似,如果不参考图像全局信息将有误报。...这种方案中,一个文本区域的ground truth被表示为具有5元组(x,y,h,w,θ)的旋转边框, 坐标(x,y)表示边框的几何中心, 高度h设定为边框的短边,宽度w为长边,方向是长边的方向。...标注数据包括文本实例的像素掩码和边框,使用像素预测与边框检测多目标联合训练。 基于文本实例间像素级重合度的Mask-NMS, 替代了传统基于水平边框间重合度的NMS算法。...该模型中,支持旋转矩形框、任意四边形两种文本区域标注形式。对应于四边形标注,模型执行时会对特征图中每个像素预测其到四个顶点的坐标差值。...对应于旋转矩形框标注,模型执行时会对特征图中每个像素预测其到矩形框四边的距离、以及矩形框的方向角。 根据开源工程中预训练模型的测试,该模型检测英文单词效果较好、检测中文长文本行效果欠佳。

    7.7K20

    ODTK:来自NVIDIA的旋转框物体检测工具箱

    现在你可以用xmin,ymin,width,height和θ来描述一个目标的边框。 在现实世界中,有些目标不能被描述为一个简单的矩形,需要更多的参数。...ODTK (b)检测到的旋转框解决了这个问题,并且更好地拟合了目标的轮廓。 旋转物体和特征的检测的应用包括遥感(图1)、 “in the wild” 文本检测、医学和工业检测。...图4,轴对齐锚框(蓝色),旋转的锚框(红色和蓝色),旋转角度:-π/6, 0和π/6 旋转框的IOU计算 ? 图5,两个旋转矩形的重叠区域为多边形。...使用shapely minimum_rotated_rectangle函数创建旋转矩形,并将四个角输入函数以生成边框值。calc_bearing是一个用arctan求θ的简单函数。...当使用这些指标时,旋转模型的精度和召回率分别为0.77和0.76,轴对齐模型的精度和召回率分别为0.37和0.55。旋转检测比轴对齐模型可以更清楚地匹配ground truth。 ?

    2.9K30

    JavaScript--DOM总结

    alt 设置或返回无法显示图像时的替代文本。 border 设置或返回图像周围的边框。...rel 设置或返回当前文档与目标 URL 之间的关系。 rev 设置或返回目标 URL 与之间当前文档的关系。...restore() 为画布重置为最近保存的图像状态。 rotate() 旋转画布。 save() 保存 CanvasRenderingContext2D 对象的属性、剪切区域和变换矩阵。...,所创建的拐角类型 lineWidth 设置或返回当前的线条宽度 miterLimit 设置或返回最大斜接长度 矩形 方法 描述 rect() 创建矩形 fillRect() 绘制“被填充”的矩形 strokeRect...,或重置当前路径 moveTo() 把路径移动到画布中的指定点,不创建线条 closePath() 创建从当前点回到起始点的路径 lineTo() 添加一个新点,然后在画布中创建从该点到最后指定点的线条

    7610

    EasyDSS点播视频添加水印的位置与定义的位置不匹配怎么办?

    去年年底我们在EasyDSS上增加了水印功能,用户可以自由定义水印的格式及位置,不管是网页端的视频还是手机端的视频,都支持添加水印,如果大家对水印功能的开发感兴趣,可以参考我们之前的EasyDSS新增生成水印模块记录...在对手机端视频的水印生成测试过程中,我们发现在点播服务中添加水印,添加后生成的视频水印最终位置与我们最开始定义的位置不同。...定义位置如下: image.png 视频输出时显示的位置如下: image.png 经过分析和测试,我们猜测应该是水印框太大导致的问题,在设置尺寸方法中又除以二,数据提交后视频尺寸返回原来的尺寸,水印图所在的...视频图片尺寸通过父组件中的oriention.mh/wh设置,所以直接在父组件赋值的地方判断手机端的视频设置,不需要在设置视频尺寸方法中进行二次缩小。...parseInt(str[1]) % 640 : 0; } 修改后再次进行测试,定义位置如下: image.png 视频输出后水印显示位置与定义位置同步: image.png

    66320

    服务器端的图像处理 | 请召唤ImageMagick助你解忧

    ,否则会出乎意料哟 文本定位与旋转 画布宽 100px,平均分成 4 分,每份 25px, 文字宽 16px, 得文字 x 的坐标左右摆动范围为 +0px, +9px,y 坐标同理,用于设置 translate...,得配合 translate 和 text 的 x,y 一起使用,原理可参考这篇文章[图像旋转的实现],注意 translate 与 rotate 的顺序 strokewidth:设置文本的边框宽度或线条宽度...stroke:设置文本的边框颜色或线条颜色 -fill 'rgba(0, 0, 0, 0)':上面设置了文本的填充颜色,会影响下面的贝塞尔曲线,所以这里指定一个透明的填充色以覆盖上面的设定,使曲线没有填充...不必要的圆括号会使 IM 增加少许额外的工作,但是却让命令更清晰不容易出错 -crop:裁剪出图像的一个或多个矩形区域,格式为 {size}{+-}x{+-}y,如果不指定偏移值 x,y,则会被解释为按指定宽高切割图像成多少份...通过换行符分割,简单封装一个 Node.js 函数获取页数: 5.5、图片转 GIF 将所有与 frame-*.jpg 模式匹配的图像转换成一张 GIF 图像,如 frame-0.jpg,frame

    3.3K10

    熬夜总结了 “HTML5画布” 的知识点(共10条)

    为了不每次更新动态场景的时候,都去绘制静态场景。 一般把静态场景绘制在离屏canvas上,更新动态场景的时候,把静态场景copy过来,而不是重新绘制。...两个方法: strokeRect() - 矩形边框 fillRect() - 填充矩形区域 strokeStyle - 设置线条的颜色 lineWidth - 设置线条宽度,默认宽度为1,单位是像素...fillStyle - 设置区域或文字的填充颜色 绘制矩形边框,使用strokeStyle方法: // 绘制矩形边框 strokeRect(x,y, width, height); 填充矩形区域,使用fillRect...rect(x,y, width, height):xy,起点坐标,矩形的宽高,绘制矩形路径 closePath方法关闭当前路径 绘制图形样式 stokeStyle 属性设置矩形边框的颜色 lineWidth...旋转rotate (A) 9.使用文本 绘制文本的方法: fillText(text, x, y, maxwidth) strokeText(texxt, x, y, maxwidth) text表示要绘制的文本

    7.1K21

    熬夜总结了 “HTML5画布” 的知识点(共10条)

    为了不每次更新动态场景的时候,都去绘制静态场景。 一般把静态场景绘制在离屏canvas上,更新动态场景的时候,把静态场景copy过来,而不是重新绘制。...两个方法: strokeRect() - 矩形边框 fillRect() - 填充矩形区域 strokeStyle - 设置线条的颜色 lineWidth - 设置线条宽度,默认宽度为1,单位是像素...fillStyle - 设置区域或文字的填充颜色 绘制矩形边框,使用strokeStyle方法: // 绘制矩形边框 strokeRect(x,y, width, height); 填充矩形区域,使用fillRect...,绘制矩形路径 closePath方法关闭当前路径 绘制图形样式 stokeStyle 属性设置矩形边框的颜色 lineWidth 属性设置边框的宽度 fillStyle 属性设置填充的颜色 绘制网格...旋转rotate (A) 9.使用文本 绘制文本的方法: fillText(text, x, y, maxwidth) strokeText(texxt, x, y, maxwidth) text表示要绘制的文本

    7.6K10
    领券