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使用Dask DataFrames 解决Pandas中并行计算的问题

大多数Dask APIPandas相同,但是Dask可以在所有CPU内核上并行运行。它甚至可以在集群上运行,但这是另一个话题。 今天你看到Dask在处理20GB CSV文件时比Pandas快多少。...运行时值因PC而异,所以我们将比较相对值。郑重声明,我使用的是MBP 16”8核i9, 16GB内存。...处理多个CSV文件 目标:读取所有CSV文件,按年值分组,并计算每列的总和。 使用Pandas处理多个数据文件是一项乏味的任务。简而言之,你必须一个一个地阅读文件,然后把它们垂直地叠起来。...glob包帮助您一次处理多个CSV文件。您可以使用data/*. CSV模式来获取data文件夹中的所有CSV文件。然后,你必须一个一个地循环读它们。最后,可以将它们连接起来并进行聚合。...结论 今天,您学习了如何从Pandas切换到Dask,以及当数据集变大时为什么应该这样做。Dask的APIPandas是99%相同的,所以你应该不会有任何切换困难。

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又见dask! 如何使用dask-geopandas处理大型地理数据

dask-geopandas的使用dask-geopandas旨在解决类似的性能问题,通过并行计算和延迟执行来提高处理大规模地理空间数据的效率。...优化建议: 资源分配:确保有足够的计算资源(CPU和内存)来处理数据。对于dask-geopandas,可以通过调整Dask的工作进程数和内存限制来优化性能。...代码审查:仔细检查实现代码,尤其是dask-geopandas的部分,确认是否正确使用了并行计算和数据分区功能。 批处理:如果可能,尝试数据分成更小的批次进行处理,而不是一次性处理所有点。...() 检查几何对象是否在某个多边形内 ddf.within(polygon) 此外,如果你有一个分布式的 dask.dataframe,你可以 x-y 点的列传递给 set_geometry 方法来设置几何形状...例如,在合并或连接操作之前,仔细考虑是否所有列都需要参与操作。 使用更高效的空间连接 在使用dask_geopandas进行空间连接时,确保操作是高效的。

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使用Wordbatch对Python分布式AI后端进行基准测试

第二个设置使用直接10 Gb / s以太网连接另一个工作节点18核i9-7980XE CPU连接。...由于更好地使用附加节点,具有附加节点的Spark几乎Ray相同,并且可以通过更大的数据大小和更复杂的处理流水线来完成。 结论性思考 这些基本基准测试演示了分布式调度程序的一些主要属性。...Dask不同,它可以很好地序列化嵌套的Python对象依赖项,并有效地在进程之间共享数据,线性地扩展复杂的管道。...dask / dask https://github.com/dask/dask 具有任务调度的并行计算。通过在GitHub上创建一个帐户来为dask / dask开发做贡献。...Spark的比较 - Dask 1.2.2文档 http://docs.dask.org/en/stable/spark.html 它们都可以部署在相同的集群上。

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【Python 数据科学】Dask.array:并行计算的利器

什么是Dask.array? 1.1 Dask简介 Dask是一个用于并行计算的强大工具,它旨在处理大规模数据集,数据拆分成小块,并使用多核或分布式系统并行计算。...((1000, 1000)) # 创建二维Dask数组 arr = da.array(data) 2.3 数组计算操作 在Dask.array中,我们可以执行类似于Numpy的数组计算和操作。...3.3 数据倾斜rebalance 在使用Dask.array进行计算时,可能会出现数据倾斜的情况。...通过使用分布式计算资源,我们可以处理更大规模的数据集,从而提高计算效率。 7. Dask.array分布式计算 7.1 分布式集群的配置 Dask.array可以利用分布式计算资源来进行并行计算。...数组可视化比较 9.1 使用Matplotlib进行数组可视化 在Dask.array中,我们可以使用Matplotlib或其他可视化工具来数组数据以图表形式展示出来。

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对比Vaex, Dask, PySpark, Modin 和Julia

为了验证这个问题,让我们在中等大小的数据集上探索一些替代方法,看看我们是否可以从中受益,或者咱们来确认只使用Pandas就可以了。...我们看一下Dask,Vaex,PySpark,Modin(全部使用python)和Julia。...在这种情况下,整个数据集加载到Pandas相比花费了更多的时间。 Spark是利用大型集群的强大功能进行海量计算的绝佳平台,可以对庞大的数据集进行快速的。...通过环境变量JULIA_NUM_THREADS设置为要使用的内核数,可以运行具有更多内核的julia。...最后总结 我们已经探索了几种流行的Pandas替代品,以确定如果数据集足够小,可以完全装入内存,那么使用其他数据是否有意义。 目前来看没有一个并行计算平台能在速度上超过Pandas。

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Spark vs Dask Python生态下的计算引擎

Spark 是独立于 Python 生态的另一个项目,但如果是在 JVM 环境下开发,并且十分需要使用 Spark SQL 等特性,可以考虑使用Spark。...对于机器学习的支持 Dask 原生支持 Scikit-learn,并且某些 Scikit-learn 中的方法重构改成了分布式的方式。并且可以轻易兼容 Python 生态中的开源算法包。...并且可以通过 Dask 提供的延迟执行装饰器使用 Python 编写支持分布式的自定义算法。...并且可以通过 UDF 执行使用 Python 编写的自定义算法。 对于深度学习的支持 Dask 直接提供了方法执行 tensorflow,而tensorflow本身就支持分布式。...或者不希望完全重写遗留的 Python 项目 你的用例很复杂,或者不完全适合 Spark 的计算模型(MapReduce) 你只希望从本地计算过渡到集群计算,而不用学习完全不同的语言生态 你希望与其他

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什么是Python中的Dask,它如何帮助你进行数据分析?

此外,您可以在处理数据的同时并行运行此代码,这将简化为更少的执行时间和等待时间! ? 该工具完全能够复杂的计算计算调度、构建甚至优化为图形。...这就是为什么运行在10tb上的公司可以选择这个工具作为首选的原因。 Dask还允许您为数据数组构建管道,稍后可以将其传输到相关的计算资源。...在本例中,您已经数据放入了Dask版本中,您可以利用Dask提供的分发特性来运行使用pandas类似的功能。...熟悉的API:这个工具不仅允许开发人员通过最小的代码重写来扩展工作流,而且还可以很好地这些工具甚至它们的API集成。 向外扩展集群:Dask计算出如何分解大型计算并有效地将它们路由到分布式硬件上。...安全性:Dask支持加密,通过使用TLS/SSL认证进行身份验证。 优缺点 让我们权衡一下这方面的利弊。 使用Dask的优点: 它使用pandas提供并行计算

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资源 | Pandas on Ray:仅需改动一行代码,即可让Pandas加速四倍

我们正在积极实现 Pandas 所有 API 的对等功能,并且已经实现了 API 的一个子集。我们会介绍目前进展的一些细节,并且给出一些使用示例。...,如果我们使用 [:] 运算符所有的数据收集到一起,Pandas on Ray 速度大约是之前的 1/36。...这个调用返回的是 Dask 数据帧还是 Pandas 数据帧? 使用 Pandas 的数据科学家不一定非得是分布式计算专家,才能对数据进行高效分析。Dask 要求用户不断了解为计算而构建的动态任务图。...尽管多线程模式让一些计算变得更快,但是一个单独的 Python 进程并不能利用机器的多个核心。 或者,Dask 数据帧可以以多进程模式运行,这种模式能够生成多个 Python 进程。...值得注意的是,Dask 的惰性计算和查询执行规划不能在单个操作中使用

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全平台都能用的pandas运算加速神器

本文要介绍的工具modin就是一个致力于在改变代码量最少的前提下,调用起多核计算资源,对pandas的计算过程进行并行化改造的Python库,并且随着其近期的一系列内容更新,modin基于Dask开始对...图1 2 基于modin的pandas运算加速 modin支持Windows、Linux以及Mac系统,其中LinuxMac平台版本的modin工作时可基于并行运算框架Ray和Dask,而Windows...平台版本目前只支持Dask作为计算后端(因为Ray没有Win版本),安装起来十分方便,可以用如下3种命令来安装具有不同后端的modin: pip install modin[dask] # 安装dask...命名为mpd: 图3 可以看到因为是Win平台,所以使用计算后端为Dask,首先我们来分别读入文件查看耗时: 图4 借助jupyter notebook记录计算时间的插件,可以看到原生的pandas...对于这部分功能,modin会在执行代码时检查自己是否支持,对于尚未支持的功能modin会自动切换到pandas单核后端来执行运算,但由于modin中组织数据的形式pandas不相同,所以中间需要经历转换

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用于ETL的Python数据转换工具详解

下面看下用于ETL的Python数据转换工具,具体内容如下所示: 前几天,我去Reddit询问是否应该Python用于ETL相关的转换,并且压倒性的回答是”是”。 ?...优点 可扩展性— Dask可以在本地计算机上运行并扩展到集群 能够处理内存不足的数据集 即使在相同的硬件上,使用相同的功能也可以提高性能(由于并行计算) 最少的代码更改即可从Pandas切换 旨在与其他...为什么每个数据科学家都应该使用Dask Modin 网站:https://github.com/modin-project/modin 总览 ModinDask相似之处在于,它试图通过使用并行性并启用分布式...Dask不同,Modin基于Ray(任务并行执行框架)。 Modin优于Dask的主要好处是Modin可以自动处理跨计算机核心分发数据(无需进行配置)。...优点 可扩展性和对更大数据集的支持 就语法而言,Spark DataFramesPandas非常相似 通过Spark SQL使用SQL语法进行查询 与其他流行的ETL工具兼容,包括Pandas(您实际上可以

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(数据科学学习手札150)基于dask对geopandas进行并行加速

2 dask-geopandas的使用   很多朋友应该听说过dask,它是Python生态里非常知名的高性能计算框架,可以针对大型数组、数据框及机器学习模型进行并行计算调度优化,而dask-geopandas...2.1 基础使用 dask-geopandasgeopandas的常用计算API是相通的,但调用方式略有不同,举一个实际例子,其中示例文件demo_points.gdb由以下代码随机生成并写出: import...()将其转换为dask-geopandas中可以直接操作的数据框对象,其中参数npartitions用于原始数据集划分为n个数据块,理论上分区越多并行运算速度越快,但受限于机器的CPU瓶颈,通常建议设置...dask-geopandas就是奔着其针对大型数据集的计算优化而去的,我们来比较一下其原生geopandas在常见GIS计算任务下的性能表现,可以看到,在geopandas的计算比较中,dask-geopandas...取得了约3倍的计算性能提升,且这种提升幅度会随着数据集规模的增加而愈发明显,因为dask可以很好的处理内存紧张时的计算优化:   当然,这并不代表我们可以在任何场景下用dask-geopandas代替

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如果要快速的读写表格,Pandas 并不是最好的选择

最近在用 Pandas 读取 csv 进行数据分析,好在数据量不是很大,频率不是很高,使用起来得心用手,不得不说真的很方便。...不过当数据量很大,你就要考虑读写的性能了,可以看下这个库,留下印象,以备不时之需。...Pandas 有两个竞争对手,一个是 Dask[1] 另一个是 DataTable[2],不过 Pandas 太牛逼了,其他两个库都提供了 Pandas 的 DataFrame 相互转换的方法。...它们都可以用来读写 Excel 有网友对此做了读写性能测试[3],先生成随机数据集,其中包含可变行和三十列——包括字符串、浮点数和整数数据类型。每个测试重复了五次,取其平均值。...写入 csv Dask Pandas DataFrame 存储到 CSV 方面的表现都比 Pandas 差。而 DataTable 表现最好,比 Pandas 提高了近 8 倍。

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NumPy 高级教程——并行计算

Python NumPy 高级教程:并行计算 并行计算是在多个处理单元上同时执行计算任务的方法,以提高程序的性能。在 NumPy 中,可以使用一些工具和技术来进行并行计算,充分利用多核处理器的优势。...在本篇博客中,我们深入介绍 NumPy 中的并行计算,并通过实例演示如何应用这些技术。 1....使用 Dask 加速计算 Dask 是一个用于并行计算的灵活工具,可以 NumPy 结合使用,提供分布式和并行计算的能力。...import dask.array as da # NumPy 数组转换为 Dask 数组 arr_dask = da.from_array(arr_large, chunks=len(arr_large...使用 Cython 进行编译优化 Cython 是一种 Python 代码转换为 C 代码的工具,从而提高执行速度。通过使用 NumPy 数组,可以在 Cython 中实现并行计算

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(数据科学学习手札86)全平台支持的pandas运算加速神器

本文要介绍的工具modin就是一个致力于在改变代码量最少的前提下,调用起多核计算资源,对pandas的计算过程进行并行化改造的Python库,并且随着其近期的一系列内容更新,modin基于Dask开始对...图1 2 基于modin的pandas运算加速 modin支持Windows、Linux以及Mac系统,其中LinuxMac平台版本的modin工作时可基于并行运算框架Ray和Dask,而Windows...平台版本目前只支持Dask作为计算后端(因为Ray没有Win版本),安装起来十分方便,可以用如下3种命令来安装具有不同后端的modin: pip install modin[dask] # 安装dask...图2   为了区分他们,在导入时暂时modin.pandas命名为mpd: ? 图3   可以看到因为是Win平台,所以使用计算后端为Dask,首先我们来分别读入文件查看耗时: ?...对于这部分功能,modin会在执行代码时检查自己是否支持,对于尚未支持的功能modin会自动切换到pandas单核后端来执行运算,但由于modin中组织数据的形式pandas不相同,所以中间需要经历转换

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一行代码,Pandas秒变分布式,快速处理TB级数据

Ray是伯克利年初推出的分布式AI框架,能用几行代码,家用电脑上的原型算法转换成适合大规模部署的分布式计算应用。...Pandas on Ray的性能虽说比不上另一个分布式DataFrame库Dask,但更容易上手,用起来和Pandas几乎没有差别。用户不需要懂分布式计算,也不用学一个新的API。...Dask不同的是,Ray使用了Apache Arrow里的共享内存对象存储,不需要对数据进行序列化和复制,就能跨进程通讯。 ?...△ 在8核32G内存的AWS m5.2xlarge实例上,Ray、Dask和Pandas读取csv的性能对比 它将Pandas包裹起来并透明地把数据和计算分布出去。...用户不需要知道他们的系统或者集群有多少核,也不用指定如何分配数据,可以继续用之前的Pandas notebook。 前面说过,使用Pandas on Ray需要替换一行代码,其实就是换掉导入语句。

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更快更强!四种Python并行库批量处理nc数据

前言 当前镜像:气象分析3.9 资源:4核16g 注意分开运行,不然会爆内存 阅读本文你学到: 远超循环批量处理nc文件效率的技巧 四种并行库的基本使用区别 wrf变量极值经纬度索引 Dask...、multiprocessing、ThreadPoolExecutor、和joblib都是Python中用于实现并行计算和任务调度的库或模块,各有其特点和应用场景: Dask Dask 是一个灵活的并行计算库...Dask能够自动将计算任务分解成小块并在多核CPU或分布式计算集群上执行,非常适合处理超出单机内存限制的数据集。Dask还提供了一个分布式任务调度器,可以管理计算资源,优化任务执行顺序。...特长区别: 特长:处理大型数据集,易于扩展到多台机器,高级数据结构支持。 区别:相比其他库,Dask提供了更高级别的抽象,特别适合于数据科学和大数据分析领域。...joblib的一个重要特点是它的智能缓存机制,可以避免重复计算,加速训练过程。 特长区别: 特长:针对数值计算优化,高效的内存缓存,易于在数据科学和机器学习中集成。

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干货 | 数据分析实战案例——用户行为预测

这就是Dask DataFrame API发挥作用的地方:通过为pandas提供一个包装器,可以智能的巨大的DataFrame分隔成更小的片段,并将它们分散到多个worker(帧)中,并存储在磁盘中而不是...dask中的数表处理库 import sys # 外部参数获取接口 面对海量数据,跑完一个模块的代码就可以加一行gc.collect()来做内存碎片回收,Dask DataframesPandas...pyecharts是一款python百度开源的echarts结合的数据可视化工具。...流程:以用户ID(U_Id)为分组键,每位用户的点击、收藏、加购物车的行为统计出来,分别为 是否点击,点击次数;是否收藏,收藏次数;是否加购物车,加购物车次数 以此来预测最终是否购买 # 去掉时间戳...、是否收藏收藏次数之间存在一定相关性,但经验证剔除其中之一纳入全部变量效果基本一致,故之后使用全部变量建模。

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