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10X Cell Ranger ATAC 算法概述

执行此步骤是为了修复条形码(barcode,细胞的标识)中偶尔出现的测序错误,从而使片段与原始条形码相关联,从而提高数据质量。16bp条形码序列是从“I2”索引读取得到的。每个条形码序列都根据正确的条形码序列的“白名单”进行检查,并计算每个白名单条形码的频率。我们试图纠正不在白名单上的条形码,方法是找出所有白名单上的条形码,它们与观察到的序列之间的2个差异(汉明距离(Hamming distance)<= 2),并根据reads数据中条形码的丰度和不正确碱基的质量值对它们进行评分。如果在此模型中,未出现在白名单中的观察到的条形码有90%的概率是真实的条形码,则将其更正为白名单条形码。

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如何隐藏Code39码的星号

CODE 39是 Intermec公司在1975年研制成功的。包括数字、字母和一些符号在内,条形码共包括43个字符。由于可以处理字母,CODE 39在工业领域必不可少,用于汽车、电子等工厂自动化行业。Code 39码支持26个英文大写字母(A-Z),十个数字(0-9),以及符号(-、.、_(空)、*、$、/、+、%)。可以对任意长度的数据进行编码,Code 39码用于物流跟踪、生产线流程等方面,是比较常用的条形码类型之一。39码的起始码和终止码为固定的星号“*”,即39码前后各有一个星号“*”来标识条形码的开始和结束。因为有些用户制作条码时,不需要显示头尾的星号,所以下面我们就介绍如何隐藏这个起始码和终止码。

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《软件工程导论第6版》--张海藩 牟永敏 课后答案及其详解 第4章 形式化说明技术

1.举例对比形式化方法和欠形式化方法的优缺点。 形式化说明: 优点:(1)简洁准确的描述物理现象,对象获动作的结果。 (2)可以在不同软件工程活动之间平滑的过度。 (3)它提供了高层确认的手段。 缺点:大多形式化的规格说明主要关注系统的功能数据,而时序的问题,控制和行为等方面的需求却更难于表示。 非形式化说明: 优点:难度低 缺点:可能存在矛盾,二义性,含糊性,不完整性级抽象层次混乱等问题 以一个简单的俄罗斯方块游戏系统规格说明为例,用自然语言描述如下: 游戏的每个状态对应一个游戏界面,开始状态下,但变量cd_start=1是进入正常游戏的状态,cd_start=2时 进入读取游戏状态,cd_start=3是进入得分榜界面查看。在得分榜界面按任意键返回开始界面,在读取游戏界面,当游戏数据读取完成后进入正常游戏状态,正常游戏状态下,同时按下左键和右键进入储存游戏界面,数据储存结束后返回正常游戏状态,在正常游戏状态下,如果变量game_res=0,则游戏结束,进入游戏结束画面。可见,用自然语言书写的系统规格说明书,罗嗦繁杂,并且可能存在矛盾,二义性,含糊性,不完整性及抽象 层次混乱等问题。

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