https://hbctraining.github.io/Intro-to-R/lessons/04_introR-data-wrangling.html
摘要: 你是否为研究数据挖掘预测问题而感到兴奋?那么如何开始呢,本案例选自Kaggle上的数据竞赛的一个数据竞赛项目《泰坦尼克:灾难中的机器学习》,案例涉及一个小型数据集及到一些有趣且易于理解的参数,是一个完美的机器学习入口。 泰坦尼克号在进行从英国到纽约的处女航时,不幸的撞到了冰山上并沉没。在这场比赛中,你必须预测泰坦尼克号上乘客们的命运。 在这场灾难中,惊恐的人们争先恐后地逃离正在沉没的船是最混乱的事。“女士和儿童优先”是这次灾难中执行的著名准则。由于救生艇数量不足,只有一小部分乘客存活下来。在接
提示:R-project网站 https://www.r-project.org/
在R中,一个object可以是任何可以赋值给变量的东西(数据结构、函数、甚至是graph),一个object有两个重要的东西叫mode和class,前者决定这个object的存储方式(numeric,character,logical),后者决定函数如何处理这个object。虽然有object的概念,但是R本身仍然是一种自顶向下式的编程方式,大部分功能都是通过各式各样的函数来实现的。
变量可归结为名义型、有序型或连续型变量。名义型变量是没有顺序之分的类别变量。类别(名义型)变量和有序类别(有序型)变量在R中称为因子(factor)。因子在R中非常重要,因为它决定了数据的分析方式以及如何进行视觉呈现。因子(factor)是R语言中比较特殊的一个数据类型, 它是一个用于存储类别的类型,举个例子,从性别上,可以把人分为:男人和女人,从年龄上划分,又可以把人分为:未成年人(<18岁),成年人(>=18)。R把表示分类的数据称为因子,因子的行为有时像字符串,有时像整数。因子是一个向量,通常情况下,每个元素都是字符类型,也有其他数据类型的元素。因子具有因子水平(Levels),用于限制因子的元素的取值范围,R强制:因子水平是字符类型,因子的元素只能从因子水平中取值,这意味着,因子的每个元素要么是因子水平中的字符(或转换为其他数据类型),要么是缺失值,这是因子的约束,是语法上的规则。
采取大量单独不完美的模型,他们的一次性错误可能不会由其他人做出。如果我们对所有这些模型的结果进行平均,我们有时可以从它们的组合中找到比任何单个部分更好的模型。这就是整体模型的工作方式,他们培养了许多不同的模型,并让他们的结果在整个团队中得到平均或投票。
R语言的数据类型中,因子(Factor)型比较特殊,也让许多初学者感到难以理解。其实就像整型用来存储整数、字符型用来存储字符或字符串类似,因子型是用来存储类别的数据类型,因子型变量因此是离散变量。
任何数据分析的第一步都是按照所需要的格式创建数据集。在 R 中,这个任务包括两个步骤:首先选择一种数据结构来存储数据,然后将数据输入或者导入这个数据结构中。下面介绍 R 中用于存储数据的多种数据结构。
今天这篇介绍数据类型中因子变量的运用在R语言和Python中的实现。 因子变量是数据结构中用于描述分类事物的一类重要变量。其在现实生活中对应着大量具有实际意义的分类事物。 比如年龄段、性别、职位、爱好,星座等。 之所以给其单独列出一个篇幅进行讲解,除了其在数据结构中的特殊地位之外,在数据可视化和数据分析与建模过程中,因子变量往往也承担中描述某一事物重要维度特征的作用,其意义非同寻常,无论是在数据处理过程中还是后期的分析与建模,都不容忽视。 通常意义上,按照其所描述的维度实际意义,因子变量一般又可细分为无序因
上次介绍了生存分析中的寿命表、K-M曲线、logrank检验、最佳切点的寻找等,本次主要介绍Cox回归。
写在前面:公众号又被我搁置好久,闲来无事,写写近期学的R语言吧,主要分为两个部分写,一主要为数据处理,二为ggplot作图。这两个部分将生信分析的绝大多数常用命令都讲到了,作为R语言入门是够用的,但是学海无涯,以此只是作为一个引子,想要进步还是要自己多学多练,举一反三才行。
开放数据库连接(Open Database Connectivity,ODBC)是为解决异构数据库间的数据共享而产生的,现已成为WOSA(The Windows Open System Architecture(Windows开放系统体系结构))的主要部分和基于Windows环境的一种数据库访问接口标准ODBC 为异构数据库访问提供统一接口,允许应用程序以SQL 为数据存取标准,存取不同DBMS管理的数据;使应用程序直接操纵DB中的数据,免除随DB的改变而改变。用ODBC 可以访问各类计算机上的DB文件,甚至访问如Excel 表和ASCI I数据文件这类非数据库对象。
使用rbind(),操作同cbind() 加和 colSums() 或 rowSums()
R是现今最受欢迎的数据分析和可视化平台之一。它是自由的开源软件,并同时提供Windows、Mac OS X和Linux系统的版本。在接下来的时间,我将把掌握、精通这个软件所需的技能学习过程以系列文章的形式发表,记录我的学习过程,供大家参考,一起有效地使用它分析自己的数据。工欲善其事必先利其器,学习R语言数据分析,第一步自然是R安转。R可以在CRAN上免费下载,安装过程可以参考我前面的视频教程
Data Frame一般被翻译为数据框,感觉就像是R中的表,由行和列组成,与Matrix不同的是,每个列可以是不同的数据类型,而Matrix是必须相同的。
如今数据分析如火如荼,R与Python大行其道。你还在用Excel整理数据么,你还在用spss整理数据么。
学习R会慢慢的发现,数据的前期准备通常会花费很多的时间,从最基础的开始学,后面逐渐使用更便利的工具(R包)解决实际的问题。
计算机语言的学习并不困难,关键是一定要由浅入深的实际操作练习。也许最开始的比较简单,学习者一带而过没有实际操作,之后的进一步学习很可能会陷入不知所云的困境,实际操作所带来的感觉是无法替代的,其价值也是非常重要的。
漂亮的圆形图。我不确定对数据分析师本身是否有额外的好处,但如果能吸引决策者的注意,那对我来说就是额外的价值。
个人理解,向量是有方向的,由大于等于2个元素构成的数据类型。也就是说,向量的所有元素必须属于同种模式(mode),或数据类型(见1.2),比如数值型,字符型等。其类型可以用typeof()查看。 标量只含有一个元素,在R中没有0维度或标量类型。单独的数字或字符串本质是一元向量。
今天分享R语言中的柱形图,所有图表语法都基于ggplot2包中的ggplot函数完成 。 其实R语言本身就带有各种作图函数,比如plot、bar、pie等,而且语法非常简单明了,为什么还要用ggplot2这种语法独立性很强、自成体系的作图包来作图呢? 一个例子就能感受到: plot(mpg$cty,mpg$hwy)#R语言内置散点图函数(无需加载任何辅助工具包) ggplot(mpg,aes(cty, hwy)) + geom_point(colour="steelblue")+labs(x = "City
如果我们对所有这些模型的结果进行平均,我们有时可以从它们的组合中找到比任何单个部分更好的模型。这就是集成模型的工作方式
在讨论分类时,我们经常分析二维数据(一个自变量,一个因变量)(点击文末“阅读原文”获取完整代码数据)。
但在实际生活中,有更多的观察值,更多的解释变量。随着两个以上的解释变量,它开始变得更加复杂的可视化。
1、R中的数据结构-Array #一维数组 x1 <- 1:5; x2 <- c(1,3,5,7,9) x3 <- array(c(2, 4, 6, 8, 10)) #多维数组 xs <- array(1:24, dim=c(3,4,2)) #访问 x1[3] x2[c(1,3,5)] x3[3:5] xs[2, 2, 2] xs[2, 2, 1] #增加 x1[6] <- 6 x2[c(7, 9, 11)] <- c(11, 13, 15) #动态增加 x1[length(x1) + 1] <
[ 导读 ]无论数据分析的目的是什么,将数据导入R中的过程都是不可或缺的。毕竟巧妇难为无米之炊。utils包是R语言的基础包之一。这个包最重要的任务其实并不是进行数据导入,而是为编程和开发R包提供非常实用的工具函数。使用utils包来进行数据导入和初步的数据探索也许仅仅只是利用了utils包不到1%的功能,但这1%却足以让你在学习R语言时事半功倍。
R数据处理能力非常强大,而且输出也非常灵活。当然在R里面的输出都是print字符形式,我们在R里面看到结果很一目了然,但是往往需要把这些结果放在三线表里面。 在临床研究中,我们经常要用到三线表来展示数据与统计值。R可以输出统计参数及检验参数,一个个往上粘贴很困难。
气泡图是一种多变量图表,是散点图的变体,也可以认为是散点图和百分比区域图的组合[1]。气泡图最基本的用法是使用三个值来确定每个数据序列,和散点图一样。气泡图通过气泡的位置及面积大小,可分析数据之间的相关性。
ggplot2是由Hadley Wickham创建的一个十分强大的可视化R包。按照ggplot2的绘图理念,Plot(图)= data(数据集)+ Aesthetics(美学映射)+ Geometry(几何对象)。本文将从ggplot2的八大基本要素逐步介绍这个强大的R可视化包。
所有的数据集合可以分为三类,连续型,名义型和有序型。连续型例如1 2 3 4 5 8 9 10,名义型如sample1 sample2 sample3 ,而有序型 good better best;周一,周二,周三……等。在R中名义型变量和有序性变量称为因子,factor。这些分类变量的可能值称为一个水平level,由这些水平值构成的向量就称为因子。因子主要用于计算频数,可以用来分组。可以通过factor()函数中的labels选项对因子的值进行批量修改。
本期继续介绍git上的神包,autoReg,如果你认为它只能像table1一样的完成统计表的输出, 那你就小看它啦!~ 它更为重要的应用就是单因素回归分析和多因素回归分析等等。 应用场景:危险因素探索、预后因素探索等。
引用是个别名,当建立引用时,程序用另一个变量或对象的名字初始化它,从那时起,引用就作为目标的别名而使用,对引用的改动就相当于对目标的改动。
导读:无论数据分析的目的是什么,将数据导入R中的过程都是不可或缺的。毕竟巧妇难为无米之炊。
HashMap 主要用来存放键值对,它基于哈希表的 Map 接口实现,是常用的 Java 集合之一,是非线程安全的。
这篇文章讲述的是R语言中关于数据框的相关知识。希望这篇R语言文章对您有所帮助!如果您有想学习的知识或建议,可以给作者留言~
结构体的定义 结构体是将零个或者多个任意类型的命令变量组合在一起的聚合数据类型。 每个变量都叫做结构体的成员。 其实简单理解,Go语言的结构体struct和其他语言的类class有相等的地位,但是GO语言放弃了包括继承在内的大量面向对象的特性,只保留了组合这个基础的特性。 所有的Go语言类型除了指针类型外,都可以有自己的方法。 先通过一个下的例子理解struct,下面的这个例子用于定义一个student的struct,这个机构体有以下属性:Name,Age,Sex,Score,分别表示这个学生的名字,年龄,
分类数据通常以表格的形式来描述。这一部分就来为大家介绍如何用你的数据创建一个表格及计算相关的频率。
R是一种语法非常简单的表达式语言(expression language),大小写敏感。可以在R环境下使用的命名字符集依赖于R所运行的系统和国家(系统的locale 设置)、允许数字、字母、“.”和“_”
R的数据结构是数据类型的封装方式,就是怎么把各种数据类型的数据组合起来,储存相同类型的数据的(同质的),储存不同类型的数据的(异质的),
在lattice图形中,lattice函数默认的图形参数包含在一个很大的列表对象中,你可通过trellis.par.get()函数来获取,并用trellis.par.set()函数来修改。show.settings()函数可展示当前的图形参数设置情况。查看当前的默认设置,并将它们存储到一个mysettings列表中:
R是一种语法非常简单的表达式语言(expression language),大小写敏感。 可以在R 环境下使用的命名字符集依赖于R 所运行的系统和国家(系统的locale 设置),允许数字,字母,“.”,“_”
大家好,在之前的文章中我们说过VSCode的优点就是有许多优秀的插件加持,今天就给大家推荐一款能让你更方便调试Python代码的神器扩展LiveCode先来看看它是如何工作的
本来找了好久没找到可以实现这个功能的R包,都打算自己写个包了,没想到这几天找到了!
在使用 R 语言的过程中,需要给函数正确的数据结构。因此,R 语言的数据结构非常重要。通常读入的数据并不能满足函数的需求,往往需要对数据进行各种转化,以达到分析函数的数据类型要求,也就是对数据进行“塑形”,因此,数据转换是 R 语言学习中最难的内容,也是最重要的内容。
第一自变量h与与第二自变量sex是等长的, 对应元素分别为同一人的身高和性别, tapply()函数分男女两组计算了身高平均值
因子分析(factor analysis)因子分析的一般步骤factor_analyzer模块进行因子分析使用Python实现因子分析初始化构建数据将原始数据标准化处理 X计算相关矩阵C计算相关矩阵C的特征值 和特征向量 确定公共因子个数k构造初始因子载荷矩阵A建立因子模型将因子表示成变量的线性组合.计算因子得分.
领取专属 10元无门槛券
手把手带您无忧上云