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我的R语言小白之梯度上升和逐步回归的结合使用

我的R语言小白之梯度上升和逐步回归的结合使用 今天是圣诞节,祝你圣诞节快乐啦,虽然我没有过圣诞节的习惯,昨天平安夜,也是看朋友圈才知道,原来是平安夜了,但是我昨晚跟铭仔两个人都不知道是平安夜跑去健身房玩了,给你们看下我两的练了一段时间的肌肉。 📷 📷 好了不显摆了,进入我们今天的主题通常在用sas拟合逻辑回归模型的时候,我们会使用逐步回归,最优得分统计模型的等方法去拟合模型。而在接触机器学习算法用R和python实践之后,我们会了解到梯度上升算法,和梯度下降算法。其实本质上模型在拟合的时候用的就是最大似然估

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深入浅出:隐马尔科夫模型

隐马尔科夫模型(Hidden Markov Model,HMM),和回归、分类那些处理相互独立的样本数据的模型不同,它用于处理时间序列数据,即样本之间有时间序列关系的数据。从这一点来说,它和卡尔曼滤波算法很像。事实上,HMM和卡尔曼滤波的算法本质是一模一样的,只不过HMM要假设隐藏变量是离散的,而卡尔曼滤波假设隐藏变量是连续的。隐藏变量是HMM里的关键概念之一,可以理解为无法直接观测到的变量,即HMM中Hidden一词的含义;与之相对的是观测变量,即可以直接观测到的变量;HMM的能力在于能够根据给出的观测变量序列,估计对应的隐藏变量序列是什么,并对未来的观测变量做预测。

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深入机器学习系列12-高斯混合模型

高斯混合模型   现有的高斯模型有单高斯模型()和高斯混合模型()两种。从几何上讲,单高斯分布模型在二维空间上近似于椭圆,在三维空间上近似于椭球。在很多情况下,属于同一类别的样本点并不满足“椭圆”分布的特性,所以我们需要引入混合高斯模型来解决这种情况。 1 单高斯模型   多维变量服从高斯分布时,它的概率密度函数定义如下:   在上述定义中,是维数为的样本向量,是模型期望,是模型协方差。对于单高斯模型,可以明确训练样本是否属于该高斯模型,所以我们经常将用训练样本的均值代替,将用训练样本的协方差代替。假设训练

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Bioinformatics | BERT4Bitter:改进苦味肽预测的基于Transformer(BERT)模型的双向编码器

今天给大家介绍的是玛希多大学数据挖掘和生物医学信息学中心发表在Bioinformatics上的文章“BERT4Bitter: a bidirectional encoder representations from transformers (BERT)-based model for improving the prediction of bitter peptides”众所周知,许多药物固有地具有苦味,并且强烈的努力旨在淡化苦味以改善味道,从而改善药物摄入的依从性,因此,开发用于预测肽苦味的快速和准确的鉴定工具是药物开发和营养研究中的重要组成部分。目前只有一种计算方法,即iBitter-SCM,交互验证和独立测试集的准确率分别为0.871和0.844。虽然iBitter-SCM产生了相当高的预测精度,但它的整体预测性能仍有改进的空间,因此非常希望开发一种新的基于机器学习的预测器。本研究提出BERT苦味方法作为第一个基于Transformer(BERT)的预测苦味肽的双向编码器表示。在本研究中,每个肽序列被视为基于自然语言处理技术的句子,其中20个氨基酸中的每一个都被视为单词DSDFF自动生成特征描述符,而不需要特征编码的系统设计和选择。

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