R中代码的运行过程 在介绍!!运算符之前，有必要先了解一下R中的代码是如何运行的。 在R console中输入一个代码，R就会返回代码的结果。...下面完成的上述操作的所需的函数都是rlang包中相应函数。 如何使用!!...这里有一个小改动，由于var_name求值后是一个Symbol，在baseR是中无法将数据赋值给Symbol的，因此需要将=替换为:=。其他细节和上述例子都是类似的。...1 0 3 1 2 # 5 0 0 3 2 3 # 6 1 0 3 1 2 上述虽然可以完成，但是实际使用时，可能更倾向于将四个新变量放置到同一个数据框中...PS：对于ggplot2而言也是一样的，它的aes也是不能直接使用变量传入列名，如果想要使用赋值了字符串的变量来传值的话，可以如上述操作。 但是也有更简单的的办法，它是？
给一个学员设置R语言安装以及R包环境，遇到了一个超级有意思的现象，首先呢，在中国大陆网络设置太难了，不出意外GitHub在线安装失败： > if (!...包的压缩包文件网络传递给学生。...发现这个包的依赖不少啊： Installing 42 packages: sitmo, RcppAnnoy, crayon, cli, glue, rlang, pillar, lifecycle, deldir...SeuratObject’, ‘Seurat’这个程序包，因此不会被安装 将程序包安装入‘C:/Users/win10/Documents/R/win-library/4.1’ (因为‘lib’没有被指定) 尤其是： 有二进制版本的...) : 拷贝C:\Users\win10\Documents\R\win-library\4.1\00LOCK-tibble\tibble\libs\x64\tibble.dll到C:\Users\
该数据集包含4种植物物种的不同特征，这些特征可区分33种不同物种（Setosa，Virginica和Versicolor）。但是，我的问题需要一个二元分类问题，而不是一个多分类问题。...下面的代码很直白的绘制了我们的图形（1个顶部图占满了网格空间的长度，2个中等大小的图，另一个单个图以及底部另外2个图） (plt1) / (plt2 + plt3) 或者，我们可以将绘图重新布置为所需的任何方式...（每个组合一个列表），并用合成数据（或每个变量组合的最小值到最大值的数据）给列表赋值。...方面的专家，所以我相信有更好的模型产生更好的决策边界，但是用purrr、map来训练不同的机器学习模型是件很有趣的事。...翻译组招募信息 工作内容：需要一颗细致的心，将选取好的外文文章翻译成流畅的中文。如果你是数据科学/统计学/计算机类的留学生，或在海外从事相关工作，或对自己外语水平有信心的朋友欢迎加入翻译小组。
由用户指定列名和表达式，而你想要你的函数能够有aes()同样的方式执行非标准计算。 如果你已经像上面的例子一样事先知道了列名，你可以使用来自rlang[2]的代词.data指代你要使用的图层数据。...这种tidy eval计算符号会捕捉用户提供的表达式，并将其传递给使用非标准计算的函数，如aes()或vars()。...然而，提供一个 plot()用于一个对象的可视化总结帮助用户理解该对象是有帮助的。为了满足你的所有用户，我们建议写一个函数将这个对象转换为一个数据框（如果更加复杂，可以是包含数据框的列表）。...对于上面的例子，函数可能是这样的： discrete_distr_data <- function(x) { tibble::tibble( value = names(x), probability...如果你的包有一个默认的可视化主题，正确的加载方法是使用一个返回默认主题的函数： default_theme <- function() { theme_custom() } mpg_drv_summary2
pak::pkg_deps_tree("tibble") # 绘制依赖树 # 从URL安装R包 pak::pkg_install("url::https://cran.rstudio.com/src.../contrib/ggh4x_0.2.8.tar.gz") # 解释包之间依赖关系 pak::pkg_deps_explain("tibble","rlang") 开发版包安装 ❝安装github上的包最主要的问题也许就是找到正确的安装命令..."packagefinder",dependencies = TRUE) library(packagefinder) go("ggraph","website") # 打开ggraph网站，速度可能稍慢...包安装会有数据缓存保留，有需要可以清理节省空间。...❞ # 清理缓存 pak::meta_clean(force = TRUE) pak::cache_clean() 关注下方公众号下回更新不迷路 ❝本节介绍到此结束，有需要学习R数据可视化的朋友欢迎到淘宝店铺
R 包也一样，有时候明明我需要用的是xx 包的xx 函数，却被R 误当作aa 包的xx 函数。虽然它们都叫做xx 函数，但功能却是大相径庭。 这时候有两种应对的思路。...一个是从使用者层面，一个是从开发者层面。 开发者：R告诉你 你错了 我们如何避免这样的问题呢。...其实作为R 包的开发者来说，最好还是显式调用： > tidyr::tibble(mat) 但有的时候，这样做也比较麻烦。要是R 可以帮我们区分，环境中是否发生冲突就好了。...而且，有得人开发的R 包使用的函数，很有可能跟你使用的其他函数撞名，直接去修改别人包中函数的源代码，成本就太大了： > showDatabaseCategory(CellChatDB) Error: Problem...Run `rlang::last_error()` to see where the error occurred. 这时候我们可以先看看环境中哪些包有该撞名的函数： ?
统计编程我惹不起就算了，你一个安装包我还搞不定了？？？...事实证明，包还是非常难安装的，一边安装，一边想着，一些收费的软件是有原因的…… 目录： 1. ggplot2包安装报错 2，安装rlange1.0.0 3. 安装Rtools3.6 4....问题来了，我有两个选择： 第一个：下载旧版本的ggplot2，它支持rlang0.4.11版本，但是很多更新的函数我无法使用了。测试了一下，可以实现。但我要用第二个。...在这里插入图片描述 找到rlang包的链接：https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/rlang/rlang_1.0.1.tar.gz 然后复制包的链接...这种方法可以推广到R3.5，R4.0，R4.1，windows系统安装Rtools就是为了防止本地编译时出错，里面有C，C++，Fortran等各种编译器，一篮子满满的。有了它，就不怕R包安装了。
这是一个rlang包中定义的一个操作符函数。 它的本质原理在于：R在运行代码时，会先将代码解析成叫做expression的中间态，然后再执行expression即可获取代码结果。...在rlang包中，expr函数类似于expression函数（expr函数暂停后的代码对象是call，基本上和expression是一个意思就行，以下统一使用expression），而eval_tidy...等操作符是rlang定义的操作符，list函数并不支持。为了解决这个问题，可以使用rlang定义的list2函数，它类似于list函数，只不过宽容度更高。 eval(expr(list(!!...x1 := 1, '{x2}' := 2) #[1] 3 由于{}是字符串插值的语法，所以可以有高级的写法，比如： var % head %>% mutate('...是没有引号包括的，不是一个字符串。
所以很多人喊着中国教育有多大的问题，结果还是拼了命让自己的孩子好好学习，现在学历对于后续的发展还是有着非常决定性的因素，社会上还是很多人因为学历不高做出很大的成绩，这是不可否认的事实，但毕竟从比例上还是少数...曾经有个小学毕业的人对于编程特别的感兴趣，然后自己买了很多关于编程的书籍，一心想要找个编程的老师给指导，这个时候不要指望着老师给出多少的指导，关键在于自己要下定多大的决心。 ?...现在做个程序员如果是在一线城市月薪过万不是什么难事，只需要初级的水平就够了，所以能够拿到多少钱跟所处的城市的经济的发展水平有着直接的关系，可能讲现在的很多城市干一辈子未必能够到达这个数目，选择在很大程度上决定了自己的大方向...，如果选择在一线城市对于技能的要求也会变得非常高，而且一线城市的消费水平也是非常巨大，特别是住房的问题就是一个难以逾越的鸿沟，所以选择好什么的城市至于能拿到多少薪资靠的是后续自己的努力。...，一个普通人没有学历自学编程拿到月薪过万也是存在可能性的，但希望大家都不要指望走这种低概率的方式去做事。
简介 R-Ladies是一个世界性的促进R语言社区性别多样性的组织，本文分析了这个组织的粉丝成员分布信息。 这篇文章主要基于d4tagirl,稍微有所修改。...（gganimate有两个包，本文用到的是老的版本。2018美日科学家因免疫治疗得诺贝尔生理医学奖|动图展示历年生理学奖中用到的是新版本，用法不太一致，还请注意。）...devtools::install_github("dgrtwo/gganimate", ref = "v0.1.1”) 另外一个依赖的软件是imageMagick软件，这是一个需要单独下载并安装在PC...或服务器端的图形编辑软件，下载地址：https://imagemagick.org/script/index.php，选择适合自己电脑系统的一个版本进行安装。...动画展示 为了利用gganimate进行动态展示，需要构建一个映射变量：时间 (后面中的frame)。
以我浅薄的认知来说，S3 挺没必要学的，大概了解下，会用就行了QAQ。 简介 之前的部分，我们对R 的面向对象有了一个大致的了解。这里，我们追随R 的发展步伐，由易到难，由简入繁，先从S3 开始。...如果一个java 开发者，看到了S3 风格的代码，他可能会头疼；但是，你是一个灵活的R 工作者，自由和洒脱是你的天性。...，最好写一个helper 函数，其打包了建造器及验证器，并有如下规范： 函数名和类相同； 其输出是建造器和验证器的组合； 对于各种error 产生的异常有明确的错误提示； 周全的传参及类型转换设定。...sloop 包也提供了一些函数去寻找泛型函数对应的类，以及不同类对应的泛型函数： s3_methods_generic("mean") #> # A tibble: 7 x 4 #> generic...这同样表示，一个S3 对象可以有多个类属性，通过向量表示： class(ordered("x")) #> [1] "ordered" "factor" class(Sys.time()) #> [1]
最近在R4上安装Seurat V4 的时候，有可能会遇到这样的报错： Error: package or namespace load failed for ‘Seurat’: object ‘markvario...升级了，这是一个分析空间数据的R包，在Seurat中是分析空间转录组数据的支持包，对应的主要函数是Seurat::RunMarkVario()。...这个工作已经由Seurat的开发者完成了，当然可能提交到CRAN还需要一点时间，但是根据Github上面的信息，应该已经同步好了。 修改Seurat的命名空间。...所以，在安装R包之前要知道这个包在那个仓库放着的，百度R包名字即可。 R包的基本形态有以下几种： ? 这些都对应一个文件，可以在.libPath()输出的路径下查看。...那么，如何快速查看一个R包的依赖环境呢？ library(Seurat) packageVersion('Seurat') [1] ‘4.0.0’ 我们使用pacman这个R包开查看。
简介 R-Ladies是一个世界性的促进R语言社区性别多样性的组织，本文分析了这个组织的粉丝成员分布信息。 这篇文章主要基于d4tagirl,稍微有所修改。...（gganimate有两个包，本文用到的是老的版本。2019年诺贝尔化学奖揭晓 |八一八，那些年的诺贝尔化学奖中用到的是新版本，用法不太一致，还请注意。）...devtools::install_github("dgrtwo/gganimate", ref = "v0.1.1”) 另外一个依赖的软件是imageMagick软件，这是一个需要单独下载并安装在PC...或服务器端的图形编辑软件，下载地址：https://imagemagick.org/script/index.php，选择适合自己电脑系统的一个版本进行安装。...动画展示 为了利用gganimate进行动态展示，需要构建一个映射变量：时间 (后面中的frame)。
scaterpackage提供了几个非常有用的功能来简化可视化。 单细胞RNA-seq的一个重要方面是控制批次效应。批量效应是在处理过程中添加到样品中的技术假象。...例如，如果在不同实验室中或甚至在同一实验室中的不同日期制备两组样品，那么我们可以观察到一起处理的样品之间更大的相似性。在最坏的情况下，批量效应可能被误认为是真正的生物变异。...理想情况下，我们期望看到来自同一个体的批次组合在一起，并且对应于每个个体的不同组。...为什么第一个PC变化所引起的方差分数如此显着？ 提示使用ntop函数的参数plotPCA。 我们的答案 ? ? 如果您的答案不同，请将您的代码与我们的代码进行比较（您需要在打开的文件中搜索此练习）。...此外，tSNE要求您提供的值perplexity反映用于构建最近邻网络的邻居数量; 高值会创建一个密集的网络，将细胞聚集在一起，而低值会使网络更稀疏，从而允许细胞群彼此分离。
R数据科学-2 是用于清洗数据的工具，如dplyr一样，其中每一列都是变量，每一行都是观察值，并且每个单元格都包含一个值。...“ tidyr”包含用于更改数据集的形状（旋转）和层次结构（嵌套和“取消嵌套”），将深度嵌套的列表转换为矩形数据框（“矩形”）以及从字符串列中提取值的工具。...以前是reshape包的内容，当然reshape可以做，但是现在tidyr 处理起来更简洁方便，快速。易于理解。 数据长宽转化 创建一个数据df，然后来进行数据长宽转化实例操作。...), Shanghai=c(2,5,3), Beijing=c(12,23,16), Guangdong=c(7,3,6)) df # A tibble...，如上述例子中， 上海id=1的有2个，然后重复shanghai2次，5次，3次，形成新增一列。
Bioactivity descriptors for uncharacterized chemical compounds 本地存储文件名 s41467-021-24150-4.pdf 公众号后台有读者留言问到了这个论文里的一些图的实现办法...复现起来还是比较麻烦的。浏览全文的时候发现了其中一个带有底纹的柱形图。这个还是比较有用的。因为有的期刊可能会要求配色只能用黑白灰。区分不同的分组加上底纹可能会比较好看。...最近又发现了一个R包ggpattern，画带有底纹的柱形图或者给柱形图添加图片都非常方便。...()，填充的内容有4个，分别是 'stripe' (default), 'crosshatch', 'point', 'circle' 做一个简单的柱形图看下效果 df<-data.frame(x=LETTERS...按照提示运行rlang::last_error(),返回内容 Don't know the function for pattern point Backtrace
之前写的很多单细胞笔记都是基于V4版本的Seurat系列包，其中SeuratData 是 R 语言中 Seurat 包提供的一个数据包，旨在为使用 Seurat 进行单细胞RNA测序分析的用户提供方便的测试数据...getOption('timeout') options(timeout=10000) # InstallData("pbmc3k") data("pbmc3k") 但是最近发现自己的一个电脑里面是没有...: CRAN packages only 3: None 4: rlang...0.1.16 Matrix_1.6-1.1 biomaRt_2.56.1 [4] igraph_1.5.1 umap_0.2.10.0 tibble...有了这些压缩包文件，使用 前面的 install.packages 函数指定各个包文件路径，然后加上 type = "source", 就可以本地安装了，无需重新在线下载啦 ： install.packages
数学中我们常见到函数的概念。但是你了解C语言中的函数吗？...需要全部记住吗？...4.2 传址调用 传址调用是把函数外部创建变量的内存地址传递给函数参数的一种调用函数的方式。 这种传参方式可以让函数和函数外边的变量建立起真正的联系，也就是函数内部可以直接操 作函数外部的变量。...写一个函数，每调用一次这个函数，就会将 num 的值增加1。 这里我们用到传址调用，每次+1即可。...每个函数都是互相独立的，不能嵌套定义。 5.2 链式访问 把一个函数的返回值作为另外一个函数的参数。
解释一下： 光看这个图，可能还不是特别明白，给大家举个例子就明白了。 我们就来声明一个学生类型，指定该学生类型拥有的成员变量有姓名，年龄，性别，学号。...); return 0; } 再嵌套一个大括号来初始化被嵌套的那个结构体。...那我们将结构体作为函数参数进行传参也是这样： 1.传值调用：直接将结构体变量作为实参传递给形参，形参将是实参的一份临时拷贝。...2.传址调用：将结构体变量的地址作为实参传递给形参，用一个结构体指针接收，传址调用可以通过形参改变结构体变量的值，而传值调用不能。...如果传递一个结构体对象的时候，结构体过大，参数压栈的的系统开销比较大，所以会导致性能的下降。 而如果我们传的是地址，地址无非就是4或8个字节，那参数压栈的开销就比较小，效率可能就会提高很多。
可能是因为其身为大学教授，因此她总能够用很生动有趣的方式将复杂的问题简化成通俗易懂的知识传递给“小白”，强烈建议有英文基础的读者能够搜集一些她的主题演讲或者书籍。...重复的列名也会发出警告，并且会在重复列名前加数字序号以做区分 col_types 列数据类型。可以有两种传参形式，具体如下。 1）NULL，默认值。函数会自动解析每一列数据的类型。 2）指定变量类型。...函数可以直接调取已经建立连接的数据库中的指定数据，并保存为tibble格式的数据集。...：自动将嵌套的数据集转换成非嵌套的平面数据集 …：设置显示方法 首先以JSON常见的数组形式创建一个字符串向量，保存为example。...4个元素即代表共有4个值，每一个值都以列表的形式返回。 当JSON格式的原始数据文件有多重嵌套时，可以通过设置参数来查看数据结构和正确读取数据。
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