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隐马尔科夫模型 和动态贝叶斯网络

总之能产生一系列事件地方都能产生有用模式。 考虑一个简单情况:有人(柯南?)试图从一块海藻来推断天气情况。...和交通灯例子不同,我们不能得到一个确定状态转移系统,但是我们还是希望能得到一个天气模式。...简单马尔科夫过程就是一阶过程,每一个状态转移只依赖于其之间那一个状态。注意这和确定系统不一样,因为这种装因是有概率,而不是确定。下面这个图展示了天气这个例子中所有可能一阶转移: ?...某些语音识别设备把内部发音机制作为一个隐藏状态序列,把最后声音看成是一个和隐藏状态序列十分似的可以观察到状态序列。...3.学习 从一个观察集中得到一个隐马尔科夫模型。 第三个问题也是困难问题,根绝观察到序列集来找到一个最有可能HMM,也就是说确定一个最有可能三元组(π,A,B)。

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隐马尔可夫模型攻略

这个序列可以画成一个状态机,不同状态按照这个状态机互相交替,每一个状态都只依赖于前一个状态,如果当前是绿灯,那么接下来就是橙灯,这是一个确定性系统,因此更容易理解和分析,只要这些状态转移都是已知。...在日常生活当中,我们总是希望根据当前天气情况来预测未来天气情况,和上面的交通灯例子不同,我们不能依靠现有知识确定天气情况转移,但是我们还是希望能得到一个天气模式。...注意这和确定性系统不一样,因为这种转移是有概率,而不是确定。 马尔可夫链是随机变量 X1, … , Xn 一个数列。...某些语音识别设备把内部发音机制作为一个隐藏状态序列,把最后声音看成是一个和隐藏状态序列十分似的可以观察到状态序列。...有了这个算法,我们就可以在一堆 HMM ,找到一个满足当前可观察序列模型(前向算法计算出来概率最大)。

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【机器学习研究】隐马尔可夫模型 (HMM) 认真研究

这个序列可以画成一个状态机,不同状态按照这个状态机互相交替,每一个状态都只依赖于前一个状态,如果当前是绿灯,那么接下来就是橙灯,这是一个确定性系统,因此更容易理解和分析,只要这些状态转移都是已知。...在日常生活当中,我们总是希望根据当前天气情况来预测未来天气情况,和上面的交通灯例子不同,我们不能依靠现有知识确定天气情况转移,但是我们还是希望能得到一个天气模式。...注意这和确定性系统不一样,因为这种转移是有概率,而不是确定。 马尔可夫链是随机变量 X1, … , Xn 一个数列。...某些语音识别设备把内部发音机制作为一个隐藏状态序列,把最后声音看成是一个和隐藏状态序列十分似的可以观察到状态序列。...有了这个算法,我们就可以在一堆 HMM ,找到一个满足当前可观察序列模型(前向算法计算出来概率最大)。

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生信爱好者周刊(第 33 期):科研与生活

在这个话题链接文章中有一段话印象深刻:“你有没有时间陪孩子家人和你做啥工作有多忙真没太大关系,关键是你有没有真正把孩子家人放第一位,舍不舍得把时间给他们。”我们从小学会了被爱,但你我也会学会爱人。...生信科技动态 1、Cell|首次大规模高分辨率揭示从一个携带致癌突变单细胞演变为侵袭性肿瘤全过程 研究团队将基于单细胞RNA-seq进化谱系示踪系统引入KP小鼠模型,连续并全面监测了一个携带致癌突变单细胞演变为侵袭性肿瘤全过程...在31%ecDNA样本中发现APOBEC3kataegis事件和染色体外DNA(ecDNA)共同出现,并将这种情况称为kyklonas事件。...,在学习了现有的几千条抗菌肽序列以后,构建了准确率超过90%抗菌肽预测方法,远远超出之前发表基于氨基酸组成和性质进行抗菌肽判定模型。...文章 1、肿瘤克隆进化之不同进化模式 总结了肿瘤克隆进化不同模式,以及各个癌种现有进化模式研究,整个系列都很值得一读。 @mugpeng贡献。

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网络协议 14 - 流媒体协议:要说爱你不容易

是不是和我们日常接触到视频大小明显不符?这是因为我们在传输过程,将视频压缩了。     为什么要压缩视频?按我们上面的估算,一个一小时视频,就有 240G,这个数据量根本没办法存储和传输。...时间冗余:视频序列相邻图像之间内容相似。一个视频连续出现图片也不是突变,可以根据已有的图片进行预测和推断。...视觉冗余:人视觉系统对某些细节不敏感,因此不会注意到每一个细节,可以允许丢失一些数据。 编码冗余:不同像素值出现概率不同,概率高字节少,概率低字节多,类似霍夫曼编码思路。     ...可以看出,I 帧完整,B 帧压缩率最高,而压缩后帧序列,应该是 IBBP 间隔出现。这就是通过时序进行编码。     ...如果客户端、服务端版本号不一致,就不能正常工作; 确定时间戳。视频播放时间是很重要一个元素,后面的数据流互通时候,经常要带上时间差值,因而一开始双方就要知道对方时间戳。

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深入浅出:隐马尔科夫模型

点击蓝字 关注我们 #TSer# 时间序列知识整理系列,持续更新 ⛳️ 赶紧后台回复"讨论"加入讨论组交流吧 ?...隐马尔科夫模型(Hidden Markov Model,HMM),和回归、分类那些处理相互独立样本数据模型不同,它用于处理时间序列数据,即样本之间有时间序列关系数据。...隐藏变量是HMM里关键概念之一,可以理解为无法直接观测到变量,即HMMHidden一词含义;与之相对是观测变量,即可以直接观测到变量;HMM能力在于能够根据给出观测变量序列,估计对应隐藏变量序列是什么...比如,我想输入“从一段字符序列推断对应输入文字”这句话,当我输入“cong”时,输入法给我候选字很多, ?...那么,有没有一种方法即能将当前变量与更早变量关联起来,又不需要那么多参数呢?当然,这里有一种非常强大手段,即引入隐变量,这是机器学习中用简单基础部件表达丰富模型有力手段。

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Nature子刊:高通量蛋白质组学方法学综述

相比之下,液色谱或高效液色谱(HPLC)可以从复杂混合物连续分离数千种蛋白质,并可与质谱结合成为LC-MS,以提高通量。其中,反相液相色谱法(RPLC)是最常用基于LC分离平台。...然后,通过依赖数据发现引擎,对MS数据进行匹配,以确定蛋白质序列数据库目标蛋白质及其相关修饰,这可分为肽段评分、蛋白质评分,最后是蛋白质推断。...还有一种特殊聚类分析,称为时间序列表达网格分析(GATE),用于根据时间序列分析和可视化高维生物分子。...层次聚类分析(HCA)和时间序列表达网格分析(GATE)示例与对已知样本进行分类聚类分析不同,(预测性)判别分析是根据算法在训练集中学习和建立内容对未知样本进行分类,例如不依赖于数据类型支持向量机...生存分析Kaplan-Meier(K-M)曲线是一种时间事件统计方法,用于研究终点事件与时间周期之间关系。它可用于评估生存时间、疾病复发、临床试验、动物研究等。K-M估计是计算生存时间简单方法。

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DL时代代码补全利器,北大出品,效果远超语言模型

变量引用信息、API 序列信息、继承关系信息等等,以自动生成后续代码。...程序元素间逻辑关系:程序代码不同元素之间存在着不同关系,例如程序变量之间引用关系、类之间继承关系、方法与参数之间调用关系等等。...程序语言序列模型:当然,程序语言也具有与自然语言相似的一面,因此可以利用程序标识符之间序列关系建立程序语言模型。aiXcoder 也使用了最新深度学习语言模型对程序序列信息进行建模。 ?...在研究过程,北京大学提出了一系列解决程序语言成分相量化办法,并且在国际上最早发表了相关论文,这些都为 aiXcoder 构造打下了基础。...,是开始进行相关研究团队之一。

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PHP数据结构-交换排序:冒泡、快排(有彩蛋)

交换排序:冒泡、快排 上篇文章我们好好地学习了一下插入类相关两个排序,不过,和交换类排序对比的话,它们真的只是弟弟。甚至可以说,在所有的排序算法出名两个排序都在今天要介绍交换排序中了。...这里其实从代码我们能够从一个地方很快地分辨出一段排序代码是否是交换排序,那就是他们会有一个对于两个元素进行数据交换过程,而且往往在普通情况下会使用一个中间变量。这个我们一会看代码就可以看到。...而且每次循环都会将数据按针对 key 值大小进行左右排列,这也是二叉搜索树核心思想。这个内容我们系列文章没有讲解,大家可以自行查阅相关资料学习。...小彩蛋:交换两个变量值 今天学习内容中都有一处核心代码,就是开始我们说过交换两个变量代码。...不过不少面试题中经常会看到一种题目就是不使用第三个变量,也就是这个临时变量来交换两个变量值。大家有没有踫到过呢?其实有几种方案都可以,我们就来简单说两个。

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聊一聊RPC

再后来,这些服务所在服务器性能被压榨一滴也没有了,没办法,只能将这些服务一个个分在不同机器上,这就是“分布式”。...对于整个项目来说,如果集群某个节点挂了,整个集群仍然可以正常工作,这是一种纵向扩展。 而分布式,是指在多台机器上部署不同模块。...文末我会给出一个简单用 Java 实现 RPC demo,这里先从一个有趣例子出发给出需要解决三个问题:Call ID 映射、序列化和反序列化、网络传输。...Call ID 映射 不知道上面的例子有没有很好解释Call ID 映射、序列化和反序列化、网络传输是什么东西。将上述例子类比到项目中,我们就能很好理解为什么需要解决这些问题了。...所以,在 RPC ,所有的函数都必须有自己一个 ID。这个 ID 在所有进程中都是唯一确定。客户端在做远程过程调用时,必须附上这个 ID。

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Nature子刊:基于静息态EEG功能连接模式识别精神疾病亚型

从一个PTSD数据集rs-EEG重建信号,从信号中提取PEC特征,根据PEC特征确定两种稳定且可复制临床相关亚型。...在计算功率包络线之前,正交化两个脑电信号分析时间序列,PEC消除了零位延迟连接。...利用主成分分析将每个顶点处三维估计源信号降化为主成分一维时间序列。然后在每个顶点小波变换提取分析信号,在小波分析信号基础上计算各顶点功率包络信号,并对其他所有顶点进行正交处理。...三、结果 由于不同频带和脑电图静息状态 (例如,睁眼和闭眼)可能携带不同神经生物学信息,哪种情况具有丰富特征用于亚型识别是先验未知。...这些结果表明,发现亚型可在使用不同脑电图设备、使用不同临床诊断和不同记录时间获得独立数据集之间转移。

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​万字综述 | 图神经网络在时间序列应用:预测、分类、填补和异常检测

在这个风电场示例不同分析任务可以归类为时间序列预测、分类、异常检测和填补。 许多时间序列涉及时间变量之间复杂相互作用(例如效应传播滞后和代表相邻交通传感器变量之间关系)。...实际上,许多时间序列数据在时空上具有特性,系列不同变量捕捉了有关不同位置(空间)信息,这意味着它不仅包含时间信息,还包括空间关系。这在城市交通网络、人口迁移和全球天气预报等场景特别明显。...这使得能够捕捉多样化和复杂关系,包括变量关系(多变量系列不同变量之间联系)和时序间关系(不同时间点之间依赖关系)。...最近,基于StemGNN,Jin等人[29]在理论上证明了使用谱GNN来模拟不同符号时间序列关系好处,例如多变量时间序列强正相关和负相关变量。...由于捕捉不同系列数据样本之间差异化类模式很重要,因此利用给定数据集中不同系列数据样本之间关系有助于对时间序列进行分类。

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求第 K 个数问题

它本身相关问题其实就不少,而且还可以不断演进,成为不同复杂程度问题。 关于这个问题分析和演进,我们不妨从一左一右两条分支——堆排序或者快排,来分别进行。...细化来说,上述第二步这个和 pivot 比较并且往左或者往右扔数逻辑是: 先把当前最左边那个数选举出来作为 pivot(选 pivot 办法有很多,这只是简单一个办法),这里 pivot 变量实际存储是它位置...前面说了,如果这堆数只在一个数组里,有两种办法可以排序,如果是在若干个不同数组里呢?一样可以从快排和堆排序两个思路去分析。...这样问题还是可以基于堆来解决,当然,首先要给每个数组各自排序。思路是类似的。 继续,如果这些数在不同机器上(文件里)呢? 我想这也是个经典问题,这个问题都问烂了。...这个方法改变了思考角度,原本是从一堆数中去找第 k 个数,现在是从中拿出一个数来,去这堆数找它应该在位置。 还蛮有趣

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【经典荐书】Yoshua Bengio大神教你深度学习(705页PDF)

机器学习专家不参与这种竞赛原因,可能是他们那些好解决办法,总是会有企业买单,不必参加类似的比赛来竞争。还有,专家从来都是乐于挑战极限,而不是来面对日常生产环境里面那些非常令人烦躁真实数据。...对于不确定函数,增加深度并不会改进效果。然而,如果函数能够拆分成变量组合形式,深度能够起到很大作用,无论从统计意义(参数少所需训练数据就少)来讲,还是从计算意义(参数少,计算量小)来讲。...3、您觉得机器学习会不会变得和时间序列分析领域一样,很多研究都是封闭,各种知识产权限制? 4、鉴于目前判别式神经网络模型取得进展,您觉得产生式模型未来能有什么发展?...问:有没有人将深度学习应用到机器翻译呢?您觉得基于神经网络方法,什么时候才能在商业机器翻译系统取代基于概率方法呢? 答:我刚开了一个文档,罗列一些机器翻译方面的神经网络论文。...他声称深度学习没有对时间序列建模。人脑是基于一系列传感数据进行思考,人学习主要在于对序列模式记忆,比如你看到一个搞怪猫视频,实际是猫动作让你发笑,而不是像Google公司所用静态图片。

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性能优化实践派与学院派

在做这种优化过程,往往在局部着手,看到一个函数调用必然想到另外一个更快函数调用、看到一个递归总要想办法改成for循环......这种性能优化方式往往会带来一些隐形收益,在短时间内很难直接看到优化结果,即便如此,我们还是要在日常开发中注意本地函数细节性能消耗,大性能问题都是从一点一滴积累出来。...同时我们也会偶尔用压缩技术,压缩一个文件,然后在读取时候再进行解压缩。这就是典型时间换空间。 貌似性能优化总是在做时空转换,那有没有从空间到时间都得到性能提升优化呢?也不是没有。...比如一个简单排序,我们开始用是冒泡排序,相信每个程序员都会编写这个双层for循环冒泡排序,后来改成了快速排序,我们假设快排就是比冒泡排序优秀,时间复杂度空间复杂度都更低。...所以说性能优化在不同时间不同应用程序、甚至不同负责人,会存在不同优化目标。

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金三银四跳槽季,BAT美团滴滴java面试大纲(带答案版)之二:ThreadLocal和Valotile

ThreadLocal和Valotile是两个比较常见知识点,虽然简单,但是能从一定程度上考察一个程序员,对多线程环境下,线程通信和数据安全认知。...办法当然不止一                种,并发包AtomicXXX一样能达到这个效果,原理,差不多,无非是通过锁来实现并发。那么还有没有其他思路呢?...2.分析:多线程编程,我们要解决问题集中在三个方面:         a.原子性,简单例子就是,i++,在多线程环境下,最终结果是不确定,为什么?...b.可见性,通俗解释就是,在A线程对一个变量做了修改,在B线程,能正确读取到修改后结果。...修改也是在内部缓存,但是何时              同步到系统内存是不能确定,有了这个时间差,在并发时候,就可能会导致,读到值,不是最新值。

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【NLP】十分钟快览自然语言处理学习总结

二重马尔可夫链,也是三元语法,三重马尔可夫链,也是四元语法 隐马尔可夫模型思想三个问题 问题1(似然度问题):给一个HMM λ=(A,B) 和一个观察序列O,确定观察序列似然度问题 P...简单直接办法就是0-1法了。简单来说,对于每一篇文章,我们扫描它词语集合,如果某一个词语出现在了词典,那么该词语在词典向量对应元素置为1,否则为0。 在经过上面三步之后,特征提取就完成了。...在本例,我们会使用余弦相似点。我们将第一位用户与其他五位对比,可以发现第一位与其他用户相似度有多少(第一位用户与其他用户相似性。可以在一个单独维度绘制用户间余弦相似性。)。...在本例,我们假设n=2,也就是说取两名与第一位用户似的用户,以生成推荐结果,这两名用户分别是用户2及用户3(图四)。...同样地,我们只取与用户之 前评论过书籍似的两本书。 根据上述描述,基于用户与基于物品协同过滤似乎非常类似,因此能得出不同结果这一点确实很有意思。

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教孩子学习乘法和除法,我算是绞尽脑汁了

第一步,在孩子看来,乘法和加法差异,那种感觉是很准确,孩子能够归纳出数量这个关键词,在这个过程,为了让孩子有更深刻认识,我让孩子写9个9算式, 我们讨论了乘法相比于加法在表达上简便性,在计算方面的便捷等...第二步,乘法口诀表记忆,因为之前孩子也背过,但是没有实际用过,隔一段时间就记得不清楚了,所以这一次我刻意做了下标记,孩子一边背诵,我一边记录孩子背诵不够确定,或者结果错误地方,最后记录下来一看,有...,在这里我带给孩子尽可能通用方法,那就是如果是23*9,89*8,有没有同样快捷办法,其实也是类似的,只是算法会有一些细小差别,我简单来说一下。...尤其是像8口诀,没有9那样技巧,记忆起来还是有些难度,为此我又绞尽脑汁想谐音,想方法,比如8*8=64,我想到记忆办法就是爸爸肉丝,就是爸爸爱吃肉丝,这样孩子可能就记住这个口诀了。...相关链接: 关于乘法一些小技巧分析 带着孩子背诵“九九乘法口诀表”,我总结了8个小技巧 教小朋友数学课感悟:所谓捷径,其实会更加懒惰 回炉深造系列:重新组装加法口诀表 《生活魔法数学

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C++开源序列化库:FStruct

使用过java或者go的人知道这些语言在进行序列化和反序列化是很容易,对于C++而言,这是困难,根本原因是C++不支持反射,虽然C++不支持反射,但是我们依旧可以通过自己方式来保存对象元信息来实现序列化与反序列化...我试着在github寻找一些用于C++序列化与反序列库,看看有没有什么办法可以帮助我快速把对象转变成JSON,我找到了一些类似的库,但是获得或多或少存在一些问题。...definition.h头文件 //definition.h 添加结构体,定义结构体 #include "example/testType.h" //用于示例2, 并非需要同时添加,如果你确定只需要单向转换...(这个接口调用太复杂,后期会优化) //当将json转为对象时,如json键值与对象成员名存在大小写不同,可以设定忽略大小写。...由于FStruct出生时间有限,后续功能将慢慢完善!

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C++开源序列化库:FStruct

使用过java或者go的人知道这些语言在进行序列化和反序列化是很容易,对于C++而言,这是困难,根本原因是C++不支持反射,虽然C++不支持反射,但是我们依旧可以通过自己方式来保存对象元信息来实现序列化与反序列化...我试着在github寻找一些用于C++序列化与反序列库,看看有没有什么办法可以帮助我快速把对象转变成JSON,我找到了一些类似的库,但是获得或多或少存在一些问题。...definition.h头文件 //definition.h 添加结构体,定义结构体 #include "example/testType.h" //用于示例2, 并非需要同时添加,如果你确定只需要单向转换...(这个接口调用太复杂,后期会优化) //当将json转为对象时,如json键值与对象成员名存在大小写不同,可以设定忽略大小写。...由于FStruct出生时间有限,后续功能将慢慢完善!

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