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学python:使用python的pyRanges模块的read_gtf函数读取gtf文件报错的解决办法

pyRanges的帮助文档 https://biocore-ntnu.github.io/pyranges/loadingcreating-pyranges.html image.png 我自己的gtf文件是这样的...ID和后面字符串是用等号链接的,通常 image.png 是用空格,所以他定义函数用来查拆分字符串的时候是用空格来分隔的,所以这个地方我们把读取代码稍微改动一下,就是增加一个等号作为分隔符 首先定义拆分最后一列的函数...for kv in re.split('; |;',l)]}) return pd.DataFrame.from_dict(rowdicts).set_index(anno.index) 读取..."Start"] = df.Start - 1 if not as_df: return PyRanges(df) else: return df 读取...gtf文件 import pyranges as pr from pyranges import PyRanges read_gtf_full("example02.gtf") example02.gtf

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使用LSTM-GAN为歌词谱曲

系统总览 我使用的是由Yi Yu和她的同事设计和训练的Lyrics-to-Melody AI模型。他们称之为有条件的LSTM-GAN,用于歌词中生成旋律[6]。...它使用一个名为Pyphen的模块,使用Hunspell连字符字典[9]将行的每个单词分解成音节。将结果输入到歌词到旋律模型。...使用MIT的Music21库[10]分析所得的乐句,确定其所处的音调。然后将该乐句转换为C大调(或A Minor),并使用Music21量化为十六分音符。...最后,使用谷歌的Magenta 库[11]对最终的MIDI文件进行一些后处理,比如分配乐器声音。 在下一节,我将详细介绍这些步骤,并显示为自定义处理编写的Python代码。...Music21(第27行在第3行调用该函数)将每行换位到C大调

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AI陪你过圣诞!百首MIDI音乐数据集打造圣诞AI作曲家

用户只要输入一个持续时间(以秒为单位,作为生成的歌曲时长),三种乐器中选择一种(备选有钟琴、铃铛、单簧管),然后就可以等着收听AI作曲家的大作。 ?...AI目前生成的曲目来看,这些曲子目前恐怕还上不了热歌排行榜。尽管如此,这个成果 - 开发团队解释说,这是大量训练的产物,还需要构建一个简单且复杂的系统。...为了训练这个网络,研究团队采用MIDI格式的100首圣诞歌曲的训练数据集,包含每个音符的音高、长度和响度的文本文件,并使用Music21(一个开源库)来进行读取和写入。...随着时间的推移,当LSTM读取MIDI文件时,会通过复制音符和和和弦序列慢慢“学习”,以生成相似的主题音乐。...据该团队称,在AWS的GPU服务实例(使用Nvidia V100-SXM2),对该模型进行全面优化和训练大约需要3个小时。

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日拱一卒,伯克利CS61A大作业,scheme 解释器(四)

你将在questions.scm文件当中实现接下来的几个问题 虽然你已经完成了scheme解释器的开发,但由于可能存在潜在的bug。...在不改动原有函数签名的情况下,唯一的办法就是使用高阶函数。在函数内部再定义一个函数,然后我们再调用这个函数。 递归的逻辑其实不难,可以参考一下代码,就不过多赘述了。...遍历rests的每一个元素,然后将first元素拼接上去即可。题目提示了我们,可以使用内置的map。map这个过程会将某一个过程应用在一个list的所有元素上。...(define (cons-all first rests) (define (concat s) (cons first s) ) (map concat rests...) ) 这道题我们之前在作业4当中用Python写过类似的,不知道大家还有没有印象。

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10.6K Star开源工具可为500多种乐器编曲,开启音乐之旅的完美选择

5.导入和导出功能:MuseScore支持多种格式的导入和导出,可以加载和保存各种流行的音乐文件格式,如MIDI、MusicXML和PDF等。...开发语言 [C++69.5%] [CartoCSS18.7%] [QML6.1%] [C1.9%] [CMake1.3%] [Shell1.0%] Other1.5% 使用步骤 1.首先,MuseScore...的GitHub releases页面下载对应操作系统的安装包,或者官网下载对应操作系统的安装包 2.启动MuseScore后,点击“新建”按钮开始创建一个新的乐谱。...3.使用软件提供的工具选择并绘制音符、节拍、和谐和调性等符号,以创建你的音乐作品。 4.根据需要,可以调整乐谱的布局、增加分页符、调整标签位置等。...6.完成编辑后,通过点击“保存”按钮将乐谱保存到本地文件,也可以选择导出为其他格式。 创作不易分享,赞,在看,三连支持一波,感谢。↓↓↓

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自动化登录并执行命令返回的脚本设计

比如常见的要针对一堆线上物理机批量执行命令,查看进程健康状态,有没有设置crontab监控自动拉起脚本,日志有没有异常等等。 最笨的办法就是挨个ip登录执行这些操作。...所以我们一般有以下的办法。 一、使用polysh: Polysh(以前称为Group Shell或gsh)是一个远程Shell多路复用器。它可以在一个shell程序中一次控制多个远程shell程序。...sshpass -p [your password] ssh [user]@[your ip] [your shell command] 注意到因为很多机器是首次登录,并没有生成凭证放在本地的信任host列表。...这样sshpass可以传递ssh一个密码,然后让ssh登录 2.1 批处理文件 假设我们现在有个文件[ip list file]上有一对ip列表,一行一个ip。那么可以使用while循环处理。...-n让/ dev / null重定向到stdin(实际上,防止标准输入读取)。这里必须加-n,要不while只会循环一次就退出了。

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Python seek()和tell()函数详解

在讲解 seek() 函数和 tell() 函数之前,首先来了解一下什么是文件指针。 我们知道,使用 open() 函数打开文件读取文件的内容时,总是会文件的第一个字符(字节)开始读起。...那么,有没有办法可以自定指定读取的起始位置呢?答案是肯定,这就需要移动文件指针的位置。 文件指针用于标明文件读写的起始位置。...假如把文件看成一个水流,文件每个数据(以 b 模式打开,每个数据就是一个字节;以普通模式打开,每个数据就是一个字符)就相当于一个水滴,而文件指针就标明了文件将要从文件的哪个位置开始读起 tell()...函数 tell() 函数的用法很简单,其基本语法格式如下: file.tell() 其中,file 表示文件对象。...seek()函数 seek() 函数用于将文件指针移动至指定位置,该函数的语法格式如下: file.seek(offset[, whence])

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精选 Github 近期13款开源工具包!(附数据集、链接)

详细文档提供使用说明和代码讲解; 3. 提供预训练的模型可以直接使用; 4. 性能评测,方便大家在不同模型之间做取舍; 5. 每个模型实现和接口尽量保证一致性,降低使用新模型的学习门槛; 6....PyTorch版Keras API: model.summary() Keras 框架有一个用于模型可视化的简洁 API —— model.summary(),本项目实现了用于 PyTorch 框架的...无需写代码:只要通过修改配置文件就可以对模型的结构进行配置,无需任何代码工作; 2....本次训练的语料是互联网上找到的 shooter 训练语料,语料质量很差劲,仅作为演示代码来用,大家可以使用自己的语料。...PNG 图像来输出 MusicXML 格式乐谱或 NoteSequence 消息。

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Python入门(17)

但是,我们有时会遇到一些需要持久化的信息,除了使用数据库以外,还有没有一些简单、灵活的方法呢?答案是有的。那就是今天我们要讲的python的文件。 1、回顾一下:input()与print() ?...如前所述,我们可以通过使用str[a:b:c] 来位置 a 开始到位置 b 结束来对序列进行切片 。c是切片的步长(Step)。默认的步长为 1 ,它会返回一份连续的文本。...(2)可以通过 read() 、readline()、write() 等方法来读取或写入文件。 (3)当你完成了文件使用,你可以调用 close()方法来关闭该文件的操作对象。...默认情况下, open() 会将文件视作文本读取方式打开。 3、Pickle ? ? ? 文件操作的确很方便,那么,除了文本内容以外,其他数据类型的对象,我们有没有办法也存储到一个文件中去呢?...通过导入 Pickle 模块,你可以将任何纯 Python 对象存储到一个文件,并在稍后将其取回,这也叫持久地存储对象。 ?

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操作系统(2)启动、中断、异常、系统调用

BIOS部分需要提供的功能如上图所示,基本输入输出用于磁盘上读取/写数据、键盘上读输入、在显示器显示输出等。系统设置的例子有哪个盘启动,或者是不是网络启动。...具体过程是: 之所以不能从BIOS里面直接读取系统的内核映像,是因为要先确定了磁盘上的文件系统(市面上的文件系统有很多种)才可以读取。...最后提一下BIOS提供的功能和限制: 注意,在进入保护模式之后,即离开了实模式之后就不能使用BIOS了,也就没办法使用BIOS提供的功能,这时候如果需要使用这些功能就要操作系统自己想办法实现。...系统启动流程 要找主引导引导记录来去确定哪个文件系统里面去读取加载程序,因为可能不只是有一个分区,不同分区使用的可能不是同一种文件系统。...系统检测主要是确定有没有系统存在,例如从U盘启动系统(WinToGo)前就会先检测一下有没有系统在你的U盘里。最后会指定的软盘、硬盘或者光驱读取第一块扇区。

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本周 Github 精选:13 款炼丹利器,有开源工具包也有超大数据集

详细文档提供使用说明和代码讲解; 3. 提供预训练的模型可以直接使用; 4. 性能评测,方便大家在不同模型之间做取舍; 5. 每个模型实现和接口尽量保证一致性,降低使用新模型的学习门槛; 6....PyTorch版Keras API: model.summary() Keras 框架有一个用于模型可视化的简洁 API —— model.summary(),本项目实现了用于 PyTorch 框架的...无需写代码:只要通过修改配置文件就可以对模型的结构进行配置,无需任何代码工作; 2....本次训练的语料是互联网上找到的 shooter 训练语料,语料质量很差劲,仅作为演示代码来用,大家可以使用自己的语料。...PNG 图像来输出 MusicXML 格式乐谱或 NoteSequence 消息。

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Pytorch神器(9)

所谓平网络,就是像前面分享见到的那种一层一层把数据从前往后传递的那种网络。而残差网络有所不同。 ? 示意图上可以看出来,残差网络的信息传递多了一个“途径”。...需要强调的是,在这个实验,作为Encoder的部分,使用残差网络也可以,使用传统的VGG网络或者其它网络也可以,只是通常我们认为残差网络的记忆能力更强,Encode的效果更好而已。...在深度学习应用中会经常使用到——因为在读写大文件的时候,用python直接操作文本文件是会死人的…… scikit-image是一个开源的用来处理图像的包,也是在深度学习中经常使用的一个辅助工具。...其产生的文件也非常大,在我的计算机上产生了一个超过300GB的h5文件。这个h5文件记录就是每个训练样本图片的code——特征表示。...crit函数是调用的misc文件夹下面的utils.py的39行到53行这个部分 ?

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Guitar Pro8吉他谱制作工具有哪些新功能?

它也是一款优秀的MIDI音序器,MIDI制作辅助工具,可以输出标准格式的MIDI,同时还支持查看、演奏乐谱和指法,帮助用户使用乐器的乐谱来创作和阅读喜欢的乐谱,多种类文件格式的导入与导出功能,可以让用户记录那些瞬间易逝的灵感...Guitar Pro免费版在众多同类型软件,它能够满足乐谱创作者、学习者的所有需求,并且该版本里的功能都是免费使用的,有需要的小伙伴们还不来下载试试吗?...您还可以调整节奏或使用飞快的速度循环整个乐谱的一部分而加强每分钟节拍。3、混合驱动你的Guitar Pro文件与乐器的全局视图可用以下乐谱。它可以让你有一个合成乐器的跟踪,从而轻松地移动它。...五、打印和分享你的文件1、Guitar Pro同时支持导入/导出的格式有:.gpx、.ptb、.midi、.ascii、.musicxml2、Guitar Pro导图格式:.wav .png .pdf下面我们就来教大家如何安装这款软件...首先选择使用需要的语言:选择好之后点击“确定”后如上图所示:确定之后会出现以下界面:阅读没有问题便点击下一步,会弹出下图的界面,这边是安装的路经,点击“安装字样便可”。

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MySQL SQL优化之覆盖索引

内容概要 利用主索引提升SQL的查询效率是我们经常使用的一个技巧,但是有些时候MySQL给出的执行计划却完全出乎我们的意料,我们预想MySQL会通过索引扫描完成查询,但是MySQL给出的执行计划却是通过全表扫描完成查询的...前些天,有个同事跟我说:“我写了个SQL,SQL很简单,但是查询速度很慢,并且针对查询条件创建了索引,然而索引却不起作用,你帮我看看有没有办法优化?”。...全表扫描、文件排序与索引扫描、索引排序的区别 全表扫描、文件排序: 虽然是全表扫描,但是扫描是顺序的(不管机械硬盘还是SSD顺序读写性能都是高的),并且数据量不是特别大,所以这部分消耗的时间应该不是特别大...既然我们已经知道是因为随机IO导致无法利用索引,那么有没有办法消除随机IO呢? 有,覆盖索引。...执行时间来看,SQL的执行时间提升到原来的1/20,已经达到我们的预期。 总结 覆盖索引是select的数据列只用索引中就能够取得,不必读取数据行,换句话说查询列要被所建的索引覆盖。

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