根据距离矩阵找到每个元素与质心之间的距离？

文章/答案/技术大牛

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python、scikit-learn、data-science、k-means、distance-matrix

我有一个距离矩阵(元素之间的成对距离)，我想找到集合的质心，并获得每个元素与质心之间的距离。KMeans(n_clusters=1)km.cluster_centers_ cluster_centers_返回一个坐标列表，但我不确定这是否表示每个</em

浏览 30提问于2021-07-14得票数 0

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如何在SVG中找到最接近的元素？

javascript、svg、geometry

我试图在SVG绘图上的所有元素中找到与给定元素欧几里得距离最近的元素。现在，我对如何测量距离并不挑剔-无论是边界框之间，质心之间还是其他任何东西。除了计算每一对元素之间的距离然后排序之外，还有其他方法吗？

浏览 0提问于2013-03-27得票数 4

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为分层聚类算法设置初始集群结构

python、initialization、hierarchical-clustering

通常，在分层聚类中，算法从每个点在其自己的组中开始，然后基于给定的度量组合组。python或R都可以

浏览 3提问于2021-01-08得票数 0

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如何计算R中DTWCLUST库的质心

r、cluster-computing

这是我的代码。但我不知道PAM是如何计算质心的，PAM是默认选项。有人能帮我理解PAM的概念吗？谢谢提前给我。

浏览 1提问于2017-08-26得票数 0

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在K-Means中传递自定义距离函数

matlab、k-means

在MATLAB k-means实现中，有没有一种传递自定义距离函数(例如jaccard距离)的方法？D = pdist(X,'jaccard');

浏览 1提问于2012-08-27得票数 3

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从numpy argmin中删除轴参数，但仍是矢量化的

python、numpy、vectorization

所以我有以下几行代码 np.argmin(distances, axis = 0) 这里的距离是k个质心和n个点之间的距离矩阵。所以它是一个k x n矩阵。因此，通过这行代码，我试图找到每个点的最近质心，方法是沿0轴获取argmin。我的目标是有一个类似的没有轴参数的矢量化代码，因为它不是在我正在使用的numpy的</

浏览 14提问于2019-04-15得票数 1

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计算数组之间的距离

python、python-3.x、numpy

我用向量化的方式计算数据点的X和中心向量之间的欧几里德距离，我的问题是，在高维的质心之间，我返回了所有距离的矩阵。我想要做的是只使用numpy返回X和质心之间最近的质心的所有距离的向量，而不使用外部库。期望的输出是向量<

浏览 4提问于2020-11-25得票数 1

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比较两个numpy数组中的所有元素，而不使用循环

python、numpy、scipy

我有一个矩阵和矩阵中每行质心的向量。我想将矩阵中的每个元素与向量中的每个元素进行比较，找出质心向量中的哪个元素最接近矩阵中的数据点。有没有办法不用循环就能做到这一点呢？我将使用大量数据，并希望它尽可能快下面是一个用python编写的非常简单的示例，展示了我

浏览 1提问于2018-05-08得票数 2

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用最小距离匹配两点

algorithm、matlab、distance、k-means、minimum

我正在解决这个问题：之后，我得到一个C值，它包含数组中这些集群的质心坐标，例如：(4个质心:第一个有坐标(30,15,48,5))，其中行表示每个质心</

浏览 3提问于2017-06-06得票数 0

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为sf对象创建距离矩阵

r、dplyr、distance、raster、sf

我有一个sf对象，一张划分为区域的地图。我想要计算每个区域的质心(使用st_point_on_surface)，然后计算每个质心之间的相对距离，就像一个距离矩阵，我可以在这个矩阵上执行计算(比如保持一个在一定半径范围内的距离)，并得到一个包含每个区域标识符的db和一个符合标准的标识符列表。抱歉

浏览 1提问于2021-07-25得票数 3

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所有质心坐标组合之间的成对距离- Matlab

matlab

下面的脚本根据对象的质心标记图像中的对象。如何在所有质心坐标组合之间形成成对距离(无重叠)并在表中返回结果？我在考虑使用pdist2，但我不知道如何构造for循环。谢谢。

浏览 22提问于2019-06-01得票数 1

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将二维形状转换为一维空间(形状分类)。)

python、image-processing

我正在寻找一个使用Python将2D形状转换为一维空间的代码/库示例，具体步骤如下：谢谢!

浏览 5提问于2017-12-04得票数 0

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如何计算每一次观测与scipy.cluster.hierarchy创建的质心之间的距离？

scipy、distance、hierarchical-clustering、centroid

我有一个向量x，它表示用tf转换的文本数据.然后利用学习的cosine_similarity()函数计算矢量各点之间的距离，并利用scipy.cluster.hierarchy建立病房距离的linkage_matrix这创建了一个分层聚类，但我不知道如何计算每个观察到的每个质心的距离。在使用sklearn中的kmeans时，我计算出可以调用tra

浏览 5提问于2022-10-27得票数 0

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K-means -如何计算最小距离

algorithm、math、k-means

在计算到每个对象的质心距离后，如何计算other中的最小距离，以便将对象分配到最近的集群？

浏览 0提问于2013-02-18得票数 0

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PCA后群体相似性与差异性的评估

r、similarity、pca、distance

目的是评估6个已知类群之间的相似性和差异性。 eigenvalue variance.percent cumulative.variance.percent91.85222 Dim.5 222.0270 8.147781

浏览 0提问于2017-11-14得票数 0

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基于k均值的图像特征的潜在语义分析

dimensionality-reduction

我已经从一组图像中提取了颜色矩，并希望使用Kmeans进行维数约简，并找到顶层k个潜在语义。如何使用Kmeans进行潜在的语义分析？

浏览 0提问于2021-10-22得票数 0

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如何从Matlab k_m()函数的输出中计算离簇质心的距离

matlab、distance、k-means、centroid

我有两个来自k均值matlab函数的输出集群。我不知道如何使用"idx“计算质心到集群中每个点之间的距离。我想得到矩阵的所有点，它们与质心的距离>2。

浏览 0提问于2019-07-31得票数 0

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找到有最小距离的项目的最大子集？

algorithm

我的问题类似于这个问题：然而，在我的例子中，与其嵌入在一维的整数之间的距离，我还有一个任意元素集和一个距离矩阵，它给出了每个元素到另一个元素的距离。距离都是整数，它们满足的要求。给定指定的最小距离(例如3)，目标是识别起始集的最大大小子集，使子集中

浏览 1提问于2017-04-04得票数 2

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测试betadisper()输出的方差

r、vegan

我有一些群体基因组数据，其中我有针对每种治疗的祖先基因组的SNPs的等位基因频率。根据我所能得出的结果，在betadisper()模型对象上进行的这些测试考虑到到质心的平均距离的差异，这在不

浏览 2提问于2017-07-12得票数 3

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特定节点周围图的聚类节点

python、python-3.x、networkx、k-means

考虑到来自networkx的节点图，如何应用所有节点的k均值集群，其中特定的节点被认为是集群的质心。= nx.Graph() G.add_edge(s[i],t[i],weight=dist[i]) 我想在网络上应用一个k均值聚类，例如，我选择质心为3和6，然后相应地对图进行聚类，生成两个子图(或输入的质心数相同)。我一直在查看中的k均值集群，它没有涵盖输入的<

浏览 2提问于2018-10-24得票数 4

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