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数学建模--皮尔逊相关系数、斯皮尔曼相关系数

1.总体的皮尔逊相关系数 我们首先要知道这个皮尔逊相关系数里面的两个概念,我们的系数的计算要使用到这两个概念,一个就是总体的均值(就是求和之后求解平均值),xy各是一组数据,我们使用这个x里面的数据减去第一组的均值乘上第二组的数值减去均值...,然后做乘法求和,除以on就是这个两组数据的协方差 皮尔逊相关系数就是在协方差的基础上面,除以各自对应的标准差,这个除以标准差的过程,实际上就是进行的这个标准化的过程,这个标准化之后的协方差就是我们的皮尔逊相关系数...; 2.样本的皮尔逊相关系数 我们的总体的皮尔逊相关系数是除以这个数组的个数n,但是这个样本的皮尔逊相关系数是除以这个n-1,这个就是两者在计算上面的区别; 上面的这个无论是总体的皮尔逊相关系数,还是样本的皮尔逊相关系数...,达到我们的建模的效果; 3.对于皮尔逊相关系数的认识 通过上面的这个图形,我们也可以看出来同样是0.816的系数,我们的散点图的绘制效果完全不同,这个就是因为我们的这个皮尔逊相关系数使用是有自己的条件的...,如果我们无论是什么模型都去计算这个皮尔逊相关系数,其实是没有他的真实含义的; 实际上只有两个变量之间是线性相关,这个相关系数的求解计算才会有实际意义,因此这个就要求我们首先要进行这个可视化,做出来这个散点图

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如何理解皮尔逊相关系数(Pearson Correlation Coefficient)

先说结论:  皮尔逊相关系数是余弦相似度在维度值缺失情况下的一种改进, 皮尔逊相关系数是余弦相似度在维度值缺失情况下的一种改进, 皮尔逊相关系数是余弦相似度在维度值缺失情况下的一种改进....如果参加过高考, 那么肯定会这么一个公式: cos = a • b / |a|•|b| 假设a = (3, 1, 0), b = (2, -1, 2) 分子是a, b两个向量的内积, (3,...1, 0) • (2, -1, 2) = 3•2 + 1•(-1) + 0•2 = 5 分母是两个向量模(模指的是向量的长度)的乘积....总之这个cos的计算不要太简单...高考一向这是送分题... 然后问题来了, 皮尔逊系数和这个cos啥关系......皮尔森相关系数计算公式 其实皮尔逊系数就是cos计算之前两个向量都先进行中心化(centered)...就这么简单

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    数学建模--带你彻底明白~~皮尔逊相关系数

    ,这个是我们躲不掉的一个问题,这个使用到的知识例如皮尔逊相关系数,斯皮尔曼相关系数等等都是我们需要掌握的,今天有幸学到了皮尔逊相关系数,感觉困扰自己很长时间的问题突然有了答案,请听我细细道来; 4.今天的博客内容概览...,这个时候很难直观的看到喜好相似度,这个时候我们就必须了解一下这个皮尔逊相关系数; 6.1基本概念 皮尔逊相关系数精确定义:用于度量两个变量或者是向量之间的相关性的参数; 6.2获得离差向量 我们想要比较这个拓拓和茂茂的相关性...#pearson皮尔逊相关系数 #kendall肯德尔相关系数 #spearman斯皮尔曼相关系数 # 下面是对于corr函数的参数的说明 #默认情况下,min_periods=1。...#若两个用户共同评分的电影在10部以下时,则不计算他们之间的皮尔逊相关系数,结果会用空值替代。...寻找相似用户 # 3.1 获取「用户1」与其他用户之间的皮尔逊相关系数 # 删除第一行的数据,因为第一行的是自己和自己的相关系数 userCorr = corrMatrix[1].drop(index

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    如何理解皮尔逊相关系数(Pearson Correlation Coefficient)

    先说结论: 皮尔逊相关系数是余弦相似度在维度值缺失情况下的一种改进, 皮尔逊相关系数是余弦相似度在维度值缺失情况下的一种改进, 皮尔逊相关系数是余弦相似度在维度值缺失情况下的一种改进....如果参加过高考, 那么肯定会这么一个公式: cos = a • b / |a|•|b| 假设a = (3, 1, 0), b = (2, -1, 2) 分子是a, b两个向量的内积, (3,...1, 0) • (2, -1, 2) = 3•2 + 1•(-1) + 0•2 = 5 分母是两个向量模(模指的是向量的长度)的乘积....总之这个cos的计算不要太简单...高考一向这是送分题... 然后问题来了, 皮尔逊系数和这个cos啥关系......皮尔森相关系数计算公式 其实皮尔逊系数就是cos计算之前两个向量都先进行中心化(centered)...就这么简单

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    【生物信息学】使用皮尔逊相关系数进行相关性分析

    一、实验介绍 本实验主要实现了自定义皮尔逊相关系数进行相关性分析。 相关性分析是一种常用的统计方法,用于评估两个或多个变量之间的关联程度。...在本实验中,我们使用了皮尔逊相关系数和斯皮尔曼相关系数这两种常见的相关性指标。...皮尔逊相关系数用于度量两个连续变量之间的线性关系,而斯皮尔曼相关系数则适用于评估两个变量之间的任何单调关系,无论是否线性。...计算变量 x 、 y 的均值。 计算变量 x、 y 的标准差。 计算皮尔逊相关系数 r,即将 x_ 和 y_ 中对应位置的值相除,然后相乘后求和。...绘制x1和y1的散点图。 使用scipy.stats.pearsonr函数计算了x1和y1的皮尔逊相关系数和p值, 使用自定义的cal_pearson函数计算了相同的相关系数。

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    机器学习特征降维

    特征降维概念 特征对训练模型时非常重要的;用于训练的数据集包含一些不重要的特征,可能导致模型性能不好、泛化性能不佳;例如: 某些特征的取值较为接近,其包含的信息较少 希望特征独立存在对预测产生影响,两个特征同增同减非常相关...,也会干扰模型的学习 特征降维是指在某些限定条件下,降低特征个数常用的方法: 低方差过滤法、PCA(主成分分析)降维法、相关系数(皮尔逊相关系数、斯皮尔曼相关系数) 低方差过滤法 低方差过滤法:指的是删除方差低于某些阈值的一些特征...特征方差小:特征值的波动范围小,包含的信息少,模型很难学习到数据的规律 特征方差大:特征值的波动范围大,包含的信息相对丰富,便于模型学习事物规律(异常值除外) 机器学习低方差过滤API: sklearn.feature_selection.VarianceThreshold...特征x和目标值y的密切程度,是否同增同减;特征x和特征x之间是否同增同减; 可以把密切相关的2个列,删除掉1列,达到特征降维的效果 常见2个相关系数:皮尔逊相关系数、斯皮尔曼相关系数 皮尔逊相关系数...,取值 [-1, 1]之间,斯皮尔曼相关系数比皮尔逊相关系数应用更加广泛。

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    ICLR 2024 | 受进化启发的损失函数用于蛋白质表征学习

    作者的结果验证了在自监督训练中优先考虑排名顺序对零样本ΔΔG预测的影响。首先,基于MSA的软标签与α散度的结果在皮尔逊相关系数和AUC上均已超过文献中的自监督基线。...然后,通过重新构建EvoRank训练目标,作者显著提升了之前文献中最好的零样本模型的表现——在六个数据集上的皮尔逊相关系数和AUC分别平均提升了约64%和约14%。...与其WT mask前身MutComputeXGT直接比较,MutRank在皮尔逊相关系数和AUC上分别提升了66%和16%。...值得注意的是,与著名的自监督方法ESM2和ProteinMPNN相比,MutRank在六个ΔΔG数据集上的皮尔逊相关系数平均分别提高了约288%和约72%。...与SOTA监督框架Stability Oracle相比,作者的零样本皮尔逊相关系数和AUC在六个数据集上的平均值仅低约13%和约3%。

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    数学建模及其基础知识详解(化学常考知识点)

    1.1、皮尔逊相关系数 皮尔逊相关系数适用于呈正态分布的连续变量。...通常会用t检验之类的方法来进行皮尔逊相关性系数检验。需要先确认这两个变量是线性相关的。 连续数据,正态分布,线性关系,均满足,用皮尔逊相关系数最恰当。若数据有定序,则用斯皮尔曼秩相关系数。...1.2、斯皮尔曼相关系数 另一种定义:等级之间的皮尔逊相关系数。 皮尔逊相关系数适用于线性关系,而斯皮尔曼相关系数适用于单调关系(线性关系的斜率是固定的)。...皮尔逊相关系数使用元数据进行计算的,而斯皮尔曼相关系数是基于秩计算的。...1.4、区别和选择 与皮尔逊相关系数相比,斯皮尔曼相关系数、肯德尔相关系数,是基于数据秩的相关系数。由于这些估计量操作的是秩,而非数据值,所以它们对离群值稳健, 并可以处理特定类型的非线性关系。

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    mahout学习之推荐算法

    计算他们的皮尔逊相关系数,得到如下表格: ? 皮尔逊相关系数也并不是总靠谱,比如两个人只看过2部相同电影,评价相同或者两个人看过200部相同电影,绝大部分评分相同。...依据后者推荐明显比前者靠谱,但是前者的皮尔逊相关系数就是高于后者。...基于斯皮尔曼相关系数的相对顺序的相似度 斯皮尔曼相关系数本质上时是皮尔逊相关系数的一个变体,他不是基于原始数据,而是只保留了原始数据的相对顺序,比如(1.5,5.0,2.6)就变为(3,1,2)。...通常使用皮尔逊相关系数作为阈值的根据。...u对j的偏好值 添加其至平均值 return 值最高的物品 由算法可以得出,其性能不受用户数目影响,仅依赖于物品偏好值之间的平均差异,可以预先计算好,当一个偏好值改变,只需改变其相关的差异值

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    教程 | 从检查过拟合到数据增强,一文简述提升神经网络性能方法

    所以,我们总是在寻求更好的方式来改善模型的性能。有很多技术可以帮助我们达到这个目标。本文将介绍这些技术,帮助大家构建更准确的神经网络。...当组合不同的猫狗分类器时,基于单个分类器之间的皮尔逊相关系数,集成算法的准确率有了提升。...2: 1111111100 = 80% accuracy Classifier 3: 1011111100 = 70% accuracy 3 个模型的皮尔逊相关系数很高。...如果我们使用多数投票的方式来组合这三个模型,会得到下面的结果: Ensemble Result: 1111111100 = 80% accuracy 现在,让我们来看一组输出具备较低皮尔逊相关系数的模型...,会得到以下结果: Ensemble Result: 1111111101 = 90% accuracy 正如你在上面所看到的,具有低皮尔逊相关系数的弱学习器的组合优于具有较高皮尔逊相关系数的学习器的组合

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    Hist2ST:联合Transformer和图神经网络从组织学图像中进行空间转录组学预测

    此前虽然已经开发了几种利用组织学图像预测基因表达的方法,但它们并没有同时包括2D视觉特征和空间相关性,从而限制了它们的性能。...进一步的通路分析表明,Hist2ST模型可以保留生物信息。在HER2+和cSCC数据集上,Hist2ST的平均皮尔逊相关系数分别比排名第二的方法HisToGene高9%和11%。...在HER2+和cSCC数据集中,ST-Net在大多数组织切片上的性能最低。这些结果表明,Hist2ST模型可以有效地从组织学图像预测基因表达模式。...为了进一步了解预测的基因表达,研究团队将组织学图像上的top预测基因可视化。可视化结果表明,Hist2ST的预测基因在这四个最重要的基因上达到了最高的皮尔逊相关系数。...就这些基因的平均皮尔逊相关系数而言,Hist2ST始终优于竞争方法,表明Hist2ST模型能够准确预测基因表达和储备标记基因信息。

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    皮尔逊相似度计算的例子(R语言)

    大家好,又见面了,我是全栈君 编译最近的协同过滤算法皮尔逊相似度计算。下顺便研究R简单使用的语言。概率统计知识。...二、类似度计算在协同过滤推荐算法中的地位 ---- 在协同过滤推荐算法中,无论是基于用户(User-based)还是基于物品(Item-based),都要通过计算用户或物品间的类似度,得到离线模型.../ (sd(user1)*(sd(user5))) =0.9449112 五、数学特性和存在问题 ---- 以下1)和2)整理自维基百科: 1)代数特性 皮尔逊相关系数的变化范围为...并不会改变两个变量的相关系数(该结论在整体和样本皮尔逊相关系数中都成立)。我们发现更一般的线性变换则会改变相关系数。...2)几何学含义 对于没有中心化的数据, 相关系数与两条可能的回归线y=gx(x) 和 x=gy(y) 夹角的余弦值一致。

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    一文读懂数据分析的流程、基本方法和实践

    :极差、方差、标准差 多元比较:相关系数 模型评估:准确率、召回率 汇总统计对一个弹性分布式数据集RDD进行概括统计,它通过调用Statistics的colStats方法实现。...目前支持的相关性方法有皮尔逊(Pearson)相关和斯皮尔曼(Spearman)相关。一般对于符合正态分布的数据使用皮尔逊相关系数,对于不符合正态分布的数据使用斯皮尔曼相关系数。...皮尔逊相关系数是用来反映两个变量相似程度的统计量,它常用于计算两个向量的相似度,皮尔逊相关系数计算公式如下: ? 其中 ? 表示两组变量, ?...表示两个变量的平均值,皮尔逊相关系数可以理解为对两个向量进行归一化以后,计算其余弦距离(即使用余弦函数cos计算相似度,用向量空间中两个向量的夹角的余弦值来衡量两个文本间的相似度),皮尔逊相关大于0表示两个变量正相关...val correlMatrix: Matrix = Statistics.corr(data, "pearson") 皮尔逊相关系数在机器学习的效果评估中经常使用,如使用皮尔逊相关系数衡量推荐系统推荐结果的效果

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    如何为协同过滤选择合适的相似度算法

    在近邻推荐中,最常用的是相似度计算方法是余弦相似度,事实上,除了余弦相似度,还有其他的计算方法,比如:欧式距离、修正余弦相似度、皮尔逊相关系数、杰卡德(Jaccard)相似度。...欧式距离度量的是空间中两个点的绝对差异,适用于分析用户能力模型之间的差异,比如消费能力、贡献内容的能力等 余弦相似度 余弦相似度度量的是两个向量的夹角。 ?...皮尔逊相关系数 皮尔逊相关系数衡量的是两个变量之间的线性关系。 ? 可以看出,皮尔逊相关系数会将原始的向量将去该向量的平均值,修正后的余弦相似度会将原始的向量中的值减去每列的平均值。...皮尔逊相关系数的取值范围是 [-1, 1],-1 表示两个变量负相关,1 表示两个变量正相关,0 表示两个变量之间没有线性关系,但不代表没有其他关系。...皮尔逊相关系数不适合用作计算布尔值向量之间相关度。 杰卡德(Jaccard)相似度 杰卡德相似度,是两个集合的交集元素个数在并集中所占的比例。 ?

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    【机器学习】乱象中寻序,虚实间求真:统计学连接数据与真理的桥梁

    4.2 常见的相关性指标 4.2.1 皮尔逊相关系数 皮尔逊相关系数(Pearson Correlation Coefficient)用于衡量两个变量之间的线性关系,范围为 [-1, 1] 。...3 9 8 4 6 11 5 10 13 我们将使用皮尔逊相关系数和斯皮尔曼相关系数分析这些变量之间的关系。...:.2f}") 运行结果: 工作年限与年薪的皮尔逊相关系数: 0.99 工作满意度与年薪的皮尔逊相关系数: 0.25 工作年限与年薪的斯皮尔曼相关系数: 1.00 工作满意度与年薪的斯皮尔曼相关系数:...0.30 4.3.3 结果解读 工作年限与年薪: 皮尔逊相关系数为 0.99,表明两者存在极强的线性关系,年薪随着工作年限的增长呈现稳定的线性增长。...线性相关性与非线性相关性: 皮尔逊相关系数只能衡量线性关系,非线性关系需要使用斯皮尔曼相关系数或其他方法。 异常值的影响: 异常值会显著影响相关性计算,应在分析前对数据进行预处理。

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    皮尔逊相关性系数和热力图

    皮尔逊相关系数 2. 热力图(haetmap) 注: Reference: 前言 特征选择是一个重要的“数据预处理”过程,在实现机器学习任务中,获得数据后通常先进行特征选择,此后再训练学习器。...[1] 特征选择的两大主要原因: 维数灾难问题[2]。因为属性或者特征过多造成的问题,如果可以从中选择出重要的特征,使得后续学习过程仅需在一部分特征上构建模型,可以大大减轻维数灾难问题。...从这个意义上讲,特征选择和降维技术有相似的动机,事实上它们也是处理高维数据的两大主流技术。 去除无关特征可以降低学习任务的难度,也同样让模型变得简单,降低计算复杂度。...皮尔逊相关系数 在统计学中,皮尔逊积矩相关系数[3](英语:Pearson product-moment correlation coefficient,又称作 PPMCC或PCCs, 文章中常用r或Pearson...两个变量之间的皮尔逊相关系数定义为两个变量之间的协方差和标准差的商: ρ

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    计算相似度

    基于相似性的度量 1.1 皮尔逊相关系数 皮尔逊相关系数度量两个随机变量之间的线性关系,包括相关程度和方向。这两个随机变量可以是连续型,也可以是离散型。 计算公式如下: 其中, 。...皮尔逊相关系数的范围在 , -1意味着两者负相关,1代表正相关。 ?...斯皮尔曼秩相关系数的计算方法,与皮尔逊相关系数类似,区别就在于斯皮尔曼相关系数中使用的是数据的秩。...下面的图显示了了皮尔逊相关系数和斯皮尔曼相关系数之间的差异。 ? 图中的数据是呈非线性单调,如果用皮尔逊相关系数——它度量线性关系,得到的相关系数是 0.88 ,而斯皮尔曼秩相关系数是 1 。...在研究数据的相似度时,根据经验,建议分别计算皮尔逊相关系数和斯皮尔曼秩相关系数。

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    最强 NLP 预训练模型库 PyTorch-Transformers 正式开源:支持 6 个预训练框架,27 个预训练模型

    PyTorch-Transformers(此前叫做pytorch-pretrained-bert)是面向自然语言处理,当前性能最高的预训练模型开源库。...88, Transformer-XL在 WikiText 103 上的困惑度为18.3, XLNet在STS-B的皮尔逊相关系数为0.916。...GPT 在 RocStories 上的 F1 分数为 88,Transformer-XL 在 WikiText 103 上的 困惑度为 18.3、XLNet 的 STS-B 上的皮尔逊积矩相关系数为 0.916...用户可以在官方网站的文档示例部分中,找到有关性能的更多详细信息。...例子 BERT-base和BERT-large分别是110M和340M参数模型,并且很难在单个GPU上使用推荐的批量大小对其进行微调,来获得良好的性能(在大多数情况下批量大小为32)。

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