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画一个带统计检验的PcOA分析结果 (再进一步,配对比较)

前期回顾 方差分析基本概念:方差分析中的“元”和“因素”是什么? PERMANOVA原理解释:这个统计检验可用于判断PCA/PCoA等的分群效果是否显著!...实战1:画一个带统计检验的PCoA分析结果 在检验完某个因素对物种组成有显著影响后,如果关注该因素不同水平对物种的构成是否存在显著影响,就需要逐一对每两对水平进行检验了。...配对Adonis确定不同管理方式两两之间对物种组成差异的影响 adonis分析可以检验某个因素整体对物种组成差异的影响,但不能比较这个因素的多个水平之间两两是否差异显著,如Management中的BF与...这时就需要pairwise.adonis来进行配对检验了。...https://thebiobucket.blogspot.com/2011/04/assumptions-for-permanova-with-adonis.html#more 作者的论文 https

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【温习统计学】均数间的多重比较的方法的选择

,在方差分析得到有统计意义的F检验值后,可以利用多重比较进行探索性分析,此时比较方法的选择要根据研究目的和样本的性质。...; 4、 最后需要注意的是,如果组数较少,如3组、4组,各种比较方法得到的结果差别不会很大;如果比较的组数很多,则要慎重选择两两均值比较的方法。...5、 LSD法:即最小显著差法;是最简单的比较方法之一,它其实只是t检验的一种简单变形,未对检验水准做任何校正,只是在标准误计算上充分利用了样本信息。...α; 11、Tukey法:这种方法要求各组样本容量相同,它也是利用Studentized Range分布进行各组均数间的比较,与S-N-K法不同,它是控制所有比较中最大的一类错误(即甲类错误)的概率不超过...α; 12、Duncan法:思路与S-N-K法相似,只不过检验统计量服从的是Duncan′s Multiple Range分布; 13、还需注意的是,SPSS同时给出了方差不齐性时的4种检验方法,但从接受程度和稳定性看

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    【统计学基础】从可视化到统计检验,比较两个或多个变量分布的方法总结

    在这篇文章中,我们将看到比较两个(或更多)分布的不同方法,并评估它们差异的量级和重要性。我们将考虑两种不同的方法,可视化和统计。...每个人要么被分配到4个不同的实验组要么被分配到对照组。 两组数据对比--可视化 让我们从最简单的开始:我们想要比较整个实验组和对照组的收入分配。我们首先探索可视化方法,然后是统计方法。...置换检验 一种非参数替代方法是置换检验。在原假设下,两个分布应该是相同的,因此打乱组标签不应该显着改变任何统计数据。 可以选择任何统计数据并检查其在原始样本中的值如何与其在组标签排列中的分布进行比较。...从这个图中也更容易理解分布的不同形状。 多组数据对比--统计学方法 最后,让我们考虑比较多个组的假设检验。为了简单起见,我们将集中讨论最常用的一个:f检验。...我们还看到了不同的方法如何适用于不同的情况。视觉方法非常直观,但统计方法对于决策至关重要,因为我们需要能够评估差异的幅度和统计意义。

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    10.6 内部排序方法的比较

    01内部排序方法的比较 1、从平均时间性能而言,快速排序最佳,其所需时间最省,但快速排序在最坏情况下的时间性能不如堆排序和归并排序。...2、除希尔排序之外的所有插入排序,起泡排序和简单选择排序,其中以直接插入排序最为简单,当序列中的记录“基本有序”或n值较小时,它时最佳的排序方法,因此常和其他的排序方法,诸如快速排序、归并排序结合起来使用...3、基数排序的时间复杂度也可以写成O(d*n)。因此,它最适用于n值很大而关键字较小的序列。...若关键字也很大,而序列中大多数记录的“最高位关键字”均不同,则亦可先按“最高位关键字”不同将序列分成若干“小”的子序列,而后进行直接插入排序。...4、 从方法的稳定性来比较,基数排序是稳定的内排方法,所有时间复杂度为O(n^2)的简单排序法也是稳定的,然而,快速排序、堆排序和希尔排序等时间性能较好的排序方法是稳定的。

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    10.7 内部排序方法的比较

    01 内部排序方法的比较 1、从平均时间性能而言,快速排序最佳,其所需时间最省,但快速排序在最坏情况下的时间性能不如堆排序和归并排序。...2、除希尔排序之外的所有插入排序,起泡排序和简单选择排序,其中以直接插入排序最为简单,当序列中的记录“基本有序”或n值较小时,它时最佳的排序方法,因此常和其他的排序方法,诸如快速排序、归并排序结合起来使用...3、基数排序的时间复杂度也可以写成O(d*n)。因此,它最适用于n值很大而关键字较小的序列。...若关键字也很大,而序列中大多数记录的“最高位关键字”均不同,则亦可先按“最高位关键字”不同将序列分成若干“小”的子序列,而后进行直接插入排序。...4、 从方法的稳定性来比较,基数排序是稳定的内排方法,所有时间复杂度为O(n^2)的简单排序法也是稳定的,然而,快速排序、堆排序和希尔排序等时间性能较好的排序方法是稳定的。

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    大数据建模方法的比较

    同样,如果我们有大量的数据,我们需要一个系统或方法来维持一切正常。对数据进行排序和存储的过程称为“数据建模”。 数据模型是组织和存储数据的一种方法。...• 质量:良好的数据模型使数据统计更加一致,减少了计算错误的可能性。 因此,大数据系统无疑需要高质量的数据建模方法来组织和存储数据,使我们能够在性能、成本、效率和质量上达到最佳平衡。...典型数据仓库建模方法 ER模型 数据仓库之父BillInmon提出的建模方法是设计一个包含整个公司的3NF模型,并通过实体关系(ER)模型描述企业业务,符合3NF的正常形态。...管理员将数据同步到与源结构相同的模型中的Oracle数据库(也称为ODS层)。根据这些ODS数据,数据工程师能够收集和处理统计数据。基本上没有系统建模的方法。...确定了一种以Kimball维数法为基础的建模方法,对核心方法进行了扩展,建立了一个公共层建模数据体系结构系统。 构建公共数据层的目的是解决共享数据存储和计算的问题。

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    如何比较两个或多个分布:从可视化到统计检验的方法总结

    在这篇文章中,我们将看到比较两个(或更多)分布的不同方法,并评估它们差异的量级和重要性。我们将考虑两种不同的方法,可视化和统计。...每个人要么被分配到4个不同的实验组要么被分配到对照组。 2组数据对比-可视化 让我们从最简单的开始:我们想要比较整个实验组和对照组的收入分配。我们首先探索可视化方法,然后是统计方法。...置换检验 一种非参数替代方法是置换检验。在原假设下,两个分布应该是相同的,因此打乱组标签不应该显着改变任何统计数据。 可以选择任何统计数据并检查其在原始样本中的值如何与其在组标签排列中的分布进行比较。...从这个图中也更容易理解分布的不同形状。 多组数据对比-统计学方法 最后,让我们考虑比较多个组的假设检验。为了简单起见,我们将集中讨论最常用的一个:f检验。...我们还看到了不同的方法如何适用于不同的情况。视觉方法非常直观,但统计方法对于决策至关重要,因为我们需要能够评估差异的幅度和统计意义。

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    8种JavaScript比较数组的方法

    在这里,我为前端开发列了一个比较数组的方法清单。介绍一些基于“属性”值对数组进行排序的方法。...我们可能会遇到一些其他方式来比较两个对象数组并发现它们的差异,或者比较和删除重复项,或者比较两个对象数组并更新对象数组的属性,或者在比较两个对象之后创建具有唯一数据的新数组的方法对象数组。...让我们看看比较对象和执行操作的不同方法是什么。 1、比较两个对象数组,删除重复项,根据属性合并对象 我们确实需要比较两个不同的对象数组,并希望在两个对象匹配特定属性值的情况下合并这两个对象。...可以使用filter()方法来实现。 该filter()方法创建一个新数组,其中所有元素都通过了由提供的功能实现的测试。...我们可以使用map()创建一组新的对象数组,并且可以使用find()方法在更新新值之前匹配特定属性。 该map()方法创建一个新数组,其中填充了在调用数组中每个元素上调用提供的函数的结果。

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    Numpy中的数学和统计方法

    使用一组数学函数对Numpy数组进行操作有两种计算方式: 对整个数组进行计算; 对源数组的某个轴的数据进行计算; 基本数组统计方法 ? ?...▲数组统计方法 统计函数的分类 下面的所有统计方法,即可以当做数组的实例方法调用,也可以当做Numpy函数来调用。 ?...非聚合计算就是方法调用返回的结果是一个由中间结果组成的数组。 ?...(如果使用cumprop方法的话就是上一行值与本行值的积); axis = 1的时候,其实和axis = 0的一样,只不过此时从列的方向去考虑,返回数组的形状和原来数组的形状依然相同,但是其中每一列的值就是本列与上一列的值组成的新列...(如果使用cumprop方法的话就是上一行值与本行值的积);

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    罗技鼠标接收器坏了后用其他接收器配对的方法

    本文介绍罗技鼠标在丢失、损坏其自身原有的接收器后,将另一个新的接收器与原有鼠标相互配对的方法。   ...具体的操作方法也很简单。...在这里因为我的接收器支持优联,所以就以上述第一个软件为例来介绍方法。但是第二个软件的用法也是类似的。   ...这里还需要提一句,上述这两个软件似乎在Logitech Options软件中本来就带有了;但是对于一些比较新的鼠标设备,已经不支持Logitech Options软件了,而是需要用另一个Logi Options...如果屏幕上的光标跟随鼠标移动,就说明已经配对成功,选择上图中的“Yes”选项即可。随后,将出现如下图所示的界面,表示我们已经配对完毕了。   此时,在我的电脑上,两个鼠标都可以操控电脑了。

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    double类型大小比较的方法

    问题 在Java中,int类型数据的大小比较可以使用双等号,double类型则不能使用双等号比较大小,那若使用double类型时怎么进行比较呢?...方法 转换为字符串 如果要比较的两个double数据的字符串精度相等,可以将数据转换成string然后借助string的equals方法来间接实现比较两个double数据是否相等。...代码运行结果如下: (2)使用doubleToLongBits()方法 该方法可以将double转换成long型数据,从而可以使double按照long的方法(, ==)判断是否大小和是否相等...代码中的0.0000001指范围(1e-6) 代码运行结果如下: 结语 针对如何在double类型时比较大小的问题,此处我们提供了三种解法,分别为先将它们转换类型变为字符串类型再进行比较,第二种是使用...注意第一种转换为字符串类型的方法只适用于比较精度相同的数据,并且只用于两者是否相等的情况下。

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    多种批次效应去除的方法比较

    提出了文章的转录组数据的60个样品并没有按照毒品上瘾与否这个表型来区分,而是不同人之间的异质性非常高,这个时候我提出来了一个解决方案,就是理论上就可以把人当做是一个批次效应,使用sva包的combat函数...当然了,去除批次效应的方法,肯定不止这一个,现在让我们列举并且比较一下吧!...deg3=topTable(fit,coef=2,adjust='BH',number = Inf) pca_plot(ex_b_sva,g) 比较原始矩阵和去除批次效应后 可以看到,只有 limma...的 removeBatchEffect 函数做到了把矩阵区分成为毒品上瘾与否的截然不同的两个部分。...毫无疑问,使用这样的去除了人的效应的表达矩阵后再做差异分析肯定是能找到非常多的有统计学显著效果的基因列表。

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    如何比较两个或多个分布:从可视化到统计检验的方法总结

    来源:DeepHub IMBA本文6400字,建议阅读12分钟我们看到了很多不同的方法来比较两个或多个分布,无论是在可视化上还是在统计上。 比较一个变量在不同组中的分布是数据科学中的一个常见问题。...在这篇文章中,我们将看到比较两个(或更多)分布的不同方法,并评估它们差异的量级和重要性。我们将考虑两种不同的方法,可视化和统计。...每个人要么被分配到4个不同的实验组要么被分配到对照组。 2组数据对比-可视化 让我们从最简单的开始:我们想要比较整个实验组和对照组的收入分配。我们首先探索可视化方法,然后是统计方法。...置换检验 一种非参数替代方法是置换检验。在原假设下,两个分布应该是相同的,因此打乱组标签不应该显着改变任何统计数据。 可以选择任何统计数据并检查其在原始样本中的值如何与其在组标签排列中的分布进行比较。...从这个图中也更容易理解分布的不同形状。 多组数据对比-统计学方法 最后,让我们考虑比较多个组的假设检验。为了简单起见,我们将集中讨论最常用的一个:f检验。

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