最近生信技能树公众号抽奖，中了一个基因检测试剂盒，挺开心的，给我老婆检测了一下，恭喜她成为我们家第一个有基因检测数据的人。感谢陕西图灵生物的奖品。...检测是采用消费级基因检测常用的snp芯片，60万左右的位点，拿到的结果大概有13M左右的样子。很友好地给了我原始数据，下面探索一下原始数据。...中国人GWAS的几个位点 新闻报道，2011年上海交通大学医学院附属瑞金医院旗下的上海市内分泌研究所、上海市血液病研究所联合国家人类基因组南方研究中心，发现了两个新的甲亢致病易感基因。...rs4947296 6 31058178 CT 这个位点的风险基因型是C，所以风险值是1.77。 rs6903608 6 32428285 TT 这个位点的风险基因型是C，所以应该是正常风险。...rs12101261 14 81451229 CT 这个位点的风险基因型是T，所以风险值是1.35。 rs6832151 位点没有检测，也没有找到联锁不平衡的位点，所以暂时不看了。
目前应用商店比较火爆的KEEP、薄荷健康等健康类APP愈发火爆， 最近，一款基于消费级基因检测的精准护肤类APP——真我APP自上线以来一个月进入苹果应用商店健康健美分类TOP10。...二、市场背景 1.1行业背景 随着经济发展以及人们生活水平和消费能力的不断提高，减肥是事关女人身材的第一美体需求，而护肤则是事关女人容貌的第一美容需求。...5.3基因检测体验 基因检测主要是通过检测皮肤、肥胖相关基因位点，掌握自己肌肤的美白、保湿、抗炎、抗皱、食欲、代谢等先天属性，再结合现状，更精准的护肤瘦身。...底部位置的【知因】就是基因检测，分为美肤基因检测和纤体基因检测，像淘宝购物界面一样，点进去，填写收货地址，购买即可，不麻烦。收到快递采样包后，按照说明口腔采集，回寄。...15天内，就能在手机上查看基因检测报告，根据基因，有详细的护肤、减肥建议，并解锁护肤品匹配分数（个性化匹配分析）。
提到基因检测，前几年，临床医生在向患者推荐时还心存疑虑，而近两年，基因检测已成为癌症诊疗的标准动作，基本上每一个癌症患者都有一套自己的基因检测报告。不得不说，一个患者一套方案的个体化诊疗时代已经到来。...这时候通过对肿瘤的基因图谱进行测试，从而确定到底是发生了哪些突变，而这个过程就叫做基因检测。 肿瘤基因测试范围从简单到复杂。最简单的测试只检测一种基因中的一种类型的突变。...不同基因检测方法比较 基因检测的技术其实很多，目前大概有13类基因检测技术，他们之间优劣势对比如下。 1、等位基因特异性PCR 优点：敏感性 - 需要突变存在1-5％。无需特殊设备。...在同一检测中，可同时检测许多基因中的替换，重复，插入，缺失，插入和外显子和基因 拷贝数变化。...结语 看了上面的介绍，是不是对常用的肿瘤基因检测有了全面的了解来呢？是不是也感受到了基因检测的复杂性？
CBFβ/MYH11融合基因是M4Eo型白血病的分子标志 PML/RARα融合基因是急性早幼粒细胞白血病(APL)的分子标志 利用RNA_seq的数据，我们可以检测融合转录本，从而识别融合基因。...title=FusionMap 通过两种方式来检测融合基因： 对于没有比对上基因组的序列，即unmapped reads, 通过识别Fusion junction-spanning reads 来识别融合基因...， 包括++， —， +-, -+ 四种组合 Position1: 检测到的融合基因的起始位置 Chromosome1 : gene1 所在的染色体 Chromsome2: gene2 所在的染色体 Position2...: 检测到的融合基因的终止位置 knowGene1 : gene1 的symbol KnowTranscriptStrand: gene1的转录本的方向，有多个转录本，就有多个方向 KnowGene2:...breakpoint 处的剪切模式越常见，则检测到的该融合基因为真实存在的融合基因的可能信越大。
差异基因的检测方法很多，但生物学家偏好使用的是fold change（FC）和t-test。猜测因为一是它们比较简单，二来好解释。...所以，如果关注基因表达的绝对变化，则看FC 如果关注潜在的噪音，则用t-test。 也就是说，FC只考虑到组间差异，二未考虑组内变异。...（2）随着作者的cut off(德尔塔value）被选择，需要权衡差异基因数目和假阳性结果的数目（FDR）. 继而，有基于贝叶斯理论的moerated t-test。也是最常用的。
还是消费级VR的春天真的来了？...然后是关于当前正在进行的“30天无忧退”活动，今年4月有消费者在黑猫上投诉称，“30天无忧退货”是虚假宣传，前后所收到的规则并不一致。...陆续上线超过百部3D经典大片版权资源，不乏漫威系列、变形金刚、银翼杀手等影史传奇经典；日前，又宣布虚拟偶像女团A-SOUL正式入驻Pico平台，并于6月17日晚20：00举办首场VR夜谈；6月23日正式上线了系统级好友应用...多年来的经验告诉我们，国内的玩家更愿意接受“道具收费，游戏免费”的模式，虽然近年来Steam有些许改变，不过也还是小众用户，Pico能否扭转这一消费习惯也是未知。...Pico能否成为字节下一个“抖音”级产品？不如先定个小目标，鉴于Quest 2发售一年累计销量超400万台，Pico何时能达到400万销量时，或许才真正具备一战之力。 *本文图片均来源于网络
近花了一些时间研究了一下关于工规，车规和消费级芯片在设计要求上的一些差异。 有一个概念需要了解，车载芯片未必是车规。 汽车电子分前装，后装之分。前装主要是主机厂为整车厂做配套的。...而消费芯片和工规芯片，都可以用普通生产线来生产。晶圆厂会先开发消费级芯片工艺，然后再发展相应的车级工艺。如果想用某个工艺，则需要询问晶圆厂是否达到车规级标准。...寿命：消费电子 3~5年，工规，10年，车规 15（按照每天15%使用时间）年。 可靠性标准：消费：JESD47， 工规：JESD47， 车规：AEC－Q100 温度，这里指的是环境温度。...消费级：-20~60度，工规级：-40~85度，车规级 －40~85度。 关于良率，车规和工规更为严格的要求，需要DFT工程师提供覆盖率更高的设计和测试向量。...可以说，车规级芯片门槛是相当高的。
前 · 言 第二单元第七讲：统计细胞检测的基因数量 原文中根据5个指标对细胞进行过滤，其中第四个是利用有表达量的基因数量进行过滤 ?...但是要过滤就要有个基础，也就是有表达量的基因数量 之前在单细胞转录组学习笔记-5：https://www.jianshu.com/p/33a7eb26bd31中提到过 # 这里检测每个样本中有多少基因是表达的...，count值以1为标准，rpkm值可以用0为标准 n_g = apply(a,2,function(x) sum(x>1)) 这里主要是重复文章的一个小提琴图，目的是检测细胞中可以表达的基因数量： ?...先分析一下：横坐标没有说明，图中也没有分组，因此原文是将全部的基因都画在了一起，于是之前构建的样本meta信息中的all这一列就用上了 实际操作 原文使用的是RPKM值 rm(list = ls...小tip：如果说可视化分群结果，发现群组间基因数量差异太大，就要考虑技术差异问题，因为由于生物学导致几千个基因关闭的可能性不是很大，可以换一种聚类算法试一试目前单细胞也有很多采用dbscan算法进行的聚类分析
许多使用消费级云存储产品的公司都面临着不同程度的安全风险，因此企业可以尝试采用IT部门和普通员工都能够接受的企业级文件同步和共享解决方案。...但是如果IT部门不仔细监控和规范数据存储方式，那么企业员工就会使用像Dropbox和Google Drive这样的消费级云产品来存储企业敏感信息。...尽管存在某些安全风险，但是相关厂商已经考虑到企业IT部门的顾虑，市场上的很多消费级云储存产品已经综合考虑了其易用性和安全性。...对于企业级文件同步和共享产品来说，用户通常希望实现四个目标：安全、消费级易用性、可扩展性以及能够集成到更大的平台当中，内容共享和协作厂商Huddle的CEO Alistair Mitchell表示。...但是由于邮件不能满足内容管理和协作需求，因此企业发现员工并没有采用IT部门批准的方式，而是使用像Dropbox这样的消费级产品。
基因融合指的是两个或者多个基因的部分序列结合到一起形成了一种新的基因。...随着高通量测序的发展，我们可以利用二代测序的数据来鉴定出发生在不同疾病当中的融合基因，所以也就出现了很多来寻找融合基因的数据库。今天就来给大家介绍几个融合基因查询的数据库。 ?...我们可以在表格当中看到哪两个基因存在融合关系。 ?...如果我们想要看其中一个融合基因的相互作用关系的话，可以点击具体的某一个融合基因，下面就会显示其基本的信息，其中包括：具体的融合方式、各自基因的蛋白相互作用、基因表达情况、和拷贝数的关系以及融合相互作用关系图...同时数据库结合了多种检测数据，基本上这个算是目前很全的关于融合基因检测的数据库了。数据库的检索方式也很简单，这个大家一看就懂。限于文章的篇幅，我们就不介绍了(主要是这个数据库的界面，看着乱。。。) ?
impute.me是个可以让你DIY分析你的基因组的网站，我的基因检测结果是没有提供impute(基因型填充)的，这个网站方便地进行了基因型填充，还有各个基因特征的预测，赞一个！...当然，这个基因型填 充是基于千人基因组计划进行的，数据结果估计不会像国内测了几十万人的准确。...有这么几个项目，分别对应了几个药物，这些应该是科学上研究比较明确的，一般测的项目全的基因检测公司都会有的项目。...基因突变 基因组中的大多数SNP实际上并未在基因中发现：它们是“基因间的”。然而，当谈论基因突变时，正如在流行媒体中所做的那样，通常意思是改变基因序列的SNP。...许多只能通过测序检测，例如来自无数的遗传学。然而，通过插补分析可以获得数十种额外可能的感兴趣突变。以下列出了直接测量的三个23andme-SNP以及两个基因中错误或无意义的所有其他推测SNP的基因型。
图像中存在很多物体拐角，本文记录像素级角点检测算法 Harris 和 Shi Tomasi。 角点简介 在现实世界中，角点对应于物体的拐角，道路的十字路口、丁字路口等。...()，它不仅支持 Harris 角点检测，也支持 Shi Tomasi 算法的角点检测。...但是，该函数检测到的角点依然是像素级别的。 角点检测基本原理 人眼对角点的识别通常是在一个局部的小区域或小窗口完成的。...； 增大 α 的值，将减小角点响应值 R，降低角点检测的灵性，减少被检测角点的数量； 减小 α 值，将增大角点响应值 R，增加角点检测的灵敏性，增加被检测角点的数量； 同时邻域的大小也会影响角点的检测...useHarrisDetector 用于指定角点检测的方法，如果是 true 则使用 Harris 角点检测，false 则使用Shi Tomasi 算法。
消费者优先级 消费者优先级的机制： 高优先级的消费者处于活跃状态的情况下优先接收和处理消息。 消息会流入到低优先级的活跃消费者仅当高优先级的消费者处于阻塞状态。...当使用了消费者优先级，如果多个活跃消费者使用了相同的高优先级属性，那么消息投递也是以循环的方式进行(其实使用了相同的优先级类似于没有启用优先级)。...启用消费者优先级的时候，RabbitMQ会优先投递消息到优先级属性比较高的消费者，但是如果所有优先级高的消费者都处于阻塞状态，RabbitMQ会把消息投递到活跃的优先级稍低的消费者，而不是一直等待优先级高的消费者解除阻塞...使用消费者优先级特性 在使用basic.consume方法可以设置参数x-priority的值为整数，数字越大则优先级越高，未设置则使用默认值0。...，后者的优先级为100，而前者的优先级为10。
众所周知，samtools加bcftools的找变异流程的运行速度是非常慢的，如果是全基因组，可能得耗费三五天。可以说是 比已经慢的发指的gatk流程还磨人！...但是，我们经常对某些细胞系进行有针对性的设计变异，比如BAF155的R1064K呀，H3F3A的K27呀，那我我们拿到高通量测序数据的时候，就肯定希望可以快速的看看这个基因是否被突变成功了。...假设，我们已经得到了所有样本的sort好的bam文件，想看看自己设计的基因突变是否成功了，可以有针对性的只call 某个基因的突变！...dbtype knownGene --geneanno --outfile H3F3A.anno H3F3A.annovar ~/biosoft/ANNOVAR/annovar/humandb/ 需要自己制作好基因的起始终止坐标文件...，这样就可以找到自己的基因的位置，比如我的H3F3A是chr1:226249552-226259702，用bcftoolls简单的call variation即可，得到的vcf文件用annovar注释一下
这个需求比较少见，主要是因为有很多朋友都做了基因检测芯片数据，而芯片检测的结果只有4列，分别是dbSNP数据库ID号，染色体，坐标，还有基因型。...1138913 TTrs201786281 1 1140851 CCw01001152631 1 1152631 CCrs2887286 1 1156131 CC 但是呢，大部分的基因检测结果注释都是基于...vcf文件的，vcf文件的详细介绍，我们以前讲过，就是 【直播】我的基因组28-必须要理解vcf格式记录的变异位点信息 #CHROM POS ID REF ALT QUAL...要想把基因检测芯片数据转为vcf格式就需要在充分理解vcf的基础上面再增加几个信息。 因为基因芯片的结果里面没有参考碱基是什么的信息，只有基因型，所以我们没办法判断纯合杂合或者突变。...10146 rs779258992 AC A1 10150 rs371194064 C T1 10165 rs796884232 A AC 这个文件我以前讲过： 【直播】我的基因组
当生物学研究人员晚上入睡时，他们通常会梦到基因组。...23andMe的CEO Anne Wojcicki也表示，对隐私的担忧是DNA检测销量下滑的主要原因。包括Nebula在内的几家新兴企业试图通过将人们的DNA放在区块链上的方式来解决这些问题。...今年夏天，他们增加了一个“赞助测序”模型，如果客户让Nebula与医药合作伙伴共享鉴定的DNA和其他数据，那么该模型将为客户提供免费的临床级基因组检测。...对整个基因组进行加密的计算成本要高得多，而在加密的基因组上运行计算的成本则会更高。 但这正是Nebula下一步要做的工作。...只有Nebula和基因组所有者才可以访问纯文本数据。最终想要实现的功能是，即使是Nebula也将无权访问，只有基因组所有者才能访问。
机器之心报道 机器之心编辑部 在消费级 GPU 上运行大规模模型是机器学习社区正面临的挑战。...实验表明，通过使用 LLM.int8()，可以在消费级 GPU 上使用多达 175B 参数的 LLM 执行推理，而不会降低性能。...该方法不仅为异常值对模型性能的影响提供了新思路，还首次使在消费级 GPU 的单个服务器上使用非常大的模型成为可能，例如 OPT-175B/BLOOM。
大多数大型语言模型(LLM)都无法在消费者硬件上进行微调。例如，650亿个参数模型需要超过780 Gb的GPU内存。这相当于10个A100 80gb的gpu。...总结 LoRa让我们的微调变得简单，而QLoRa可以让我们使用消费级的GPU对具有10亿个参数的模型进行微调，并且根据QLoRa论文，性能不会显著下降。
而消费级基因检测作为其中的一个重要应用领域，更有望在未来五年内迎来几何状的高速增长期。...同时，伴随着消费者健康意识的增强，健康消费观升级，越来越多的人开始关注自身的身体健康、营养情况等深层次需求。 而消费主体年轻化也成为消费级基因检测市场的增长原因之一。...80后、90后作为当下的消费主力军，更乐于尝试新鲜事物，且渴望认知自己，而基因检测的手段很好的满足他们对自身遗传和身体健康信息的好奇心，这直接促进了消费级基因检测产品多样性发展。...事实上，消费级基因检测在商业领域引爆的关键因素就在于检测的技术突破促使成本降低，逐渐使得该项服务被大众消费所接受。 ?...如今，随着市场竞争的日趋白热化，整体行业的发展也开始进入“双腿跑步”的阶段，可以发现，是否拥有以下两大特征是当前消费级基因检测企业能否“跑”出来的原因： 数据分析能力成关键 从宏观层面来讲，中国大多数消费级基因检测公司都处于
在此背景下，个性化医疗和基因检测在美国迅速找到了发展的土壤。过去的几年里，人类对蛋白质组和代谢途径的了解和认识已大大增加。...虽然这类基因检测技术已经非常成熟，且应用广泛，但也逐渐显现出专业化和专业认证的趋势。...比如近期基因检测买方公司信诺决定，他们不会支付任何BRACAnalysis测试的费用，除非由一个委员会认证的遗传学家亲自检测，必须是由经过独立专业训练的遗传学专业，如医学遗传学家或顾问且拥有美国遗传学委员会认证的检测实验室...换句话说，基因检测手段很成熟，很多实验室都能实现，然而检测结果的解读却非常困难，因为这依赖于基于大数据上的数据库。 比如，Myriad最值得骄傲的就是拥有专有数据库，它用来解释不确定的遗传检测结果。...当然，随着时间的推移这种优势会慢慢减弱，但是无论如何，这从侧面说明了数据库在基因检测中的核心作用。
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