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添加用于ggpubr统计测试比较的括号

括号的添加用于ggpubr统计测试比较。

括号在统计学中常用于表示比较组之间的显著性差异。在ggpubr中,可以使用括号来标记统计测试比较的结果,以便更直观地展示不同组之间的差异。

在ggpubr中,可以通过添加add_comparison()函数来添加括号。这个函数需要指定需要进行比较的组合,以及使用的统计检验方法。常用的统计检验方法有t检验、方差分析(ANOVA)等。

以下是一个示例代码,展示了如何使用ggpubr添加括号进行统计测试比较:

代码语言:txt
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library(ggplot2)
library(ggpubr)

# 创建一个数据集
data <- data.frame(
  group = rep(c("A", "B", "C"), each = 10),
  value = c(rnorm(10, mean = 5), rnorm(10, mean = 7), rnorm(10, mean = 9))
)

# 绘制箱线图
p <- ggboxplot(data, x = "group", y = "value",
               color = "group", palette = "jco",
               add = "jitter")

# 添加统计测试比较的括号
p <- add_comparison(p, group = c("A", "B"), 
                    test = "t.test", 
                    p.adjust.method = "holm")

p <- add_comparison(p, group = c("A", "C"), 
                    test = "t.test", 
                    p.adjust.method = "holm")

p <- add_comparison(p, group = c("B", "C"), 
                    test = "t.test", 
                    p.adjust.method = "holm")

# 显示图形
print(p)

在上述示例中,首先创建了一个包含组别和数值的数据集。然后使用ggpubr的ggboxplot()函数绘制了箱线图,并设置了颜色和调色板。

接着,使用add_comparison()函数分别添加了组A和组B、组A和组C、组B和组C之间的统计测试比较。在这个示例中,使用了t检验作为统计检验方法,并使用holm法进行多重校正。

最后,通过print()函数显示了带有括号的箱线图。

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