我想从一个8*6的数据帧生成一个热图。dataframe中的最后一行包含注释列的信息。data.frame", row.names = c("Gut", "AL")) 我的热图生成代码如下)(n=100),cellwi
浏览 1379提问于2020-11-28得票数 0
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有人知道R中heatmap.2的“颜色键和直方图”中的线条吗？当我生成热图时，一些线出现在颜色键部分，我不知道它们代表什么。(下图中的绿线) ?
浏览 14提问于2020-04-06得票数 1
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所以我试着在R中生成一个热图用于基因表达分析...我在C中有536 GB的内存，但是当我尝试执行热图时，它显示了这条消息。错误:无法分配11.1 Gb大小的向量另外:警告消息: 1: In distfun(x)：已达到总分配3544Mb:请参阅帮助(memory.size)
我怎么才能解决这个问题呢？我正在Windows操作系统中运行R，64位
浏览 2提问于2015-08-29得票数 0
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热图生成
、、
我需要一些关于在R中用heatmap.2生成热图的建议，我有一个基因表达值矩阵，它有15,616行和27列，用于生成热图。问题是我正在使用的代码是创建热图，但是可视化效果并不好，因为矩阵大小很大。那么，你能给我一些建议，如何从这么大的矩阵中得到一个合适的热图吗？我正在附加用于生成热图和收到的警告的命令。如果有人能帮助我调整尺寸以
浏览 3提问于2013-05-07得票数 1
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GridSearchCV结果热图
、、、、
我正在尝试为sklearn的GridSearchCV结果生成一个热图。我喜欢sklearn-evaluation的一点是它非常容易生成热图。然而，我遇到了一个问题。当我给一个参数为None时，例如 max_depth = [3, 4, 5, 6, None] 在生成热图时，它显示以下错误： TypeError: '<' not supported between我已经找到了其他生成<
浏览 37提问于2021-06-26得票数 4
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我正在尝试学习如何在R中生成热图，所以如果这些问题看起来非常基础的话，很抱歉。")), 我想生成一个热图aes(color="white"))
我还希望颜色范围从黄色到红色，基于
浏览 3提问于2015-04-07得票数 1
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我是R的新手，我正在尝试生成一个热图，作为一个管道的一部分，稍后它将把热图与代谢途径联系起来。我有以下表格的excel文件中的数据：
tissue1 tissue2 tissue3 ...我的目标是有某种函数或方法，我可以调用它，它将只为适当的行生成一个热映射，类似于heatmap(gene2)。我大约有800排。我希望每个热图都有一个独立的比例尺(索引在其他行上)，这有可
浏览 5提问于2014-02-03得票数 1
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我想生成一个热图，用颜色渐变显示我的物种的丰富度。Here is the header of the data 有没有R或R代码的软件包可以帮助我将其可视化为热图(地理)？ 提前感谢
浏览 14提问于2019-10-13得票数 0
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我正在尝试对蛋白质dna相互作用数据集进行聚类，并使用R包gplots中的heatmap.2绘制热图。下面是我生成这些图的完整过程:使用一些相关性生成距离矩阵，在我的例子中是pearson。mtscaled, Colv=T,Rowv=T, scale='none',symm = T, col = brewer.pal(9,"Reds"))通过执行以下操作，我可以使用正常的热图</e
浏览 0提问于2012-09-21得票数 10
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我正试着给我的corrplot热图添加一个第二色的标签键。我已经使用r值生成了热图。我有两个数据集，其中一个包含我用来构建相关矩阵的数据。第二个是基因及其来源的列表。我想在图的左边加一个颜色标签，表明每个基因的来源。下面是我想要添加的类别： 基因来源 X人类 Y HumanMouse Z鼠标 ? 谢谢 编辑:这是我的热图的代码 corrplot(upreg_cor$r, type = "upper&q
浏览 27提问于2019-01-29得票数 0
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我想要绘制一个与R中的矩阵相对应的热图，我使用以下命令：问题是，heatmap命令似乎要分别为每一列生成热图，而不考虑整个矩阵。
浏览 3提问于2014-05-27得票数 1
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我想知道是否有人对在R中显示带有{网状}的Seaborn图有任何见解。inbuilt AirPassengers dataset#converting Time-Series object into an R() that converts R object into a python
sns$heatmap(r_to_py(df1), fmt="g", cmap ='viridis&#x
浏览 4提问于2021-12-03得票数 1
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我想在R中生成一个热图/相关图，我已经研究过各种包，比如corrplot、ggcorrplot和pheatmap，但是我发现很难到达我想要的地方。
我会很感激你的帮助。谢谢。
浏览 0提问于2019-07-19得票数 1
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在R中，有一个用树状图生成热图的函数，称为pheatmap::pheatmap。minkowski是pheatmap绘制树状图的距离测量选项之一。但是，如何在函数pheatmap中设置p (明可夫斯基距离的幂)？
谢谢。
浏览 17提问于2017-06-16得票数 0
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当我在R中应用热图函数时，结果是一个二次热图。我希望热图具有与我的输入矩阵(平方单元)相同的比例。当你生成mtcars数据集的热图时，你会得到一个二次热图。即使输入矩阵是矩形的。dim(mtcars)
heatmap(as.matrix(mtcars), scale = "none", Rowv = NA, Colv = NA) 我希望
浏览 37提问于2019-04-19得票数 0
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我已经在python3中使用seaboard生成了2000张热图。问题是它也会生成一个白色的边框。我只想保存热图。我想删除这些白色边框，因为我想根据这些热图训练我的模型，我认为拥有这些边框可能会扰乱结果。因为每个热图都有这个边界，所以这些边界很重要吗？ 我写的生成这些热图的代码。False)
浏览 138提问于2019-01-17得票数 1
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我正试图用透明的彩色地图创建一个带有海运的热图，因为图像应该显示在背景中。到目前为止，热图的创建工作得很好，但是，即使热映射的线宽设置为0.0，单元格之间的一些行仍然是可见的。创建热图的代码如下所示：ax.collections[0].set_alpha(0.5生成的热</e
浏览 3提问于2018-12-11得票数 3
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我用我的基因表达(TPM) csv数据在R中生成热图。这是我用过的密码。> library(ggplot2)> exp.data<-read.csv(file="C:/R/Bulk-seq_DEG.csv")> head(exp.data_matrix)
> heatmap(exp.data_matrix, Rowv=N
浏览 2提问于2021-09-17得票数 0
我试图用ggplot2和stat_density2d在R中构造一个密度热图。虽然它给了我一个在两个轴上的密度图，但它在期望的热图旁边产生了奇怪的三角形空间。我遵循这个，因此下面的代码生成热图本身(不散布)：
# HEATMAP看起来R是连接点，但突然跳到另一边的情节
浏览 2提问于2016-04-06得票数 2
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