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kerash5模型换为tensorflowpb模型操作

背景:目前keras框架使用简单,很容易上手,深得广大算法工程师喜爱,但是当部署到客户端时,可能会出现各种各样bug,甚至不支持使用keras,本文来解决kerash5模型换为客户端常用...pb模型,代码及排坑 我是在实际工程中要用到tensorflow训练pb模型,但是训练代码是用keras写,所以生成keras特定h5模型,所以用到了h5_to_pb.py函数。...附上h5_to_pb.py(python3) #*-coding:utf-8-* """ keras.h5模型文件,转换成TensorFlowpb文件 """ # ==============...下边是两个函数介绍: save()保存模型结果,它既保持了模型图结构,又保存了模型参数。...save_weights()保存模型结果,它只保存了模型参数,但并没有保存模型图结构 以上这篇kerash5模型换为tensorflowpb模型操作就是小编分享给大家全部内容了,希望能给大家一个参考

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JMC|用于从头药物设计生成模型

随着计算机科学快速发展,人工智能(AI)方法在图像处理、模式识别和自然语言处理等领域取得了成功。机器学习,尤其是深度学习也被应用于药物发现,例如预测化合物性质和活性以及它们与蛋白质靶标的相互作用。...当 RNN 模型用于从头药物设计时,分子可以表示为序列(例如使用 SMILES),在用大量SMILES字符串训练后,RNN模型可以用来生成一个、原始数据集中不包含有效SMILES,因此可以认为是一个分子结构生成模型...GAN包括一个生成器 G 和一个判别器 D(图 3A)。通常,生成器学习随机噪声映射到需要接近数据分布特定分布,而判别器确定输入是真实数据还是生成器生成样本,通常是二元分类器。...如何评估模型质量和生成分子仍然是一个悬而未决问题,这需要共同努力以更好地改进基准评估方法并评估已发布生成模型能力。 现有研究另一个明显缺点是缺乏实验验证。...此外,在生成模型用于药物设计时,需要严格评估生成分子新颖性。 总的来说,我们才刚刚开始使用生成模型设计分子,这种模型还有很多方面需要进一步改进,需要更多计算和实验验证以及基准测试。

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LLM2Vec介绍和Llama 3换为嵌入模型代码示例

但是这篇论文LLM2Vec,可以任何LLM转换为文本嵌入模型,这样我们就可以直接使用现有的大语言模型信息进行RAG了。...嵌入模型和生成模型 嵌入模型主要用于文本数据转换为数值形式向量表示,这些向量能够捕捉单词、短语或整个文档语义信息。...最有名嵌入模型就是BERT是一个典型encoder-only模型 生成模型设计用来基于训练数据生成新数据实例。在NLP中,这通常意味着生成文本。...其实我们可以这篇论文重点简单理解为,如何一个decoder-only模型快速并且无损转换成一个encoder-only模型。...LLM2Vec 在论文中提出了一种名为LLM2Vec方法,用于仅解码器大型语言模型(LLM)转换为强大文本编码器。

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单个像素入射光转换为数字信号基本模型

在数码成像技术迅猛发展的当今时代,对图像质量追求已经穿越了摄影艺术领域,深入到了相机与手机设计、生产和制造一个环节。...不论是对那些致力于把握每一道光线摄影爱好者,还是那些精益求精、追求完美产品设计与制造专家,甚至是摄影技术运用于机器视觉和科学研究领域先行者们,理解和测量相机关键特性,已经成为确保成像质量关键所在...这个系列文章目标是为从业者提供一个坚实理论基础,配合实践中测量技巧,以科学方法提升和保障产品成像品质。...通过阅读这个系列文章,您将获得: 对光物理性质和光学系统深入理解; 关于数字图像传感器工作原理全面知识; 实际测量和评价图像质量技能; 以及这些知识应用于实际工作中能力。...比如,下面是我撰写最新章节截图,正在讨论单像素入射光转换为数字信号数学模型 下面是系列文章思维导图 文章预览截图:

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深度生成模型用于设计新颖多样抗菌肽

在此,我们提出了AMPTrans-lstm模型,一种基于深度生成网络合理设计AMPs方法。AMPTrans-lstm管道包括预训练、迁移学习和模块识别。...通过分析对比生成AMPs和训练AMPs,证明了AMPTrans-lstm可以扩展训练AMPs设计空间并产生合理和全新AMPs序列。 模型架构 (A) LSTM结构细节。...除了最后一层,所有的层都使用leakyReLU激活。最后一个卷积层使用双曲切线激活函数,卷积核大小为1。 (C) AMPTrans-lstm是一个深度生成模型,由三个模块组成。...我们在一个大数据集上预训练了Transformer和LSTM模型,并在我们小数据集上对它们进行了微调。...在新样本生成过程中,我们通过LSTM采样生成了一些肽序列,然后将它们输入到Transformer模型中,用于解码新肽序列。之后,训练好QSAR模型被用来预测肽序列活性分数。

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共轭计算变分推理:非共轭模型变分推理转换为共轭模型推理 1703

专门为共轭模型设计方法,即使计算效率高,也难以处理非共轭项。另一方面,随机梯度方法可以处理非共轭项,但它们通常忽略模型共轭结构,这可能导致收敛缓慢。...这种模型被广泛应用于机器学习和统计学中,然而对它们进行变分推理在计算上仍然具有挑战性。 难点在于模型非共轭部分。...在本文中,我们这种计算称为共轭计算(下一节将给出一个例子)。 这些类型共轭计算已广泛用于变分推理,主要是由于它们计算效率。...这些方法一个优点是,它们可以作为一个黑盒,应用于各种各样推理问题。然而,这些方法通常不直接利用共轭性,例如在随机梯度计算期间。...对于这个模型类,我们梯度步骤可以写成一个信息传递算法,其中VMP或SVI用于共轭部分,而随机梯度用于其余部分。当模型是共轭时,我们算法方便地降低到VMP。

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​ ProtGPT2是一个用于蛋白质设计深度无监督语言模型

简读分享 | 蒋一 编辑 | 李仲深 论文题目 ProtGPT2 is a deep unsupervised language model for protein design 论文摘要 蛋白质设计目的是建立为特定目的来定制新型蛋白质...最近在基于Transformer架构方面取得进展使得语言模型实现能够生成具有类似人类能力文本。...在这一成功激励下,作者描述了ProtGPT2,一个在蛋白质空间上训练语言模型,它按照自然原则生成新蛋白质序列。...生成蛋白质显示出自然氨基酸倾向,而无序预测表明,ProtGPT2生成蛋白质中88%是球状,与自然序列一致。...对ProtGPT2序列AlphaFold预测产生了具有体现和大循环折叠良好非理想化结构,并揭示了目前结构数据库中没有捕获拓扑结构。

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Briefings in Bioinformatics | 用于PPI抑制剂设计深度分子生成模型

作者构建了一个蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)靶向药物相似性数据集,并提出了一个首次用于PPI抑制剂设计深度分子生成框架,从种子化合物特征生成新类药性分子。...该框架使用与PPI抑制剂相关关键特征作为输入,并为PPI抑制剂从头分子设计开发深度分子生成模型。首次针对PPI抑制剂定量类药性指标QEPPI用于PPI靶向化合物分子生成模型评估。...传统计算机引导 PPI 抑制剂设计已取得重大进展,并且分子生成模型近年来得到了迅速发展。不幸是,迄今为止,尚未将基于深度生成模型方法应用于 PPI 抑制剂设计。...该研究首次探索了PPI 抑制剂分子生成模型从头分子设计。研究人员模型表现出与各种最先进分子生成模型相当性能。该模型首次QEPPI应用于分子生成模型中生成分子PPI药物相似性评估。...目前是第一次深度分子生成模型用于 PPI 抑制剂从头设计。此外,首次应用 QEPPI 作为分子生成模型评估指标用于PPI靶向化合物分子设计

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用于分子Linker设计等变3D条件扩散模型

在这项工作中,我们提出了一个扩散模型一个E(3)等变3D条件扩散模型分子连接设计模型。给定一组不相连片段,我们模型缺失原子放在中间,并设计一个包含所有初始片段分子。...早期分子连接设计计算方法是基于数据库搜索和物理模拟,这两种方法都是计算密集型。现有的方法要么基于语法模式识别,要么基于自回归模型。...此外,DiffLinker调节机制允许传递关于周围蛋白质口袋原子额外信息,这使该模型用于基于结构药物设计应用。 我们经验表明,在生成片段对之间化学相关连接方面比以前方法更有效。...3 方法 在本节中,我们介绍DiffLinker,一种新E(3)等变扩散模型用于生成以3D片段为条件分子连接。我们制定了底层去噪分布等方差要求,并再提出了一个可学习动态函数。...更具体地说,我们假设每个点云x都有一个相应上下文u,这是另一个由所有输入片段和蛋白质口袋原子组成点云,这些原子在整个扩散和去噪过程中保持不变,如图1所示。

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PNAS | 开发用于优化蛋白质设计3D模型

研究人员开发了一个计算程序,以帮助设计治疗用蛋白质,预测相互作用。 ? 研究人员已经开发出一种过程,他们说这种过程可以减少计算蛋白设计所涉及工作。...为了开发一种优化设计方法,研究小组扫描了包含150,000种已知蛋白质3D模型数据库。他们发现蛋白质中经常会出现少量结构模式,并且蛋白质结构中许多多样性都来自于这些结构单元组合方式。...这一发现使研究小组提出了一个假设,即与其蛋白质建模为相互作用原子复杂网络,不如将它们更简单地表示为一组有限结构构件组合。 ?...研究人员说,使用这种新方法,可以更容易地根据建立模式来判断新蛋白质结构。该方法使科学家能够参考已知结构库,从而轻松地尝试更具创意设计。...新工艺着眼于蛋白质中存在较大原子块(称为第三基序),以设计功能性蛋白质。这些是反复出现结构布置,类似于建筑物中拱门或立柱,可用于设计新颖蛋白质而无需考虑其原子级组成。

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Vision Mamba:Mamba应用于计算机视觉任务模型

因为图像不仅仅是像素序列;它们还包含复杂模式,变化空间关系,以及理解整体环境需要。这种复杂性使得视觉数据有效处理成为一项具有挑战性任务,特别是在规模和高分辨率下。...这种方法解决了可视数据固有的位置敏感性,这是传统Transformer模型经常遇到一个关键问题,特别是在更高分辨率下。...Vision Mamba Encoder Vim模型首先将输入图像划分为小块,然后小块投影到令牌中。这些令牌随后被输入到Vim编码器中。...与用于文本序列建模Mamba模型不同,Vim编码器在正向和反向两个方向上处理标记序列。 还记得双向LSTM么,Vim一个突出特点是它双向处理能力。...总结 论文介绍了一种Mamba用于视觉任务方法,该方法利用双向状态空间模型(ssm)进行全局视觉上下文建模和位置嵌入。

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​薛定谔高级总监|AlphaFold模型可以用于基于结构药物设计

就目前而言,AlphaFold2无法模拟这些非常重要影响。 问:AlphaFold模型可以用于基于结构GPCR设计吗?...在预测正确配体结合模式以及在计算预测和实验数据之间建立稳健相关性、以推动GPCR前瞻性设计方面,存在着几个关键障碍。...我们特别选择了那些既没有公开实验结构,也没有近似同源实验结构制药靶点--要求AlphaFold建立一个与已有模型相似度高达95%蛋白质模型是没有意义。...为了完善用于前瞻性设计GPCR AlphaFold模型,我们采用了两种基于物理学技术:IFD-MD(配体灵活地对接到结合位点)和 FEP+(我们基于自由能扰动计算结合亲和力测定),以对模型提出定量挑战...我们研究结果表明,一旦应用基于物理技术对AlphaFold模型进行了适当改进,它们就可以用于基于结构GPCR设计

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Follow-Your-Emoji,基于扩散模型动态表情肖像动画生成模型,可以参考头像表情和动作转换为动画

香渊科技与香港科技大学和清华大学研究团队合作开发了一款名为“Follow-Your-Emoji”创新人像动画框架,这一技术基于扩散模型,能够静态肖像转化为表情丰富动画。...动画生成过程中,通过使用扩散模型(Stable Diffusion)和表情感知标志点技术(Expression-Aware Landmark),此框架能够精确控制动画一个细节。...无论是通过单一动作序列驱动多个不同参考头像,还是使用单一参考头像结合多个不同驱动视频,Follow-Your-Emoji都能提供一致和高质量动画效果。...总的来说,Follow-Your-Emoji技术开发不仅展示了扩散模型在动画制作中强大潜力,也为动画制作行业带来了新工具,使得个性化和动态内容创作更加方便和精确。...这一技术推广和应用,预示着我们进入了一个全新、高度互动数字娱乐时代。

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清华大学发布珠算:一个用于生成模型Python库

在峰会第一天下午「机器学习」主题 Session 上,清华大学副教授朱军分享解读《珠算:贝叶斯深度学习 GPU 库(ZhuSuan: a GPU Library for Bayesian Deep...)是一个构建于 TensorFlow 之上用于生成模型(Generative Model) Python 库。...和现有的主要为有监督学习任务设计深度学习库不同,珠算主要特点是其在很大程度上植根于贝叶斯推理(Bayesian Inference),因此,珠算能支持各种生成模型:既包括传统分层贝叶斯模型(如话题模型...文档 在线文档地址:http://zhusuan.readthedocs.io/ 其中包含三个使用教程(Tutorials)和代码API文档: 变分自编码器分步实现 ZhuSuan中基本概念 用于多元回归问题贝叶斯神经网络...:HMC 开发 如果要以「可编辑」或「开发」模式安装珠算,在主目录下运行: pip install -e .

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Django小技巧22: 设计一个模型

翻译整理自: simpleisbetterthancomplex.com 本篇分享一些技巧,用户改进 Model 设计。其中有很多与命名约定有关, 这可以大大提高代码可读性。...模型定义是对单个对象表示, 而不是公司集合. 这通常会导致混淆,因为我们倾向于通过数据库思考。模型最终被翻译成table.该表使用其复数形式命名....related_name 可以为反向关系定义一个有意义名称 经验法则: 如果你不确定related_name是什么, 请使用包含所定义ForeignKey模型复数形式....employees特殊属性, 该属性返回一个 QuerySet,其中包含与此公司相关所有员工实例 Python google = Company.objects.get(name='Google')...虽然两者是有区别的, 但一个拥有null=True和blank=False字段是完全没有问题

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Mac 开发之 做一个JSON模型属性小公举

图片来自网络 在Xcode8 以前各种插件可以使用时候,就有一个可以根据Json内容来生成模型对应Property属性,节省了开发者要手写时间,但由于各种插件给使用方便同时,也给Xcode...,然而这种新插件方式制作插件,在运行时与Xcode不在同一个进程,因此失去了原来许多便捷地方(当然,安全性更好了,这是一个取舍结果) 基于上面的原因,加上继续学习Mac开发练习,我们可以手动尝试自己做个工具...根据Json 内容生成 模型对应property 标识 2. 清空和复制已经转换后结果 好了,学无止境,现在就重头开始一步一步来完成这个小工具吧~ 0....由于窗口有两个水平方向文本视图,因此我把窗口最小初始化size设置为(900,323),这样整个界面看起来是一个水平长方形,便于操作和阅读 设置window最小size 3....选中ViewController.m文件,进行视图初始化设置 初始化设置 这里有个细节需要注意: 在Mac OSX中,使用NSTextView控件进行文本输入时,系统会自动英文双引号变为中文双引号

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资源 | 清华大学发布珠算:一个用于生成模型Python库

在峰会第一天下午「机器学习」主题 Session 上,清华大学副教授朱军分享演讲《珠算:贝叶斯深度学习 GPU 库(ZhuSuan: a GPU Library with Bayesian Deep...库 珠算(ZhuSuan)是一个构建于 TensorFlow 之上用于生成模型(Generative Model) Python 库。...和现有的主要为监督式任务设计深度学习库不同,珠算特点是其在很大程度上根基于贝叶斯推理(Bayesian Inference),因此支持各种生成模型:既包括传统分层贝叶斯模型,也有最近深度生成模型...在第一个稳定版(1.0)发布之前,请在主目录中运行以下代码来克隆这个库: pip install . 这会自动安装珠算及其依赖包。 如果你正在开发珠算,你可能需要以「可编辑」或「开发」模式进行安装。...:HMC 开发 如果要以「可编辑」或「开发」模式安装珠算,在主目录下运行: pip install -e .

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