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R语言广义线性混合模型(GLMM)bootstrap预测置信区间可视化

library(lme4) # 加载lme4包,用于线性混合效应模型的分析 # 第一个案例:简单的线性混合效应模型,从10个组中模拟100个数据点,具有一个连续的固定效应变量...并使用bootMer函数进行了自助法(bootstrap)来估计置信区间。...1.96 * sqrt(pvar1), # 预测区间的下限 # 第二版:使用bootMer进行自助法估计置信区间 # 定义一个函数,该函数应用于nsim次模拟,返回拟合值...计算预测值的方差(pvar1),进而得到预测区间。 计算包含随机效应方差的总方差(tvar1),进而得到置信区间。 使用bootMer函数进行自助法抽样,估计置信区间。...通常,我们会使用自助法(bootstrap)或者基于模型的近似方法来估计这些区间。

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R语言使用bootstrap和增量法计算广义线性模型(GLM)预测置信区间

p=15062 ---- 考虑简单的泊松回归 。给定的样本 ,其中 ,目标是导出用于一个95%的置信区间 给出 ,其中 是预测。...因此,我们要导出预测的置信区间,而不是观测值,即下图的点 > r=glm(dist~speed,data=cars,family=poisson)> P=predict(r,type="response...这些值的计算基于以下计算 在对数泊松回归的情况下, 让我们回到最初的问题。 线性组合的置信区间 获得置信区间的第一个想法是获得置信区间 (通过取边界的指数值)。...+1.96*P2$se.fit),col="blue",lwd=3) 基于该技术,置信区间不再以预测为中心。...+1.96*P2$se.fit)1173.9341> P1$fit+1.96*P1$se.fit1172.9101 bootstrap技术 第三种方法是使用bootstrap技术基于渐近正态性(仅50个观测值

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    R语言基于Bootstrap的线性回归预测置信区间估计方法分析汽车制动距离|数据分享

    p=21625 我们知道参数的置信区间的计算,这些都服从一定的分布(t分布、正态分布),因此在标准误前乘以相应的t分值或Z分值。但如果我们找不到合适的分布时,就无法计算置信区间了吗?...幸运的是,有一种方法几乎可以用于计算各种参数的置信区间,这就是Bootstrap 法。 相关视频 本文使用BOOTSTRAP来获得预测的置信区间。...当我们想给预测一个置信区间时,预测的置信区间取决于参数估计误差。...R语言Bootstrap、百分位Bootstrap法抽样参数估计置信区间分析通勤时间和学生锻炼数据 01 02 03 04 预测置信区间 让我们从预测的置信区间开始 > for(s in 1:500)...现在让我们看看另一种类型的置信区间,关于感兴趣变量的可能值。

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    R语言使用bootstrap和增量法计算广义线性模型(GLM)预测置信区间|附代码数据

    给定的样本 ,其中 ,目标是导出用于一个95%的置信区间 给出 ,其中 是预测。...因此,我们要导出预测的置信区间,而不是观测值,即下图的点 > r=glm(dist~speed,data=cars,family=poisson) > P=predict(r,type="response...这些值的计算基于以下计算 在对数泊松回归的情况下, 让我们回到最初的问题。 线性组合的置信区间 获得置信区间的第一个想法是获得置信区间 (通过取边界的指数值)。...+1.96*P2$se.fit),col="blue",lwd=3) 基于该技术,置信区间不再以预测为中心。...我们的想法是从数据集中取样,并对这些新样本进行log-Poisson回归,并重复很多次数, ---- ---- 本文选自《R语言使用bootstrap和增量法计算广义线性模型(GLM)预测置信区间

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    R语言使用bootstrap和增量法计算广义线性模型(GLM)预测置信区间|附代码数据

    p=15062 最近我们被客户要求撰写关于广义线性模型(GLM)预测置信区间的研究报告,包括一些图形和统计输出。...考虑简单的泊松回归 我们要导出预测的置信区间,而不是观测值,即下图的点 > r=glm(dist~speed,data=cars,family=poisson) > P=predict(r,type="...这些值的计算基于以下计算 在对数泊松回归的情况下, 让我们回到最初的问题。 线性组合的置信区间 获得置信区间的第一个想法是获得置信区间 (通过取边界的指数值)。...+1.96*P2$se.fit),col="blue",lwd=3) 基于该技术,置信区间不再以预测为中心。...(P2$fit+1.96*P2$se.fit) 1 173.9341 > P1$fit+1.96*P1$se.fit 1 172.9101 bootstrap技术 第三种方法是使用bootstrap技术基于渐近正态性

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    用于时间序列预测的AutoML

    成对的数字特征的数字运算(加,减,乘和除)始终会提高基于树的模型的得分,因为新特征可能会揭示数据中的某些隐藏关系。 例如,预测一下公寓的价格。...但是,如果执行所有可能对的数值运算,则此类特征工程策略存在两个重大问题:过拟合(在时间序列任务中尤其重要)和内存问题(使用了16个RAM泊坞窗)。为了减少负面影响,选择了一小部分特征并将其用于对。...在这次比赛中,可以频繁更新模型,因此验证部分应该较小:验证部分是全部训练数据的10%。它用于早期停止,即在增强合奏时优化树木的数量。...完成此步骤后,模型可以开始进行预测,并且随后的所有步骤都是可选的(bt对于获得高分至关重要)。 使用最佳数量的树,可以对完整数据进行模型拟合。 使用了单独的LigthGBM模型进行预测。...还用不同的种子测试了装袋和训练以减少预测的差异,但是这些方法花费了很多时间,并且得分的提高不足以包含在最终解决方案中。

    1.9K20

    用于时间序列预测的Python环境

    Python生态系统正在不断的成长和壮大,并可能成为应用机器学习的主要平台。 采用Python进行时间序列预测的主要原因是因为它是一种通用编程语言,可以用于研发和生产。...它是进行时间序列预测的一个Python附加内容。 两个SciPy库为大多数人提供了基础; 他们是NumPy用于提供高效的数组操作,Matplotlib用于绘制数据。...与pandas时间序列预测相关的主要功能包括: 用于表示单变量时间序列的_Series_对象。 显式处理数据和日期时间范围内的日期时间索引。 变换,如移位、滞后和填充。...它建立在SciPy生态系统的基础之上,并支持NumPy阵列和Pandas 系列对象形式的数据。 它提供了一套统计测试和建模方法,以及专门用于时间序列分析的工具,也可以用于预测。...它包括Python,SciPy和scikit-learn——您所需要的用于学习,练习和使用Python环境下的时间序列预测的所有环境。

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    用于预测恶劣天气的深度学习

    即使现在超级计算机的能力越来越强,数值天气模型的预测能力也只能维持6天左右,尽管它与地点、季节和天气模式的类型有一定的关系。 持续的天气模式往往是极端事件的驱动因素,尤其难以预测。...一般来说,数值天气模型在预测天气方面做得很好,但它们在极端天气方面仍然存在一些困难。“我们正在尝试用一种非常不同的方式来预测极端天气。”...在此期间,人们通过查看天气模式和模式匹配的目录来进行天气预测,这被称为模拟预测。但二战后,随着计算机的普及,气象学家们放弃了这种方法。...模拟技术是一种复杂的预测方法,它要求预报员记住一个即将发生的天气事件。这是一项很难使用的技术,因为在未来很少有一个完美的事件模拟。它仍然是观测海洋降雨以及预测降雨量和降水分布的一种有用方法。...我们将重点讨论提前时间较长的预测,因为数值模型的性能很差。如果成功,这将是天气预报的一大进步。”

    1.7K10

    Bioinformatics|接触预测的演化:用于接触预测的方法正在发展

    接触预测在蛋白质结构与功能的预测与分析中起着重要的作用。目前接触预测方法的数量在不断增多,如何评价这些方法各自的优缺点也便成了一个问题。...该研究选择了四种接触预测的方法:aMIc、CCMpred、metaPSICOV及DNCON2,从预测精度、预测集和背景集的比较、预测结果中接触残基对的分布与类型、保守序列中残基接触的预测等多个方面进行评估...几种方法从预测集预测的接触残基对中的键合作用要高于背景集,这说明几种方法所预测出的接触残基对可能存在键合作用。...此外,CCMpred预测的接触中多种键合作用类型的占比也更高,也就是说CCMpred预测的接触更可能具有生物学意义。...图一:四种接触预测方法在不同长度区间内的预测精度 ? 图二:(a)不同接触预测方法的预测集P与背景集BG的比对(b)不同方法预测出的接触残基对构成的各种结构的占比 ?

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    如何理解95%置信区间_95的置信区间和90的置信区间

    接下来看下区间估计: 给定置信水平,根据估计值确定真实值可能出现的区间范围,该区间通常以估计值为中心,该区间则为置信区间。...3.置信区间与置信水平 一般我们用中括号[a,b]表示样本估计总体平均值误差范围的区间。a、b的具体数值取决于你对于”该区间包含总体均值”这一结果的可信程度,因此[a,b]被称为置信区间。...一般来说,选定某一个置信区间,我们的目的是为了让”ab之间包含总体平均值”的结果有一特定的概率,这个概率就是所谓的置信水平。...例如我们最常用的95%置信水平,就是说做100次抽样,有95次的置信区间包含了总体均值。...从上面的例子来看,计算置信区间的套路如下: 1.首先明确要求解的问题。

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    深度解析机器学习中的置信区间(附代码)

    教程概览 本教程分为3个部分: 什么是置信区间 分类精度(accuracy)的置信区间 非参数(Nonparametric)置信区间 什么是置信区间 置信区间是总体变量估计的界限,它是一个区间统计量,用于量化估计的不确定性...置信区间也能在回归预测模型中用于呈现误差,例如:范围x到y覆盖模型真实误差的可能性有95%。或者,在95%的置信水平下,模型误差是x+/-y。...它们也可以被解释并用于比较机器学习模型。 ? 这些不确定性估计在两方面有帮助。首先,区间让模型的使用者了解模型的好坏。[…]这样一来,在比较不同模型时置信区间可以用于衡量证据的权重。...现在我们已经知道了什么是置信区间,让我们看几种给预测模型计算置信区间的方法。 分类精度的置信区间 分类问题是指给定一些输入数据,预测它们的标签或者类别结果变量。...或者,我们可能不知道计算性能分数置信区间的分析方法。 ? 参数型置信区间的假设经常不成立。预测变量有时不是正态分布的,即使是,正态分布的方差在预测变量的所有等级上可能也不相同。

    4.4K30

    【译】用于时间序列预测的Python环境

    采用Python进行时间序列预测的主要原因是因为它是一种通用编程语言,可以用于研发和生产。 在这篇文章中,您将了解到Python环境下的时间序列预测。...它是进行时间序列预测的一个Python附加内容。 两个SciPy库为大多数人提供了基础; 他们是NumPy用于提供高效的数组操作,Matplotlib用于绘制数据。...与pandas时间序列预测相关的主要功能包括: 用于表示单变量时间序列的_Series_对象。 显式处理数据和日期时间范围内的日期时间索引。 变换,如移位、滞后和填充。...它建立在SciPy生态系统的基础之上,并支持NumPy阵列和Pandas 系列对象形式的数据。 它提供了一套统计测试和建模方法,以及专门用于时间序列分析的工具,也可以用于预测。...它包括Python,SciPy和scikit-learn——您所需要的用于学习,练习和使用Python环境下的时间序列预测的所有环境。

    1.9K20

    R语言中回归模型预测的不同类型置信区间应用比较分析

    p=13913 我们讨论了使用程序来获得预测的置信区间的方法。我们讨论线性回归。...正如在R课堂上(以及在预测模型的过程中)所回顾的,当我们要为预测提供一个置信区间时,建议您为预测器确定置信区间(这将取决于预测误差)参数的估计)和潜在值的置信区间(这也取决于模型误差,即残差的离散度)。...让我们从预测的置信区间开始: abline(reg,col="light blue") points(x,predict(reg,newdata=data.frame(speed=x)),pch=...蓝色值是可能的预测,可以通过在我们的观察数据库中重新采样获得。...残差(以及因此的斜率和回归线的常数的估计值)的正态性假设下的置信区间(为90%)如下 lines(0:30,U[,2],col="red",lwd=2) lines(0:30,U[,3],col=

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    用于时间序列概率预测的蒙特卡罗模拟

    随着计算机性能的飞速发展,蒙特卡罗模拟的应用范围也在不断扩展。 在金融领域,蒙特卡罗模拟被广泛用于定价衍生品、管理投资组合风险、预测市场波动等。...当我们演示它的工作原理时,我将演示使用它来模拟未来股票价格的两种分布:高斯分布和学生 t 分布。这两种分布通常被量化分析人员用于股票市场数据。...为了预测明天的价格,我们可以随机抽取另一个收益率,从而推算后天的价格。通过这个过程,我们可以得出未来 200 天可能的价格走势之一。当然,这只是一种可能的价格路径。...这就是统计学家所说的肥尾,定量分析人员通常使用学生 t 分布来模拟股价收益率。 学生 t 分布有三个参数:自由度参数、标度和位置。 自由度:自由度参数表示用于估计群体参数的样本中独立观测值的数量。...: 实际收益与学生 t 分布预测对比 与之前一样,我们将模拟未来 200 天的价格走势。

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    AI绘画中UNet用于预测噪声

    介绍 在AI绘画领域中,UNet是一种常见的神经网络架构,广泛用于图像相关的任务,尤其是在图像分割领域中表现突出。...在这种结合中,UNet通常用于其强大的特征提取和重建能力,而扩散模型用于生成过程中的细节增强和变化模拟。...这种结合可以用于创造性绘画、图像修复、风格迁移等任务,其中不仅需要精确的图像内容,还需要高质量的图像纹理和细节。...这种方法的一个例子是将扩散模型用于生成纹理,然后通过UNet进行细化,以实现更高质量的图像输出。...UNet 应用 UNet架构最初是为医学图像分割而设计的,但由于其高效的特征学习和上下文整合能力,它已经被广泛应用于多种不同的图像处理任务。

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    计算与推断思维 十四、回归的推断

    首先,我们来看看我们是否相信,回归模型是一系列适当假设,用于描述出生体重和孕期之间的关系。...,我们调用bootstrap_slope来找到真实斜率的置信区间,我们得到了一个区间,非常接近我们之前获得的东西:大约 0.38 到 0.56 盎司每天。...下表显示了 10 条线的斜率、截距以及预测。 自举预测区间 如果我们增加重采样过程的重复次数,我们可以生成预测的经验直方图。这将允许我们创建预测区间,使用为斜率创建自举置信区间时的相同的百分比方法。...该函数有五个参数: 表的名称 预测变量和响应变量的列标签 用于预测的x的值 所需的自举重复次数 在每次重复中,函数将自举原始散点图,并基于x的指定值查找y的预测值。...因此,在开始基于模型进行预测,或者对模型参数进行假设检验之前,我们首先要确定回归模型是否适用于我们的数据。

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    R语言中回归模型预测的不同类型置信区间应用比较分析

    p=13913 我们讨论了使用程序来获得预测的置信区间的方法。我们将讨论线性回归。...正如在R课堂上(以及在预测模型的过程中)所回顾的,当我们要为预测提供一个置信区间时,建议您为预测器确定置信区间(这将取决于预测误差)参数的估计)和潜在值的置信区间(这也取决于模型误差,即残差的离散度)。...让我们从预测的置信区间开始: abline(reg,col="light blue")points(x,predict(reg,newdata=data.frame(speed=x)),pch=19,col...="blue") 蓝色值是可能的预测,可以通过在我们的观察数据库中重新采样获得。...残差(以及因此的斜率和回归线的常数的估计值)的正态性假设下的置信区间(为90%)如下 lines(0:30,U[,2],col="red",lwd=2)lines(0:30,U[,3],col="red

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    CycleMLP:一种用于密集预测的mlp架构

    但是它的参数大小是固定的,并且对图像尺度具有二次计算复杂度。 论文的Cycle FC:具有与通道FC相同的线性复杂度和比通道FC更大的感受野。 (d)-(f)为三个不同步长示例:橙色块表示采样位置。...为了简单起见省略了批处理尺寸,并将特征的宽度设置为1。 在保持计算效率的同时,扩大mlp类模型的接受域,以应对下游密集的预测任务。...基本的Cycle FC算子可以表述为: 大小为 Cin×Cout 的 Wmlp 和大小为 Cout 的 b 是Cycle FC的参数。...上表所示,更大的感受野带来了对语义分割和对象检测等密集预测任务的改进。同时,Cycle FC在输入分辨率上仍然保持了计算效率和灵活性,flop和参数数均与空间尺度呈线性关系。...打不世故GFNet与输入分辨率相关,这可能会影响密集预测的性能。 消融实验 左:移除三个平行分支中的一个后,top-1的精度显著下降,特别是在丢弃1×7或7×1分支时。

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    R语言中回归模型预测的不同类型置信区间应用比较分析

    p=13913 我们讨论了使用程序来获得预测的置信区间的方法。我们将讨论线性回归。...正如在R课堂上(以及在预测模型的过程中)所回顾的,当我们要为预测提供一个置信区间时,建议您为预测器确定置信区间(这将取决于预测误差)参数的估计)和潜在值的置信区间(这也取决于模型误差,即残差的离散度)。...让我们从预测的置信区间开始: abline(reg,col="light blue")points(x,predict(reg,newdata=data.frame(speed=x)),pch=19,col...="blue") 蓝色值是可能的预测,可以通过在我们的观察数据库中重新采样获得。...残差(以及因此的斜率和回归线的常数的估计值)的正态性假设下的置信区间(为90%)如下 lines(0:30,U[,2],col="red",lwd=2)lines(0:30,U[,3],col="red

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    用于时间序列预测的最佳深度学习模型总结

    并且所有前50名基本上都是基于ML的(大部分是树型模型)。这场比赛看到了LightGBM(用于时间序列预测)以及Amazon's Deepar [2]和N-Beats [3]的首次亮相。...外部学习过程发生在堆叠层,帮助模型学习所有时间序列的全局特征。 双重残差叠加:残差连接和叠加的想法是非常巧妙的,它几乎被用于每一种类型的深度神经网络。...每一个连续的块只对由前一个块重建的backcast产生的残差进行建模,然后基于该误差更新预测。这有助于模型更好地逼近有用的后推信号,同时最终的堆栈预测预测被建模为所有部分预测的分层和。...注意:原始的N-BEATS实现只适用于单变量时间序列。 DeepAR 结合深度学习和自回归特性的新颖时间序列模型。...我们将他总结为以下4点 1、掩蔽 作为数据进入编码器的前一步。输入序列(Sᶦ)已分布到P片中,其长度为L。因此,用于预测下一个时间步长的滑动窗口的langth是P XL。

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