泳道图可以展示不同患者在一定时间内接受不同治疗（或者处于不同时期）的情况，在肿瘤治疗领域的文献中很常见，但是竟然百度不到它的具体含义。。。...泳道图 上面这张图横坐标表示月数，纵坐标表示病人ID，一个条形就是一个病人，条形的颜色表示疾病的不同阶段，不同的形状表示肿瘤治疗中的起止，这张图是用SAS画出来的~ 复习下肿瘤领域的几个术语： 完全缓解...“数就是图，图就是数 这个图形其实不复杂，主体部分就是我们常见的条形图，再加上几个形状，无非就是不同的坐标进行映射即可。...在ggplot2中一旦你掌握了规律，修改这些东西真的非常简单！ ggplot2修改坐标轴详细介绍 超详细教程：修改ggplot2图例 下面就是修改细节。...以后还会分享一些中药数据挖掘方面的内容，长款数据转换将会是其中的核心技能~ 最后给大家看看怎么用Excel画泳道图：https://peltiertech.com/swimmer-plots-excel
0.25), + axis.text.x=element_text(size = 13,colour="black",angle = myAngle)) 4.png 2绘制不带空心的玫瑰图...+ axis.text.x=element_text(size = 13,colour="black",angle = myAngle)) image.png 3绘制带空心的玫瑰图
在用ggplot画图的过程中，我们常常希望能够循环某个变量同时画很多图。如我们的数据是testdata ?...ggplot里面的其他变量也要改成字符串的形式，即可以很容易的实现循环出图。 即 ? 写成一个function，适用于下次直接进行基因表达查询 ?
哑铃图（Dumbbell Chart），也叫DNA图。当我们想要比较不同指标不同组的情况可用多个“哑铃”表示。另外，如果想表示某一组在不同条件下的变化情况也可以用这种方法。哑铃图如下图所示： ?...在R中实现可以考虑用ggalt这个包（基于ggplot2）。...最后加上 coord_flip() 可以将图片翻转为竖着的哑铃图。
安装： install.packages("ggforce") 加载： library(ggforce) 先看一个正常的图： ggplot(iris, aes(Petal.Length, Petal.Width
计算Bonferroni校正后的显著性阈值。这是通过将0.05除以GWAS数据中的行数（即测试的总数）来实现的，用于调整多重比较的影响。
❝本节来介绍如何使用「ggplot2」来绘制嵌套圆形图，图形绘制倒也简单主要是细节的调整结果仅供参考❞ 加载R包 library(tidyverse) 导入数据 bytes_total <- read_csv
前面介绍了一些ggplot绘图，ggplot2|从0开始绘制直方图，ggplot2|从0开始绘制箱线图，ggplot2|从0开始绘制折线图，这次介绍一下当数据为发散性正负值的时候，几种比较合适的展示方式...一 载入数据并处理 library(ggplot2) # 使用mtcars数据集 data("mtcars") # 保留car name ，新建一列 mtcars$car_name <- rownames...二 Diverging bars Diverging bars是一种可以同时处理负值和正值的条形图。...注意为了使柱状图创建柱形图而不是直方图，需要确保： （1）设置stat=identity （2）在aes()中同时提供x和y，其中x是字符或因子，y是数值。...四 Diverging Dot Plot 同样可以用点图传达相似的信息，圈圈里面加上具体的数值。
工作的时候画出来这么一张图： p <- ggplot(compare_runs, aes(x = log10(V5 + 10^-3), y = log10(V10 + 10^-3), color = group...一开始我打算修改分组的levels的顺序，将这一组换一下位置，但是最终图并没有变化。...最后发现可以直接再加一个图层，将这一组重新画一组点图即可： compare_gencode <- compare_runs[1:8661, ] p + \ geom_point(data = compare_gencode
本文利用R语言的ggplot2包，从头带您绘制文献级别的KEGG富集分析气泡图。...一 载入数据集和R包 library(ggplot2) pathway = read.csv("KEGG.csv",header=TRUE,check.names = FALSE) head(pathway...二 绘制KEGG气泡图 2.1初始化数据并绘制散点图 ggplot(pathway,aes(Pvalue,PATHWAY)) + geom_point() ?...四 参考资料 ggplot2：数据分析与图形艺术 好了，更换成自己的数据集即可以自己动手绘制KEGG通路气泡图了。
下面是墨眉 《共享我们的大脑 》 的投稿 全部的代码都是复制粘贴即可运行 在数据展示时为了体现各因素的比重（百分比），有时会用到堆叠柱状图，这里介绍下用 ggplot2 画堆叠柱状图的代码和相应的美化方法...二、ggplot2作柱状图 作图前有个很重要的前置动作，要把宽矩阵转换为长矩阵（具体名词解释可以百度，关键原因是计算机和人的识别习性是不同的） library(reshape2) data_plot =...library(ggplot2) p = ggplot( data_plot, aes( x = name, weight = percent, fill = attitude))+ geom_bar...( position = "stack") # 如果把 "stack" 改成 "dodge"，可以变成分组柱状图 P ?...四、观测值和样本排序 然后是排序的问题，如果我想调整不同类型柱子的顺序，让他们按大小排序，可以用factor 函数 order_x = apply( data_percent[,1:7], 2, sum
今天的推文是个 ggplot2 案例，不过也是一个动态图表，在开始敲今天的代码之前我们先了解一下什么是“赫罗图”？...后来的研究发现，这张图是研究恒星演化的重要工具，因此把这样一张图以当时两位天文学家的名字来命名，称为赫罗图。...赫罗图是恒星的光谱类型与光度之关系图，赫罗图的纵轴是光度与绝对星等，而横轴则是光谱类型及恒星的表面温度，从左向右递减。...这篇文章的核心代码来源于 zonination/h-r-diagram 当然我不是直接 Ctrl + C / V 把代码直接复制过了，我在作者的代码基础上进行了更正和改进。...) library(tidyverse) library(ggplot2) # 读入数据 # 发现这个数据使用 read_csv 读取的时候有点问题，ci 和 x 变量错位了，absmag 和 spect
，才知道这类图叫计数图（Counts plot）,但是印象里ggplot2好像没有现成的函数来做这个事情，在不知如何下手之际突然想到之前看过一篇文章Top 50 ggplot2 Visualizations...- The Master List (With Full R Code), 应该会有对应的内容，果不其然，发现了 ggplot2 包中的 geom_count() 函数，以下内容记录自己重复计数图的代码...其中一种解决办法是用 jitter plot (这个jitter自己也不知道如何翻译)来代替 Scatter plot（散点图）ggplot2 对应的函数为 geom_jitter(),他可以让重叠的点随机分布在原始位置的周围...同样的数据集，图B看起来数据就多出来许多 代码 library(ggplot2) library(ggpubr) p1<-ggplot(mpg,aes(cty,hwy))+ geom_point()...，散点重叠的位置只画一个点，用这个点的大小来代表这个位置重叠点的多少（there is more points overlap, the size of the circle gets bigger）,
arrange(-age) %>% mutate(g_rank = row_number(), name = fct_reorder(name, age)) %>% ungroup() 绘制一个基础图
❝本节来介绍如何使用分面来绘制热图并填充特殊字符，下面通过一个小例子来进行展示； 加载R包 library(tidyverse) library(ggtext) library(ggforce) 数据清洗
2017年8月份的R语言更新包中，默默地加入了支持ggplot2树状图的新几何对象，从此在R语言中制作树状图，不用再求助于第三方包的辅助了。...中会多出一个树状图几何对象——geom_treemap()。...实际上我曾经分享过一个树状图案例，但是是使用第三方辅助包制作，一直在等ggplot2出树状图图层。...通过在美学映射中设置subgroup参数（一个类别型变量），函数内部可以自动完成亚群的变量聚合计算，并在图形成用框线显示出次级类别大小的规模。...treemapify包给ggplot2提供的geom_treemap()，填补了ggplot2原生几何对象在树状图领域的空白，可谓是进一步扩展、丰富ggplot2生态系统。
❝本节来分享一个绘制哑铃图的小教程，里面细节满满;各位观众老爷细细品味，下面来看具体案例 ❞ 导入数据 read_tsv("data.xls") %>% distinct(country_name
❝本节来介绍如何对常见的柱状图稍加改造绘制成一张美观的面积图，下面通过一个小例子来进行展示； 加载R包 library(tidyverse) library(ggtext) 导入数据 df <-..., y = mean_probability, fill = legend_text)) + geom_area(alpha = 0.95)+ # 也可使用 geom_col()来绘制条形图
欢迎关注R语言数据分析指南 案例图 仿图 绘图思路 ❝此图用R绘制难点有两处 (1)在于绘制连接处并进行渐变色填充 (2)绘制独立的甜甜圈图进行拼图 目前ggplot2 3.5已经能指定为图形进行渐变色填充...，那么连接处我们可以当做是旭日图的第三圈并独立对其进行渐变颜色填充，至于拼图个人建议还是AI编辑器实现更为简便。...注释文档+文档清单」 library(tidyverse) library(geomtextpath) library(ggnewscale) load("da.Rdata") # 加载数据 绘制旭日图...element_blank(), panel.background =element_blank(), plot.background=element_blank()) 绘制甜甜圈图
这篇是生信技能树的一个学徒作业：小队列的肿瘤外显子临床预后意义 主要学习的图是这几个： 突变全景图 fig2a fig2c 读取数据 附件下载地址：https://ehoonline.biomedcentral.com...Function" "Transcript" "ExIn_ID" "Cosmic ID" "Vary Type" ## [11] "caseAF" Fig2a Fig2a其实就是突变全景图的右边条形图部分...element_line(color = "black",size = 1.1) ) fig2a Fig1 最开始想用complexheatmap画，但是发现是长数据，可以直接用ggplot2...=NULL)+ theme(axis.text.x = element_blank(), axis.ticks = element_blank() ) p1 热图部分...fig2c 可以用trackviewer画，但是我还不会。。只能偷个懒用maftools画。 这个附件也不像常见的几个软件的结果，应该是作者修改过的，所以也没办法直接用技能树的方法转换为maf。
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