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我从我的同事那里收到了一份带有坐标的发送基因的列表。，从染色体的编号开始，然后是开始位置和结束位置，用":“分隔。8045137,1:8022820:8022967,1:8037705:8037817,1:8021880:8021956,1:8029380:8029481,1:8030930:8031036 我需要计算每个基因(每条线)的区域长度，即结束位置和开始位置之间的差异(如果一个基因</em
浏览 22提问于2020-09-15得票数 0
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我正在尝试理解旅行商问题中的基因型、表型和适应度等术语。假设我有4个城市ABCD，它们的坐标是(0,3)(1,4)(5,6)(2,9)，它们的基因型、表型和适合度是什么？
浏览 0提问于2014-05-19得票数 0
我有一个data.frame，它有一组不相交的、不重叠的、有序的、有方向的线性间隔，由它们的间隔序列名称(下面的seqname)定义，以及它们的start和end坐标：
df <- data.frame(seqname是染色体)，我正在试图确定它们是同一基因的一部分，还是独立基因的一部分。截止值是经验性的，基于实际的基因<
浏览 23提问于2021-02-17得票数 0
我在研究遗传算法。我有一个疑问如下:假设我有两个大小不同的染色体，如下: 1234567 ABCDEFGHIJ123|4567=>ABC4567
浏览 1提问于2018-05-27得票数 0
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我有一个关于进化算法“大小”的一般问题。每个EA可以根据它们的个体大小(染色体长度)、它们的种群大小或适应度评估的数量(e.q代数)进行调整。
我想，这些衡量标准取决于问题本身。但我想知道，对于特定的进化算法，是否有已知的最大(种群/个体/世代)大小？还是取决于搜索空间和计算能力？
浏览 3提问于2015-05-26得票数 1
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我在SQL上的桌子上有个问题。我有两个表：table 1 (8000 lines)由一列组成，其中一列只包含唯一的基因id's (ex.HxC4233)，table 2 (20000 lines)由两列组成，其中包含类似于表1的基因id，但是有一些重复的(所以不是唯一的)具有相应基因长度的列。我想要创建一个查询，由表一中所有唯一的<em
浏览 2提问于2020-11-30得票数 0
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我希望使用描述的解决方案计算两个地理点(由纬度和经度对定义)之间的距离。尽管我理解一般的概念，但对于我来说，先将所有的球面坐标(lat/long)转换为3D单位长度笛卡尔坐标的部分对我来说是有问题的。
有人能解释一下我们需要编写的算法才能实现上述目标吗？
浏览 0提问于2018-10-26得票数 0
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线性插值-收缩线
、、
假设我们有一个名为1D的数组，它由9个元素组成：、Source0到8。
目的地=0* 2.5 =源->成功！使用这个精确的值。目的地1=1* 2.5 =源2.5 ->没有这样
浏览 0提问于2018-01-21得票数 0
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我有一个网格，它的每个单元格都由它的x和y坐标(整数)决定。此网格的宽度为100x100。我该怎么做呢?？问题是我没有这条线的长度...我正在考虑找到第二个点，然后使用Bresenham的算法，但计算起来太长了，因为我找到<
浏览 6提问于2016-12-20得票数 0
利用遗传算法，适应度函数确定转换规则的最优序列，以生成与参数标准(面积、视图、最小构造等)相匹配的几何。
由于几何学代表了建筑，所以有一些建设性的规则需要遵守。我的问题是遗传算法的一般方法：什么时候检查由染色体产生的几何的有效性?在基因插入点的，还是只给出无效的几何图形一个坏的适应值？这将创建一个由两个部分组成的</em
浏览 5提问于2013-02-06得票数 2
我有数百万个字符串，我想检查另一个数十亿字符串集合中每个字符串的精确匹配位置。在Python中执行此操作的最有效方法是什么？
浏览 0提问于2021-01-29得票数 1
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我需要计算二维不规则多边形面的面积，从它的三维坐标。 我可以从二维坐标计算出不规则多边形的面积，但不能从三维坐标计算出来。 如果可能的话，我想用Excel或VBA来完成。 非常感谢！:)
浏览 43提问于2020-07-12得票数 0
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几个月前，我发明了一种遗传算法，但在解决任何问题的过程中，我都是一个星期。我最初的目标是在游戏应用中使用遗传算法。我的最后一个想法是：
将一些突变应用于基因(被选择的机会取决于突变率)，它
浏览 0提问于2014-12-17得票数 0
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我已经在谷歌挖掘了2天，寻找解决车辆路线问题的拾取和交付变体的算法的解释，但是，我找不到，所以请有人给我一个例子或指出一些资源，最好是工作中的例子。我遇到了一种叫做保存算法的东西，但是找不到任何关于如何使用它来解决提货和交付变体的资源。
浏览 31提问于2021-02-11得票数 1
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将DNA字符串分成片段
、、、
我是R编程的新手。
基因组由20个基因组成，每个基因的长度为50个碱基。基因组的前50个碱基对应于基因1，后50个碱基对应于基因2，依此类推。
浏览 2提问于2015-03-10得票数 1
我想当你知道染色体上基因的数量时，我就有了写GA的诀窍。例如，如果您正在搜索一个字符串，并且您知道字符串的长度，您可以只生成初始的随机字符串填充，然后进行繁殖和变异，直到(希望)收敛到一个解决方案。但是，您并不总是知道输入的数量。假设您想要解决给定的数字0到9以及操作符+、-、*和/的问题，找到一个表示给定目标数的序列。当您阅读时，运算符将从左到右依次应用(取自此页)。你不知道在最初的种群
浏览 0提问于2017-01-05得票数 6
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我知道这里有很多与我的问题相关的问题，但我仍然很困惑。我对计算几何学有点陌生，任何建议都会有帮助。问题:一组n矩形，其边与x或y轴平行，长度和高度相同；每个矩形的四个角点的坐标已知，设计了一个O(nlogn)-time除法和征服算法来计算所有矩形的并，并表示这些矩形所覆盖的合并面积。这些长方形可以是不相交的，也可以是触碰的，也可以是重叠的，而且有
浏览 35提问于2014-03-10得票数 2
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所以，既然的答案基本上是说，我真的应该研究我的生物的基因编码*，我做到了！因此，我创建了以下整洁的小结构(byte[]-)：
Z=链的长度(基本上，这是为了将来的构建，在这里，我想让进化控制甚至整个链的<e
浏览 3提问于2011-09-15得票数 2
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嗨，我正试着把乐高积木装成一个不对称的形状。形状如下：
我可以选择所有的乐高积木(不同的重量)是： 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 0 0 0 1 1 1 1 0 0 0 0
现在，我需要以最低的成本将这些块拟合成这样的
浏览 9提问于2022-05-28得票数 0
所以，原则上归一化一个原始计数RNAseq文件是非常简单的…如何/从哪里导入基因长度并将其与集成ID进行匹配？我使用来自cpm值的EdgeR rpkm，它返回“rpkm.default(x_cpm)中出错:缺少参数"gene.length”，没有默认值“
谢谢
浏览 10提问于2020-06-05得票数 0
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