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    RNAseq建库方法

    背景 当前 RNAseq 主要研究的是 mRNA,由于一次转录过程中,mRNA 只占很少一部分(约 4~5%),需要采用特殊的建库方式将 mRNA 从总 RNA 中分离出来。...短链非编码 RNAs(如 miRNA)既无法用 oligo-dT 方法富集,因此对其研究需要特定的分离建库方法,一般是切胶或磁珠分选后直接连接接头 (sequential RNA ligation,通常构建出来都是链特异性文库...三、链特异性 链特异性转录组测序(strand-specific RNA-seq)是指转录组测序过程中文库构建采用的链特异性建库方式。...此建库方式可以保留转录组测序时转录本的方向信息,即可以确定转录本是来源于基因组上面的正义链还是反义链。 目前构建链特异性文库的方法有多种,其中用的最普遍的即是 dUTP 方法。...具体建库流程如下: 链特异性文库 四、小RNA建库 五、spike-in 内参 RNA 的 spike-in 一种绝对定量的方法,在原有的 RNAseq 文库中加入已知量的

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    反向工程(自动建表建库大杀器)

    通俗理解:基于XCode开发的应用,无需数据库安装脚本,连接字符串指向哪一台哪一种数据库,系统就自动在上面建库建表!...正式定义:基于实体类的表结构信息,在连接字符串指定的目标数据库上自动执行建库建表、添删改字段、创建索引等操作,支持各种数据库! 应用系统首次启动完成的时候,也是自动建表建库并初始化完成的时候。...自始至终,我们没有编写SQL脚本,没有去数据库创建数据表。 代码写完就跑起来,测试通过就部署到正式库。...首次连接数据库时,库名指定School报错,因为根本就不存在这个库。 因此,XCode切换到系统库,开始创建数据库School,并创建数据表和索引。...这里完全是MySql语法,不同于上面的SQLite建表语句。 感兴趣的同学,还可以试试Oracle和SqlServer等数据库。 正向工程 正向工程就是从数据库读取表结构信息,生成模型信息。

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    Entity Framework——建模建库

    1数据库初始化策略选择 三种初始化策略: 1)CreateDatabaseIfNotExists:默认的策略。如果数据库不存在,那么就创建数据库。...但是如果数据库已存在,而且实体发生了变化,就会出现异常。 2)DropCreateDatabaseIfModelChanges:模型改变时,原来的数据库会被删除,自动重新创建一个新的数据库。...3)DropCreateDatabaseAlways:每次运行都会删除原来的数据库,然后重新生成数据库。...4)Null:在Codefirst模式下,当实体结构改变时,运行程序不会自动生成表,改变实体结构与改变表结构互不影响, 前三种策略无法应对的问题是:分别改变实体模型和数据库表结构。...解决办法: 采用第四种初始化策略,初次使用codefirst方式创建好数据库以后,不使用任何数据库初始化策略,即给Database.SetInitializer传null。

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    粗聊Mysql——你会建库建表么?

    本文中说到的“建”,并非单纯的建一个库,或是建一张表,而是你建好的库和表在项目的运营中,是否能应付各种事件,下面我说说几个我在项目中遇到的问题以及处理的方法,算是一个小小的心得,给大家分享下。...比如现在有2张表,一张新闻栏目表,一张新闻表,现在两张表需要进行关联,我想大多数人的做法肯定是在新闻表里建一个新闻栏目id,然后把新闻栏目表里的主键ID(自增)写到这个字段里,通过这样进行两表关联。   ...这样就会造成一种情况,如果那天对数据库进行优化,把主键进行了重新排序(暂时没有找到mysql优化软件会优化主键,但是可以通过代码删除主键,然后从新建立自增主键来实现主键重新排序),那就彻底杯具了,栏目和文章完全对不上号了...所以我建议两表之间关联不用主键,而是单独建一个编号的字段,我们这里可以用mysql的uuid()函数做为编号,相关文献可以参考《UUID做主键好还是不好》,只所以一张表要2个主键,一个物理主键(自增id...所以我建议,既然定义为varchar,就代表不会涉及到计算,何不干脆定义一个通用的长度,比如varchar(50),如果真要限制长度,用程序去判断,不要让数据库来限制,不然用户输了一长串,结果mysql

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    MySQL 系列教程之(五)DDL 操作:建库建表

    MySQL 数据库 创建数据库 使用root登录后,可以使用 create database if not exists user default charset utf8 创建数据库,该命令的作用:...如果数据库不存在则创建,存在则不创建。...创建RUNOOB数据库,并设定编码集为utf8 删除数据库 删库有风险,动手需谨慎 drop database 库名; MySQL 数据表 创建MySQL数据表需要以下信息: 表名 表字段名 定义每个表字段...public/img/pic.jpg' )engine=innodb default charset=utf8; 实例解析: 如果你不想字段为 NULL 可以设置字段的属性为 NOT NULL, 在操作数据库时如果输入该字段的数据为...查看表结构 desc stu; 查看建表语句 show create table stu\G 修改表结构 格式: alter table 表名 action(更改选项); 添加字段: 添加字段:alter

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    空间数据库-msyql空间数据大纲

    空间数据库,提到空间数据库,首先想到的一定是Esri公司的ArcSDE(SDE即Spatial Database Engine,空间数据库引擎),ArcSDE主要支持的数据库包括Oracle,SQL Server...功能好,性能好,但是收费ArcGIS 空间数据库官方学习资料非常齐全,网上资料也很多开源MySql,PostgreSQL等数据库才是主流——反正程序员不啥钱MySql支持的类型点 POINT(15 20...AsText(pnt) FROM `gis` WHERE MBRWithin(pnt,GeomFromText('Polygon(1 1,0 30,30 30,30 0,1 )'))参考资料:MySQL空间数据库...https://blog.csdn.net/gaojingyuan/article/details/79004990Mysql gis 空间数据库功能详解学习 https://blog.csdn.net...转载本站文章《空间数据库-msyql空间数据大纲》,请注明出处:https://www.zhoulujun.cn/html/GIS/GIS-Science/8162.html

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    【DB笔试面试853】在Oracle中,什么是手动建库?手动建库有哪些步骤?

    ♣ 问题 在Oracle中,什么是手动建库?手动建库有哪些步骤?...♣ 答案 有时候因为环境的缘故不能使用图形界面或者不能使用DBCA的静默方式来创建一个新库,那么这个时候可以考虑使用“CREATE DATABASE”这种SQL命令行来创建数据库,该方式称为手动建库方式...使用手动建库的优点是:可以用脚本来创建数据库。另外,在OCM的考试中也要求DBA进行手动建库。.../sqlplus/admin/help/hlpbld.sql helpus.sql SPOOL off 下表是有关手动建库过程中常见脚本的用途: 脚本名称 运行用户 简介 @?...& 说明: 有关手动建库的更多内容可以参考我的BLOG:http://blog.itpub.net/26736162/viewspace-2121981/、http://blog.itpub.net/26736162

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    pptx:Python的PPT操作库

    读取PPT文档内容 先了解下PPT基本结构在python分别是什么含义: Slide:幻灯片,就是演示文稿中每一页的页面。 Shape:方框,在每页幻灯片内插入的方框,可以是形状,也可以是文本框。...Placeholder:占位符:存在PPT母版里面的幻灯片的某一部件:Placeholder 3.1 添加slide和内容 1)选择PPT模板 a、使用ppt自带的模板 prs= Presentation...() prs.slide_layouts[index] ppt自带了常用的1-48种模板通过index选择对应的模板 b、使用自定义ppt模板 prs= Presentation('template.pptx...框中的文字自动换行 # -------------------------------------- # fill = text_box.fill fill.solid() # 使用之前一定要导入RGBColor这个库...框中的文字自动换行 # -------------------------------------- # fill = text_box.fill fill.solid() # 使用之前一定要导入RGBColor这个库

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    Vertica 安装,建库,新建测试用户并授予权限,建表,入库

    测试环境:RHEL 6.4 + Vertica 6.1.3-7 需求:搭建Vertica数据库3节点的测试环境,建立测试用户,建表,测试数据入库。.../vertica/sbin/install_vertica -s vnode1,vnode2,vnode3 -r /opt/vertica-*.rpm 7.dbadmin用户,用admintools 建库...和Data pathname -> 确认建库 -> 建库成功 注:建库过程中建议动态去关注Dblog,看是否有什么问题,因为等建库失败后再去看有可能这个日志连同上级目录就被自动删除了。...所以导致无法成功建库,坑人的是屏幕输出却是毫不相关的一些Python的报错信息。...这时反过来找有没有日志记录了有效信息,才发现建库失败后,建库过程中所建立的目录都被自动删除,回头再找目录下的日志自然已经是不复存在了。

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