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去除箱线图中的outliers

异常值outlier:指样本中的个别值,其数值明显偏离它(或他们)所属样本的其余观测值,也称异常数据,离群值。当遇到一组数据中有少量outliers,一般是需要剔除,避免对正确的结果造成干扰。...我们可以通过箱线图来检测并去除outliers. 箱线图可以通过5个数来概括:最小值,最大值,下四分位(Q1,在25%位置),上四分位(Q3,在75%位置),中位值(50%位置)。...箱线图能够显示离群点,可以通过IQR(InterQuartile Range,四分位距即Q3-Q1)计算得到。该离群点定义为异常值被定义为小于Q1-1.5IQR或大于Q3+1.5IQR的值。...75%分位数+1.5(75%分位数-25%分位数) LowerLimit=Q1-1.5IQR=25%分位数 - 1.5(75%分位数-25%分位数) 即在UpperLimit与LowerLimit之外的值为...因此,存在离群值(红色的方点),下面去除离群值。 首先定义一个函数,将outliers替换成NA。

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    R语言ggplot2做箱线图的时候如何添加表示平均值的线

    箱线图展示的就是分位数,中间的线表示的是中位数,也就是50%分位数,如果非要在箱线图上画上表示平均值的线段也是可以实现的,今天介绍一下实现代码 示例数据集我们用R语言的内置数据集PlantGrowth...image.png 首先是画一个最普通的箱线图 df<-read.csv("PlantGrowth.csv") library(ggplot2) library(tidyverse) p1<-ggplot...ggplot_build(p1)$data[[1]] image.png 我们利用原始数据计算一下平均值,然后将数据集的平均值添加到这组数据中 df %>% group_by(group...rename("group_1"="group") %>% cbind(ggplot_build(p1)$data[[1]]) -> df1 然后利用geom_segment()函数添加品均值的线段...不知道有没有比较好的办法 (猜测geom_boxplot函数里应该是有一个步骤计算中位数的,试着看看源代码,看能不能把中位数的代码改为平均值) 还有一个问题是如果是分组的箱线图那么应该如何来实现呢?

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    Python OpenCV查找图中的四边形矩形

    目标是找到下图中的矩形轮廓和四边形轮廓: ?...矩形的检测包含检测轮廓是四个顶点,同时两条边的夹角接近90°,代码和效果如下: import numpy as np import cv2 as cv # 设置putText函数字体 font=cv.FONT_HERSHEY_SIMPLEX...# 条件判断逼近边的数量是否为4,轮廓面积是否大于1000,检测轮廓是否为凸的 if len(cnt) == 4 and cv.contourArea(cnt) > 1000...代码比较简单,核心步骤上面已添加注释,筛选条件自己可以改,如果只想检测四边形,不限制为矩形,则修改如下地方: # 只检测矩形(cos90° = 0) if max_cos < 0.1: # 检测四边形...大家使用的时候根据具体情况进行修改,C++的demo路径如下: F:\opencv4.2_release\opencv\sources\samples\cpp\squares.cpp

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    R语言绘图之ggplot2

    那么今天我们就为大家介绍一下目前在R语言中流行的绘图包ggplot2。 1. ggplot2的安装:install.packages("ggplot2")。...2. ggplot2的绘图原理: ggplot2的核心理念是将绘图与数据分离,数据相关的绘图与数据无关的绘图分离,并按图层作图。...著名的拿破仑远征图) geom_rug 触须 geom_segment 线段 geom_smooth 平滑的条件均值 geom_step 阶梯图 geom_text 文本 geom_tile 瓦片(即一个个的小长方形或多边形...几何对象(geom_)上面指定的图形属性需要呈现在一定的几何对象上才能被我们看到,这些承载图形属性的对象可能是点,可能是线,可能是bar stat :统计变换比如求均值,求方差等,当我们需要展示出某个变量的某种统计特征的时候...,需要用到统计变换 annotate:添加注释 #由于设置的文本会覆盖原来的图中对应的位置,可以改变文本的透明度或者颜色例:annotate(geom='text')会向图形添加一个单独的文本对象 annotate

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    箱线图的生物学含义

    2.箱线图的组成 箱形图使用第25,50和75百分位数(也称为下四分位数(Q1),中位数(m或Q2)和上四分位数(Q3),以及四分位数范围(IQR = Q3-Q1,涵盖50%的中央数据)来反映样本的分布...用四分位数绘制箱形图的是一个公认的惯例:永远不应使用箱子或线来显示平均值、标准差或标准误。中位数不一定在箱子中心,两边延伸的线也不一定是对称的。...四、箱线图的优点与不足 1.箱线图能直观展现样本的分布 从下图中可以看出箱线图的统计描述比均值和标准差更直观的展现了数据集的统计分布。 ?...箱形图的数据可视化比较 图a中,100个数据点的样本集,每个数据从上到下依次是均匀分布,具有两种不同方差的两个单峰分布,双峰分布。...箱线图利用摘要统计指标(中位数和四分位数)和主要数据(四分位数内的50%的数据)的分布。箱形图可以展示任何数据集的最小值,下四分位数,中位数,上四分位数和最大值,可以反映数据集的分布和差异。

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    如何更改ggplot2中堆积条形图中的堆积顺序

    拟合曲线 R语言之可视化①④一页多图(1) R语言之可视化①⑤ROC曲线 R语言之可视化①⑥一页多图(2) R语言之可视化①⑦调色板 R语言之可视化①⑧子图组合patchwork包 R语言之可视化①⑨之ggplot2...中的图例修改 R语言之可视化(20)之geom_label()和geom_text() R语言之可视化(21)令人眼前一亮的颜色包 R语言之可视化(22)绘制堆积条形图 R语言之可视化(23)高亮某一元素...R语言之可视化(24)生成带P值得箱线图 R语言之可视化(25)绘制相关图(ggcorr包) R语言之可视化(26)ggplot2绘制饼图 R语言之可视化(27)通过R语言制作BBC风格的精美图片 R...语言之可视化(28)蜜蜂图 R语言之可视化(29)如何更改ggplot2中堆积条形图中的堆积顺序 问题:如何控制由ggplot2创建的堆积条的堆积顺序。...原始图表 library(reshape2) library(ggplot2) ra.melt <- melt(ra) p <- ggplot(ra.melt, aes(x = variable, y

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    一文掌握小提琴图的所有画法

    通常密度会随附一种叠加的图表类型,如箱形图,以提供一些其他的数据信息,即矩形上下边框代表第一个和第三个四分位数,中间点是中位数。 小提琴图可以用来观察数据的分布情况,也可用于比较多个组之间的分布。...,或"asterisk" p.adjust.method = "holm", #p值校正方法 notchwidth = 0.5, #对于有缺口的箱形图,缺口相对于主体的宽度(默认为0.5...这里的小提琴图是箱形图和核密度图的组合。...legend.position="none" #不加图例 ) + coord_flip() #翻转坐标 ggnormalviolin ggnormalviolin是使用ggplot2根据指定的均值和标准差创建正态分布的小提琴图的方法...data = d, aes(x = Distribution)) + geom_normalviolin(aes(mu = Distribution_mean, #mu是正态分布的均值

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    Day7:R语言课程 (R语言进行数据可视化)

    3.用`map_dbl()`处理数据 为了获得所有样本的平均值,可以使用用生成数字向量的函数map_dbl()。...ggscatter5 注意:可以使用example("geom_point")来探索可添加到绘图中的众多不同的映射和图层。滚动浏览不同的图,记住代码的修改方式。...已经有了用ggplot2进行绘图所需的所有信息,可以尝试绘制一个箱线图。...箱形图提供了基于五分位数的数据分布图。框的顶部和底部代表第一和第三个四分位数(分别为25%和75%)。框内的线代表中位数(50%)。在框的上方和下方延伸到的点代表数据集的最大值和最小值。...提示:使用fill映射来观察每种基因型中细胞类型之间样本均值的差异。 最终图片看起来应该如下所示。 ?

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    「R」数据可视化2 : 箱形图

    什么是箱形图 箱形图(Box-plot)是一种用作显示一组数据分散情况的统计图,因形状如箱子而得名。除了生信领域,该图在其他领域也经常被使用。...箱形图能显示出一组数据的最大值(Maximum)、最小值(Minimum)、中位数(Median)及上下四分位数(1st/3rd Quartile),同时还可以显示逸出值(Outlier)。 ?...箱形图怎么画 (1) 需要什么格式的数据 我们需要的数据只要两列,一列为x,一列为y。本次我们使用R中提供的iris数据。 ?...比如我们想要探究不同物种的花萼长度差异。 (2) 如何使用ggplot2做箱形图 利用ggplot2画图的核心命令是geom_boxplot。我们先来尝试做一个最最基础也是最丑的boxplot图。...可以看到不同的物种之间Sepal.Length有所不同,那么这种差异显著吗? 这个时候我们就需要做检验,那么如何可以直接把检验结果展示在图中呢。这个时候我们可以使用另一个R包ggpubr。

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    R for data science (第一章) ②

    在ggplot2语法中,我们说它们使用不同的geom。 geom是绘图用于表示数据的几何对象。 人们经常根据情节使用的几何类型来描绘情节。...例如,条形图使用条形图,折线图使用线条图,箱形图使用箱形图格栅等。 散点图打破了这一趋势; 他们使用点geom。 如上所述,您可以使用不同的geom来绘制相同的数据。...左边的图使用点geom,右边的图使用光滑的geom,一条适合数据的平滑线。 要更改绘图中的geom,请更改添加到ggplot()的geom函数。...ggplot2将为分组变量的每个唯一值绘制一个单独的对象。实际上,每当您将美学映射到离散变量时,ggplot2都会自动将这些geoms的数据分组(如线型示例中所示)。...您可以通过将一组映射传递给ggplot()来避免这种类型的重复。 ggplot2会将这些映射视为适用于图中每个geom的全局映射。

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    找出平面上的特殊无向图中的所有三角形的算法

    问题提出背景:在非结构化三角形网格生成过程中,若采用前沿推进法,在推进过程中是不好构造三角形的(而且也没有要),最好在把所有的边都连好以后再找出所有三角形,于是提出了问题:在由三角形构成的平面无向图中如何找出所有三角形...要注意的是,这个无向图很特殊, 1.这个图在平面上。 2.这个图是由三角形构成的(如果不是由三角行构成,那这个网格就没有用处了)。...如果没有这两个函数的判断,每个三角形会被输出6次,而有了这两个函数的限制后,强制在3个元素的6中排列中指定1种, 就消除了重复。...另外,这样输出的三角形中其内部可能有其他的点,若要消除,再加上一层过滤,去除掉那些”p有邻点在p,np,nnp三角形中的”情况即可, 这是因为这个图由三角形构成的特殊性质,如果有在p–np–nnp中有点...,假设这些点都不和p相连,那么, 这些点和p-np, p-nnp构成的区域必然不是三角形!

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