组合filter、across和starts_with以跨R中的列进行字符串搜索 - 腾讯云开发者社区 - 腾讯云

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「R」dplyr 列式计算

❝在近期使用「dplyr」进行多列选择性操作，如 mutate_at() 时，发现文档提示一系列的「dplyr」函数变体已经过期，看来后续要退休了，使用 across() 是它们的统一替代品，所以最近抽时间针对性的学习和翻译下...，但是通过拷贝和粘贴的方式进行的话既枯燥就容易产生错误。..._if, _at, _all 「dplyr」以前的版本允许以不同的方式将函数应用到多个列：使用带有_if、_at和_all后缀的函数。这些功能解决了迫切的需求而被许多人使用，但现在被取代了。...across() 统一了 _if 和 _at 的语义让我们可以随心按照位置、名字和类型选择变量，甚至是随心所欲地组合它们，这在以前是不可能的。...例如，你现在可以转换以 x 开头的数值列：across(where(is.numeric) & starts_with("x")). across() 不需要使用 vars()。

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R语言基于dplyr实现数据快捷操作

R语言在处理大数据方面一直是被人诟病的地方，那么有人就为R语言打造了一个dplyr包可以实现高效的数据预处理，减少内存的消耗，提升处理效率。今天就给大家详细看下这个包的具体功能。...2. arrange 对数据集进行整体基于单列或者多列进行排序。实例 ##升序 mtcars %>% arrange(cyl, disp) ?...可以直接填入变量名，也可以直接用列号，或者更深一层添加功能函数：start_with(以什么开头的变量)，where（什么要求的变量）实例： iris %>%select(starts_with("Petal..."))##以Petal开头的变量 iris %>% select(where(is.factor)) ##属性为因子的变量。...16. across 针对某一列进行操作，两个参数：第一个为列名，第二个为操作函数。

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R&Python Data Science 系列：数据处理（1）

这一部分介绍一下R和Python数据处理用到的筛选、衍生以及计算函数。主要介绍如何使用R语言和Python中的两个程序包进行数据处理，R语言中的dplyr和Python中的dfply第三方包。...也可以根据参数快速筛选出相应数据 starts_with('c') ：查找以字符c前缀开头的列； ends_with('c')：查找以字符c后缀结束的列； contains('c')：筛选出包包字符...##筛选出以c开头的列： diamonds >> select(starts_with('c')) >> head(3) ?...python中用~符号取反，若想删除数据集以c开头的列： ##删除数据集以c开头的列 diamonds >> select(~starts_with('c')) >> head(3) ?...注意在python和R中distinct()函数有细微的差别。 4.5 filter_by函数按照某种条件进行筛选，python中也可以使用mask()函数，两者等价。

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R 茶话会（七：高效的处理数据框的列）

换句话说，就是如何可以批量的对数据框的指定行或者列进行某种操作。...R 数据整理（六：根据分类新增列的种种方法 1.0）其实按照我的思路，还是惯用的循环了，对数据框的列名判断一下，如果所取的列在数据框中，就修改一下其格式，重新赋值： data(cancer, package...也可以： test2 %>% summarise(across(-where(is.character), mean)) 其中where 类似base 中的which，相当于接受逻辑值，以返回对应位置...和select 这些一样，他们也有一些挑列的专属函数： select(test, starts_with("Petal")) #选中..开头的列 select(test, ends_with("Width...批量处理组合一般的运算逻辑判断方便获得指定列（通过& ）无缝结合tidyverse 中的其他函数 image.png

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两个神奇的R包介绍，外加实用小抄

3.函数后面跟括号，括号里第一个参数是都数据框名 4.字符串要加双引号，行名和列名不用加，其他单元格（姑且这么叫了）里出现的字符串要加。...这是一种组织表格数据的方式，提供了一种能够跨包使用的统一的数据格式。有多统一？每个变量（variable）占一列，每个情况（case，姑且这么翻译）和观测值（observation）占一行。...expand（列出每列值所有可能的组合，天哪我是写到这里的时候刚看懂的！）来看示例 ? ? 我是看到了结果才知道我干了啥的喂。就是选中的列中的值各种组合，成为一个新表。...Sampleid select(frame3,contains("n")) #列名包含n的列 select(frame3,starts_with("a")) #以a开头的列 5.mutate 根据原有的列生成新的列...这是根据相同的列名进行合并，当在两个表格中列名不一样时，需要在括号内加 by=c("col1"="col2") 其中col1和2分别是在两个表格中的需合并的列名 semi_join，anti_join

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Python从零开始第三章数据处理与分析①python中的dplyr（2）目录

目录第二章（pandas） Python从零开始第三章数据处理与分析①dplyr风格的python代码 Python从零开始第三章数据处理与分析①python中的dplyr（2） ==========...===================================== filter/select功能 select和drop函数在数据处理中很有用，可以轻松地选择和删除列。...这些功能旨在select和drop功能，并可与〜一起使用。首先，快速了解可用功能： starts_with（prefix）：查找以字符串前缀开头的列。...ends_with（suffix）：查找以字符串后缀结尾的列。 contains（substr）：查找名称中包含子字符串的列。 everything（）：所有列。...columns_between（start_col，end_col，inclusive = True）：查找指定的开始列和结束列之间的列。包含性布尔关键字参数指示是否应包含结束列。

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Day07 生信马拉松-数据整理中的R

1.3 按位置提取字符串 #提取x中第5和第9位的字符串 str_sub(x,5,9) 1.4 字符检测 str_detect(x2,"h") # 第一个参数为向量名，第二个是检测的关键词 str_starts...(x2,"T") #判断x2中T开头的字符串,输出逻辑向量 str_ends(x2,"e") #判断x2中e结尾的字符串,输出逻辑向量 1.5 字符串替换 x2 str_replace(x2,"o",...) 筛选列的函数select() 筛选行的函数filter() 2.4.2 多重嵌套，代码不易读 pheatmap::pheatmap(head(as.matrix(select(iris,-5)),50...：使gene名变为列名，将样本名转化为data.frame中的第一列 ggplot2对行名并不友好，通常要使样本名转化为data.frame中的第一列，防止在后续代码运行过程中行名丢失图片图片 step2...dir() # 列出工作目录下的文件 dir(pattern = ".R$") #列出工作目录下以.R结尾的文件 file.create("douhua.txt") #用代码创建文件 file.exists

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十二、R语言的综合应用

生信技能树学习之R语言的综合应用一、玩转字符串 图片 x <- "The birch canoe slid on the smooth planks." x [1] "The birch canoe...##是用来返回向量中元素的个数返回值1 1.2.字符串拆分 str_split(x," ") ### 以空格为分隔符，拆分开。...###没有赋值，所以修改后的test还是5列图片 2.4 连续的步骤 select() 筛选列 filter() 筛选行 2.4.1.多次赋值，产生多个变量 x1 = filter(iris,Sepal.Width...("gene"), ### 把gene1、gene2、gene3这几列合并，starts_with("gene")，以gene开头的列。...---- dir() # 列出工作目录下的文件 dir(pattern = ".R$") #列出工作目录下以.R结尾的文件 file.create("douhua.txt") #用代码创建文件 file.exists

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R语言基础提升与总结

* Sepal.Width)⭐只是在控制台上对数据框test进行了一些操作，实际上的test还是只有5列！...，按列拼接成为一个矩阵 do.call完成批量操作4 表达矩阵画箱线图4.1 表达矩阵的概念基因表达的数据通常使用表达矩阵来表示其中矩阵的行代表某个基因在不同样本（不同处理，或时间点等）中的表达水平列表示某个样本中各个基因的表达水平...**(cols = starts_with("gene"),#需要合并的列 names_to = "gene", values_to = "count...，其实是对左边的数据框取子集7 一些顶呱呱的函数7.1 match()7.2 一些处理文件的函数dir() # 列出工作目录下的文件dir(pattern = ".R$") #列出工作目录下以.R结尾的文件...$表示以……结尾dir(pattern = ".R") file.create("douhua.txt") #用代码创建文件file.exists("douhua.txt") #某文件在工作目录下是否存在

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数据处理的R包

MARGIN=2：操作基于列 MARGIN=c(1,2)：对行和列都进行操作 FUN内置的函数有mean（平均值）、medium（中位数）、sum（求和）、min（最小值）、max（最大值），当然还包括自定义函数...教程，可以参考官方文档：http://plyr.had.co.nz/ 3.2.2 dplyr dplyr是一个强大的R包，用于处理，清理和汇总非结构化数据，使得R中的数据探索和数据操作变得简单快捷，也是出于...筛选以"Pet开头的属性任一大于>6.5的行 > iris_data%>% filter_at(vars(starts_with("Pet")), any_vars(. >6.5)) Sepal.Length...（base包函数） [1] "2020-01-23" （2）日期格式转化日期值通常以文本的形式输入到R中，然后转化为以数值形式存储的日期变量。...可以方便的与ggplot进行涂层叠加，实现在R中的地图绘制需求。 ggmap包中的函数 get_map：ggmap包中最基本函数，用来下载地图。 geocode：用来返回某地的经纬度。

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R语言笔记-6

#字符串的替换 str_replace(str,"o","O") str_replace_all(str,"o","O") #删除字符串中的字符 str_remove(str," ") str_remove_all...(str," ") 输出结果：图片数据框的处理-dplyr library(dplyr) head(iris,5) #将内部数据iris所有列按Sepal.Length列的数值从小到大排列 head...)),5) #去除重复的Species列内容 head(arrange(iris,Species,.keep_all = T),5) #筛选Sepal.Width大于3的行 head(filter(iris...,Sepal.Width>3),5) #筛选出Sepal.Length和Sepal.Width列 head(select(iris,Sepal.Length,Sepal.Width),5) #管道符可以将上一函数的输出...图片 MARGIN参数，1表示针对列，2表示针对行 FUN参数，可使用任何函数，包括自定义的函数 data=iris[1:5,1:4] data #计算每一列的加和 apply(data,1,sum)

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R语言宏基因组学统计分析(第四章)笔记

4.1.1 安装R、RStudio和R包 R提供一个基于命令行的统计框架，RStudio作为IDE，所有统计分析和图形可以使用它进行。...字符串分隔strsplit()strsplit("5_15_dryst","_") 模式匹配grep()和替代gsub()正则表达式了，最常用的是grep(模式，字符串), sub(模式，替代，字符串)...正则表达式中，R语言的通配符$,*等，如果匹配它们需要用"\"，如果匹配“\”,得上“\\”了。其他的还是和别的语言一致的。 ?...在以行和列转换和汇总表格数据方面，非常有用，包括选择行，过滤列、排序行，增加新列和汇总。...重要的函数包括： select() 和 rename() 基于名字选择列(变量) filter() 基于值过滤行(cases) arrange() 重新排序行 (cases) mutate() 和 transmute

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生信技能树- R语言-day7

str_starts(x2,"T") #是否以t开头str_ends(x2,"e")#是否e结束5.字符串替换x2str_replace(x2,"o","A") #如果向量里的一个数据有两个o，只替换第一个...，如果没有赋值，那么这个数据框还是没有新加，没有赋值，就没有产生补充select（）filter（）如何简化连续的步骤1....对列表/向量中的每个元素实施相同的操作lapply(1:4,rnorm)两个数据框的链接merge可以合并inner_join:交集都存在的取inner_join(test1,test2,by="name...宽变长的方法：pdat = dat%>%pivot_longer(cols = starts_with("gene"), #要把gene 1，2，3这一行变成列names_to = "gene",#命名为...() # 列出工作目录下的文件dir(pattern = ".R$") #列出工作目录下以.R结尾的文件file.create("douhua.txt") #用代码创建文件file.exists("douhua.txt

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从零开始的异世界生信学习 R语言部分 06 R应用专题

select和filter 筛选出来的结果是数据框 3.连续操作，优秀的管道符号%>% 快捷键 ctrl + shift +m # 1.多次赋值，产生多个变量 x1 = filter(iris,Sepal.Width...可以用来进行分组，通过str_detect函数识别数据中的关键词，然后进行分组 samples = c("tumor1","tumor2","tumor3","normal1","normal2","...操作的函数，批量操作图片图片分批次将运行结果保存为R.data格式便于管理数据图片大段代码暂时不运行可以进行折叠，并加入一个if 判断或者注释掉表达矩阵箱线图表达矩阵 R 语言作图要求将宽数据的表达矩阵转变成长数据后昨天...%>% pivot_longer(cols = starts_with("gene"), ##选择那几列的列名合成在一起组成新的一列 names_to = "gene...", ##新的列的名字 values_to = "count") ## 把原来列中的数值一一对应形成一个新的数值列'count' 图片 library(ggplot2

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「Workshop」第二期：程序控制与数据操作流

涉及编程的数据和代码都会放到 https://github.com/XSLiuLab/Workshop 推荐图书《R for Data Science》[1] 《R 语言编程指南》《R 实战》其他推荐见.../geek-r-tutorial/base.html 内容：基础语法控制与循环结构函数与包数据读取和保存 read....ends_with one_of matches 行筛选 slice, filter, sample_n, sample_frac, top_n, distinct 列筛选 select 排序 arrange...文档和《R 语言编程指南》后几期主题本期未讲述的内容？？？...正则表达式与字符串处理：base 与 stringr 列表处理与迭代计算：purrr 统计建模：stats 与 broom 绘图：graphics 与 ggplot2 函数编程：apply家族和purrr

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R语言第二章数据处理②选择行

正文这篇博客主要介绍学习以下R函数： slice（）：按位置提取行 filter（）：提取符合特定逻辑条件的行。例如，iris％>％filter（Sepal.Length> 6）。...filter_all（），filter_if（）和filter_at（）：过滤变量然后选择行。这些函数复制所有变量或变量选择的逻辑标准。...通过删除分组列“Species”，从my_data创建一个新的演示数据集： #去掉Species列 my_data2 % select(-Species) #选择所有属性大于...2的行 my_data2 %>% filter_all(all_vars(.> 2)) #选择任何一个属性大于2的行 my_data2 %>% filter_all(any_vars(.> 2)) #选择以...sep开头的属性任一大于2的行 my_data2 %>% filter_at(vars(starts_with("Sep")), any_vars(. > 2)) 根据缺失值筛选行 friends_data

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dplyr中的across操作

dplyr中的across函数取代了之前的xx_if/xx_at/xx_all，用法更加灵活，初学时觉得不如xx_if/xx_at/xx_all简单易懂，用习惯后真是利器！...主要是介绍across函数的用法，这是dplyr1.0才出来的一个函数，大大简化了代码可用于对多列做同一个操作。...一般用法陷阱 across其他连用和filter()连用一般用法 library(dplyr, warn.conflicts = FALSE) across()有两个基本参数： .cols：选择你想操作的列....fn：你想进行的操作，可以使一个函数或者多个函数组成的列表可以替代_if()，at_()，all_() starwars %>% summarise(across(where(is.character...和filter()连用 across()不能直接和filter()连用，和filter()连用的是if_any()和if_all()。

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数据处理第3部分：选择行的基本和高级的方法

在这篇文章中，我们将介绍如何挑选您的数据。除了filter的基础知识外，它还介绍了一些更好的方法，用near（）和between（）挑选数字列，或用正则表达式过滤字符串列。...这有两个主要选项：base R的grepl（）函数，或stringr包中的str_detect（）。无论何时寻找部分匹配，重要的是要记住R是区分大小写的。...*filter（xor（condition1，condition2）将返回只满足其中一个条件的所有行，而不是满足两个条件时。可以组合多个AND，OR和NOT条件。...如果是这样，那么将对这些列执行过滤器指令。 *filter_at（）要求你在vars（）参数中指定要进行过滤的列。在这些情况下，有一般语法：首先指定哪些列，然后提及过滤器的条件。...或者您只是过滤所有列的字符串“food”。在下面的示例代码中，我在所有列中搜索字符串“Ca”。我想保留在任何变量中出现字符串“Ca”的行，所以我将条件包装在any_vars（）中。

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Learn R 专题1-3

,包含空格和符号 length(x) #返回的是向量中元素的个数，即x中只有一个元素 [1] 1 y = c("jimmy 150","nicker 140","tony 152") #y是字符型向量...因为没有赋值 > test$new=test$Sepal.Length*test$Sepal.Width #以这种方式才是真正的添加新的一列 -------注意：R语言中的修改，都要赋值，没有赋值就没有发生过...------- 补充 select()、filter()筛选列、行优秀的管道符号 x1 = filter(iris,Sepal.Width>3) #从iris出发先筛选行 x2 = select(x1...；cbind是按列拼接起来（向量长度得是相同的）长脚本管理方式 if(T){} #运行{}中的代码;可折叠 if(F){} #跳过{}中的代码专题四表达矩阵画箱线图表达矩阵 set.seed(10086...#X 是数据框/矩阵名；MARGING为1表示行；为2表示列，FUN是函数；对x的每一行/列进行FUN这个函数;...用于写函数的参数 > test<- iris[1:6,1:4] > apply(test

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5R语言综合运用

(x)#字符串长度 ## [1] 42 length(x)#注释str_length(x) 是 stringr 包中的函数，用于计算一个字符串中的字符数（包括空格和标点符号）。...R语言中，select函数用于选择数据框中的列，可以使用列名或者向量来指定要选择的列。...例如，若要选择数据框df中的列x和y，可以使用以下代码：library(dplyr)，df 10且y 10 & y < 5)，与select函数类似，filter也可以使用多个逻辑条件组合...# 2.如何把上一题结果中的Control和Vemurafenib改成全部小写？

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