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数据科学主要以统计学、机器学习、数据可视化等,使用工具将原始数据转换为认识和知识(可视化或者模型),主要研究内容包括数据导入、数据转换、可视化、构建模型等。当前R语言和Python是两门最重要的数据科学工具,本系列主要介绍R和Python在数据导入、数据转换、可视化以及模型构建上的使用。整个系列会按照数据转换、可视化、数据导入、模型构建进行介绍。在数据转换和可视化模块中,R和Python有很多相近的语法代码。
step1 对matrix进行转置:使gene名变为列名,将样本名转化为data.frame中的第一列
[1] "The birch canoe slid on the smooth planks."
认识Tidy Data1.Reshape Data2.Handle Missing Values3.Expand Tables4.split cells一、测试数据1.新建数据框2.用tidyr进行处理3.按照geneid排序4.空值操作用表二、Dplyr能实现的小动作1.arrange 排序2.fliter3.distinct4.select5.mutate6.summarise7.bind_rows8.交集、并集、全集9.关联
正则表达式是一个特殊的字符序列,便于检查字符串是否与某种模式匹配,正则表达式也是对字符串的处理,通过定义一个规则,使得从字符串中匹配出符合规则的字符串,正则表达式可以
semi_join anti_join实际上没有发生过两个数据框的连接,其实是对左边的数据框取子集
专题一:玩转字符串1.检测字符串长度x <- "The birch canoe slid on the smooth planks."xstr_length(x)#检测字符串内的字符数,空格也算length(x)#向量里面元素的个数2.字符串拆分str_split(x," ")#以空格为分隔符号将字符串拆分开x2 = str_split(x," ")[[1]];x2y = c("jimmy 150","nicker 140","tony 152")str_split(y," ")str_split(y,"
例如下面这个稍微复杂一点的数组 [ { IceCream: ['mint', 'chocolate'], Fruit: 'banana' }, { IceCream: ['candy', 'brownie'], Fruit: 'apple' }, { IceCream: ['cake', 'strawberry'], Fruit: 'orange' } ] 假设有几个需求: 1. 查找 IceCream 中包含 'ca' 的项 2. 查找 Fruit 以 'app' 开头的项 3. 查找
在实际的问题中,数据分析者面对的可能是有几十万条记录、几百个变量的数据集。处理这种大型的数据集需要消耗计算机比较大的内存空间,所以尽可能使用 64 位的操作系统和内存比较大的设备。否则,数据分析可能要花太长时间甚至无法进行。此外,处理数据的有效策略可以在很大程度上提高分析效率。
一、玩转字符串 stringr包 图片 1.str_length() 检测字符串长度 x <- "The birch canoe slid on the smooth planks." x ### 1.检测字符串长度 str_length(x) #计算字符串中有多少字符 length(x) #计算向量中元素的个数 图片 图片 2. str_split 字符串拆分 x <- "The birch canoe slid on the smooth planks." x ### 2.字符串拆分 str_sp
同时对数据框的多列执行相同的函数操作经常有用,但是通过拷贝和粘贴的方式进行的话既枯燥就容易产生错误。
1.字符串图片1.str_length图片x <- "The birch canoe slid on the smooth planks."x### 1.检测字符串长度str_length(x)length(x) #返回字符串的个数2.str_splitsplit返回列表,但是列表不能进行计算,对列表进行取子集### 2.字符串拆分str_split(x," ")x2 = str_split(x," ")[[1]];x2y = c("jimmy 150","nicker 140","tony 152")st
citation("ggplo2")取包引用信息,RStudio.Version()可以获取RStudio引用信息。
-(3)注意:之前提到过,矩阵的某一列不能单独转换数据类型,需要把矩阵转换成数据框再转换某列的数据类型;或者把这列单独提取出来再转换其数据类型;
y4 <- filter(deg, a>1 & b < 0.05);table(y4)
INSTR在字符串中查找子字符串,并返回子字符串的第一个字符的位置。 位置以整数形式返回,从字符串的开头开始计算。 如果substring没有找到,则返回0(0)。 如果传递给任何一个参数一个NULL值,INSTR将返回NULL。
以项目的方式管理R代码和文件,可以很大程度规避 1)工作路径不对,2)找不到文件 ,3)代码和文件不对应 ,等常见的问题。
使用机器学习和过股票价格来预测下一个时期的价格或方向并不是什么新鲜事,它也不会产生任何有意义的预测。在这篇文章中我们将一系列资产的时间序列数据分解成一个简单的分类问题,看看机器学习模型能否更好地预测下一个周期方向。目标和策略是每天投资一项资产。其资产将是机器学习模型最有信心在下一个上升Ť+1期间股价上涨的资产。换句话说,我们对机器学习模型给出最大预测概率的资产进行投资,即给定资产明天将升值。也就是说,如果模型预测在第t天,GOOG的资产将以0.78的预测概率高于之前的收盘价,并且还预测AMZN将以0.53的概率上升,那么我们今天将投资于GOOG。我们每天只投资一项资产,该模型可以扩展到卖空、多资产购买和多周期等。
主要介绍几个基于 tidyverse 的函数: select():将一列或多列提取为数据表。 它还可用于从数据框中删除列。 select_if():根据特定条件选择列。 例如可以使用此函数选择列,如果它是数字。 辅助函数 - starts_with(),ends_with(),contains(),matches(),one_of():根据名称选择列/变量 根据列的位置选择列或者根据列的名字选择列 #选择第一列到第三列 my_data %>% select(1:3) #选择第一列和第三列 my_dat
我们知道,R语言学习,80%的时间都是在清洗数据,而选择合适的数据进行分析和处理也至关重要,如何选择合适的列进行分析,你知道几种方法?
《R for Data Science》: http://r4ds.had.co.nz/
当我们使用C++时,库的基础知识比较熟悉,尤其是在C++中创建字符串时使用的std::string。这无疑是对旧的C风格“字符串”(使用以空字符结尾的字符数组)的一种改进。然而,C++标准库在C++17和C++20中引入了更有用的组件,可以帮助你编写更高效的代码。
配置环境:python 3.6 python编辑器:pycharm 代码如下: #!/usr/bin/env python #-*- coding: utf-8 -*- def strCase(): "字符串大小写转换" print("演示字符串大小写转换") print("演示字符串S赋值为:' ThIs is a PYTHON '") S = ' ThIs is a PYTHON ' print("大写转换成小写:\tS.lower() \t= %s
整理数据的本质可以归纳为:对数据进行分割(Split),然后应用(Apply)某些处理函数,最后将结果重新组合(Combine)成所需的格式返回,简单描述为:Split - Apply - Combine。plyr包是Hadley Wickham为解决split – apply – combine问题而写的一个包。使用plyr包可以针对不同的数据类型,在一个函数内同时完成split – apply – combine三个步骤。plyr包的主函数是**ply形式的,函数名的第一个字符代表输入数据的类型,第二个字符代表输出数据的类型,其中第一个字符可以是(d、l、a),第二个字母可以是(d、l、a、_ ),不同的字母表示不同的数据格式,d表示数据框格式,l表示列表,a表示数组,_则表示没有输出。
Tidyverse 是 Rstudio 公司推出的专门使用 R 进行数据分析的一整套工具集合,里面包括了readr,tidyr, dplyr,purrr,tibble,stringr, forcats,ggplot2 等包。https://github.com/tidyverse/
图片 专题1 玩转字符串 图片 检测字符串长度 代码1 str_length(x) if(!require(stringr))install.packages('stringr') library(stringr) x <- "The birch canoe slid on the smooth planks." x [1] "The birch canoe slid on the smooth planks." str_length(x) [1] 42 ### 1.检测字符串长度,包含空格和符号 le
1. S.find(substr,[start,[end]]) 返回S中出现substr的第一个字母的标号,如果S中没有substr则返回-1,start和end作用就相当于在S[start:end]中搜索
filter()函数用于筛选出一个观测子集,第一个参数是数据库框的名称,第二个参数以及随后的参数是用来筛选数据框的表达式。
4. filter 匹配对应行的数据。并生成结果。等同于subset函数。实例:
tidyverse作为R语言数据分析中的瑞士军刀,非常好用,一个小小的缺点就是速度慢,data.table速度快,所以他们团队又开发了dtplyr,加快运行速度。
官方网站:https://www.elastic.co/guide/index.html
基数树(Radix Trie)也叫基数特里树或压缩前缀树,是一种多叉树,一种更节省空间的 Trie(前缀树)。
碎碎念:这个没啥好仔细展示的,含义也很直观,主要是要记住有这个函数,等需要用的时候回来找
完全切分、正向最长匹配和逆向最长匹配这三种算法的缺点就是如何判断集合中是否含有字符串。
字符串在编程中是一种不可或缺的数据类型,它在文本和字符数据时提供了丰富而强大的功能。掌握了字符串的使用方法,你能够更加便捷地进行文本处理、数据操作、用户交互等任务,从而提高编程效率和质量。
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Part5文件读取 >write.csv(test,file="example.csv") > read.csv()通常读取CSV格式 > write.table(test,file="example.txt") > read.table()通常读取txt格式 > save(test,file="example.Rdata") > load("example.Rdata") > a <- data.table::fread("soft.t
$FIND返回一个整数,指定子字符串在字符串中的结束位置。 $FIND搜索字符串的子字符串。 如果找到子字符串,$FIND返回子字符串后面第一个字符的整数位置。 如果substring未找到,$FIND返回0值。
代码来自《r-data-science-quick-reference-master》的内容。
通过基于变量名的操作,select()函数可以让你生成一个有用的变量子集。基本用法如下:
描述: 不管对于那一门编程语言,字符串类型都是及其重要的,所以在学习编程语言后会发现近40%左右都与字符串有关,特别是PHP当然在Linux中的shell脚本开发也同样存在;所以下面主要是字符串搜索命令采用正则匹配的命令,都是在shell编程中比较常用的;
可以使用函数sample_n()选择n个随机行,也可以使用sample_frac()选择行的随机分数。 我们首先使用函数set.seed()来启动随机数生成器引擎。 这对于用户重现分析非常重要。
那么就带来一个问题,怎么用二进制来表示我们程序中需要使用的信息呢,比如 数字、字符、表情等等。
TCGA在去年更新之后提供了Count、TPM、FPKM三种格式的mRNA表达量数据,同时提供了ensembl gene ID、基因名、基因类型,因此有必要更新一下数据了。
最近因为需要从大量的文本中检索字符串,于是想比较一下java jdk提供的 indexof 算法,和其他字符串搜索算法的效率。字符串搜索算法有多种,其中比较有名的是boyer-moore算法。在Moore 先生的主页上有关于 boyer-moore算法的详细介绍。 moore先生介绍的通俗易懂,相信大家都能看明白。
模式和被搜索的字符串既可以是 Unicode 字符串 (str) ,也可以是8位字节串 (bytes)。 但是,Unicode 字符串与8位字节串不能混用:也就是说,你不能用一个字节串模式去匹配 Unicode 字符串,反之亦然;类似地,当进行替换操作时,替换字符串的类型也必须与所用的模式和搜索字符串的类型一致。
doris执行异常:[Err] 1064 - errCode = 2, detailMessage = cannot combine SELECT DISTINCT with aggregate functions or GROUP BY
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