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R语言广义线性混合模型GLMMs在生态学中应用可视化2实例合集|附数据代码

它包括用于 (i) 对给定模型和设计进行功效分析的工具;(ii) 计算功效曲线以评估功效和样本量之间的权衡。 本文提供了一个教程,使用具有混合效果的计数数据的简单示例(具有代表环境监测数据的结构)。...但是,更快的 _z -test 更适合学习使用该包以及在功效分析期间进行初始探索性工作。 增加样本量 在第一个示例中,估计功率很低。...图2 检测大小为 -0.05 的固定效应的功效 (±95% CI),使用 powerCurve 函数在一系列样本大小上计算。...图 3 检测大小为 -0.05 的固定效应的功效 (±95% CI),使用 powerCurve 在一系列样本大小上计算。...图 4 检测大小为 -0.05 的固定效应的功效 (±95% CI),使用 powerCurve 函数在一系列样本大小上计算。

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R语言广义线性混合模型GLMMs在生态学中应用可视化2实例合集|附数据代码

它包括用于 (i) 对给定模型和设计进行功效分析的工具;(ii) 计算功效曲线以评估功效和样本量之间的权衡。 本文提供了一个教程,使用具有混合效果的计数数据的简单示例(具有代表环境监测数据的结构)。...但是,更快的 _z -test 更适合学习使用该包以及在功效分析期间进行初始探索性工作。 增加样本量 在第一个示例中,估计功率很低。...图2 检测大小为 -0.05 的固定效应的功效 (±95% CI),使用 powerCurve 函数在一系列样本大小上计算。...图 3 检测大小为 -0.05 的固定效应的功效 (±95% CI),使用 powerCurve 在一系列样本大小上计算。...图 4 检测大小为 -0.05 的固定效应的功效 (±95% CI),使用 powerCurve 函数在一系列样本大小上计算。

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    经典功率谱估计及Matlab仿真

    本文给出了经典功率谱估计的几类方法,并通过Matlab的实验仿真对经典功率谱估计方法性能进行了分析,最后说明了经典功率谱估计法的局限性和造成这种局限性的原因。...分辨率即功率谱上能够区分的最小相邻频率成分,分辨率越高,我们观察信号的频率成分越清晰;方差大小则反映到功率谱波动性的大小,如果方差太大,功率谱波动性大,则很容易造成有用的频率成分被噪声淹没。...所以,我们希望得到的这个"非精确"的功率谱,分辨率越高越好,方差越小越好。 同时,我们给出概率论与数理统计中所学的一致估计和非一致估计的概念,假定真实信号的功率谱为 ?...图2-1 实验所用的随机信号 当数据点数N分别为128、256、512和1024时,得到的功率谱分别如图2-2、图2-3、图2-4和图2-5所示。...2.1.7总结 周期图法获得的功率谱随着样本点数越多,分辨率越大、方差越大;平均周期图法以牺牲分辨率来进一步改善方差;修正的平均周期图法允许段的重叠来进一步增大分段数、或者分段数相同,每段样本点数变多。

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    【统计、图形和样本量软件】上海道宁为您提高强大的统计分析、图形和样本量工具

    从那时起,成千上万的客户使用NCSS软件(NCSS和PASS)进行统计、图形和功率分析/样本大小的目的。在过去的 40 年中,我们的使命是提供准确、用户友好、全面支持的统计分析、图形和样本量工具。...其中一些特征是趋势线(最小二乘)和置信限、多项式、样条曲线、黄土曲线、边界箱线图和向日葵图。NCSS也有一个用于绘制三维散点图的过程,在后面的部分中会显示。...05、准备使用输出运行PASS程序时,样本量结果和相应的图将显示在输出窗口中。可以单击样本大小或功率曲线以在单独的窗口中显示以进行查看或保存。使用输出导航树可以轻松导航输出。...桥接研究:使用两组等效性检验的桥接研究(连续结果);使用两组非劣效性检验的桥接研究(连续结果) 组顺序测试:对于这些组序列功率和样本量程序中的每一个,NCSS 2022 中都有相应的组序列分析和样本量重新估计程序...;具有固定不合格的属性的验收抽样 其他:两个泊松率之比的检验 02、PASS 2022中的改进程序 条件功效和样本量重新估计:手段的条件权力程序进行了改进,以包括Tk或Zk的选项。

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    生态学模拟对广义线性混合模型GLMM进行功率(功效、效能、效力)分析power analysis环境监测数据

    但是,更快的 _z -test 更适合学习使用该包以及在功效分析期间进行初始探索性工作。 增加样本量 在第一个示例中,估计功率很低。...由于模型 1 没有足够的功率,我们没有通过 powerCurve 运行它。绘制的输出如图所示。 我们可以看到,检测_x _趋势的 能力随着采样大小的增加而增加。...图2 检测大小为 -0.05 的固定效应的功效 (±95% CI),使用 powerCurve 函数在一系列样本大小上计算。...图 3 检测大小为 -0.05 的固定效应的功效 (±95% CI),使用 powerCurve 在一系列样本大小上计算。...图 4 检测大小为 -0.05 的固定效应的功效 (±95% CI),使用 powerCurve 函数在一系列样本大小上计算。

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    【知识】实体关系图(ERD)的定义和绘制

    通过绘制ER图来可视化数据库设计思想,您有机会识别错误和设计缺陷,并在数据库中执行更改之前进行更正。...因此,有了这个ER图工具,ER设计就不再是一个静态的图,而是反映物理数据库结构的一面镜子。 2.2.4 帮助收集需求 ——通过绘制描述系统高级业务对象的概念性ERD来确定信息系统的需求。...属性具有描述属性的名称和描述属性类型的类型,如字符串的varchar和整数的int。在为物理数据库开发绘制ERD时,务必确保使用目标RDBMS支持的类型。...2.4 概念、逻辑和物理数据模型 ER模型通常是在三个抽象层次上绘制的: 概念ERD /概念数据模型 逻辑ERD /逻辑数据模型 物理ERD /物理数据模型 虽然ER模型的所有三个级别都包含具有属性和关系的实体...物理数据模型示例 2.5 如何绘制ER图? 如果你发现很难开始画ER图,不要担心。在这一节中,我们将为您提供一些ERD技巧。尝试按照下面的步骤来理解如何有效地绘制ER图。

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    时频分析方法及其在EEG脑电中的应用

    例如,图2A和图2B中的波具有相同的频率和相位(即它们是完美排列的),因此它们都从振荡的峰值开始。这些通常被称为锁相信号。...类似地,TF分析捕捉到500 ms时功率和频率增加时的10 Hz锁相振荡。作为一个单独的测量,TF分析还提供了给定频率的相位随时间的估计。...与ERP相比,TF分析需要考虑TF分析的基线窗口大小,窗口通常应该在相关事件开始之前。TF分析通常使用几百毫秒,并在感兴趣的事件之前结束。理想情况下,基线条件应该与感兴趣的时期具有相似的长度。...相位同步可以通过平均各个trials的相位角值来估计,因为相位角是圆的,而不是线性的,相位角在一个具有实虚分量的复平面中表示,相位角差的平均值通过矢量数学计算。...我们建议在TF分解后下采样到125 Hz,特别是对于具有许多条件和/或大样本容量的数据集。

    1.4K20

    matlab画点图如何设置点的大小颜色_matlab如何根据点绘制曲线图

    Matlab中,plot绘图的曲线线宽、标记点大小、标记点边框颜色和填充颜色的设置 1、LineWidth:用于设置线宽,其后的ProperValue选项为数值,如0.5,1,2.5等,单位为points​...; 2、MarkerEdgeColor:用于设置标记点的边框线条颜色,其后的ProperValue选项为颜色字符,如‘g’,’b’,’k’等​; 3、MarkerFaceColor:用于设置标记点的内部区域填充颜色...,其后的ProperValue选项为 颜色字符,如‘g’,’b’,’k’等​​; 4、Markersize:用于设置标记点的大小,其后的ProperValue选项为数值,单位为points。​...plot(x,y,’–p‘,’MarkerSize’,10,’MarkerFaceColor’,’m‘,’MarkerEdgeColor’,’b‘,’LineWidth’,1.5) 上面这个句子中标红的就是可以替换的地方...如发现本站有涉嫌侵权/违法违规的内容, 请发送邮件至 举报,一经查实,本站将立刻删除。

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    Python绘制时间序列数据的时序图、自相关图和偏自相关图

    时序图、自相关图和偏相关图是判断时间序列数据是否平稳的重要依据。...另外,绘制自相关图的函数plot_acf()和绘制偏自相关图的函数plot_pacf()还有更多参数可以使用,请自行挖掘和探索。...freq='D')) return df # 生成测试数据,模拟某商店营业额 data = generateData('20170601', '20170701') print(data) # 绘制时序图...plot_acf(data).show() # 绘制偏自相关图 plot_pacf(data).show() 某次运行得到的随机数据为: 营业额 2017-06-...从时序图来看,有明显的增长趋势,原始数据属于不平稳序列。 相应的自相关图为: ? 从自相关图来看,呈现三角对称形式,不存在截尾或拖尾,属于单调序列的典型表现形式,原始数据属于不平稳序列。

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    圈图 | 不同品种的基因型数据绘制PCA图和聚类分析图

    PCA是降维的一种方法。 本次再增加一下聚类的形式。 很多软件可以分析PCA,这里介绍一下使用plink软件和R语言,进行PCA分析,并且使用ggplot2绘制2D和3D的PCA图。...绘制后的图如下: 2-D PCA图: ? 图片解释,将每个品种用不同的颜色表示,同时绘制置信区间圆圈,X坐标是PC1,解释24.9%的变异,Y坐标是PC2,解释10.61%的变异。...可以看到,三个品种在PCA图里面分的比较开,C品种的有两个A和B的点,应该是异常数据。 3-D PCA图: ?...2,计算G矩阵 3,计算PCA的特征向量和特征值 4,根据特征值计算解释百分比 5,根据特征向量和品种标签,进行PCA的绘制 绘制代码如下: 首先,使用plink命令,将基因型数据转化为012...然后使用R语言,计算PCA,并绘制PCA图。

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    R语言t检验和非正态性的鲁棒性

    首先,我们将绘制一个大的(n = 100000)样本并绘制其分布以查看它的外观: 我们可以看到它的分布是高度偏斜的。从表面上看,我们会担心对这些数据使用t检验,假设X是正态分布的。 ?...为了看看样本的样本分布,我们将选择样本大小为n,并从对数正态分布中重复绘制大小为n的样本,计算样本均值,然后绘制这些样本均值的分布。...如此小的样本量,如果其中一个样本从分布的尾部具有高值,则这将给出与真实均值相差很远的样本均值。如果我们重复,但现在n = 10: 它现在看起来更正常,但它仍然是偏斜的 - 样本均值有时很大。...检查这种情况的更直接的方法是进行模拟研究,其中我们凭经验估计t检验的1型错误率,在给定的n选择下应用于该分布。...当然,如果X不是正态分布的,即使假设正态性的t检验的类型1错误率接近5%,测试也不会是最佳的。也就是说,将存在零假设的替代测试,其具有检测替代假设的更大功率。

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    【MATLAB】基本绘图 ( 绘制多图 | 设置图形对话框在 Windows 界面的位置和大小 | 在一个图形上绘制多个小图形 )

    3文章目录 一、绘制多图 1、绘制多图 2、代码示例 二、设置图形对话框在 Windows 界面的位置和大小 三、在一个图形上绘制多个小图形 一、绘制多图 ---- 1、绘制多图 存在一种绘图情况 ,...需要同时展示两条曲线 , 但是二者的 x 或 y 轴差距过大 , 需要绘制在两个图中 ; 在绘制每个图前 , 先调用一次 figure , 就会在新的对话框中生成一张新的图形 ; 使用示例如下 :..., y1); % 绘制第二个图像 , 指数函授 figure , plot(x, y2) 绘图结果 : 二、设置图形对话框在 Windows 界面的位置和大小 ---- 使用 figure 函数可以设置图形的位置和大小...equal tight 执行结果 : 上面绘制出来的图的效果 , 最正确的是第 张图的样式 equal , x 轴上长度 1 与 y 轴上长度 1 相同 , 是最直观的效果 ; square...样式表示的是坐标轴的 x 轴和 y 轴长度相同 ; equal tight 样式是在 equal 样式基础上 , 贴边切割有效曲线图形 ;

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    R语言中绘制箱形图的替代品:蜂群图和小提琴图

    在这里,我们将仔细研究箱形图的潜在替代方案:蜂群图和小提琴图。  蜂群图 原则上,蜂群图类似于一维散点图,因为它将单个测量结果显示为点。...但是,不同之处在于,蜂群图采用了一种逻辑,以确保所绘制的点彼此靠近且不会重叠。 那么,什么时候应该使用蜂群图?由于蜂群图中的点不应重叠,因此此类图仅适用于相对少量的测量。...小提琴图的想法是将箱形图和密度图结合起来。...由于该图依赖于密度估计,因此只有在有足够数量的数据可用于获得可靠估计时,该图才有意义。否则,估计的密度可能表示数据中实际上没有的趋势。...,对于小样本量 。

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    静息态网络核心区域的动态连接的调制激活

    10Hz功率得到的连接和fMRI连接具有显著的样本间相关性,(Pearson’s r = 0.39, P 图1B)。显示了在10Hz功率下个体有强的fcMRI通常会有强的MEG连接。...(A)ACC和PCC的MEG信号的时间相关性的散点图,颜色代表Pearson相关的大小,和弦标记显著性r值,(B)FcMRI在10Hz左右的MEG连接散点图,每个点代表样本,黑色为回归线。 ?...(C)ACC的流入(左)和PCC的流出(右)的组级估计。...有效顶点被标记为感兴趣区域(ROI),表示GC值较大的区域(图2B)。得到ROI后,在每个受试者中绘制ROI,然后在对象之间覆盖以得出组级别的估计(图2C)。...在每个时间窗内,估计ACC每个顶点的GC和PSD(图3A),并将顶点和时间段聚类成时空簇,得到时间(> 20 s)和空间稳定(> 20个相邻顶点)的时空模式。

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    Balsamiq Mockups 产品原型图绘制工具的破解和使用教程

    说实话作为一个前端,会不会这个软件都是没事的,毕竟这个是经理才可以用到的软件,科普一下,Balsamiq Mockups是一款美国加利福尼亚一个工作室在2008年开发出来的一款很好用的产品原型绘制软件,...我是无意中发现的(其实是没办法,产品原型没人画,只能我画),我之前没有用这款软件,之前用的是Axure RP8这款绘制产品原型的软件,但是这次是绘制手机端的界面,所以用那个就不是很好用了,既然画了就不说废话了...2.安装好软件后,将注册机放在安装目录的文件夹内 3.双击注册机,软件运行,看到有注册按钮后,点注册,在注册信息里填写用户名等,注册码随便填写 4.点击确定按钮,注册机将出现正确的注册码,将刚才的注册名和正确注册码填入软件即可注册...这是主界面,这个时候我们可以看到,我们是没有注册的,但是这个软件是提供了注册机的,我们这个时候需要点击查看是不是注册过,点击 help - register 这个时候他会让你填写名字和注册码,我们这个时候先去注册机里面获取...这是一个很简单的绘制过程,那么我们可以自己编辑风格,例如这样的: ? 可以用苹果4S ? 设置是在工具栏里面: ? 风格是在下方: ?

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