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我有一个由数字观测组成的大型数据集。对于这个数据集，我计算了k-means，并为其定义了6个聚类。如何绘制每个集群的热图？
浏览 45提问于2019-01-16得票数 1
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我想知道其他人对K-means聚类排序做了什么。我正在制作热图(主要是数据)，并使用自定义热图函数(基于R的内置热图函数)获得漂亮的图形。然而，我想要两个改进。第一种是根据递减的平均值对我的集群进行排序。nstart=10)d = data.frame(d, fit$cluster)
d = d[order(d$fit.c
浏览 1提问于2011-01-25得票数 5
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从R中的PCA坐标创建热图
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我想在一个变量上创建一个针对其自身的热图。但是，我没有矩阵格式。我有每个项目的PCA1和PCA2坐标，我想知道如何在此基础上创建热图。这是我的数据的样子(其中cluster是k-means聚类分类)echocardiography0.72 -0.02 3
hemorrhag
浏览 13提问于2017-06-24得票数 0
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我最近开始使用R来对我的数据进行聚类。我的目的是有一个热图与相关的树状图，并在热图上的聚类的方块识别。到目前为止，我尝试了来自hclust包的gplots，我可以用下面的代码在树状图上绘制矩形：b <- as.dist0.95 0.43
e 0.65 0.47 0.56
浏览 6提问于2015-01-20得票数 0
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假设我已经将包含1000个实例的5个类的训练数据集聚类到5个聚类(中心)，例如使用k-means。然后，我通过在测试数据集上进行验证，构建了一个混淆矩阵。然后我想用这个绘制ROC曲线，怎么可能做到呢？
浏览 2提问于2012-03-21得票数 2
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R中的集群和热图
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我已经完成了一些聚类教程，我确实得到了一些输出，然而，我在聚类后得到的热图与使用另一个程序从相同的数据表中生成的热图完全不对应。虽然该程序的热图确实显示了对象之间标记表达的明显差异，但我的热图没有显示太多差异，并且我无法识别热图上的任何聚类(即颜色)模式，它看起来只是一组彼此接近的随机杂乱<e
浏览 1提问于2012-03-22得票数 4
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我想绘制一个DataFrame的集群热图。使用seaborn.clustermap，我非常接近结果。但我只想要没有层次树和列表栏的热图，但我不知道如何停用它们。
浏览 2提问于2016-12-12得票数 1
我有跨20列的90个观察值(行)的数据集。我已经生成了一个非常整洁的热图，它使用pheatmap包将我的数据分成两组。虽然它不是完全干净的，但根据我的情况，这两个树状图很大程度上将我的样本分为两个不同的组。现在，我想要将这90个集合减少到一个更严格的集合，大约20-30个观察点，但仍然希望保留与pheatmap中所示的相同的聚类顺序。有没有办法做
浏览 0提问于2017-05-05得票数 2
我在R中的kohonen包的帮助下创建了一个集群。该集群由6个不同的属性定义，形成一个15x15矩阵=225个不同的集群。现在，我想要创建某种传说，根据特定的值(比如热图)，用不同的颜色填充每个集群的可视化。问题是，这个特定的值不是定义集群的6个属性的一部分。因此，我不能使用
浏览 5提问于2022-02-11得票数 1
我没有做任何调整就实现了这个方法，而且我的结果也不那么明显，尽管我没有调整任何参数。在我自己的例子情节里，我在看什么？
浏览 5提问于2019-11-01得票数 0
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我正在学习KMeans集群的概念。如果变量是连续的，我知道如何聚类。但此数据集包含分类/离散变量，如性别和邮政编码。
浏览 3提问于2016-09-12得票数 0
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我有以下热图的示例图像(我现在有数百个这样的images...for，以后会增长)：
用我的人眼，我会说heatmap1，3和4是相似的，或者3和4是最相似的，我不确定我希望能够根据模式和强度将最相似的热图图划分成不同的组。
例如，中的每个heatmap包含24行和5列(行表示时间，列表示功能)。每列中的每一种颜色代表一个介于0到1之间的数字
浏览 10提问于2017-05-11得票数 0
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我有一个包含三个组的表达式矩阵。我需要绘制或分割带有特定范围的列的热图。number of colums: 151 where 1st column is gene idsGroup2: 41:80我搜索了一下热图，得到了一些像这样的点击。但它们是基于特定的集群。我需要给我的范围作为(2:40, 41:80, 81:151
浏览 2提问于2020-02-19得票数 0
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运行肘部方法，我发现k=5似乎是一个很好的集群数量。不幸的是，当我标准化我的特性时，我得到了一个单例集群，即使有几个init。当我没有标准化的时候，这是不会发生的。我知道功能的标准化是一个经常被问到的问题，但是我仍然不明白这是不是一个好的实践。在这里我进行标准化，因为某些功能的差异很大。如果这是个坏主意，你能解释一下为什么吗？以下是K-means结果的MDS可视化
浏览 0提问于2018-12-18得票数 0
我还阅读了在R中应用dbscan的基本介绍。我的数据是开始/结束位置和时间(超过50k行)。0.837480354951308, -0.313301931309727)), row.names = c(NA,-10L), class = c("tbl_df", "tbl", "data.frame"))
然而，我的聚类结果总是合并到一个
浏览 61提问于2021-05-31得票数 0
我正在尝试通过heatmap.2生成一个图，但我想了解集群是如何完成的。因此，我尝试在函数调用之前复制树状图，并用它们绘制。然而，最终的数字是不同的。有什么线索吗？热图1： xlab="Samples", ylab="Genes" ,scale="no
浏览 3提问于2013-11-11得票数 1
现在，我正在使用Seaborn的集群地图生成一些集群热图--到目前为止还不错。
对于特定的用例，我需要在特定的单元格周围绘制彩色边框。有办法吗？
浏览 11提问于2015-07-08得票数 24
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