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沙龙
2
回答
为什么igraph spinglass告诉我“不能处理未连接的
图
”?
algorithm
、
python-2.7
、
nodes
、
igraph
、
vertices
我使用的是完全相同的
图
,但我得到了一个错误。igraph.InternalError: Error at clustertool.cpp:286: Cannot work with unconnected graph, Invalid value 我确实有边和顶点,并且相同的
图
可以与图中的所有其他社区检测算法
浏览 4
提问于2015-12-29
得票数 1
1
回答
在Python中绘制
聚
类
图
python
、
graph
、
cluster-analysis
、
graph-drawing
、
unsupervised-learning
我已经有了一种
聚
类
我的
图
的方法,所以
聚
类
的过程不是这里的问题。我想做的是,一旦我们对所有节点进行
聚
类
-在Python中绘制
聚
类
图
,如下所示:我研究了networkx、igraph和graph-tool,但它们似乎完成了
聚
类
,而不是绘图。我应该使用什么库来绘制已经聚集的
图
,这将最小化交叉链接的数量,有什么想法和主张吗?
浏览 6
提问于2013-05-22
得票数 6
2
回答
使用python
聚
类
/查找类似的热
图
python
、
image-processing
、
machine-learning
、
computer-vision
、
k-means
我有以下热
图
的示例图像(我现在有数百个这样的images...for,以后会增长): 用我的人眼,我会说heatmap1,3和4是相似的,或者3和4是最相似的,我不确定我希望能够根据模式和强度将最相似的热
图
图
划分成不同的组。 例如,中的每个heatmap包含24行和5列(行表示时间,列表示功能)。每列中的每一种颜色代表一个介于0到1之间的数字。与其他热
图
相比,第1列中用于heatmap 3和4的模式和强度更相似。但是,我不想看每一列,而是要比较每个热
图
的总体模式和强
浏览 10
提问于2017-05-11
得票数 0
3
回答
python中的谱
聚
类
图
python
、
scikit-learn
、
cluster-analysis
、
graph-theory
、
spectral
我想使用谱
聚
类
在python中对
图
进行
聚
类
。 这两种方法都提
浏览 9
提问于2017-09-16
得票数 33
回答已采纳
1
回答
相似矩阵上的
图
和热
图
r
、
heatmap
、
hierarchical-clustering
、
dendrogram
我已经为数据的成对比较计算了一个相似矩阵,我希望使用分层
聚
类
和热
图
来可视化数据。热
图
不是一个问题,但是对于分层
聚
类
,它似乎是对我的相似性矩阵做了一个距离矩阵(如果有变化,我将使用包aheatmap ),然后进行
聚
类
。什么是最好的方法来指定它已经是一个基于数据的相似矩阵和
聚
类
,就在热
图
的旁边? 谢谢!
浏览 1
提问于2018-04-06
得票数 1
回答已采纳
1
回答
我怎么能生成这样的
图
呢?
javascript
、
r
、
ggplot2
、
d3.js
、
dendrogram
我遇到过这样一种
图
,它对给定的timeseries数据集执行分层
聚
类
。有人能告诉我怎么画这样的
图
吗?
浏览 2
提问于2012-03-17
得票数 31
回答已采纳
1
回答
0.8.2中的
聚
类
cluster-analysis
、
social-networking
、
gephi
、
sna
我对
图
做了很多有用的事情,使用内置的功能,但会对比包含什么更好的
聚
类
算法感兴趣(我使用Force Atlas 2来安排节点)。例如,我想使用模块化属性将节点分组到集群中。我试着下载了两个
插件
(Girvan和一个马尔可夫
聚
类
算法),但是想不出如何将它们应用到我的图形中。它们会出现在工作流中的“集群”窗口中,但当我选择它们时,"Run“按钮就会变成灰色。它们也不会出现在主UI上的“
插件
”下拉列表中。有什么想法吗?
浏览 2
提问于2015-05-20
得票数 2
1
回答
聚
类
多网络
clustering
、
graphs
、
social-network-analysis
我在寻找网络中的社区检测方法。例如,如果我有一个由100人组成的网络(每个节点都是一个人),那么如何集群节点呢?将这些人分组的最佳方法是什么?我知道这个问题很开放,但我只是在寻找一个正确的方向。
浏览 0
提问于2017-04-06
得票数 0
回答已采纳
1
回答
聚
类
和分裂
聚
类
最终能得到相同的结果吗?
algorithm
、
cluster-analysis
、
hierarchical-clustering
、
unsupervised-learning
现在,我知道凝聚是自下而上的方法,而分裂是自上而下的方法。但是,我不知道他们在具体的过程中有什么不同。例如,它们是否都使用邻近矩阵来计算样本之间的任何成对距离?此外,如果设置所有相同的参数,像相同的连接准则,相同的cluster...do目标数,它们最终得到的结果是完全相同的?
浏览 1
提问于2021-02-21
得票数 1
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7
回答
交互式热
图
/矩阵可视化
matrix
、
visualization
、
google-visualization
我想在网页上显示我在R中生成的热
图
(矩阵)。我的矩阵看起来像这样,但在我的例子中,大小是300x300。
浏览 0
提问于2011-12-13
得票数 1
1
回答
如何在许多CFG中应用?
clustering
、
graphs
我有大约1000个DAG(有向无环
图
)的不同文件显示java.io.BufferedReader的使用。下面是其中一个
图
的表示 9 [ label="9 : ROOT:setup()#0" ]; 12 [ label34; 27 -> 34; 29 -> 34; 34 -> 35; 35 -> 3
浏览 0
提问于2016-02-02
得票数 2
1
回答
如何在Matlab的生物信息学工具箱中使用
聚
类
图
的其他
聚
类
方法
oop
、
matlab
、
bioinformatics
、
hierarchical-clustering
你好,我已经搜索了代码,但是对于面向对象的编程,特别是Matlab的版本,我非常无知。因此,我所知道的只是函数调用行'obj =obj.get群集‘,但是不知道如何编辑它,因此我使用自己的
聚
类
算法而
浏览 7
提问于2010-10-20
得票数 0
3
回答
谱
聚
类
与层次
聚
类
cluster-analysis
、
data-mining
、
hierarchical-clustering
、
spectral
有谁能解释一下,与光谱
聚
类
相比,使用层次
聚
类
有什么好处?我知道它们是如何工作的,但我想知道在哪种情况下使用分层
聚
类比使用光谱
聚
类
更好。
浏览 6
提问于2016-04-15
得票数 3
回答已采纳
1
回答
你能从R中的pheatmap中提取数据矩阵吗?
r
、
pheatmap
我根据基因微阵列数据创建了一个热
图
,然后使用pheatmap对数据进行
聚
类
并输出热
图
。 有没有办法将热
图
的
聚
类
数据以矩阵形式输出到excel文件中?
浏览 2
提问于2015-09-25
得票数 0
1
回答
如何描述这个UMAP连接
图
feature-engineering
、
dimensionality-reduction
、
graphs
我生成了我的研究数据的UMAP连通
图
。我如何解释/描述这个关于UMAP连通性的情节?由于B8和B6之间有很多连接性,所以集群是相似的吗?
浏览 0
提问于2022-08-10
得票数 1
1
回答
使用python的层次
聚
类
树形
图
python
、
graph
、
cluster-analysis
、
hierarchical-clustering
、
dendrogram
我被要求绘制一个层次
聚
类
图
的树状
图
。我得到的输入如下:这个
图
的所有边的列表。下一步是对
图
进行
聚
类
,然后根据
聚
类
后的
图
绘制树状
图
。(
聚
类
,获取树状
图
)到目前为止,我一直在使用图形工具来绘制图形,我还运行了我在互联网上从Scipy.clustering.hierarchy包中找到的
浏览 0
提问于2014-10-19
得票数 1
3
回答
Ext
JS
5
聚
类
图
javascript
、
extjs
、
extjs5
有人试图在Ext 5中实现集群图表吗?但在中没有任何例子。 可能是Ext版本的问题吗?我使用的是5.0.0.970,它似乎是目前的最新版本。
浏览 2
提问于2014-06-27
得票数 0
回答已采纳
1
回答
我们如何使用
聚
类
系数进行
聚
类
?有什么特别的算法吗?
graph
、
cluster-analysis
我想使用局部
聚
类
系数对我的
图
进行
聚
类
。据我所知,
聚
类
系数衡量的是一个节点形成集群的可能性,但我似乎找不到任何使用
聚
类
系数的具体
聚
类
算法。 我试着搜索论文,但似乎没有相关的论文。我是不是遗漏了什么?
浏览 0
提问于2012-05-20
得票数 1
回答已采纳
1
回答
使用R和
聚
类
绘制热
图
r
、
ggplot2
、
heatmap
、
pheatmap
大家好,我正在尝试绘制热
图
想要的
聚
类
图
和
图
看起来不太好想要更改颜色我是新手可以告诉我如何绘制具有
聚
类
值的热
图
吗?
聚
类
值显示相似的模式
聚
类
在一起我的数据library(ggplot2) mydata=read.table("Test_data
浏览 8
提问于2020-11-19
得票数 0
1
回答
Java中的二维层次
聚
类
库
java
、
bioinformatics
、
hierarchical-clustering
我正在从事一个开源Java项目,在该项目中,我们需要对热
图
进行
聚
类
并绘制树状
图
。是否有任何2D层次
聚
类
库可供随时使用? 提前谢谢。
浏览 2
提问于2021-11-08
得票数 0
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