条形图是科研中常用的图,但是有时候可能你会觉得普通的条形图过于平平无奇。还有些时候展示的空间有限,数据却很庞大,这时再用普通的条形图可能就不利于展示信息了。那么要怎么办呢?不如考虑一下使用环状条形图。我们先来看几个关于环状条形图的例子。
考虑到公众号后台数不胜数的提问其实并不是生物学知识或者数据处理知识的困惑,仅仅是绘图小技巧以及数据转换的困难。所以我们一再强调系统性掌握编程知识的重要性,在这个打基础方面我让实习生“身先士卒”,起码每个人在每个编程语言上面都需要看至少五本书而且每本书都需要看五遍以上,并且详细的记录笔记。
条形图专用于离散变量和数值变量之间的可视化展现,其通过柱子的高低,直观地比较离散变量各水平之间的差异,它被广泛地应用于工业界和学术界。在R语言的ggplot2包中,读者可以借助于geom_bar函数轻松地绘制条形图。对于条形图大家对其的印象是什么呢?又见过哪些种类的条形图呢?在本篇文章我将带着各位网友说道说道有关条形图的哪些品种。
Geom_text()将文本直接添加到绘图中。 geom_label()在文本后面绘制一个矩形,使其更易于阅读。
柱形图 简介 英文:histogram或者column diagram 排列在工作表的列或行中的数据可以绘制到柱形图中。在柱形图中,通常沿水平轴组织类别,而沿垂直轴组织数值。 柱形图具有下列图表子类型
最近忙的厉害,产量下降的有点严重,感谢各位还没取关的小伙伴儿。 一周前更新了一篇数据地图上的气泡散点图的内容,不知怎地,这段时间就是跟地图死磕上了,今天还是数据地图,不过是在数据地图上呈现条形图、柱形图。 之前的一篇因为有现成的作图包支持,geom_scatterpie函数不用花费太大力气就解决了数据地图上的气泡散点图问题。 可是到目前为止我还没有发现支持对应坐标位置的条形图、柱形图,这一篇是参考了知乎上大神提供的思路。 加载包: library(maptools) library(ggplot2) lib
没有难学的技艺,只有不够辛勤的付出! 今天这篇文章推送仿的的是网易数独的一幅信息图,内容呈现的是全球各国人民对于养老所持的态度,数据来源于Pew Reserch Centre。 图表整体难度中等,使用
R有几种不同的系统用来产生图形,但ggplot2是最优雅而多变的那一种。ggplot2实现了图形语法,一种描述和构建图形的逻辑系统。通过ggplo2,我们能够快速学习,多处应用。
💡专注R语言在🩺生物医学中的使用 首先是加载R包和数据 library(tidyverse) library(ggtext) library(showtext) showtext_auto() load("E:/R/r-learning/r4ds/000files/df_animals_2.rdata") 主题设置 theme_set(theme_minimal(base_size = 19, base_family = "Girassol")) theme_update( text = elem
❝「今天VIP群里有观众老爷询问如何绘制环状堆砌条形图」例图如下所示,既然观众老爷们有需求,那小编就来简单写篇文档进行介绍;下面来看具体案例「数据代码已经上传VIP群,请自行下载」 ❞ 例图 📷 图形解读 ❝可以看到就是一张普通的堆砌条形图只不过改为了圆形展示,通过图形我们可以看到数据分为两组,并且每一个样本数值有正负之分,因此与常见的条形图绘制方法无二,只是在于构建极坐标并合理的添加文本;由于小编手里没有合适的数据因此使用R内置数据集来进行展示,下面来看具体细节 ❞ 加载R包 library(tidyv
上一篇中我们介绍了ggplot2的基本语法规则,为了生成各种复杂的叠加图层,需要了解ggplot2中一些基本的几何图形的构造规则,本文便就常见的基础几何图形进行说明;
1. ggplot2的安装:install.packages("ggplot2")。
❝本节来介绍如何使用「ggplot2结合ggforce」来绘制别具一格的条形图,下面小编通过一个案例来进行展示,图形仅供展示用,希望各位观众老爷能够喜欢。❞
桑基图(Sankey diagram),即桑基能量分流图,也叫桑基能量平衡图。它是一种特定类型的流程图,图中延伸的分支的宽度对应数据流量的大小,通常应用于能源、材料成分、金融等数据的可视化分析。因1898年Matthew Henry Phineas Riall Sankey绘制的“蒸汽机的能源效率图”而闻名,此后便以其名字命名为“桑基图”。
马赛克图(mosaic plot),显示分类数据中一对变量之间的关系,原理类似双向的100%堆叠式条形图,但其中所有条形在数值/标尺轴上具有相等长度,并会被划分成段。可以通过这两个变量来检测类别与其子类别之间的关系。
geom_label可以使用fill对颜色进行填充,fontface设置字体,geom_text不能填充颜色
ggplot函数所制作的图表默认设计风格虽然经过设计师的精雕细琢,但是并不是尽如人意。 毕竟在这个大众审美水平水平越来越高的时代里,企业中的各式报告也强调与企业的VI相互统一,形成自身风格与特点。 这样就要求R语言所制作的图表能够根据所需的风格与主题,高度可定制。当然ggplot函数中是支持这种多样性的订制需求的,甚至像那些知名的咨询或者顶级财经媒体的御用图表模板已经被制作成了图表主题分享在R语言的主题包之中。 接下来要介绍关于图表主题设置的一些细节: 关于柱形图与条形图的转化问题: 这个问题昨天已经提到了
但是学生的表现实在是太超出我意料了,能超脱于现有的工具,达到随心所欲的定制化,值得分享!
今天跟大家分享多系列与分面组图的美化技巧! 昨天讲的关于多序列柱形图与条形图美化技巧,其实还漏掉了一些一点儿。 当数据序列比较多的时候,特别是超过四个以后,还用堆积柱形图(条形图)、或者簇状柱形图的话,图表必然会因为系列太多而受到挤压或者变形,整体就会不协调、不美观。 还有ggplot不支持次坐标轴功能,它的作图思维基本源于塔夫脱的可视化理念,而且作者个人的审美也接受次坐标轴(大牛任性),但是他留给大家解决多序列图表的方案是——分面组图~ data<-data.frame(Name = c("苹果","谷歌
连续两次求贤令:曾经我给你带来了十万用户,但现在祝你倒闭,以及 生信技能树知识整理实习生招募,让我走大运结识了几位优秀小伙伴!大家开始根据我的ngs组学视频进行一系列公共数据集分析实战,其中几个小伙伴让我非常惊喜,不需要怎么沟通和指导,就默默的完成了一个实战!
今天看到一个看着挺养眼的经济学人图表案例,于是职业病爆发了,用ggplot2按照自己的思路写了一遍。现在把代码思路分享给大家! 加载包: library("ggplot2") library("tid
ggplot2是R语言最流行的第三方扩展包,是RStudio首席科学家Hadley Wickham读博期间的作品。根据其绘图理念,图形由以下几个模块组成:
一个小案例,使用ggplot2绘制蝴蝶图,在巩固温习条形图坐标轴翻转的同时,重新熟悉一下如何利用grid系统进行版式布局。 原图如下: 该图表思路很简单,就是两个条形图通过坐标轴翻转,使用grid包
作者:严涛 浙江大学作物遗传育种在读研究生(生物信息学方向)伪码农,R语言爱好者,爱开源
随着互联网+和大数据科技的发展,VFX可视化和数据可视化越来越受到人们的喜爱,在R语言中,绘制GIF动图主要是在gganimate包中运行,制作视频主要是在av包,gganimate是图形语法的扩展,由ggplot2包实现,它增加了对使用ggplot2用户熟悉的API声明动画的支持
❝今天来主要介绍如何在不引入外部几何对象的前提下在图形的原有的基础上「自定义修改轴文本颜色」,也许恰好您正好有此特殊需求,希望对各位观众老爷有所帮助;下面来看具体案例; ❞ 加载R包 library(tidyverse) 数据清洗 data1 <- mtcars %>% head(6) %>% mutate_if(is.numeric, function(x) x+10) %>% log10() %>% as.data.frame() %>% rownames_to_column("ty
基因集富集分析是很常见的分析内容,可视化展示的方式也多样。本文提供两组分组间的差异表达基因集的功能富集结果的一些相对美观的可视化方式。
❝本节来介绍如何「在计算多样性指数的基础上来进行显著性标记」; 加载R包 library(tidyverse) library(vegan) library(magrittr) library(multcompView) 导入数据 alpha <- read.delim("otu_taxa_table-2.xls",sep="\t",row.names = 1) %>% t() %>% as.data.frame() group <- read_tsv("group.xls") %>% set_
倾斜图,又名斜线图、斜率图,可以展示单指标不同时期的变化情况,既能展示值的大小变化,同时能展示排名变化。倾斜图可以看作简化后的折线图,如果我们对一条线如何发展的细节不感兴趣,而只想看看它沿哪个方向发展,那么斜率图就是一个不错的选择。尤其如果我们有很多折线,它们通常看上去没有普通的折线图那么混乱。以下是两个倾斜图的例子:
我们使用df <- df[-which(df$fraction < 0.03),]去掉部分或用AI处理.
ggplot2是R语言中四大著名绘图框架之一,且因为其极高的参数设置自由度和图像的美学感,即使其绘图速度不是很快,但丝毫不影响其成为R中最受欢迎的绘图框架;ggplot2的作者是现任Rstudio首席科学家的Hadley Wickham,ggplot2基于Leland Wilkinson在Grammar of Graphics(图形的语法)中提出的理论,取首字母缩写再加上plot,于是得名ggplot,末尾的2是因为Hadley写包的一个习惯——对先前的版本不满意便写一个新版本的名称不变仅在末尾加上2,如reshape2等;
ggplot2 R的作图工具包,可以使用非常简单的语句实现非常复杂漂亮的效果。 qplot 加载qplot library(ggplot2) # 测试数据集,ggplot2内置的钻石数据 qplot(carat, price, data = diamonds) dsmall <- diamonds[sample(nrow(diamonds), 100), ] #对diamonds数据集进行抽样 #1. 按color,size,shape的基本分类可视化 #1.1 简单的散点图(利用color分
最近科研绘图中,需要解决这么一个需求。如何将下图中的左图(低配版)转化为右图(高配版, x,y 轴分离)。
很久没有作图了,主要是一时找不到应该练手的案例。 然后昨天逛网易数独栏目的数据新闻,看到一幅还不错的案例,对于我来说值得一试,然后就手痒给照葫芦画瓢弄出来了。(主要是其中涉及到的细节处理很麻烦) 当然过程是花了些时间的,主要是需要慢慢打磨其中的细节,需要利用很多技术来处理图形版面的交接位置。 令我感触最深的是,想要用ggplot2随心所欲的画图,ggplot2掌握的再熟练,也只是勉强过的了技术关,而图表背后的思维和结构更考验人,更具有挑战性。 好在我学习R语言之前,就已经利用Excel临摹了大量的高难度信息
大数据文摘出品 编译:睡不着的iris、陈同学、YYY 不知道如何在地图上可视化网络图?下面这篇博客将使用R中的igraph、ggplot2或ggraph包来介绍三种在地图上可视化网络图的方法。在对地理位置以及位置的连接关系进行可视化时,还可以在图中展示一些属性。 当我们对节点(nodes)为地理位置的网络图进行可视化时,比较有效的做法是将这些节点绘制在地图上并画出它们之间的连接关系,因为这样我们可以直接看到网络图中节点的地理分布及其连接关系。 但这与传统的网络图是不同的。在传统的网络图中,节点的分布取决于
本文主要使用函数coord_polar()用于生成饼图,它只是极坐标中的堆积条形图。
关于这个误差bar的添加,主要的问题其实是计算的问题,需要max和min,如果存在分组的问题,那么就需要使用按照分组再计算max和min,然后再在aes中使用。 love&peace
《第二十二条军规》是美国作家约瑟夫·海勒创作的长篇小说,该小说以第二次世界大战为背景,通过对驻扎在地中海一个名叫皮亚诺扎岛(此岛为作者所虚构)上的美国空军飞行大队所发生的一系列事件的描写,揭示了一个非理性的、无秩序的、梦魇似的荒诞世界。我喜欢整本书中语言的创造性使用和荒谬人物的互动。本文对该小说进行文本挖掘和可视化。
饼图是一个分为多个扇区的圆,每个扇区代表整体的一部分。它通常用于显示百分比,其中扇区之和等于 100%。
我们都知道条形图通过直的或水平的条形开展型量的分布( 数)。函数barplot()的最简单的用法是: barplot(height),其中的height是一个向量或一个
今天给大家复现一篇高分文章中对单细胞功能富集结果进行展示的条形图,此图无论是配色还是美观程度都还可以!
upset plot我们已经介绍了多种画法,包括最流行的UpsetR,还介绍了使用complexHeatmap包画upset plot,以及ggupset包。这些包各有各的特色,基本用法差不多,在一些组合图形方面各有不同,大家可以翻看之前的文章。
excel作为一个强大的统计工具,自身包含着一部分数据可视化的功能。R作为可视化的大势,自然也可以画出这些图,有一篇就通过ggplot2包进行了部分总结,甚是有趣,小编复刻学习了一番,现对代码做简单注释,以作分享。
在BBC数据团队开发了一个R包,以ggplot2内部风格创建可发布出版物的图形,并且使新手更容易到R创建图形。 例如:
❝本节来介绍如何ggplot2来绘制正负分布的条形图,在之前展示案例的基础上进行了一些小的改动,下面通过1个案例来进行展示 加载R包 library(tidyverse) library(grid) library(ggtext) 导入数据 chocolate <- read_csv('chocolate.csv') mean <- mean(chocolate$rating) 数据清洗 df <- chocolate %>% group_by(company_location) %>%
https://r4ds.hadley.nz/data-visualize#visualizing-relationships
今天,随着数据量的不断增加,数据可视化成为将数字变成可用的信息的一个重要方式。R语言提供了一系列的已有函数和可调用的库,通过建立可视化的方式进行数据的呈现。在使用技术的方式实现可视化之前,我们可以先和AI科技评论一起看看如何选择正确的图表类型。 作者 Dikesh Jariwala是一个软件工程师,并且在Tatvic平台上编写了一些很酷很有趣的程序。他用API编写了第一版Price Discovery,AI科技评论对他所写的这篇文章做了编译,未经许可不得转载。 如何选择正确的图表类型 四种可选择的基本
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