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脑肿瘤的影像组学:图像评估、定量特征描述和机器学习方法

影像组学描述了从影像图像中提取定量特征的一系列计算方法。其结果常常被用于评估影像诊断,预后以及肿瘤治疗。然而,在临床环境中,优化特征提取和快速获取信息的方法仍然面临重大挑战。同样重要的是,从临床应用角度,预测的影像组学特征必须明确地与有意义的生物学特征和影像科医生熟悉的定性成像特性相关联。在这里,我们使用跨学科的方法来强化影像组学的研究。我们通过提供基于新的临床见解的计算模型(例如,计算机视觉和机器学习)来探究脑肿瘤影像学研究(例如,潜在的图像意义)。我们概述了当前定量图像特征提取和预测方法,以及支持临床决策不同水平的可行的临床分类。我们还进一步讨论了机器学习未来可能面临的挑战和数据处理方法,以推进影像组学研究。本文发表在American Journal of Neuroradiology杂志。

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计算化学的深度学习

人工神经网络的兴衰在计算机科学和计算化学的科学文献中都有详细记载。然而近二十年后,我们现在看到了对深度学习兴趣的复兴,这是一种基于多层神经网络的机器学习算法。在过去的几年里,我们看到了深度学习在许多领域的变革性影响,尤其是在语音识别和计算机视觉领域,在这些领域的大多数专家从业人员现在经常避开之前建立的有利于深度的模型学习模型。在这篇综述中,我们对深层神经网络理论及其独特性质进行了介绍性概述,将它们与化学信息学中使用的传统机器学习算法区分开来。通过概述深度神经网络的各种新兴应用,我们强调它的普遍性和广泛的适用性,以应对该领域的各种挑战,包括定量结构活性关系,虚拟筛选,蛋白质结构预测,量子化学,材料设计和财产预测。在回顾深度神经网络的表现时,我们观察到在不同的研究课题中,针对非神经网络最先进的模型的一致表现优异,而基于深度神经网络的模型通常超出了各自任务的“玻璃天花板”预期。加上用于训练深度神经网络的GPU加速计算的成熟度以及用于训练这些网络的化学数据的指数增长,我们预计深度学习算法将成为计算化学的宝贵工具。

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专访 | 分子科学中的机器学习:不会燎原的星星之火?

机器之心原创 作者:邱陆陆 继计算机视觉、语音识别、自然语言处理之后,谁是下一个迎来深度学习的浪潮冲击的领域?聚集了世界上最聪明头脑的自然科学领域会不会「首当其冲」?科学家们如何应用深度学习?他们是否担心被神经网络取代?我们在上海纽约大学主办的「分子科学中的机器学习方法及应用」暑期学校里,与三位分子科学教授聊了聊。 机器学习的热度已经蔓延到了自然科学领域。如果你在今年夏天走进高校物理系的论文答辩现场,会发现「机器学习」成为了物理系论文中仅次于「物理」的高频词汇。「没提到机器学习简直可以算作文章的一个亮点了」

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YOLOPoint开源 | 新年YOLO依然坚挺,通过结合YOLOv5&SuperPoint,成就多任务SOTA

关键点通常是指Low-Level 的Landmark,如点、角点或边缘,它们可以从不同的视角轻松检索。这使得移动车辆能够估计其相对于周围环境的位置和方向,甚至可以使用一个或多个相机执行闭环(即同时定位与地图构建,SLAM)。在历史上,这项任务是通过手工设计的特征描述子来完成的,如ORB,SURF,HOG,SIFT。然而,这些方法要么不支持实时处理,要么在光照变化、运动模糊等干扰下表现不佳,或者检测到的关键点是聚集成簇而不是在图像中分散,这降低了姿态估计的准确性。学习到的特征描述子旨在解决这些问题,通常通过以随机亮度、模糊和对比度的形式进行数据增强。

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学界 | FAIR提出用聚类方法结合卷积网络,实现无监督端到端图像分类

预训练的卷积神经网络,或称卷积网络,已经成为大多数计算机视觉应用的基础构建模块 [1,2,3,4]。它们能提取极好的通用特征,用来提高在有限数据上学习的模型的泛化能力 [5]。大型全监督数据集 ImageNet[6] 的建立促进了卷积网络的预训练的进展。然而,Stock 和 Cisse [7] 最近提出的经验证据表明,在 ImageNet 上表现最优的分类器的性能在很大程度上被低估了,而且几乎没有遗留错误问题。这在一定程度上解释了为什么尽管近年来出现了大量新架构,但性能仍然饱和 [2,8,9]。事实上,按照今天的标准,ImageNet 是相对较小的;它「仅仅」包含了一百万张涵盖各个领域的分类图片。所以建立一个更大更多样化,甚至包含数十亿图片的数据集是顺理成章的。而这也将需要大量的手工标注,尽管社区多年来积累了丰富的众包专家知识 [10],但通过原始的元数据代替标签会导致视觉表征的偏差,从而产生无法预测的后果 [11]。这就需要在无监督的情况下对互联网级别的数据集进行训练的方法。

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