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1
回答
过滤
中间
包含
AAGAGACAAG
的
单
倍
型
、
对于我
的
项目,我需要找出哪种
单
倍
型
(40个SNP)主要导致表型。 为此,我想找出哪些
单
倍
型
与非常高或非常负面的双倍
型
效应有关。因为有294种不同
的
单
倍
型
,所以我需要选择一个较小
的
窗口(比如10个SNP)。现在,我希望r使用以下命令显示40个SNP中
包含
10个SNP
的
所有行: filter(TailWinOAR11, mHap %
浏览 22
提问于2021-02-25
得票数 -2
回答已采纳
2
回答
用于将方程应用于每个唯一类别的R循环
、
、
、
我正在寻求帮助,编写一个R循环来计算每个独特
单
倍
型
的
香农信息含量(SIC)。数据包括第1列中
的
单
倍
型
和第2列中
单
倍
型
的
频率。正如您在仅具有4个唯一
单
倍
型
的
示例数据中看到
的
那样,每个
单
倍
型
有不同
的
数量,每个
单</em
浏览 0
提问于2013-11-04
得票数 1
1
回答
如何在haploNet
单
型
网络中绘制饼图{pegas}
、
、
、
、
我正在尝试使用{pegas}
的
haploNet函数来绘制单
倍
型
网络,但我无法将来自不同群体
的
相同
单
倍
型
放入相同
的
拼图中。我可以用下面的脚本构建一个
单
倍
型
网络:h <- haplotype(x)plot(net) 我想
浏览 32
提问于2014-09-10
得票数 3
1
回答
用haploNet (pegas)鉴定R中
单
倍
型
的
突变
、
、
、
我认为这可能是一个简单
的
问题,但我无法解决它阅读了pegas
的
文档。我想用FASTA文件绘制一个
单
倍
型
网络,并识别哪些突变正在分离不同
的
单
倍
型
。- haploNet(haps50)) 如何识别我
的
FASTA文件中突变
的
位置,例如,将
浏览 1
提问于2018-03-23
得票数 0
回答已采纳
2
回答
如何选择数据
的
最佳匹配模式(
单
倍
型
)?Python 2.7
、
、
我正在为我
的
实习做一个药物遗传剖析器。对于这个剖析器,我需要确定病人最有可能
的
单
倍
型
。到目前为止我所拥有的是:
浏览 1
提问于2018-05-01
得票数 0
1
回答
将两个列表中
的
信息按R中第一个值进行集成
、
、
、
我需要一些帮助来整合R中两个列表中
的
信息。[1] 31 31 31 31 31 [1] 31 31 31 31 31 [1] 30 31 31 31 31 我有第二个列表,表示那些
单
倍
型
的
元数据每个元素对应于上面列表中
浏览 6
提问于2022-08-18
得票数 1
回答已采纳
1
回答
如何在haploNet
单
倍
网络中绘制正确
的
饼图{pegas} {ape} {adegenet}
、
、
、
当使用haploNet包在
单
倍
型
网络上制作一些情节时,我使用了一个在互联网上可用
的
脚本。不过,我觉得有些地方不对劲。该脚本可用伍德老鼠示例
的
形式。这不会是太大
的
问题,但是程序需要第9行来为IX绘制饼图,这是VIII
的
数据。 你可以看到,对于V,直到IX,它不是它应该是的(这些是交换
的
行)。例如: IX中只有一个
单
倍
型
,但是有两个
单
倍
型
的<
浏览 5
提问于2015-07-04
得票数 3
1
回答
用MSA包在r中创建
单
倍
型
网络图
我正在尝试msa包,并希望创建一个
单
倍
型
网络图。当我运行这个命令 hap Warning messages:some sequences were not assigned to the same haplotype because 这就是为什么我
的
单体型图看起来那么拥挤和混乱
浏览 5
提问于2022-08-02
得票数 0
2
回答
R:(Pegas)
单
倍
型
问题-(错误:h必须是类‘
单
倍
型
’)
、
、
我最近开始研究
单
倍
型
数据,我正在处理1000个基因组项目的数据,并试图用R中
的
Pegas软件包来操作它,到目前为止,我已经做了这么多:a <- "ftp://ftp-trace.ncbi.nih.govchrY.vcf.gz", which.loci = which(SNP))net <- haploNet(h)我想绘制一个
单
<
浏览 12
提问于2016-05-03
得票数 3
回答已采纳
2
回答
如何将丰度矩阵转换为存在-不存在矩阵,同时保持每个样本
的
丰度
我正在尝试像这样转换一个丰度矩阵: 这样,我就可以保持每个采样群体中
单
倍
型
的
丰富性。
浏览 42
提问于2018-06-09
得票数 -1
6
回答
R-将一串重复氨基酸从NNNN转换为(N4)
、
我正在从多个序列比对中计算
单
倍
型
,并得到重复序列,如RNNNNNNNT和RNNNT。有许多变化,使它很难理解
的
数据。数据如下所示,我感兴趣
的
是基于haplotypes_1生成列haplotypes_1,如所示: 1
浏览 2
提问于2017-11-27
得票数 8
回答已采纳
3
回答
如何压缩不连续
的
整数?
我正在尝试将非连续数字压缩为
单
倍
型
数据子集。"integer" #[1] 1 2 3 4 5 7 8 9 10 11 我想要[1:5, 7:11],这看起来很简单,但是我还没有找到一个完全符合我
的
问题
的
解决方案
浏览 12
提问于2019-05-22
得票数 0
回答已采纳
2
回答
如何绘制没有背景连接或标签
的
网络?佩帕斯
、
按照
的
说明,我使用pegas软件包制作了一个
单
倍
型
网络。它已经成功地绘制了图,但是从下面的图中可以看到,所有的连接标签都是绘制
的
,从而使图形呈现出拥挤
的
外观。我怎么才能把这些。
浏览 8
提问于2015-10-26
得票数 0
回答已采纳
1
回答
有希望在不久
的
将来将std::bitset<128>转换为单一
的
128位整数吗?
、
、
、
我使用std::bitset来表示短DNA序列(
单
倍
型
)。就我
的
目的而言,我需要能够将每个这样
的
序列转换为一个整数。目前,由于std::bitset::to_ullong
的
工作方式,这个要求似乎限制了我
的
序列长度为<=64?由于在C++ ()中有表示128位整数
的
方法,我想知道在std::bitset支持直接转换为128位整数之前需要多长时间?
浏览 22
提问于2021-11-01
得票数 3
1
回答
在ASP.NET核心中,有什么方法可以从Program.cs中建立
中间
件吗?
、
、
我有一些
中间
件需要启用,它们需要在任何其他
中间
件之前添加,因为它们所做
的
一切。我可以在IWebHostBuilder上创建一个扩展方法来添加服务,同样用于配置日志记录,但我看不到以编程方式添加
中间
件
的
任何方法。有办法这样做吗?看一下WebHost/WebHostBuilder
的
源代码,什么也没有跳出来。 鉴于第一个意见,我可能还不够清楚。我知道如何创建
中间
件并使用它。我要做
的
是确保当框架在启动时调用配置(IApplicationBuilde
浏览 0
提问于2017-04-25
得票数 11
回答已采纳
4
回答
在Python中组合、减少和映射最干净
的
方法
、
、
、
我正在做一些深入
的
学习,我想抓住所有隐藏层
的
价值。所以我最后写了这样
的
函数: activations = [] for w, b in zip(ws, bs)u = np.maximum(0, u.dot(w)+b) return activationsout = reduce(lambda u,
浏览 6
提问于2016-09-25
得票数 3
回答已采纳
2
回答
此数据库是否需要多到多个数据库?
、
、
、
我正在为一个可能
的
PHP MySQL项目设计一个数据库,我可能正在承担。我是一个完全
的
新手在关系
型
数据库设计,并只与
单
表数据库之前
的
工作。这是表格
的
图表:因此,“Cars”
包含
每种型号
的
汽车,其他3个表格
包含
汽车可以安装
的
部件。因此,每辆车可以从三个表中
的
每一个中获得不同
的
部件,并且每个部件可以从部件表中安装到不同
的
车中。实际上,大约有10个这样<em
浏览 10
提问于2012-07-30
得票数 1
回答已采纳
4
回答
循环是硬
的
[Python]
10', 'CYP2C19 *10', 'CYP2C19 *10', 'CYP2C19 请注意,
单
倍
型
与基因匹配(即
单
倍
型
列表中字符串
的
第一个项为"CFTR",并与基因list...so中
的
第一个元素匹
浏览 5
提问于2017-05-30
得票数 4
回答已采纳
2
回答
为什么在Argon模板中有这么多相同
的
路由?
、
、
、
我是web dev和Laravel
的
新手。为什么有这么多相同
的
路线?
浏览 0
提问于2020-02-23
得票数 0
2
回答
在C#中
过滤
字典和“简化”其值
的
最快方法
、
、
、
在C#中,给定一个SortedDictionary,我需要对它
的
键进行
过滤
,然后“简化”它
的
值。这最好用下面的MWE来解释,它完全符合我
的
要求。class SimpleItem public double item1 { get; set; }} 通过分析我
的
实际代码因此,我只是简单地要求另一种方法(希望是最快
的
)来做完全相同
的
事情。
浏览 5
提问于2018-01-16
得票数 0
回答已采纳
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