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Python解析psiBlast输出的JSON文件结果

是通过如下代码完成的 import json file_fh = open("test2.json") ajsonD = json.load(file_fh) ajsonD {'公众号': {'宗旨':...正确地打开方式': ['阅读', '置顶', '转发'], '名字': '生信宝典'}} ajsonD['公众号']['名字'] '生信宝典' 什么是PSIBLAST PSI-BLAST位置特异的迭代搜索工具...Python解析PSIBLAST的JSON输出结果 BLAST的输出结果可以有多种,在线的配对比较结果,线下常用的表格输出,这次尝试的是JSON的输出,运行命令如下 psiblast -db nr -out...结果获取匹配的蛋白的名字和序列,JSON文件解析的关键是知道关注的信息在哪个关键字下可以找到,然后需要怎么操作进入到关键字所在数据层,具体操作见如下视频,视频中一步步尝试如何不断试错,解析JSON文件,...获得想要的Python脚本和解析结果。

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    【谷粒学院】006-统一返回结果JSON、分页查询

    一、统一返回结果 1、统一返回数据格式 项目中我们会将响应封装成json返回,一般我们会将所有接口的数据格式统一, 使前端(iOS Android,Web)对数据的操作更一致、轻松; 一般情况下,统一返回数据格式没有固定的格式...成功", "data": {} } 失败: { "success": false, "code": 20001, "message": "失败", "data": {} } 因此,我们定义统一结果...success": 布尔, //响应是否成功 "code": 数字, //响应码 "message": 字符串, //返回消息 "data": HashMap //返回数据,放在键值对中 } 2、创建统一结果返回类...ResultCode { //成功状态码 Integer SUCCESS = 20000; //失败状态码 Integer ERROR = 20001; } 第三步:创建结果类...artifactId> 0.0.1-SNAPSHOT 第二步:修改Controller中的返回结果

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    python测试开发django-15.查询结果转json(serializers)

    前言 django查询数据库返回的是可迭代的queryset序列,如果不太习惯这种数据的话,可以用serializers方法转成json数据,更直观 返回json数据,需要用到JsonResponse。...django里面有个serializers方法可以,直接把查询的结果转成json数据 接着上一篇查询User表里面的所以数据,用all()方法 serializers方法需要先从django.core...^get_json$’, testdb.get_json,访问后得到的结果(返回的数据自己在线解析过) { "result": [{ "model": "hello.user...数据,但是上面返回的结果里面有一些多余的字段model和pk,不是我们想要的。...testdb.json_data,访问后得到的结果(返回的数据自己在线解析过) { "data": [{ "user_name": "yoyo", "psw":

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    迭代

    如果给定一个list或tuple,可以通过for循环来遍历这个list或tuple,这种遍历我们称为迭代(Iteration) 在Python中,迭代是通过for ... in来完成的 Python...,而无需太关心该对象究竟是list还是其他数据类型 任何可迭代对象都可以作用于for循环,包括自定义的数据类型,只要符合迭代条件,就可以使用for循环 迭代list   迭代list是通过下标完成的...  for x in range(5):     print(x) 迭代dict   list这种数据类型虽然有下标,但很多其他数据类型是没有下标的,但只要是可迭代对象,无论有无下标,都可以迭代,比如...dict   因为dict的存储不是按照list的方式顺序排列,所以,迭代出的结果顺序很可能不一样 d = {'a': 1, 'b': 2, 'c': 3} for key in d...,整数是否可迭代 输出下标并迭代   Python内置的enumerate函数可把list变成索引-元素对,这样就可以在for循环中同时迭代索引和元素本身 for i, value in enumerate

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    迭代(iterable)和迭代器

    简介: 迭代(iterable) #任何可迭代对象都可以作用于for循环,包括我们自定义的数据类型,只要符合迭代条件,就可以使用for循环 d = {'a': 1, 'b': 2, 'c': 3} #对...dict迭代 for k,v in d.迭代(iterable)#任何可迭代对象都可以作用于for循环,包括我们自定义的数据类型,只要符合迭代条件,就可以使用for循环d = {'a': 1, 'b':...2, 'c': 3} #对dict迭代for k,v in d.items(): # 如果要同时迭代key和value,可以用for k, v in d.items()print(k,v)#默认情况下...,dict迭代的是key # 如果要迭代value,可以用for value in d.values()#字符串也是可迭代对象,因此,也可以作用于for循环#如何判断一个对象是可迭代对象呢?...Iterable类型判断from collections import Iterable #导入collections模块的Iterable类型n=isinstance(d,Iterable)print(n) #结果为

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    策略迭代和值迭代

    当计算第t次的v,q时,等式右边的v,q是第t-1次计算之后保留的v,q,而等式左边是第t次计算后保留计算结果。主要可以采用两种方式来迭代计算最优的策略和值函数。...我们可以把策略迭代和值迭代看成是一种表格型的方法, Q \in \mathbb{R}^{status\_num \times action\_num} ,即设置一个状态数和动作数构成的矩阵, Q[i,j...以下为策略迭代的伪代码,可以参考上述的文字描述进行理解 值迭代 因为策略迭代每次都需要等到每个状态对应的值函数收敛后,再进行策略的更新与提升,但有时候即使状态对应的值函数没有收敛,也可以进行策略的改善...值迭代就是从这个想法出发提出的方法,他与策略迭代不同的是策略迭代每次都需要等到值函数收敛后在进行策略提升,值迭代是在计算该状态下不同动作的值函数后,寻找最大的值函数对应的动作,进行保留,当不同状态的值函数收敛后...代码 本文对应的方法已经上传到了github上面,并对代码进行了注释,希望对大家理解策略迭代和值迭代有帮助。

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    python迭代、可迭代对象、迭代器及生

    迭代 通常意义上的迭代是指:重复执行一系列运算,从前面的量依次推出后面的量的过程,每一次迭代的结果,会作为下一次迭代的初始值。...,for语句中给定了一个初始输入 i=0 ,然后开始执行一个重复推导变量 i 是否小于 100 ,如果小于就对 i 加1并执行循环体中代码的过程,且每次执行后的结果将作为下一次推导的输入值,这个过程就是迭代...可迭代对象与迭代器 可迭代对象:使用内置iter函数可以获取迭代器的对象,称为可迭代对象。通常指实现了能返回迭代器的__iter__方法或实现了__getitem__方法且其参数从0开始索引的对象。...区别与联系:迭代器可以迭代,但可迭代对象不是迭代器。...可迭代对象一定不能是自身的迭代器,即可迭代对象一定不能实现__next__方法;迭代器应该一直可以迭代,其__iter__方法应该返回自身;可迭代对象可以重复使用(可以不断生成新的迭代器),但迭代器只能用一次

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    ​迭代

    循环(loop) - 最基础的概念, 所有重复的行为 递归(recursion) - 在函数内调用自身, 将复杂情况逐步转化成基本情况 (数学)迭代(iterate) - 在多次循环中逐步接近结果 (...迭代 迭代算法是用计算机解决问题的一种基本方法。...利用迭代算法解决问题,需要做好以下三个方面的工作: 确定迭代变量。 在可以用迭代算法解决的问题中,至少存在一个直接或间接地不断由旧值递推出新值的变量,这个变量就是迭代变量。 建立迭代关系式。...所谓迭代关系式,指如何从变量的前一个值推出其下一个值的公式(或关系)。 迭代关系式的建立是解决迭代问题的关键,通常可以使用递推或倒推的方法来完成。 对迭代过程进行控制。 在什么时候结束迭代过程?...这是编写迭代程序必须考虑的问题。 不能让迭代过程无休止地重复执行下去。 迭代过程的控制通常可分为两种情况: 一种是所需的迭代次数是个确定的值,可以计算出来;另一种是所需的迭代次数无法确定。

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    Python迭代和迭代器详解

    我们将要来学习python的重要概念迭代和迭代器,通过简单实用的例子如列表迭代器和xrange。 可迭代 一个对象,物理或者虚拟存储的序列。...类似对其他可迭代类型也会返回迭代器对象。 iter()用在自定义的类型会怎样呢?我们先自己定义一个String类: ? 那么,st是可迭代的吗? ?...自动迭代 for循环会自动迭代 ? 我们可以不用for循环来实现吗? ?...迭代器 关于迭代器先说几条……….. ? 我们试一试模仿for循环 ? 前面我们看过了iterable类,我们知道iter会返回迭代器对象。 现在我们试着理解迭代器类的设计。 ?...我们来用`list_iter`自己定义一个列表迭代器 ? 从一个问题开始——xrange是迭代还是迭代器? 我们来看看 ? 几个关键点: ?

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    迭代器

    集合面试点汇总 我们会在这里介绍我所涉及到的集合相关的面试点内容,本篇内容持续更新 我们会介绍下述集合的相关面试点: 迭代器 ArrayList LinkedList HashMap 迭代器 这里我们来介绍一下迭代器的面试点...迭代器中断处理机制 迭代器是操作集合的工具,当我们已经创建了一个迭代器之后,我们就不能再对原集合进行修改,否则可能报错出现问题 实际上迭代器对于中途修改集合的操作给出了两个处理方式: fail-fast...我们直接从底层方法讲起: /*Itr迭代器通常使用fail-fast中断处理机制*/ /*判断如何发生其他进程修改集合*/ private class Itr implements Iterator...int expectedModCount = modCount; // 我们会使用hasNext和next方法进行迭代器foreach public boolean...我们同样从底层代码查看: /*COWIterator迭代器采用的fail-safe处理方法*/ static final class COWIterator implements ListIterator

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    【python】可迭代对象与迭代器

    一、判断可迭代对象与迭代器的方法 1、方法一:isinstance() 既可以判断可迭代对象又可判断迭代器 如果是返回True 不是返回False from collections.abc import...只要对象定义了__iter__与__next__方法,那这个对象就是迭代器 可迭代对象:__iter__ 迭代器:__iter__与__next__ 所以有:迭代器一定是可迭代对象,可迭代对象不一定是迭代器...四、for循环原理 可迭代对象一般来说是可迭代的,可以用for循环来迭代。...,如果a不是可迭代对象那么for循环会报错,所以能够进行for循环的都是可迭代对象。...如range(5),“abc”, [1,2,3],{1,2,3},{1:1,2:2}等等都是可迭代对象。 iter()函数实际上把可迭代对象a变成迭代器。因为只有迭代器才有next()方法。

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