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详解距离协方差矩阵计算(超详细)

二、距离(Mahalanobis Distance) 1.定义 距离(Mahalanobis distance)是由印度统计学家哈拉诺比斯(P. C....是n×m矩阵,所以DM(x)是m×m矩阵,衡量是向量x不同分量两两之间距离。...2.哈拉诺比斯距离也可以定义为两个服从同一分布并且其协方差矩阵为Σ 样本点x与y差异程度: 假设x,y都是3维向量,那么由于(x-y)T是1×3矩阵,Σ逆是3×3矩阵(因为这里我们数据点有...3个维度属性),(x-y)是3×1矩阵,所以d(x,y)是一个1×1数值,衡量是x与y之间距离。...3.两个样本点距离计算示例: Matlab计算协方差矩阵验算(矩阵a列代表属性,行代表样本点): 得到协方差矩阵后,我们就可以计算出v和x之间距离了: Matlab验算:

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VINS后端非线性优化目标函数

代价函数  我们建立后端需要优化代价函数:  代价函数中3个残差项分别对应边缘化先验信息,IMU残差,视觉重投影残差,需要注意是,三种残差都是使用距离进行表示(相比欧式距离,多了协方差矩阵...我们将IMU残差使用最小二乘法进行求解,当优化变量产生增量后,则有以下公式:  其中 为相应Jacobian表达式,我们使用距离公式对上式进行展开,并且求导,令导数为0,则可以得到增量表达式为...:  由此递推,我们可以得到代价函数展开式:  其中 为IMU积分协方差矩阵, 为视觉观测协方差矩阵。...我们对下面的优化变量开始求导:  Jacobian具体推导过程比较简单,全部都是导数基本性质,只有在对旋转求导时较为麻烦,需要通过导数定义,四元数定义,左右乘性质进行推导: 2.2 视觉残差...,减少计算量,但我们不能直接删除,否则会破坏约束关系,导致求解崩溃,因此我们通过舒尔补公式,保留需要marg那一帧约束关系。

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python 各类距离公式实现

距离(Mahalanobis Distance) (1)距离定义 有M个样本向量X1~Xm,协方差矩阵记为S,均值记为向量μ,则其中样本向量X到u距离表示为: ?...而其中向量Xi与Xj之间距离定义为: ? 若协方差矩阵是单位矩阵(各个样本向量之间独立同分布),则公式就成了: ? 也就是欧氏距离了。...S = np.cov(X) # 两个维度之间协方差矩阵 SI = np.linalg.inv(S) # 协方差矩阵矩阵 # 距离计算两个样本之间距离,此处共有10个样本,两两组合,共有45...: 1)距离计算是建立在总体样本基础上,这一点可以从上述协方差矩阵解释中可以得出,也就是说,如果拿同样两个样本,放入两个不同总体中,最后计算得出两个样本间距离通常是不相同,除非这两个总体协方差矩阵碰巧相同...; 2)在计算距离过程中,要求总体样本数大于样本维数,否则得到总体样本协方差矩阵矩阵不存在,这种情况下,用欧式距离计算即可。

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距离 (哈拉诺比斯距离) (Mahalanobis distance)

距离(Mahalanobis distance)是由印度统计学家哈拉诺比斯(P. C. Mahalanobis)提出,表示点与一个分布之间距离。...它是一种有效计算两个未知样本集相似度方法。与欧氏距离不同是,它考虑到各种特性之间联系,本文介绍距离相关内容。...距离 度量样本距离某个分布距离,先将样本与分布标准化到多维标准正态分布后度量欧式距离 思想 将变量按照主成分进行旋转,消除维度间相关性 对向量和分布进行标准化,让各个维度同为标准正态分布...我们将去相关化、0均值化、标准化过后数据记为Z: image.png 而距离就是度量纠正过后向量Z到分布中心(原点)欧式距离: image.png 参考资料 https...://baike.baidu.com/item/距离/8927833?

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计算向量间相似度常用方法

基于距离相似度计算方法 计算相似度时,一类常用方法是计算两个向量之间距离,两个向量间距离越近,则两个向量越相似。...from Wikipedia 1.4 闵可夫斯基距离 (Minkowski Distance) 闵距离不是一种距离,而是一组距离定义。其计算公式为: ? 其中p为变参数。...1.6 距离 (Mahalanobis Distance) 有M个样本向量X1~Xm,协方差矩阵记为S,均值记为向量μ,则其中样本向量X到μ距离表示为: ?...而其中向量Xi与Xj之间距离定义为: ? 若协方差矩阵是单位矩阵(各个样本向量之间独立同分布),则距离就是欧式距离;若协方差矩阵是对角矩阵,则距离就是标准化欧式距离。...1.7 兰距离 (Lance Williams Distance) 兰距离计算方法如下: ? 2.

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全面归纳距离和相似度方法(7种)

切比雪夫距离就是当p趋向于无穷大时距离: 闵距离相关知识 距离度量定义 距离函数并不一定是距离度量,当距离函数要作为距离度量,需要满足: 由此可见,闵距离可以作为距离度量,而大部分相似度并不能作为距离度量...另外可以使用距离协方差距离),与欧式距离不同其考虑到各种特性之间联系是(量纲)尺度无关 (Scale Invariant) ,可以排除变量之间相关性干扰,缺点是夸大了变化微小变量作用。...距离定义为: 距离原理是使用矩阵对两两向量进行投影后,再通过常规欧几里得距离度量两对象间距离。...当协方差矩阵为单位矩阵距离就简化为欧氏距离;如果协方差矩阵为对角阵,其也可称为正规化欧氏距离。...基于信息论推导一些距离度量学习算法,比如ITML和MCML等通常是使用距离度量矩阵定义一个分布,然后推导出最小化两个分布KL距离或者Jeffery距离等等。

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机器学习中“距离与相似度”计算汇总

写在前面 涵盖了常用到距离与相似度计算方式,其中包括欧几里得距离、标准化欧几里得距离、曼哈顿距离、汉明距离、切比雪夫距离距离、兰距离、闵科夫斯基距离、编辑距离、余弦相似度、杰卡德相似度、Dice...Mahalanobis)提出,表示数据协方差距离。有时也被称为哈拉诺比斯距离。它是一种有效计算两个未知样本集相似度方法。...对于一个均值为μ=(μ1,μ2,μ3,…,μp)**T,协方差矩阵为Σ多变量向量x=(x1,x2,x3,…,xp)**T,其距离为: ?...距离也可以定义为两个服从同一分布并且其协方差矩阵为Σ随机变量x与y差异程度: ? 如果协方差矩阵为单位矩阵距离就简化为欧氏距离;如果协方差矩阵为对角阵,其也可称为正规化欧氏距离。 ?...,可以得到它几个特点如下: 两点之间距离与原始数据测量单位无关(不受量纲影响) 标准化数据和中心化数据(即原始数据与均值之差)计算二点之间距离相同 可以排除变量之间相关性干扰

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【译文】30分钟让你分清几种距离

若学过线性代数读者便可以知道,向量加减就是向量元素对应加减,(即括号中元素)上面的式子可以化成向量之间计算: ? 2.曼哈顿距离: 我们又称为城市街区距离,至于为什么,你看完下面的就知道了....闵可夫斯基距离   (1)闵距离定义:两个n维变量A(x11,x12,…,x1n)与B(x21,x22,…,x2n)间闵可夫斯基距离定义为: ? 其中p是一个变参数。...5.距离 (1)距离定义 有M个样本向量X1~Xm,协方差矩阵记为S,均值记为向量μ,则其中样本向量X到u距离表示为: ? 而其中向量Xi与Xj之间距离定义为: ?...若协方差矩阵是单位矩阵(各个样本向量之间独立同分布),则公式就成了如下,也就是欧氏距离了。 ? 若协方差矩阵是对角矩阵,公式变成了标准化欧氏距离。...(2)距离优缺点:量纲无关,排除变量之间相关性干扰 6.汉明距离 (1)汉明距离定义 两个等长字符串之间汉明距离定义为将其中一个变为另外一个所需要作最小替换次数。

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Machine Learning -- 11种相似性度量方法(总结版)

(4)Matlab计算欧氏距离 Matlab计算距离主要使用pdist函数。若X是一个M×N矩阵,则pdist(X)将X矩阵M行每一行作为一个N维向量,然后计算这M个向量两两间距离。...距离(Mahalanobis Distance) (1)距离定义 有M个样本向量X1~Xm,协方差矩阵记为S,均值记为向量μ,则其中样本向量X到u距离表示为: ?...而其中向量Xi与Xj之间距离定义为: ? 若协方差矩阵是单位矩阵(各个样本向量之间独立同分布),则公式就成了: ? 也就是欧氏距离了。   ...若协方差矩阵是对角矩阵,公式变成了标准化欧氏距离。 (2)距离优缺点:量纲无关,排除变量之间相关性干扰。...(3) Matlab计算(1 2),( 1 3),( 2 2),( 3 1)两两之间距离 X = [1 2; 1 3; 2 2; 3 1] Y = pdist(X,'mahalanobis') 结果

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一文掌握异常检测实用方法 | 技术实践

在实际应用中,需要建立数据协方差矩阵,并计算矩阵特征向量。对应最大特征值(即主要成分)特征向量可用作重新构建原数据集。...从数学角度看,我们可以通过计算样本协方差矩阵,来估计出最能代表集合分布椭圆。分布是指从测试点到质心距离除以椭圆在测试点方向上宽度。...为了使用距离来判别一个测试点属于 N 个分类中哪一个,首先应该基于已知样本与各个分类对应情况,来估计每个类协方差矩阵。...方法一:PCA + 距离 正如本文“技术部分”中所介绍,第一种方法先进行主成分分析,然后计算距离,来辨别一个数据点是正常还是异常(即设备退化信号)。...从上面的分布图来看,我们可以定义距离大于 3 部分为异常。这种检测设备老化估计方法,需要计算测试集中全部数据点距离,并将其与所设置阈值进行比较,来标记其是否异常。

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机器学习相似性度量

若X是一个M×N矩阵,则pdist(X)将X矩阵M行每一行作为一个N维向量,然后计算这M个向量两两间距离。...距离(Mahalanobis Distance) (1)距离定义 有M个样本向量X1~Xm,协方差矩阵记为S,均值记为向量μ,则其中样本向量X到u距离表示为:...而其中向量Xi与Xj之间距离定义为: 若协方差矩阵是单位矩阵(各个样本向量之间独立同分布),则公式就成了: 也就是欧氏距离了。   ...若协方差矩阵是对角矩阵,公式变成了标准化欧氏距离。 (2)距离优缺点:量纲无关,排除变量之间相关性干扰。...(3) Matlab计算(1 2),( 1 3),( 2 2),( 3 1)两两之间距离 X = [1 2; 1 3; 2 2; 3 1] Y = pdist(X,'mahalanobis') 结果

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在机器学习中用到了各式各样距离

(4)Matlab计算欧氏距离 Matlab计算距离主要使用pdist函数。若X是一个M×N矩阵,则pdist(X)将X矩阵M行每一行作为一个N维向量,然后计算这M个向量两两间距离。...距离(MahalanobisDistance) (1)距离定义 有M个样本向量X1~Xm,协方差矩阵记为S,均值记为向量μ,则其中样本向量X到u距离表示为: ?...而其中向量Xi与Xj之间距离定义为: ? 若协方差矩阵是单位矩阵(各个样本向量之间独立同分布),则公式就成了: ? 也就是欧氏距离了。   ...若协方差矩阵是对角矩阵,公式变成了标准化欧氏距离。 (2)距离优缺点:量纲无关,排除变量之间相关性干扰。...(3)Matlab计算(1 2),( 1 3),( 2 2),( 3 1)两两之间距离 X = [1 2; 1 3; 2 2; 3 1] Y = pdist(X,'mahalanobis') 结果

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机器学习中应用到各种距离介绍(附上Matlab代码)

(4)Matlab计算欧氏距离 Matlab计算距离主要使用pdist函数。若X是一个M×N矩阵,则pdist(X)将X矩阵M行每一行作为一个N维向量,然后计算这M个向量两两间距离。...距离(MahalanobisDistance) (1)距离定义 有M个样本向量X1~Xm,协方差矩阵记为S,均值记为向量μ,则其中样本向量X到u距离表示为: ?...而其中向量Xi与Xj之间距离定义为: ? 若协方差矩阵是单位矩阵(各个样本向量之间独立同分布),则公式就成了: ? 也就是欧氏距离了。   ...若协方差矩阵是对角矩阵,公式变成了标准化欧氏距离。 (2)距离优缺点:量纲无关,排除变量之间相关性干扰。...(3)Matlab计算(1 2),( 1 3),( 2 2),( 3 1)两两之间距离 X = [1 2; 1 3; 2 2; 3 1] Y = pdist(X,'mahalanobis')

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ML中相似性度量和距离计算&Python实现

距离(Mahalanobis Distance) 有M个样本向量​,协方差矩阵记为S,均值记为向量μ,则其中样本向量X到u距离表示为 而其中向量​与​之间距离定义为:...若协方差矩阵是单位矩阵(各个样本向量之间独立同分布),则公式就成了: 也就是欧氏距离了。...若协方差矩阵是对角矩阵,公式变成了标准化欧氏距离距离优缺点:量纲(scale)无关,排除变量之间相关性干扰。...(b) #距离要求样本数要大于维数,否则无法求协方差矩阵 #此处进行转置,表示10个样本,每个样本2维 X = np.vstack([A,B]) XT...#距离计算两个样本之间距离,此处共有10个样本,两两组合,共有45个距离

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R语言数据分析与挖掘(第八章):判别分析(1)——距离判别法

2 mahalanobis()函数 不难发现,函数dist()不能用于计算距离,下面介绍一个专门用于计算距离函数: mahalanobis(), 其基本书写格式为: mahalanobis(x...参数介绍: x:指定用于计算距离数据对象,p维数据向量或矩阵; Center:指定分布均值,即总体均值; Cov:指定分布协力差,即总体协方差,一般用样本协方差进行评估; inverted...,默认值为NUll,表示不进行加权,采用传统距离判别法; TstX: 指定测试集数据对象,可以为向量、矩阵或数据框,若为向量,则将被识别为单个案例行向量,默认值为NULL,表示直接对训练集进行判别...,其中函数colMeans()表示按列计算均值;训练集中每一个观测样本分别对应三个距离,然后利用函数cbind()将三个距离值与原始数据集中测试样本对应分类合并在一起,输出结果如上所示。...对于测试集中每一个观测样本而言,三个距离中最小那一个所对应类别即为测试样本属于类别,如第一条记录中,第一个距离值明显小于另外两个,故第一条记录应归为第一类,即该鸢尾花属于setosa类

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机器学习中相似性度量总结

(4)Matlab计算欧氏距离 Matlab计算距离主要使用pdist函数。若X是一个M×N矩阵,则pdist(X)将X矩阵M行每一行作为一个N维向量,然后计算这M个向量两两间距离。...距离(Mahalanobis Distance) ---- (1)距离定义 有M个样本向量X1~Xm,协方差矩阵记为S,均值记为向量μ,则其中样本向量X到u距离表示为: ?...而其中向量Xi与Xj之间距离定义为: ? 若协方差矩阵是单位矩阵(各个样本向量之间独立同分布),则公式就成了: ? 也就是欧氏距离了。...若协方差矩阵是对角矩阵,公式变成了标准化欧氏距离。 (2)距离优缺点:量纲无关,排除变量之间相关性干扰。...(3) Matlab计算(1 2),( 1 3),( 2 2),( 3 1)两两之间距离 X = [1 2; 1 3; 2 2; 3 1] Y = pdist(X,'mahalanobis') 结果

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机器学习中相似性度量总结

若X是一个M×N矩阵,则pdist(X)将X矩阵M行每一行作为一个N维向量,然后计算这M个向量两两间距离。...距离(Mahalanobis Distance) ---- (1)距离定义 有M个样本向量X1~Xm,协方差矩阵记为S,均值记为向量μ,则其中样本向量X到u距离表示为: 而其中向量Xi与...Xj之间距离定义为: 若协方差矩阵是单位矩阵(各个样本向量之间独立同分布),则公式就成了: 也就是欧氏距离了。...若协方差矩阵是对角矩阵,公式变成了标准化欧氏距离。 (2)距离优缺点:量纲无关,排除变量之间相关性干扰。...(3) Matlab计算(1 2),( 1 3),( 2 2),( 3 1)两两之间距离 X = [1 2; 1 3; 2 2; 3 1] Y = pdist(X,'mahalanobis') 结果

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聚类算法 ---- 大数据聚类算法综述

5)距离(Mahalanobis Distance)。 距离是一种关于协方差矩阵距离度量表示方法,其公式为: 距离优点是距离与属性量纲无关,并排除了属性之间相关性干扰。...若各个属性之间独立同分布,则协方差矩阵为单位矩阵。这样,平方距离也就转化为了欧氏距离[18-19]。 6)对称点距离(Point Symmetry Distance)。...距离度量也可以源于相关系数[20],如皮尔逊相关系数定义为: 8)余弦相似度(Cosine Similarity)。 最后一种直接计算相似性方法是余弦相似度。...在这8类聚类相似度测量方法中,需要注意是最后三类相似性计算方法不再符合对称性、非负性与反身性要求,即属于非可度量范畴。连续性变量相似性度量方法在不同聚类算法中应用,如表1所示。...计算机科学(S1期):380-383. [1]伍育红. 聚类算法综述[J]. 计算机科学, 2015, 42(0z1):491-499,524.

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聚类方法 学习总结

(2)哈拉诺比斯距离距离) (3)相关系数 (4)余弦相似度 2)类与类之间距离 (1)最短距离或单连接 (2)最长距离或完全连接 (3)中心距离:两个类中心距离。...m维特征样本和样本闵可夫斯基距离: p=1时为曼哈顿距离: p=2时为欧氏距离: 时为切比雪夫距离: (3)哈拉诺比斯距离距离) 另一种常用相似度,考虑各个特征之间相关性并与各个特征尺度无关...距离越大相似度越小。 样本集合X协方差矩阵为S,m维特征样本和样本哈拉诺比斯距离: S为单位矩阵时,距离就是欧氏距离,所以距离是欧氏距离推广。...(2)类均值,又称为类中心 表示G中样本个数 (3)类直径(diameter),是类中任意两个样本之间最大距离 表示样本和之间距离 (4)类样本散布矩阵协方差矩阵样本散布矩阵(scatter...matrix) 类样本协方差矩阵 3)类与类之间距离 类与类之间距离D(p,q),也称为连接。

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【数据分析 R语言实现】12.1判别分析及R实现

判别分析方法有多种,常用距离判别法(距离)、Fisher判别法和Bayes判别法。 12.1.1距离判别法 距离判别法基本思想是根据样品x和总体G距离来判断样品所属总体。...12.1.2距离判别法R实现 总体来讲,进行距离判别分析时只需要知道总体数字特征(均值和协方差矩阵),而不涉及总体分布函数。...另一个函数是mahalanobis(),专门用来计算距离,其调用格式为 mahalanobis(x, center,cov,inverted=FALSE,…) 其中x是样本数据向量或矩阵;center...目前在程序包WMDB中,函数wmd( )可以实现加权距离判别分析,它利用了上面的函数mahalanobis()进行计算,并返回一个结果表单和准确度报告,在两个总体和多个总体条件下均可直接计算。...,计算结果distance是每个训练样本距离总体距离,判别分析就是在这个结果基础上进行

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