通过AWK更改tsv中的列内容

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awk、sed

我有一个表results.tsv，它看起来像： 270712 HET HET MTHFR_ABY+JUN HET HET FSH564320 HOM HET MTHFR_ABY+JUN HET HET FSH 我需要在$4中更改输入。如果$2 = $3，则将在$4 "OK“中。如果不是，则会出现$4 "FALSE“。我试过awk awk -F'\t' -

浏览 13提问于2020-06-10得票数 1

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检查文件中的行是否有相同的列数

bash、csv

我有许多tsv文件，我想检查每个文件的格式是否正确。首先，我想检查每一行是否有正确的列数。有办法这样做吗？如果有命令行解决方案的话，我想要一个。

浏览 5提问于2015-10-10得票数 3

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awk字段分隔符无法按预期工作，$0返回未拆分记录？

awk、split、field

最初，它是关于_和.作为FS的，并且只适用于第一列。但现在看来一点分裂都不起作用？.tsv contig_23343 164awk 'BEGIN { FS = _ } ; {print $0}' test_file.tsv并给出了不变的输出。编辑:是的，我做了：“尝试更改记录中<em

浏览 0提问于2018-03-16得票数 3

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基于第一列组合几个制表符分隔文件的某些列

awk、merge、csv

inFile中的第一列包含不一定存在于所有inFiles中的字符串。使用AWK，我不能正确地将它拼凑在一起。这些是我认为我需要的组件：增加第一列中的字符串，但只将每个“名称”添加一次到“1stColumn

浏览 1提问于2014-07-30得票数 3

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如何使用"awk“多次修改同一行

awk

我有一个名为score.tsv的文件，其内容更类似于：2 tom 50 notgood我想将第二行的第四个字段“不好”修改为“失败”。awk -F"\t" '{if (NR==2) $4="fail";print > "temp.tsv"}' score.tsv然后我意识到我需要把第二行的第二个字段改为

浏览 3提问于2013-11-19得票数 0

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如何在表格文件的特定列中使用sed

text-processing、awk、sed

我有一个表格文件A.tsv (separator=\t)：20644|kmkmoii 75 lolo20655 66 lala20477 88 lili 我知道如何使用sed：sed 's/|.*//' A.tsv >

浏览 0提问于2021-08-31得票数 -1

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为每列bash创建带有百分比的tsv

bash、shell、csv、awk

我正在尝试从tsv中创建一个新的tsv。在第一个列中，我有一个带有示例名称的列和几个带有数字的列。在第二个列中，我希望每个列的百分比除以所有列的总和。我做了这个，什么样的作品，但它不是分开的标签。cat multiqc_data/mqc_featurecounts

浏览 5提问于2022-07-25得票数 0

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Bash将TSV文件中的特定列提取为新文件，并添加带有提取列头的额外列。

linux、bash、shell、csv、awk

我有这样的文件xyb323 232 3232 8992 3278xyvg87 439 3434 2434 43434 我需要将该文件中的信息提取到4个单独的文件中，这些文件提取列1并在列2、3和4上迭代，然后添加另一列和提取列的标题如下我可以

浏览 5提问于2018-03-14得票数 2

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按表值连接文件

bash、shell-script、text-processing

它包括：“第一个文件”列，该列指定包含相应组信息的第一个文件(字母顺序)的模式， “最后一个文件”列，它为包含相应组信息的最后一个文件(字母顺序)指定模式。在这个给定的示例中，所有文件(ABC1234011.tsv、ABC1234012.tsv、ABC1234013.tsv、ABC1234014.tsv、ABC12340

浏览 0提问于2021-10-20得票数 7

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如何在一个awk命令中替换列、重新排列、包括和排除.tsv文件中的数据

csv、awk、multiple-columns

我有一个.tsv文件，其中我想用1/替换第6列的值，直到最后一列为止，2/不包括第4和第5列，3/重新排列，即将第3列替换为第2列，最后在第2列和第3列之间包括一列，其中值为所有观察(行)的数字0。我成功地做到了这一点，方法是生成一个新的.tsv，它只包含第6列的值，然后在下面使用awk</

浏览 14提问于2022-03-16得票数 0

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按一列合并两个文件- awk

join、awk、merge

我有两个不同的脚本通过一个匹配的列合并文件。文件1.tsv-4列，用制表符分隔2 OLD c.11A+1>R p.Ill1639Losfile2.tsv - 14列，由制表符分隔 LAK "empty_column" c.66H>T .

浏览 2提问于2018-08-28得票数 0

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选择特定字段并将其写入新文件

bash、shell、awk

我的任务是把几个文件总结成一个tsv文件。我必须从文件列表中选择特定的数据，并将其写为tsv文件中的一行以制表符分隔的列。文件中的每一行都有一个'name‘作为第一列，因此很容易过滤数据($1 == "NAME")。一个文件==一行在tsv中。到目前为止，我写了以下内容： #!awk '$

浏览 2提问于2021-11-08得票数 2

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比较三个文件:使用列比较显示的所有文件中的行

shell、awk、files、grep

我有三个文件( 2d.tsv、3d.tsv、4d.tsv )，它们格式相同(相同数据类型的列数相同，但行数不同)。我希望通过比较第3列和编写三个新文件( 2d_new.tsv、3d_new.tsv、4d_new.tsv )来选择所有文件中存在的行，也就是说，我希望这三个新文件具有相同的行数，并根据其余的行维护它们原来的第一<em

浏览 0提问于2019-10-19得票数 1

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如何在awk命令中按名称引用列？

text-processing、awk

23 10 15 67现在，我的目标是将带有空格的所有此类行添加到我的output_file中，例如：34 12 5631 99 100awk -F 如果列"B“总是在第2位置，那么这很好，但是如果它处于不同的位置，它就不能工作了。如何在awk命令中按名称来称呼列

浏览 0提问于2020-10-26得票数 2

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在并行处理中使用awk获取语法错误

linux、unix、awk、parallel-processing、gnu-parallel

我在一个文件夹中有44个.tsv文件，我想用bedtools tool的intersect命令计算每个成对的交集的数目。每个输出文件将有4列，我只需要在每个输出文件中保存列4的值的总和。当我一个人做的时候，我可以很容易地做，但是当我使用并行处理来同时做整个过程时，我得到了语法错误$ bedtools intersect -a p1.tsv --a p1.<

浏览 0提问于2019-07-02得票数 4

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如何在windows上运行包含awk脚本的makefile？

windows、awk、makefile

我有一个.awk脚本，用于在一个.tsv文件中为一个主题的条件和试验分配名称和编号。我到处搜索，但我遇到的

浏览 4提问于2016-06-09得票数 0

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“使用AWK从所有列

bash、csv、awk

我目前正在尝试创建一个awk脚本，该脚本将获取我的.csv并将其转换为.tsv。"“的字符串，即使我们有可能被认为是整数的内容。我最初的测试是尝试从所有内容中删除{"，"}，然后将内容定义为某些列上的字符串，但当我尝试引用它时，我得到了一个错误。FS="",""; OFS="\t" } {$1=$1; prin

浏览 38提问于2019-10-30得票数 0

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根据tsv文件中的值重命名文件

bash、csv

我的输入是一个带有5列的tsv文件。它有‘位置’'A'，'B‘等列名，在tsv中不时重复。如何分割这个tsv文件，使每个文件都有一组列标题和数据，而不是下一组列标题。22 0 04 0 0 19 0 06 43 0 0 0 0 理想的输出是将上面的输出分割

浏览 1提问于2018-04-23得票数 1

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Bash迭代TSV文件的字段并将其除以列之和。

bash、awk

我有一个带有几个列的tsv文件，我想遍历每个字段，并将其除以该列的总和：A 1 2 1输出：我有以下内容要遍历字段，但我不确定如何找到字段所在的列的和： awk -v FS='\t' -v OFS='\t' '{for

浏览 8提问于2022-07-12得票数 1

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如何在awk命令中使用数学和shell变量？

bash、awk

问题是，我试图使用awk返回基于awk命令中使用sum的值，这是我无法工作的。gene=awk 'FNR == "$((${SGE_TASK_ID

浏览 0提问于2019-02-07得票数 0

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