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这种作者只提供了每组多个重复样本合并后数据的怎么办

,问: 有4个分组为三个时间节点 + 一个对照的高通量RNA测序数据,每个分组有5个生物学重复样本,但是测序的时候呢同一个组别中的这五个样本的 RNA 进行了 pool,然后再测序。...但是感觉 这个时候 kimi 不是很智能,他并没有给出一个很好的处理方式: 对于您提到的高通量RNA测序数据分析,其中包含三个时间节点和一个对照组,每个分组有5个生物学重复样本,且这些样本的RNA在测序前进行了...这些工具能够处理重复样本,并考虑到生物学变异和测序技术变异。 数据可视化:为了更好地理解数据,可以进行主成分分析(PCA)或聚类分析,以可视化样本之间的相似性。...考虑生物学重复:由于每个组别中的样本RNA进行了pooling,这可能会影响对生物学重复的分析。在分析时,需要考虑到这一点,并可能需要使用更复杂的统计模型来估计生物学变异。...Mfuzz 分析可以找到 一些与时间变化相关的基因模块 ,且进行 Mfuzz 分析的时候,组内的生物学重复样本也会被处理成均值。

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    【Prometheus】Prometheus的样本

    在 Prometheus 中,"样本"(Sample)是指时间序列数据的一个基本单位,包含了某个特定时刻的一个度量值。一个样本由以下几部分组成: 1....时间戳(Timestamp) 样本会记录数据的时间戳,表示这个数据值是在什么时候被采集的。 Prometheus 会根据配置的抓取间隔定期拉取目标的度量数据。...每次采集的数据都会附带一个时间戳,表示数据的时间点。 2. 度量名称(Metric Name) 每个样本都关联着一个度量(或指标)名称,这个名称用于描述被监控的事物。...Prometheus 中的时间序列 Prometheus 中的时间序列是由一系列带有时间戳的样本组成的。...Prometheus 样本的类型 Prometheus 支持多种度量类型,它们定义了样本值的含义和如何增长: Counter(计数器):计数器值只能增加,表示某个事件的累计发生次数(例如 HTTP 请求总数

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    PHATGOOSE:使用LoRA Experts创建低成本混合专家模型实现零样本泛化

    PEFT模块(如LoRA)实现零样本泛化的新方法 这个方法冻结整个模型,包括PEFT模块,并为每个模块训练一个类似于混合专家(MoE)模型中使用的路由(门控)网络。...这种门控网络训练的计算量非常小,并且通过在推理期间使用top-k路由策略进行令牌分发,提高了模型处理未显式训练的任务的能力。...PHATGOOSE的有效性在t5系列模型上进行了测试,与之前专家或依赖单个PEFT模块的方法相比,在标准基准上的零样本泛化方面表现优异。有时它的表现也优于明确目标的多任务训练。...作者的实验采用T5模型,专家模块在两个集合上训练:T0(36个数据集)和FLAN(166个数据集)。PHATGOOSE在零样本评估中优于过去的路由方法,如检索、合并和平均基线。...论文提出了一种很有前途的方法,将独立训练的专家模型以分散的方式组合在一起,提高零样本泛化能力,这是一个非常有意思的研究方向,并且提供了源代码,所以推荐仔细阅读。

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    谈谈企业的成本

    今天和大家聊聊企业中存在的成本问题。 第一,我们了解经济学里的机会成本。机会成本就是你现在在A事情,但如果不做A,你可以做B这件事。那么对于A而言,B就是你的成本。...你可能有很多机会,但成本有限,你只能选择做一个。比如说理财,你不要觉得不亏就行。对于机会成本来说,定期的理财收益就是你的机会成本。 机会成本不好核算,很多人选择了一件事情后,经常后悔自己的选择。...其实没必要,人是理性的。对于你当时来说,这个选择是你最佳的选择。要怪只能怪自己认知不够。 第二,对企业来说,有固定成本和变动成本之分。...而在财务上有一个“作业成本法”,他英文叫Activity Based Costing,简称ABC。作业成本法的出现,实际上顺应了一个潮流,就是企业内部的成本结构,需要分摊的部分,比例越来越大。...在这种情况下,一笔费用发生了,就必须要通过追溯是什么行为引发了成本,成本发生的驱动因素是什么,才能找到哪一件产品、哪一个项目该负担这个成本。 第四,算清楚成本之后,我们可以从成本的角度为客户分类。

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    好样本,事半功倍:使用样本设计工程 (SDE) 来构造更好的大模型下游微调样本

    然而,由于成本问题、政策问题、数据安全问题,许多中小企业或个人是无法使用GPT3/4这种级别的大模型的,转而选择一些开源的稍小的LLMs(尤其10B左右),这时,仅仅使用PE技巧来设计prompt是无法解决许多稍微复杂点的下游任务的...值得强调的是,PE中CoT是一种低成本的技巧,因为只需要添加一个咒语,或是提供极少量的推理实例即可,而针对微调样本进行CoT设计,则成本相对高昂,因为我们需要对每一个微调样本都添加推理方面的标注。...关于这一点我们的解释是,使用占位符,可以保持格式的一致性,虽然增加了一定的输出成本,但让模型更容易学习。...CoT 设计对于ID任务上没有明显效果,但是在OOD场景下效果明显:OOD任务上,CoT 方式明显提升了模型泛化性能,但是在ID上效果不明显,甚至有的还有损害,这可能因为ID任务更简单,所以CoT本身增加的训练成本抵消掉了其在这种场景下的增益...由于考虑到CoT的不稳定性和成本问题,这里没有使用。

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    Prometheus 使用Python推送指标数据到Pushgateway

    刮取(scrap)”这些指标,并使用相同时间戳 t1 作为对应时序数据的时间戳,然而,普罗米修斯不会这样做,它会把从推送网关(Pushgateway)“刮取”数据时的时间戳当作指标数据对应的时间戳。...在普罗米修斯的世界观中,一个Metric可以在任何时候被刮取,一个无法被”刮取”的Metric基本上是不存在了。...对此,普罗米修斯多少还是有点“容忍”的,但是如果它不能在 5 分钟内获得一个Metric的任何样本,那么它就会表现得好像该Metric不再存在一样。...将推送时间附加为时间戳将无法达到这一目的,因为在最后一次推送5分钟之后,普罗米修斯会认为你的Metric已经过时,就好像它再也不能被“刮取”一样。...(普罗米修斯只能识别每个样本的一个时间戳,无法区分“推压时间”和“刮取时间”。)

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    质量较差样本的QC

    对基因检测的期望值与对UMI检测的期望值情况相似。 除Unsorted的样本外,所有样本都检测到大量的基因(中位数在1,000-3,000个基因之间),这与每个样本的每个细胞的UMI数量相对应。...在Unsorted的样本中检测到的基因数量非常少,因此线粒体的表达似乎更高。未分选样本的质量差似乎不是由于死亡或濒临死亡的细胞造成的。...尽管hPSC样本比Sorted样本多一点,但其他样本的线粒体表达却很少。由于预期hPSC样本的细胞类型具有更高水平的线粒体表达,因此不使用该指标的阈值可能是明智的。 ?...有时,我们可以通过此指标检测低复杂度的细胞类型(如红细胞)的污染。 除未排序的样本外,所有样本的复杂度都很好,因此这些样本中不太可能存在低复杂度的细胞类型的污染。...未分类的样本的肩部比预期的大,但按此指标还不错。 除了Unsorted样本外,所有样本的复杂性看起来都很好,因此在这些样本中不太可能存在低复杂性细胞类型的污染。

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    软件研发成本构成中的直接成本包括哪些?

    我们在估算软件项目成本之前需要先清晰的了解它的成本构成。而软件研发成本的构成仅包括软件研发过程中的所有直接成本和间接成本。   什么是软件研发的直接成本呢?...直接成本又包括哪些内容?   软件研发的直接成本是指为了达成特定研发项目所支出的各类资源总和。这些资源与此研发项目是强关联的,一旦该项目结束或中止,则这些成本不再发生。...示例1:项目成员因项目加班而产生的餐费宜计入直接非人力成本的办公费中,而项目成员的工作午餐费宜计入直接人力成本。   ...示例2:项目组封闭开发租用会议室而产生的费用宜计入直接非人力成本中的办公费,而研发部例会租用会议室产生的费用宜按照间接非人力成本分摊。   ...示例3:为项目采购专用测试软件的成本宜计入直接非人力成本中的采购费,而日常办公软件的成本宜按照间接非人力成本进行分摊。

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    开源浪费的隐藏成本

    自动化依赖管理——如果自动化是可靠的——提供了一种方法来应对这些挑战,方法是简化流程,减少人工工作,并使团队能够专注于创新,而不是重复的软件成分分析 (SCA) 任务。 问题的范围很大。...开发人员花费多达35%的时间来解决依赖关系问题或管理漏洞——这些时间本可以更好地用于构建新产品、偿还技术债务或引入自动化以提高成本效率。 高效的供应链管理带来的一个可喜的结果是更强的安全性。...自动化在这里至关重要,它减少了人工工作,使开发人员能够专注于创造性的、高价值的工作,而不是重复性的依赖项管理任务。...组织可以通过采用战略性的、数据驱动的实践并在每个阶段利用自动化来收回损失的生产力,同时显著降低成本。...开源已成为现代软件开发的基石。通过减轻隐藏成本并利用自动化来增强流程,组织可以确保它仍然是创新的可持续和安全的基石,并将推动未来多年的发展。

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    缓存的收益和成本

    通常情况下,我们在设计程序的时候,会在客户端和存储层之间加入缓存层(例如redis和memcache)。存储层一般用来持久化数据,而缓存层则是为了更快的返回所需要的的数据结果。...在一些开销比较大的复杂计算很多的场景下,例如(MySQL的大SQL),引入缓存在加速请求响应是必要的,总体来看,缓存带来的收益如下: 1、加速读写:缓存层面都是基于内存的,而存储层面的优点在于持久化数据...除此之外,缓存还有以下的成本和风险需要考虑: 1、缓存层面和存储层的数据不一致:在一定时间窗口内,如果存储层进行了更新,而缓存层面的数据还没有过期,则会出现缓存的数据和存储层的数据不一致的现象发生。...这和我们制定的缓存更新策略有关,为了保证一致性,可以适度缩短缓存失效时间。 2、代码维护成本以及运维成本:加入缓存层面之后,需要处理缓存层和存储层的业务逻辑,代码数量会增加。...对于这种情况,在设计缓存的时候,一定要配置高可用,保证缓存在一定的恶劣场景下的可用性。

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    对APT攻击样本的探索

    APT样本信息 该样本主要是由word.exe(word名称自定义的)文档的应用程序和一个自带隐藏的wwlib.dll模块文件组成的。...APT样本逆向分析 逆向前的准备 1、需熟悉常用的工具:Exeinfo PE、pchunter、CFF Explorer、IDA、ollydbg。...从APT样本的特性上进行找突破点: 白加黑的加载方式; HTTP、HTTPS网络通信方式; shellcode释放功能代码等等。...从上图可以看到该样本采用Unicode编码方式的,所以后面对系统函数进行下断点都直接下Unicode编码的函数就可以了。...APT样本的总结 相类似的APT攻击样本,主要依赖的载体是以word文档,而且没有利用系统漏洞,而是在其中嵌入恶意代码,通过宏代码进行触发执行恶意代码行为,最终向目标主机植入后门。

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    使用IDR软件处理生物学重复样本的peak calling

    对于chip_seq, atac_seq等实验而言,生物学重复样本的peak calling结果很难完全一致。...对于多个生物学重复样本的peak calling结果, 如何筛选出最终的可以代表这一组样本的peak是一个难题。...目前常见的策略有以下几种 直接合并生物学重复样本的reads, 然后进行peak calling,这样一组样本只会有一个peak calling的结果,这样的做法投机取巧,丢失了生物学重复的意义,忽略重复样本之间的异质性...,不够稳定 采用IDR软件评估生物学重复样本间的相关性,并根据阈值筛选出最终的一组peak IDR是Irreproducible Discovery Rata的缩写,代表不可重复性率,是一个专门用于从多个生物学重复样本的...通过IDR软件可以很方便的处理生物学重复样本的peak calling结果,筛选出一组一致性高的peak。

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    从指标到洞察力的普罗米修斯监控

    普罗米修斯官网的首页简单的对普罗米修斯做了定义:从指标到洞察力 。 普罗米修斯通过领先的开源监控解决方案为用户的指标和告警提供强大的支持。...导出器公开 普罗米修斯 指标,通常是将以非 普罗米修斯 格式公开的指标转换为 普罗米修斯 支持的格式。 PromQL(普罗米修斯查询语言) PromQL是普罗米修斯查询语言。...这允许 普罗米修斯 在它们终止后抓取它们的指标(实时性较高可以先缓存在推送网关中后续由普罗米修斯拉取。 Sample(样本) 样本是时间序列中某个时间点的单个值。...在 普罗米修斯 中,每个样本都包含一个 float64 值和一个毫秒精度的时间戳。...这里常见术语列举的相对还是比较多的,不过慢慢消化,下面就开始通过一个简单的案例来入门普罗米修斯的使用来实现对普罗米修斯自身的一些指标的暴漏与抓取。

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    一文搞懂Prometheus、Grafana(含腾讯云上实战)

    也可以是直接内置在监控目标中的代码(如在项目代码层面接入普罗米修斯API,实现指标上报)。总结下来就是,只要能够向Prometheus提供标准格式的监控样本数据,那就是一个Exporter。...,5分钟前的瞬时样本数据,或昨天一天的区间内的样本数据呢?...,接下来的例子我们以golang代码里接入普罗米修斯,代码层面实现指标上报这种模式为例。...[购买普罗米修斯]2.TSF服务部署在部署我们的TSF服务时,需要注意将普罗米修斯上报端口(即容器端口)映射到主机端口上,这样普罗米修斯才能获取到对应的上报数据。...[内网访问]第二步,回到普罗米修斯控制台,点击新购买的Prometheus服务的名称,进入到服务详情。

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    从指标到洞察力的普罗米修斯

    简介为什么需要普罗米修斯?普罗米修斯官网的首页简单的对普罗米修斯做了定义:从指标到洞察力 ,普罗米修斯通过领先的开源监控解决方案为用户的指标和告警提供强大的支持。...从官方文档参考到的内容如下所示:图片 可以看到普罗米修斯在多维度指标监控告警等方面拥有强大的支持,下面就进入正题,从普罗米修斯的架构到入门案例来看下如何使用普罗米修斯进行服务指标监控。...导出器公开 普罗米修斯 指标,通常是将以非 普罗米修斯 格式公开的指标转换为 普罗米修斯 支持的格式。PromQL(普罗米修斯查询语言) PromQL是普罗米修斯查询语言。...这允许 普罗米修斯 在它们终止后抓取它们的指标(实时性较高可以先缓存在推送网关中后续由普罗米修斯拉取。Sample(样本) 样本是时间序列中某个时间点的单个值。...在 普罗米修斯 中,每个样本都包含一个 float64 值和一个毫秒精度的时间戳。

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    Dropbox的成本估算

    此外,Dropbox还部署了"防止文件重复上传"的机制,如果确认不同用户上传的是同一个文件,则只保存一个样本,这可以大大减少影音文件占用的空间。最后,用户之间分享的文件,也只保留一个样本。...我们假定重复文件的影响因子是20%,那么平均每个用户最多占用的空间就是1.6GB。2500万用户占用的空间总和,就是40000TB。我们把这个数字,当做Dropbox存储空间的上限。...以它现在的规模,至少需要200台服务器(或者服务器的实例)完成相关运算。假定每台服务器的成本是0.3美元/小时,就相当于每月4.3万美元。...六、总费用 将上面五项费用加总,就得到了用户规模2500万时,Dropbox的月度成本在274万美元--439万美元之间。...七、一些推论 (1)Dropbox每个用户的平均成本,在0.11美元--0.18美元之间。

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    Excel公式:有重复的?没重复的?又要判断了

    问题很简洁:判断单元格中的数字有无重复?如下图1所示。 图1 注:本文示例整理自chandoo.org。 有重复?还是没有重复?这是经常遇到的情形。 对于简单的少量的数据,一眼就看得出来。...下面的公式使用SUBSTITUTE函数依次用空替换单元格中的数字,然后计算替换后的值的长度,如果存在重复的数字,则至少替换2次,其长度会至少减少2,因此,如果替换后长度的差值小于2,则表明没有重复的数字...下面的公式统计FIND函数查找的结果,然后与单元格中数字的长度比较,从而判断是否存在重复数。...下面的公式使用MODE函数获取将单元格中数拆分后的数字中有无重复值。...,如果有大于1的,表明存在重复数字。

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