随机效应Cox模型

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coxme比例风险假设

r、cox-regression、hazard

我正在使用R中的coxme函数{coxme}运行混合效果Cox模型，我想检查比例风险的假设。2015年，类似的问题也在上发布，但没有得到答案。我的问题是: 1)如何在混合效应cox模型coxme上检验PH假设?2)如果coxme模型没有等价的cox.zph，那么在科学文章中发表运

浏览 10提问于2016-12-30得票数 0

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R: coxme()中的比例危险假设

r、survival-analysis

我使用R中的coxme()函数建立了一个混合效应模型，该模型分析了不同国家企业的产品成功事件。固定效应是国内生产总值、人口、技术和文化变量。随机效应是不同的国家。我知道，使用coxph()可以使用cox.zph()命令测试比例风险。我的问题:如何用coxme()检查比例危险？

浏览 3提问于2015-09-04得票数 3

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r、random、effect、cox

我拟合了一个随机效应cox模型，其中为研究中心添加了一个随机效应。然后使用plotHR函数绘制剂量-反应关系图。但我遇到了一个错误。下面是我使用的示例R代码。trt + (1|center), eortc)我可以使用plotHR绘制efit1，但在绘制efit2时遇到错误，我在cox模型中添加了随机效果。

浏览 13提问于2018-09-05得票数 1

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等效于R中的coxme？

我与R中的coxme包做了斗争，我想使用一个函数，比如survfit() --它通常用于coxph()模型--来绘制调整后的生存曲线，并在不同的参数值下找到中位生存期。如果我使用coxph (无随机效应)来拟合模型，我可以做以下工作：data(burn) survfit(cox_nr, n

浏览 2提问于2012-10-31得票数 10

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"deepskyblue"),xlim=c(0,838), ylim=c(0,1), xlab="Days Since Planting")现在我最大的问题是决定使用哪一种模型最合适：survdiff，survreg还是coxph 我做过一些背景研究，但我在统计模型或编程方面没有很强的背景--从我可以看出：survreg是参数的，survdiff是非参数的，coxph是半参数的(不确定这意味着什么

浏览 0提问于2018-09-03得票数 1

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Logit回归: glmer vs bife

r、logistic-regression、lme4

我发现来自lme4包和bife包的glmer模型适合这种工作。glmer_1 <- glmer(CVC_dummy~at_log + (1|year), data=own, family=binomial(link="

浏览 1提问于2019-02-20得票数 3

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混合效应Cox模型(coxme)在乳胶中的输出

r、output

我用coxme导出了一个混合效应Cox模型，并试图在一个乳胶表中提取结果。我看到texreg()不起作用，我想知道是否还会有其他的选择。

浏览 1提问于2017-11-07得票数 1

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计算序数：：clmm的边际效应

r、multi-level、ordinal、marginal-effects

我在计算AME (…)时遇到了一些问题平均边际效应…)从一个具有随机效应的序数模型(序数：：clmm())开始，(在我的例子中是一个四层年因子)。的ggeffects::ggpredict()函数可以工作，但是指定随机效应的点(S)是有问题的，在这里，我看不到我的平均边际效应。3.00 | [ 1.97, 4.03] asoasf 我已经在包的GitHub中发布了一个问题，但是我很高兴听到关于的任何备选方案(其他回归函数/方法，带有at预测或其

浏览 24提问于2022-03-03得票数 1

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带疏浚的lme4随机效应结构

r、mixed-models

我已经为在lme4中选择模型建立了一个dredge模型，但是我很难将随机效应与我的完整模型的相关固定effects.The结构对齐，如下所示。(0+x2|Year) + (0+x2|Country) + (1 | Year) +(1|Country), family=binomial('logit'),data = alldata) 在该模型结构中，dredge中的模型选择产生固定效应的三种组合，即x1、x2和x1+x2，而

浏览 6提问于2015-07-01得票数 1

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我能用plm软件包来估计那些模型吗？

panel、plm、random-effects

我想比较以下模型的估计值，但我不知道是否可以用plm软件包来估计模型(5)：fit.pooling <- plm(form, data = pdata, model = "pooling/ Yt.4/随机效应(ind/

浏览 1提问于2018-02-23得票数 0

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在nlme中指定多个独立的随机效应

r、lme4、mixed-models、nlme

我正在分析一些鲸鱼旅游数据，并试图在nlme软件包中构建线性混合效应模型，看看我的任何解释变量是否会影响鲸鱼和游客之间的相遇时间。(我也愿意在lme4中运行这个模型。)我的变量是： Month所以我的随机变量是Id和Vessel，还有Year和Month作为嵌套随

浏览 2提问于2016-04-04得票数 2

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使用glmer的多级模型:奇异性问题

r、lme4、mixed-models、singular、multilevel-analysis

我用R来运行一个带有随机拦截的逻辑多级模型。我在用频率法(glmer)。由于研究中心的政策，我无法使用贝叶斯方法。我正在使用一种用于交叉性研究的多级建模方法，称为个体异质性和判别精度的多级分析(MAIHDA)。该方法使用单个级别数据作为级别2(交集组)，并在其交叉口内嵌套个体。随机效应(2级)被称为intersect1，它包括每个分类变量的唯一组合(性别x婚姻x残疾)。

浏览 3提问于2022-01-12得票数 1

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R中的coefplot2( )问题

r、plot

我在R中运行了几个MCMCglmm模型，并希望绘制回归估计值以及置信区间。我只对绘制固定效果感兴趣，因为我的随机效应是单个演员，个人接受者和团队--所有这些在统计上都不重要。我的MCMCglmm模型叫做m1.teaching。这是对我有用的代码。我首先将回归估计/系数列表为一个新的对象：然后，我创建了另一个新对象，只包含混合效应(当前和r)估计值和置信区间： m1.coefs.present.r我之所以想这样做，是因为

浏览 4提问于2014-06-19得票数 1

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混合模型拟合误差:观测数、随机效应的<=数

r、lme4、model-fitting

我正在尝试拟合几个混合线性模型。summary(model3 <- lme4::lmer(LPP2POz ~ COND + (COND|ID), data = dataLPP2POz)) 误差:观测次数(=75)项的随机效应数(=75)；随机效应参数和剩余方差(或尺度参数)可能无法识别。任何人都能弄清楚为什么这个模型会逆转这个错误吗？

浏览 2提问于2021-10-27得票数 2

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是否存在识别线性模型中R的二次分量的方法？

r、statistics、linear-regression

假设我们有一个形式为y=x1+x2+的加法模型...有很多变数。在R中有没有一个例程来识别应该被认为表现出二次效应的变量？我知道Box-Cox变换允许识别y的链接，但是x呢?

浏览 0提问于2011-05-06得票数 3

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如何在R中用glmmTMB拟合随机效应模型？

mixed-models、random-effects、glmmtmb

我想用R中的glmmTMB函数拟合一个随机效应模型，我指定模型为模型= glmmTMB(Y ~ (1+x1+x2|group))。估计结果仍然包含存储在obj$env$last.par.best1中的作为beta的通用截距，即使我没有将1作为随机部分之外的通用截距。有人知道如何用glmmTMB来拟合随机效应模型吗？谢谢!我之所以想要一个随机效应模型，是因为我有一个包含很多组的面板数

浏览 8提问于2022-10-26得票数 0

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如何运行加权Cox回归模型

r、survival-analysis、weighted、cox-regression

我试图运行一个加权Cox回归模型，但我发现的任何资源实际上都没有帮助找到如何做到这一点。基本上，我只想运行下面指定的模型，但是加权。

浏览 4提问于2022-11-21得票数 0

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从2D到1D，如何在混合模型中传递第二个随机效应[Python，Statsmodel]

python、pandas、dataframe、statsmodels

它们是随机成分。我会把它传递给混合模型：md = smf.mixedlm("y ~ x", df, groups=df["r1"], re_formula但是现在我想添加第二个随机变量，但是这只能作为一个一维数组.我也不知道如何将传递给groups的2个变量的数据重新排列为一维数组因此，简单地说，：如何以这种方式重新排列数据，以便我可以将2个变量作为1D

浏览 3提问于2019-12-16得票数 1

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如何在线性混合效应模型中定义随机效应？

我读过一篇论文，介绍了线性混合效应模型在数据分析中的应用。我对如何定义方程中的随机效应感到困惑。首先，如何定义组合的随机效果，例如??????−?????????，其中?????第二，如何在斜率项中包含随机效应，如截距+斜率* (var1 +随机效应)+残差我不知道如何编写代码来表示这个方程。我希望得到这些方程的表达式。

浏览 34提问于2019-05-07得票数 0

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混合模型的比较:随机效应群的奇异拟合，但仅在某些模型中。我应该把RE组从所有的模型中删除，还是在单数的地方？

r、lme4、random-effects、singular、model-comparison

我正在用lmer函数在包lme4中拟合几个混合模型，每个模型具有相同的固定效应和随机效应，但响应变量不同。这些模型的目的是确定环境条件如何影响特定树种的不同果实和种子性状。响应变量:测量水果和种子的数量，如鲜质量、干质量、体积随机效应:地点、树木lmer(fruit.mass ~ temperature，但是，一些模型产生了奇异

浏览 5提问于2022-02-17得票数 1

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