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转录组差异分析这样做能行吗?

前段时间,我们分享了转录组三种常见差异分析的推文以及单样本1V1进行差异分析的推文。对单个样本进行差异分析时,我们能获得相应的差异基因。在转录组三种常见差异分析的推文中,我们利用取交集的方式看了下三种方法获得共同差异基因的交集情况。曾老师提出了一个有趣的猜想,试想如果我们将3V3的样本拆分成3次1V1进行差异分析,是否会出现什么有趣的现象呢。为了让结果可比,我们就用上次的数据集GSE190114吧。此次,我们除了关注3次1V1差异分析上调与下调差异基因分别共同的交集情况之外,还将关注3种常见分析方法的上调与下调差异基因分别与拆分成3次1V1差异分析的上调与下调差异基因的共同交集情况,「用于探究是否能够拆分成3次1V1后进行差异分析」。话不多说,由于此次所使用的数据与上次一样,对此次的探究描述与数据集介绍感兴趣的小伙伴,请移驾至三种转录组差异分析方法及区别你会了吗?。

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