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    Dictys:单细胞多组学分析发育连续性的动态基因调控网络

    本文介绍由哈佛医学院的Luca Pinello通讯预印在bioRxiv的研究成果:基因调控网络(GRN)是细胞功能和特性的关键决定因素,并且会在发育和疾病期间动态重组。尽管经过了几十年的发展,GRN推理仍然面临诸多挑战,如动态重组、因果推理、反馈回路建模和上下文特异性。为了解决这些问题,作者开发了一种动态GRN推断和分析方法Dictys,该方法利用了染色质可及性、基因表达的多组学单细胞分析、上下文特异性转录因子(TF)足迹、随机过程网络和scRNA-seq读取计数的高效概率模型。Dictys提高了GRN重建的准确性和再现性,并能够跨发育环境对特定上下文和动态GRN进行推断和比较分析。Dictys通过细胞类型特异性和动态GRN进行网络分析,恢复了人类血液和小鼠皮肤发育的独特见解。其动态网络可视化可以对发育驱动因子TF及其调控目标进行时间分辨的发现和研究。同时,Dictys是一个免费、开源和用户友好的Python包。

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    去IOE升级来袭 国安+去IOE “软件潮”或来袭

    中国共产党十八届三中全会公报指出:将设立国家安全委员会,完善国家安全体制和国家安全战略,确保国家安全。随着我国信息化程度的提高,软件国产化已经成为国家安全的重要组成部分。此前的“棱镜门”事件不仅为国家信息安全保护敲响了警钟,也让国产软件厂商更深切地体会到产业发展的重要性和自己所肩负的国家信息安全保护的重大责任。在关系国计民生的国家级重点项目知识产权、公安、安全等领域采用国产软件,对于国家安全有着重要的意义。昨日国务院常务会议上通过了关于依法公开制售假冒伪劣商品和侵犯知识产权行政处罚案件的意见,也对正版软件产

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    领券