bioconda 来自于 Anaconda 软件，本质上只是 Anaconda 一个单独的生物软件源。...经常看到 Anaconda，Miniconda 以及bioconda，三者之间有什么关系呢？...Anaconda：集合了常用 Python 包的数据科学平台 （full） Miniconda：精简版 Anaconda （Lite） bioconda：专门用来管理生物软件 （...三者的管理工具都是conda 命令。 下图形象的展示了三者的关系 要想使用 bioconda，需要三个步骤，下载软件，安装软件，添加软件源。...defaults 是用来管理 python 相关的包。
3 Anaconda的安装 3.1 Windows系统 3.2 Linux系统 3.3 测试 4 虚拟环境管理(速查字典) 1 混乱的Python库 你有没有遇到过这样的问题 在项目A中需要用到某个...通过报错信息不断安装依赖包终于解决了依赖库的问题，但随之而来的就是版本问题，也就是上面例子所体现的依赖冲突，本质上是某个包开发时的不向下兼容导致的 为了解决上面的问题，更好地管理Python库，让其扬长避短...Anaconda中包含了conda等180多个科学包及其依赖项。其中conda则是一个开源的软件包管理系统和环境管理系统，用于安装多个版本的软件包及其依赖关系，并在它们之间轻松切换。...Anaconda了 选择安装路径 保持默认选项 等待安装结束 配置环境变量 3.2 Linux系统 对于Linux系统，没有图形化的安装界面，按下面输入终端命令即可 进入Anaconda安装目录并运行官方安装程序...默认地，用户会进入Anaconda自带的base环境，注意base环境已经与安装Anaconda前的环境不同，因此第一次使用Anaconda可能会产生依赖冲突和缺失。
此外，conda 安装这些库的位置不会与通过其他方法安装的库的其他实例产生冲突。不管使用 pip 还是 conda 安装 GPU 支持的 TensorFlow，NVIDIA 驱动程序都必须单独安装。...下面是使用 conda 安装所需的步骤。 pip uninstall tensorflow 如果还没有安装 Anaconda 或 Miniconda，需要先安装它们。...Miniconda 仅安装 conda 和一些依赖项，Anaconda 则会预安装大量包。我更喜欢 Miniconda。...使用 conda 安装时，如果选择 Anaconda，则伴随 TensorFlow 同时安装的还有 Anaconda 库中的 1400 多个常用软件包，它们会提供一个完整的数据科学环境。...最后，尽管 Anaconda 在官网上展示了使用 Conda 安装的优势与步骤，但 TensorFlow 官方网站尚未介绍使用 conda 进行安装的方法： ?
下载Anaconda安装包：推荐去清华大学开源软件镜像站下载，因为官网上下载会比较慢而且不稳定，比如我在官网下载到一半时就莫名中断了（不知为啥），所以还是推荐到这个网站上自行找自己想下载的版本对应下载...安装Anaconda 其实安装了python环境还想安装Anaconda环境并不冲突，不用担心有什么冲突之类的问题，直接安装即可。...重点来了，安装Anaconda时，安装包的路径和安装目录路径都尽量用英文，而且也不要用到空格命名这种骚操作，怕出现各种莫名的问题；比如我的Anaconda安装包放在一个中文目录文件夹下，点击安装时居然显示没有权限访问之类的问题...“ ; ” ①添加Anaconda安装的主目录路径，比如我的是“D:\Anaconda” ②添加Anaconda的Scripts目录路径，比如我的是“D:\Anaconda\Scripts”； 必须要配置这两个项目...”旁边的设置齿轮图标，选中“Add”，然后就出现下面页面，选择“system Interpreter”，就能看到Anaconda环境自动导进来了，如果没有自动导进来，就手动找到Anaconda安装目录下
Anaconda的包使用软件包管理系统Conda进行管理。...虚拟环境管理 在conda中可以建立多个虚拟环境，用于隔离不同项目所需的不同版本的工具包，以防止版本上的冲突。...Jupyter notebook ：基于web的交互式计算环境，可以编辑易于人们阅读的文档，用于展示数据分析的过程。...D:\software\devapps\anaconda3-5.2.0\envs\python37 C:\Users\Andy> 包管理 一般来说 conda 仓库的软件没有 PyPI 更新快和全。...-n target_env_name package_name # 删除没有用的包 $ conda clean -p 虚拟环境管理 # 创建环境，后面的python=3.6是指定python的版本
为了解决这些问题，有不少发行版的Python，比如WinPython、Anaconda、pycharm等，这些发行版将python和许多常用的package打包，方便pythoners直接使用，此外，还有...另外值得一提的是，conda 并不仅仅管理Python的工具包，它也能安装非python的包。比如在新版的 Anaconda 中就可以安装R语言的集成开发环境 Rstudio。...虚拟环境管理： 在conda中可以建立多个虚拟环境，用于隔离不同项目所需的不同版本的工具包，以防止版本上的冲突。...Jupyter notebook ：基于web的交互式计算环境，可以编辑易于人们阅读的文档，用于展示数据分析的过程。...你自己有研究过，这样别人一指点你，一来你听的懂，两人没有沟通障碍；二来也许他人的一句话就把你混乱的思路缕清了，你就好像看见自己出错的点在哪了。）
类似于cdh，可以解决安装包的版本依赖的问题 Linux的Anaconda安装 2-如何安装anconda？..._64.sh或bash Anaconda3-2021.05-Linux-x86_64.sh 直接Enter下一步到底，完成 配置环境变量，参考课件 3-Anaconda有很多软件 IPython...conda和pip都是安装python package conda list可以展示出package的版本信息 conda 可以创建独立的沙箱环境，避免版本冲突，能够做到环境独立 conda...，并且安装PySpark3.1.2的包 步骤： 如果使用crt上传文件一般使用rz命令，yum install -y lrzsz 1-在3台虚拟机上准备anconda 2-安装anaconda，sh anaconda.sh...会不断地调用Task，将Task发送到Executor执行，在所有的Task 都正确执行或者超过执行次数的限制仍然没有执行成功时停止； 环境搭建StandaloneHA 回顾：Spark的Standalone
首次尝试 平常安装python包都是去pycharm的setting里面，在设置Project Interpreter中点小加号去装的，但这次却报了错。想来应该是有些依赖包没有装。...可是，有哪些依赖包、适用版本是多少，网上也没有详细的信息说明。因此，准备老老实实的常规操作了。...安装Anaconda 下载 Anaconda3 安装包 官方的太慢了，我使用的是清华镜像源：win 32位 win 64位 安装 Anaconda3 一路确定，但是这两个建议不要勾选，第一个可能会和本来你已经安装的...puthon的环境变量产生冲突，第二个没必要，第二个会更改pycharm创建项目时的默认解释器 安装 TensorFlow 在开始菜单中打开 Anaconda Prompt，执行如下两行命令设置镜像源...python环境中安装的包也搬过来，这也是我们先安装Anaconda的目的。
你也许还想到，如果不同的人编写的模块名相同怎么办？为了避免模块名冲突，Python 又引入了按目录来组织模块的方法，称为包（Package）。...现在，假设我们的abc和xyz这两个模块名字与其他模块冲突了，于是我们可以通过包来组织模块，避免冲突。...方法是选择一个顶层包名，比如mycompany，按照如下目录存放： mycompany ├─ __init__.py ├─ abc.py └─ xyz.py 引入了包以后，只要顶层的包名不与别人冲突，那所有模块都不会与别人冲突...__init__.py可以是空文件，也可以有 Python 代码，因为__init__.py本身就是一个模块，而它的模块名就是mycompany。 类似的，可以有多级目录，组成多级层次的包结构。...可以从Anaconda官网下载GUI安装包，安装包有 500~600M，所以需要耐心等待下载。
另外值得一提的是，conda 并不仅仅管理Python的工具包，它也能安装非python的包。比如在新版的 Anaconda 中就可以安装R语言的集成开发环境 Rstudio。...**environment管理：**在conda中可以建立多个虚拟环境，用于隔离不同项目所需的不同版本的工具包，以防止版本上的冲突。...用户安装的不同python环境都会被放在目录~/anaconda/envs下，可以在命令中运行conda info -e查看已安装的环境，当前被激活的环境会显示有一个星号或者括号。...，list_of_packages是在新环境中需要安装的工具包，有多个时用空格隔开 # 创建一个名为的环境，指定Python版本是3.5（conda会自动寻找3.5.x中的最新版本） conda create...conda create -n BBB --clone AAA # 删除一个已有的环境 conda remove -n xxxx --all # 环境重命名 # conda没有重命名的命令，所以可以先
这里说一下为什么不是Anaconda,因为它太占内存了，足足有5G左右，我的云服务器才40G硬盘，实在是玩不起呐。...但是Anaconda和Miniconda的用法完全一摸一样，使用上不要担心，完全就是一个多装了很多包，一个少装了很多包。...如果经历过的朋友可能深有体会，没有经历过的朋友更好。 但是，!!!...conda 常用命令 这里列举的是常用的命令，有一些命令并没有列举，自行查看手册哈 基本命令 linux和win上，命令是有些区别的,linux上需要加上conda #获取版本号 conda -V...安装第三方包 这里采用的方法通过pip安装 conda激活一个虚拟环境之后，使用的也是当前的python和pip,一点都不用担心和原系统的pip冲突 步骤 进入指定虚拟环境activate <env_name
、matplotlib、pillow包版本冲突啊，然后就是各种尝试，直至重装Anaconda，当时特头疼，最后无意中解决了，今天又碰到了类似的问题，这次记录下来防止忘记 系统版本： Windows 10...此时查看电脑环境变量中没有Anaconda的路径，然后根据上面的博客增加了三条环境变量（当时就想那安装Anaconda时为什么要提示不配置环境变量呢）。...下面是正常使用matplotlib的一个demo 关于这次主要有几个疑惑： 为啥命令行中导入包没有问题，在Pycharm中就有问题？...最后结论是Pycharm本身有问题，这是官方说法，师姐电脑上的版本刚好是2018的，直接升级为19版本，然后发现新版本的pycharm中，在配置解释器的时候下面也多出了一个conda executable...路径（我记得之前好像是没有的），终于恢复正常，不用自己配置anaconda的环境变量啥了（ = _ =） 发布者：全栈程序员栈长，转载请注明出处：https://javaforall.cn/158593
python 3 建议使用 anaconda 软件包。请到这个地址下载适合自己操作系统的 Python 3 版本，并且进行安装。...我曾经做了一个视频教程，完整展示和讲解了 anaconda 的安装流程，并且介绍了如何进行相关的命令行操作。欢迎点击这个链接，观看相关的介绍说明。...否则可能会造成冲突。...或者直接点击这个链接，下载压缩包并且解压。 压缩包里面，有两个文件。...之后，执行： python batch-markdown-to-pdf.py 如果一切正常，你会看到程序在运行，不过没有什么输出提示的。 因为转换 pdf 的工作需要一些时间。
第三方库很多都是个人或者团队，非 Python 官方开发的库，所以难免五花八门，杂乱不堪。 甚至有时候，各个版本的库，还存在各式各样的冲突。 这个库不兼容那个库，各种「无厘头」报错层出不穷。...而名为 faceswap 的环境是我专门为换脸算法搭建的环境，因为它的依赖和有些通用第三方库包是冲突的。 Anaconda 还是跨平台的，在 Windows、MacOS、Linux 都可以安装。...工作后，跑算法，往往都是在服务器上运行的。 连个图像界面都没有的服务器，你还能用 Pycharm ？ Jupyter Notebook 是一个基于网页的交互式计算笔记本环境。 ?...Anaconda 下载地址： https://www.anaconda.com/products/individual#download-section 根据自己的环境选择安装包： ?...从上图可以看到，有两个环境，一个是 base ，自带的基础环境，另一个是我们新创建的名为 jack 的环境。 安装好环境后，我们可以使用指令激活 jack 环境： activate jack ?
我质疑了一下，chatGPT知错就改 对不起，我可能没有表达清楚。在Python中，os模块是标准库的一部分，而不是内置函数的一部分。...第三方库，site 路径，也就是 C:\\Users\\zoeyxiong\\Anaconda3\\lib\\site-packages这种 所以在定义模块的时候，不要和标准库名冲突，除非你想取代它。...在import中，还有其他的代码规范建议： 禁止引入无用import 避免使用 import * 命名冲突：如果多个模块中都定义了同名的变量、函数或类，那么使用import *语句可能会导致命名冲突，...首先我们先了解模块和包的区别： 模块（module） python中一个py文件就是一个模块，module_name.py中，module_name就是模块名 包（package） 包就是目录，包里面可以有...module，还可以有子包。
目前是源的问题已经配置好了。 conda的镜像源配置好后，安装内容冲突 [cennmgdynz.png?...[图片.png] R环境下面的seurat的安装 install.packages("Seurat) [图片.png] 发现还是有3个warning，因此开始手动安装缺少这两个包。...手动安装第一个包后发现有可能还是编译的环境出现了问题，因此我还是选择用conda进行安装。...[图片.png] 同样的问题，library(RcppAnnoy)也是没有，我就开始怀疑为什么都conda下来了，还是没有这个包。...conda，发现确实是有R的，加入环境变量后是4.1.3的版本，随后安装seurat，目前是终于安装成功了。
Anaconda：主要针对 Python 的数据科学整合包，包括有 Numpy，Pandas，Sklearn等。重要的是，自带管理软件 conda，它拥有安装，更新，删除，解决包依赖关系的包管理功能。...同时，conda拥有环境管理功能，能创建独立运行环境， 使各项目间包环境和版本互不冲突和影响。另外，Conda 还可以管理包括 Bowtie2，FastQC 等软件环境，甚至 R 包环境。...Conda 环境的使用示例 有了 Anaconda 的支持，为什么还要 Conda 环境？...但是，有时候，我们并不需要这么多的包，而是需要特定版本的 Python 或者 Python 包，或是依赖冲突等问题，这就要求有一个独立运行的环境。而 Conda 建立的环境正好满足了这个需求。...可以看到在最前面多了一个 (example) ，这个代表激活的 conda 环境 3.查看 conda 环境里有哪些包 输入命令 conda list，可以查看我们建立的环境里包含哪些包。
Conda 是一个开源的软件包管理系统和环境管理系统，用于安装多个版本的软件包及其依赖关系，并在它们之间轻松切换。...还是比较大的，需要下载一会： 下载完毕： conda安装过程 conda工具菜单 conda有很多的工具，可以直接点击开始，在菜单列表中找到【Anaconda】，功能都在里面。...创建测试文件 基础编码运行测试 跑一个输出，跑一个requests，都成功，代表我们安装的没有问题。super successed。...总结 Conda的优势主要体现在以下几个方面： 环境管理：Conda可以创建和管理多个独立的环境，每个环境可以有不同的软件版本和依赖项。...简化软件包管理：使用Conda可以简化软件包管理和部署的复杂性，避免版本冲突和依赖关系问题，从而提高工作效率。
以下是自己在收集资料的过程中看到一篇很好的安装教程，分享一下。 声明： python版本和tensorflow版本之间有对应关系。如果搞不好，会出现各种问题。...就和安装普通的软件一样，全部选择默认即可，注意勾选将python3.6添加进环境变量。 这样Anaconda就安装好了，我们可以通过下面的命令来查看Anaconda已经安装了哪些包。...运行 开始菜单->Anaconda3—>Anaconda Prompt ： conda list 可以看到已经安装了numpy、sympy等常用的包。...（4）安装cpu版本的TensorFlow pip install tensorflow==2.0 注：这里没有介绍GPU版本的安装方法，GPU版本需要安装cuda8+cudnn5，如需要的请搜索其他博文...这类问题（pip安装完包之后再去引用报错：找不到执行模块）一般是由于版本冲突引起的。所以要考虑调整python或者tensorflow的版本。
即使是我不怕麻烦，一个模块可以手动卸载重装，如果遇到多个模块同时冲突的情况呢？这个时候就比较头疼了。 正是这个问题的出现，往Python中引入了虚拟环境的概念。...就可以在电脑上装一个虚拟的系统，然后这个系统用起来，和在你实际的机器上没有差别。但是这两个系统是完全独立的，你在虚拟机里安装的软件不会影响到实际机器的使用，即使是不同版本的相同软件也不会互相冲突。...因为是隔离开的，也不存在不同版本的相同软件互相干扰的情况。它们的整体结构，就像下面这个图里展示的这样。...虚拟环境中可以根据你自己的项目需要，安装不同的包，这样就可以将不同的项目和对应的Python版本、包模块都隔离开来，互不影响。就可以非常方便地开发自己的项目了。...常用的虚拟环境介绍 目前常用的虚拟环境有virualenv、pyenv、anaconda。
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