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系统比较Seurat和scanpy版本之间、软件之间的分析差异

Seurat和Scanpy是实现这种工作流的最广泛使用的软件,通常被认为是实现类似的单个步骤。下面我们就需要比较一下软件之间、以及不同版本之间的数据分析差异。...除了比较所有聚类中显著marker基因的外,还可以比较marker之间的相似性(即DE分析后每个聚类的基因)。...下采样比较考虑到软件之间引入的可变性,一个自然的问题是如何对这些差异的大小进行基准测试。为此,在生成过滤UMI矩阵之前,模拟reads和细胞的下采样,并比较了沿下采样分数梯度引入的差异与全尺寸数据。...将Scanpy v1.9与较早的v1.4进行比较还揭示了重要marker基因和marker list的巨大差异,这是由于删除了不同版本之间的marker过滤。...这些版本之间的logFC计算和调整后的p值没有差异。比较使用默认设置的Cell Ranger软件v7和Cell Ranger v6生成的计数矩阵也揭示了所有DE指标之间的差异。

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Thanos 和 VictoriaMetrics 之间的深入比较:性能和差异

本文对 Thanos 和 VictoriaMetrics 进行了比较,讨论了它们是什么、它们的架构组件以及它们的差异。 Thanos是什么?...它拥有卓越的数据压缩和高速数据摄取能力,使其成为大规模监控任务的有吸引力的替代方案。...Thanos和VictoriaMetrics之间的差异 Thanos 和 VictoriaMetrics 是大规模运行的监控系统,旨在为时间序列数据提供长期存储解决方案,特别是在可观测性领域使用 Prometheus...然而,两者之间存在几个关键区别。 起源与目的 Thanos:作为一个项目而诞生,旨在解决 Prometheus 中多集群监控和长期存储的需求,而无需求助于完全独立的监控系统。...社区与发展 Thanos:拥有一个强大而活跃的社区,来自许多组织的贡献,包括 Slack 社区频道。这也是 CNCF 的孵化项目。

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    SaaS ERP与传统ERP:它们之间差异的全面比较

    以下是使云ERP系统对许多公司有利的一些关键差异: 更简单的设置– SaaS ERP系统可以设置为仅需几分钟即可由公司的办公设施访问。...灵活的选择– SaaS解决方案的提供商通常能够为公司提供比出售整套ERP软件解决方案的公司更多的选择。借助SaaS软件,您可以随时进行自己的配置,选择和选择所需的功能。...更好的控制–如果您的公司已经存在了一段时间,那么您已经建立了定义明确的业务流程。这意味着您需要一个将控制权交给您的ERP软件解决方案,以便您可以根据自己的独特需求来工作软件功能。...降低成本–如果比较成本,您可能会发现SaaS的价格比传统的ERP软件便宜。使用SaaS解决方案特别省钱的是初始设置成本。如果许多初创公司必须用昂贵的软件包资助大笔采购,就无法起步。...到目前为止,可以通过SaaS模型访问许多不同的ERP软件选项。尽管传统软件和SaaS商业解决方案软件之间需要权衡取舍,但基于Web的ERP软件的优势却超过了传统软件为各行各业的公司带来的任何优势。

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    两次差异分析结果的比较不要局限于韦恩图

    其实这个问题并不在于上下调基因数量,应该是看质量,这样的对比才有意义。 最初级的就是韦恩图啦 大家在做差异分析结果比较的时候,喜欢看两次分析结果的基因交集,比如韦恩图。...如果画一个差异变化倍数(logFC)散点图,就可以很直观的给出两次分析结果差异了。...分析一文就够(单机版+R语言版) 根据分组信息做差异分析- 这个一文不够的 差异分析得到的结果注释一文就够 两个差异分析的结果的对比,韦恩图是比较符合直觉的展现方式。...我们在《生信菜鸟团》有一个专辑反复提到过,大家可以自行去阅读: 两个差异分析的结果的对比 其次是变化倍数的散点图 比如我们可以在PBMC3K数据集里面,做两次单细胞差异分析: CD14_deg =...详见:两次单细胞差异分析后的结果进行相关性散点图绘制 相关性确实是可以说明我们的两次差异分析是一致的,但是很多时候,我们并不是想重复前人的数据分析结果,而是确实先看看两次差异分析的结果的不一致的地方。

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    C++17常用新特性(五)---强制省略拷贝或传递未实质化的对象

    如下面的泛型函数: template T factory(Args&& ...args){ return T{std::forward>(42); cout<<"aValue="<<aValue<<endl; return 0; } 在上面的代码中,泛型函数除了可以用于一般变量的创建外还可以对...在泛型函数中使用了完美转发,具体可以参考下文: 【C++11】 改成程序性能的方法--完美转发 除此之外,在C++17之后类中禁止移动构造函数的默认生成在实际使用时可以正常编译和运行,但是在C++17之前是编译不过的...具体如下: 3.1 C++11之前的值类型体系 C++11之前。值类型体系主要是从C语言继承而来。划分也比较简单,主要根据赋值语句进行划分,分为左值和右值。...prvalue:主要是用来表示进行初始化的表达式。而xvalue是他们之间存在的交叉,表示的是一个资源可以被回收利用的对象。

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    【Rust 基础篇】在函数和结构体中使用泛型

    本篇博客将详细介绍如何在函数和结构体中使用泛型,包括泛型函数的定义、泛型参数的约束以及泛型结构体的实现。 一、泛型函数 在 Rust 中,我们可以定义泛型函数,它可以适用于多种不同类型的参数。...该函数使用了一个泛型参数 T,它可以代表任意类型。在函数内部,我们可以使用泛型参数 T 来处理传入的值。 在 main 函数中,我们调用了 print 函数两次,分别传入了整数和字符串。...由于 print 函数是一个泛型函数,它可以适用于不同类型的参数。 泛型参数的约束 有时,我们希望对泛型参数进行约束,以限制可接受的类型。...在 main 函数中,我们调用了 add 函数两次,分别传入了整数和浮点数。由于泛型参数 T 符合约束条件,所以可以进行加法运算,并返回正确的结果。...由于泛型参数 T 可以代表任意类型,所以可以在结构体中使用不同的类型。 泛型参数的约束 与泛型函数类似,我们也可以对泛型参数进行约束,以限制可接受的类型。

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    Go 泛型之类型参数

    Go 泛型之了解类型参数 一、Go 的泛型与其他主流编程语言的泛型差异 Go泛型和其他支持泛型的主流编程语言之间的泛型设计与实现存在差异一样,Go 的泛型与其他主流编程语言的泛型也是不同的。...在 Go 1.18 版本之前,Go 的确没有比较理想的解决类似上述“通用”问题的手段,直到 Go 1.18 版本泛型落地后,我们可以用泛型语法实现 maxGenerics 函数: // max_generics.go...函数传入的实际参数为 []int{…} 时,Go 编译器会将其类型 []int 与泛型函数参数列表中对应参数的类型([]T)作比较,并推断出 T == int 这一结果。...其实泛型函数调用是一个不同于普通函数调用的过程,为了揭开其中的“奥秘”,接下来我们看看泛型函数调用过程究竟发生了什么。...我们也可以用一种更形象的方式来描述上述泛型函数的实例化过程。实例化就好比一家生产“求最大值”机器的工厂,它会根据要比较大小的对象的类型将这样的机器生产出来。

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    OpenCV4 C++学习 必备基础语法知识二

    微信公众号:OpenCV学堂 关注获取更多计算机视觉与深度学习知识 前言 之前我写过一篇介绍学习OpenCV C++一些前置基础C++11的基础知识,主要是介绍了输出打印、各种常见数据容器,这里又整理了一篇...,主要涉及时间计算与格式化输出、各种数据类型之间的相互转换、简单的定义方法与泛型方法定义使用。...这里我们使用C++11,同样可以计算,而且C++11还支持各种日期与系统时间的格式化输出,主要是基于std::chrono包的各种函数应用,这部分的代码演示如下: std::cout 的代码中会有template类似的语法,很多小白都直接蒙了,其实这个是现代编译器支持,各种语言都会有的泛型。...OpenCV中的图像数据常见支持uchar与float类型操作,我们以此为例定义一个泛型函数,实现浮点数与字节类型图像数据的遍历与操作,方法定义与代码实现如下: template <typename T

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    Go 泛型浅析

    编译器实现泛型侧重于创建泛型函数和方法的实例,这些函数和方法将使用具体的类型参数来执行。...接口类型和非接口类型属于不同的gcshape ,即使非接口类型有着和接口相同的双指针结构,因为在调用方法时它们的行为差异很大。...我们把一个泛型函数或方法针对一组shape类型参数的实例化,称为shape实例化。 字典格式 字典是在编译阶段静态确定的,与泛型函数或方法的调用以及调用时具体的类型实参相对应。...子字典区间 所谓子字典 sub-dictionaries ,也就是当前这个泛型函数或方法又调用其他泛型函数或方法时,这些子调用所需要传递的字典。没错,这也是需要从外层一起生成并传递进来的。...子字典的结构比较简单,我们就不再展开说明了。

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    【C++11】左值引用、右值引用和移动语义

    在c++11当中新增了右值引用语法特性,无论是左值引用还是右值引用,都是给对象起别名。...y; //给表达式x+y取别名为r6 左值引用和右值引用比较 左值引用 左值引用只能引用左值,不能引用右值 但是const左值引用既可以引用左值,也可以引用右值 /左值引用引用右值 double x...例如: 函数中可以看到,这里只能使用传值返回,传值返回会导致至少1次拷贝构造(如果是一些旧一点的编译器可能是两次拷贝构造)。...string s3(std::move(s1)); return 0; } 完美转发 完美转发(Perfect Forwarding) 是 C++11 引入的核心特性之一,用于在泛型编程中精确传递参数的左值...假设有一个泛型函数 wrapper,需要将参数转发给另一个函数 target: template void wrapper(T arg) { target(arg);

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    Go 泛型之明确使用时机与泛型实现原理

    我们可以看到,以上两个方案都有各自的不足,那么有比较理想的方案么? 有的,那就是使用 Go 泛型。其实不止 Go 语言,其他支持泛型的主流编程语言的通用数据结构实现也都使用了泛型。...*s = (*s)[:len(*s)-1] return result, true } 泛型版实现基本消除了前面两种方案的不足,如果非要说和 IntStack、StringStack 等的差异...最后,如果非要总结为一条,那就是:如果你发现自己多次编写完全相同的代码,其中副本之间的唯一区别是代码使用不同的类型,那么可考虑使用类型参数了。...,这种方案产生了大量的代码,其中大部分是多余的,有时候还需要一个好的链接器来消除重复的拷贝,显然这个实现路径会“拖慢编译器”; Java 路径:就像 Java 的泛型实现方案那样,通过隐式的装箱和拆箱操作消除类型差异...更重要的是它对性能可能有比较大的影响,比如通过 dict 的指针的间接类型信息和方法的访问导致运行时开销较大;再比如,如果泛型函数调用时的类型实参是 int,那么如果使用 Stenciling 方案,我们可以通过寄存器复制即可实现

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    第七章 函数

    ------------------------------------------------------------- extern "C" //C类 型函数 int Add(int x, int...is called\n"; } }; Str fun() { Str x; return x; } int main() { Str res = fun(); //两次拷贝构造...,因此会输出两次"Copy constructor is called" } 返回类型 返回类型表示了函数计算结果的类型,可以为void 返回类型的几种书写方法 经典方法:位于函数头的前部 C+...+11引入的方式:位于函数头的后部(泛型编程和类的成员函数编写可能会简化编写) C++14引入的方式:返回类型的自动推导 使用constexpr if构造“具有不同返回类型...(表示在编译器执行,也可以在运行期执行)(C++11起)/consteval函数(C++20起)(只能在编译期执行) 内联函数的展开: 1.逻辑简单的函数可能会被展开 2.内联函数展开并不是简单的替换

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    Go 1.18 新增三大功能之一“泛型”怎么使用?

    函数的类型参数 - 泛型函数 我们先使用 “泛型” 重写一下 Part 02 的 MinAny() 函数,代码如下: func MinAny[T int](x, y T) T { if x <...y { return x } return y } 阅读上面这段代码,我们可以发现,在函数名和参数列表之间的 [T int],这就是类型参数,我们在函数 MinAny...中使用类型参数,该函数就是“泛型函数”。...需要注意的是,“泛型类型”和“泛型函数”使用方式不同,它不能像“泛型函数”具备类型推断的功能,而是需要显示指定类型实参,代码如下: salary := &MinSalary[int]{ salary...除此之外,语法上没有太大区别,需要注意的是“泛型方法”不能像“泛型函数”那样,具有自身的类型参数,以下代码目前是不支持的。

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    【C++11】 改进我们的设计模式---观察者模式

    ,但是在实际的使用时,这种实现方式并不灵活,有很多的限定,最明显的两个限制是: 需要使用继承关系,继承的缺点有很多,如:继承关系会造成派生类中产生冗余代码,降低了代码的灵活性,且需要实现父类中定义的方法...主题和观察者之间的接口定义方式是固定的,不能适应后续随着业务发展带来的新的交互方式的变化。...2 改进后的观察者模式 为了解决经典观察者模式中的问题,可以使用C++11中提供的新的语言特性,如将消息通知接口进行参数化和使用std::function函数绑定解决类的继承问题,通过完美转发和可变参数模板消除接口接口变化的影响...return k; } int m_iObersevre = 0; std::map m_mapOberserve; }; 如上面的代码所示,使用C+...+11后的观察者模式通过维护一个泛型函数列表消除了类继承导致的代码耦合,使得只需要传入观察者调用函数既可。

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    用 C++ 和 Java 写算法,有差别吗?

    大部分情况下,两种语言的基本数据类型可以根据下表进行一对一的转换,但是也有差异,需要特别注意。...Java 的 long 比较单纯,无论是 32 位的系统还是 64 位的系统,它都表示 64 位整数。 ?...Java 没有与之对应的泛型函数接口,但是 Java 的很多 Collection 都支持 forEach() 接口: ?...7、枚举 与 C 相比,C++ 强化了类型差异,枚举变量和整数变量之间不能互相赋值,但是使用方法依然是直接使用枚举值,没有限制域。...C++ 的函数有很多类型修饰,比如常见的 const,C++11 后新增了 final 和 override,但是 = 0 一直是一个比较奇怪的存在,它表明这个函数没有实现,需要在派生类中实现,同时,也说明这个类是不能被实例化的

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    写算法,用 C++ 还是用 Java ,差别大吗?

    大部分情况下,两种语言的基本数据类型可以根据下表进行一对一的转换,但是也有差异,需要特别注意。...Java 的 long 比较单纯,无论是 32 位的系统还是 64 位的系统,它都表示 64 位整数。 ?...Java 没有与之对应的泛型函数接口,但是 Java 的很多 Collection 都支持 forEach() 接口: ?...枚举 与 C 相比,C++ 强化了类型差异,枚举变量和整数变量之间不能互相赋值,但是使用方法依然是直接使用枚举值,没有限制域。...C++ 的函数有很多类型修饰,比如常见的 const,C++11 后新增了 final 和 override,但是 = 0 一直是一个比较奇怪的存在,它表明这个函数没有实现,需要在派生类中实现,同时,也说明这个类是不能被实例化的

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    为什么泛型会让你的Go程序变慢

    可以比较用 inteface 当参数调用 WriteByte 的汇编代码和泛型代码,来分析下性能 Intermission: Calling an interface method in Go 当比较代码前...直观的讲,可以假设泛型方法调用,总是比 interface 接口的方法调用慢,原因就在于两次解引用 name time/op alloc/op...这并不是特别不符合人体工程学,而且开销也大,由于 Go 中的 slice 是可变的,而 string 是不可变的,在它们之间进行转换时,无论哪个方向都会强制进行分配对象 这种大量的代码重复看起来确实是泛型的一个有利目标...1% Valid/ASCII/String-16 930ns ± 3% Valid/ASCII/GenericString-16 811ns ± 2% 两个实现之间的性能差异在误差范围之内...当涉及到方法调用时,泛型将指针变成了两次直接的接口,而接口则变成了......嗯,如果我说实话,是相当可怕的东西。

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