说实话,自从之前好好学习了一下入门的R以后,一直没有用过R,很多东西都忘了,还是需要靠做笔记方便日后查阅。 本期讲一下R包的几种来源以及安装指定版本R包的几种方法。 R包来源及安装方法 1....安装指定版本R包 复现文章或R包的更新与当前的R版本或R代码不兼容时,就需要考虑安装某个特定版本的R包了,这里列一些常见的安装指定版本R包的方法供大家参考。...) : object 'get_fun_from_pkg' not found 经过查询发现(参考资料2),clusterProfiler的依赖包rvcheck的版本太新,下载0.1.8的版本即可...在装有devtools的基础上,我使用以下命令重新装了0.1.8版本的rvcheck后,顺利的安装了clusterProfiler。...源码安装 在这里也许能找到你需要的R包历史版本。
今天,另一个同事告诉我,说服务器的clusterProfiler和enrichplot自从重新装了服务器,就没有安装成功做,做分析都是放到个人电脑上去做的。不能忍,今天就解决。...系统环境 操作系统centos7 R 版本MRO4.0.2 有root权限 需要安装clusterProfiler和enrichplot包 2....,能不能让大家使用 不确定Rstudio-server能不能指定新建环境中的R4.1版本 3....) 错误: package or namespace load failed for ‘clusterProfiler’ in dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ......) 错误: package or namespace load failed for ‘clusterProfiler’ in dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...
OpenSSL是一个开源的ssl技术,由于我需要使用php相关功能,需要获取https的文件所以必须安装这个东西了,下面我整理了两种关于OpenSSL安装配置方法。...安装环境: 操作系统:CentOs7安静 OpenSSL Version:openssl-1.0.2j.tar.gz 目前版本最新的SSL地址为http://www.openssl.org/source...文件夹 3、进入解压的目录:cd openssl-1.0.2j 4、设定Openssl 安装,( –prefix )参数为欲安装之目录,也就是安装后的档案会出现在该目录下: 执行命令: ....上网查才发现我安装的CentOS7中没有GCC编译器 保证系统网络畅通以后,执行命令 yum -y install gcc 安装GCC(注意,一定要忘了顺畅,不然安装不了) 7、安装 Openssl...卸载旧版本 OpenSSL的方法 apt-get purge openssl rm -rf /etc/ssl #删除配置文件 以上就是本文的全部内容,希望对大家的学习有所帮助。
Ubuntu 直接使用rocker提供的r镜像。...run --name ubuntu -it rocker/r-ubuntu:18.04 /bin/bash 进入R,然后安装CRAN包的安装方式进行安装。...install libssl-dev 安装UCSCXenaShiny成功后,进一步关注App启动时的依赖安装。...原因是最新版本仅支持 R≥4.0(测试使用的3.6)。...,发现centos7差不多是ubuntu的2倍。
不得不说,现在各种软件系统的版本更新都好迅速! 一般来说,新安装的ubuntu系统都太干净,缺很多库文件,下面的代码先运行一波!...sudo apt install -y libssl-dev 安装最新版R语言 使用root权限(系统管理员)安装最新版的R,我们的ubuntu是20,所以选择focal这个代号,然后是cran40...实际上还需要使用root权限(系统管理员)安装一些R包。...安装一些R包 这里我们使用root权限(系统管理员):sudo R options()$repos options()$BioC_mirror #options(BioC_mirror="https...sudo chmod -R 2770 /var/www/html 同时,也需要管理ubuntu的端口,Nginx安装后,理论上IP可以在浏览器打开访问,但是要求网页端口80的开通的。
由于系统都是centos7的。我想把节点摘掉重新安装一下系统(系统替换为centos8.2)然后重新加入集群。以k8s-master-03节点为例.........关于ml lt版本: kernel-lt(长期支持版本) kernel-ml(主线最新版本) 一般的长期稳定支持版就好了,嗯我手贱选择了ml版本了...... 3....-in /etc/kubernetes/pki/ca.crt | openssl rsa -pubin -outform der 2>/dev/null | openssl dgst -sha256...k8s-master-01主机安装了etcd客户端方法如下: [image.png] 使用etcd命令查看相关信息: etcd_v3 endpoint status --write-out=table...试验一下: kubectl get nodes [image.png] 嗯到了这里的还有修改/etc/kubernetes/manifests目录下kube-controller-manager.yaml
今天就来介绍如何安装Ambari和如何使用Ambari来部署Hadoop集群。 对于HDP集群,ambari是一个极其优秀的管理软件。本文就来介绍,如何使用ambari来部署一个HDP集群。...默认会安装并使用 Oracle 的 JDK,但是建议选择custom,然后填入你的jdk地址即可,这样会快很多,因为无需下载jdk 指定 Ambari Server 的运行用户为 root 其他配置均使用默认...4、confirm hosts 也就是安装向目的主机安装ambari agent,一行写一台主机,填写是要主要填写主机主机名,不要填写IP,要不然有可能出现以下错误: ambari agent machine...经验教训:遇到组件错误,首先查看组件的日志而不是ambari的提示,组件日志是最为准确有效的。...对于使用ambari安装Hive等组件,下一篇文章再讲。
查看Ubuntu系统以及R版本 cat /etc/issue 通常来说,很多R包的安装对R版本是有要求的,比如BiocManager需要 R (≥ 3.5.0),但是并不需要最新版R语言。...Ubuntu倒是很稳定的更新,我的其实已经是Ubuntu18了 ,其它版本需要修改Ubuntu源文件,使用VIM编辑器修改文件:/etc/apt/sources.list 假如系统R版本不够,就需要升级...# 首先删除系统自带旧版本的R sudo apt-get --purge remove r-base r-base-core r-base-dev sudo apt-get --purge remove...install -y r-base r-base-core r-base-dev 使用sudo安装一些必备包 这里只是举例,我比较常用的包,安装非常耗时,一般来说小半天就过去了。...sudo apt-get -y install libmariadb-client-lgpl-dev libcurl4-openssl-dev libudunits2-dev
clusterProfiler这个包进行KEGG富集分析的时候,遇到了下面这个错误 最开始以为是网络问题,换了手机热点,还是报同样的错误。...一怒之下,直接把这个包给删了,又通过BiocManager::install("clusterProfiler")重新安装了一遍,结果还是报同样的错误。...也可以直接到你R的安装路径下面,找到library这个文件夹,然后找到clusterProfiler文件夹,全部删掉。 2....注意,windows用户下载框出来的这个包。 3. 然后在R或这Rstudio里面从本地安装包,选择刚下载的那个压缩文件,进行安装。 R是这样的 Rstudio是这样的 4....装好之后,还是原来的配方,又是熟悉的味道 具体如何使用这个包,这里就不再展开了,下面的视频里面讲的很清楚。
/configre的时候,报错: 需要安装 yum -y install pcre-devel 然后: yum -y install zlib-devel 安装php7 #centos7 ...:user与root目录一直 #root运行php-fpm的话需要php-fpm -R vi /etc/php-fpm.d/www.conf #修改后如下: [...]...;listen = 127.0.0.1:9000 listen = /var/run/php-fpm/php-fpm.sock #这样nginx就可以使用php-fpm.sock了 安装mysql #mysql5.7...yum install yum install https://dev.mysql.com/get/mysql57-community-release-el7-11.noarch.rpm #更多见...http://www.heanny.cn/post-354.html 安装python3 安装依赖 yum -y install zlib-devel bzip2-devel openssl-devel
作为一个企业级私有Registry服务器,Harbor提供了更好的性能和安全,提升用户使用Registry构建和运行环境传输镜像的效率。...centos7 172.27.9.181 / / / NFS服务器 ubuntu安装详见:Ubuntu16.04.5以lvm方式安装全记录 docker安装详见:Ubuntu16.04安装Docker...nfs软件 root@ubuntu1604:~# apt-get install nfs-common -y 挂载 root@ubuntu1604:~# showmount -e 172.27.9.181...(172.27.9.38)拉取镜像centos7,在做此操作前需进行前文的“拷贝证书”操作。...安装及使用:https://github.com/int32bit/python-harborclient/blob/master/README.zh.md 本文参考: https://github.com
(Core) #安装依赖包 yum -y install wget cmake gcc gcc-c++ ncurses ncurses-devel libaio-devel openssl openssl-devel...-R mysql.mysql /data/mysql chmod -R 755 /usr/local/mysql/ chmod -R 755 /data/mysql/ #解压并开始安装 tar -zxf...host, user, authentication_string, plugin from user; 2、yum存储库安装MySQL wget https://dev.mysql.com/get/mysql80...,如果使用了将会导致在正确修改密码是报如下错误: mysql> ALTER USER 'root'@'localhost' IDENTIFIED WITH mysql_native_password BY...'修改密码时会一直报错,必须清空后再修改,因为authentication_string字段下只能是MySQL加密后的43位字符串密码,其他的会报格式错误,所以在MySQL8.0以后能修改密码的方法只能是
可能把大多数人挡在门外的就是R包安装了,因为我们之所以会选择R语言,就是因为它丰富的第三方包,可以不费吹灰之力实现大量的统计可视化。...但是最近频繁看到粉丝留言表明安装clusterProfiler包失败,这个clusterProfiler是大名鼎鼎的Y叔开发,基本上是每个做生物信息学数据分析的人都会使用它的,做超几何分布检验(富集分析...而且还取决于你的操作系统,如果是Windows或者Mac,基本上看:Windows电脑使用Rstudio会有多少错误呢 以及【紧急通知】下载R包却联网失败?初学者的痛,就能解决了。...其实本质上还是联网的问题,缺什么包就安装它即可。...’ * removing ‘/opt/R/3.6.3/lib/R/library/clusterProfiler’ 所以通常我们不建议大家使用ubuntu等Linux系统来操作R语言代码,各种花式报错:
ffmpeg既可以播放视频,也提供命令行工具来处理视频,另外还有强大的视频处理库用于开发,下面是以Linux为例介绍ffmpeg的安装流程的简单的命令行对视频进行转码操作,是ffmpeg中最最简单的入门内容...with-libvmaf \ --with-libxml2 \ --with-opencore-amr \ --with-openh264 \ --with-openjpeg \ --with-openssl...apt update && \ apt-get install -y software-properties-common && \ apt update && \ add-apt-repository...-y ppa:jonathonf/ffmpeg-4 && \ apt install -y ffmpeg Centos7 安装步骤 yum install epel-release -y && \.../homebrew-ffmpeg#installation-and-usage 到此这篇关于Centos7安装FFmpeg音/视频工具简易文档的文章就介绍到这了,更多相关Centos7安装FFmpeg内容请搜素
其他调试参考文章 centos7使用lldb调试netcore应用转储dump文件 centos7 lldb 调试netcore应用的内存泄漏和死循环示例(dump文件调试) 生成dump文件 如何在...dotnet:2.2-sdk RUN apt-get update && apt-get install -y \ cmake llvm-3.9 \ clang-3.9 \ lldb...yet in the target process错误问题。...安装dotnet-symbol插件 下载组件的符号文件。...方便有效查看堆栈信息 dotnet tool install -g dotnet-symbol 插件安装后,针对要调试的dump文件下载对应的符号,实用程序dotnet-symbol将自动为我们的dump
如果你的clusterProfiler安装有困难 R语言对临床医师/医学生来说已经是最容易学的编程语言了,相比起C语言,python,java,PHP来说。...可能把大多数人挡在门外的就是R包安装了,因为我们之所以会选择R语言,就是因为它丰富的第三方包,可以不费吹灰之力实现大量的统计可视化。...但是最近频繁看到粉丝留言表明安装clusterProfiler包失败,这个clusterProfiler是大名鼎鼎的Y叔开发,基本上是每个做生物信息学数据分析的人都会使用它的,做超几何分布检验(富集分析...而且还取决于你的操作系统,如果是Windows或者Mac,基本上看:Windows电脑使用Rstudio会有多少错误呢 以及【紧急通知】下载R包却联网失败?初学者的痛,就能解决了。...’ * removing ‘/opt/R/3.6.3/lib/R/library/clusterProfiler’ 所以通常我们不建议大家使用ubuntu等Linux系统来操作R语言代码,各种花式报错:
基于centos7制作docker镜像 docker镜像是企业非常常用的一种应用打包,应用交付的方式. docker天生优势,一处构建处处运行,在任何机器构建的服务均可以在任意一台安装有docker的主机上运行...首先安装centos7平台环境 docker run -itd --name centos7 cenots:7 docker run -it --name centos7 centos:7 2....安装nginx依赖包 yum install -y pcre pcre-devel openssl openssl-devel \ gd-devel zlib-devel gcc net-tools...dev/stdout /var/log/nginx/access.log && \ ln -sf /dev/stderr /var/log/nginx/error.log RUN chown -R...现在主流的文件服务器 可以使用 NFS fastdfs 来实现 同时他们要指定 UID : 如: useradd www -u 1200 -M -s /sbin/nologin [image-20200316165900256
环境(CentOS Linux release 7.6.1810 (Core) 内核版本3.10.0-957.21.3.el7.x86_64) 一、环境配置 1、依赖安装 yum install gdb...gcc gcc-c++ ncurses-devel cmake libaio bison zlib-devel openssl openssl-devel patch 2、下载代码 wget https...://downloads.mysql.com/archives/get/p/23/file/mysql-boost-5.7.18.tar.gz 3、解压文件 tar -xvf mysql-boost-5.7.18...调试MySQL5.7源代码的一个简单笔记。...细节的地方没有全部写进去,大家有问题可以留言或者私信我交流。
一、centos7 安装 Python3.6.5教程 1、在安装Python之前,需要先安装一些后面遇到的依赖问题(如果有依赖问题,按照提示安装): yum -y install zlib-devel...6、让Centos7系统能够默认使用Python3.6 cd /usr/bin/ ? ...以上步骤为Centos7 安装Python3.6.5的实际操作文档。...二、Centos7安装 Ipython 6.1.0 1、安装依赖环境 yum install xz gcc zlib zlib-devel wget sqlite-devel openssl-devel...出现这样的错误,说明环境变量设置错误,修改方式如下: alias ipython='python -m IPython' ?
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